Protein–RNA interactions for Protein: S4R181

Ccdc166, Coiled-coil domain-containing 166, mousemouse

Predictions only

Length 449 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc166S4R181 Dhx30-224ENSMUST00000200066 4623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Ccdc166S4R181 Ptf1aos-201ENSMUST00000122978 916 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Ccdc166S4R181 Gm14114-201ENSMUST00000139345 287 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Ccdc166S4R181 Gm3764-209ENSMUST00000181550 1093 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Ccdc166S4R181 Gm26938-201ENSMUST00000182839 744 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Ccdc166S4R181 Spata33-206ENSMUST00000212637 569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Ccdc166S4R181 Acbd6-201ENSMUST00000035560 5592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Ccdc166S4R181 Pced1a-202ENSMUST00000110277 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Ccdc166S4R181 Zfc3h1-201ENSMUST00000036044 6957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Ccdc166S4R181 Man1c1-202ENSMUST00000054096 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
Ccdc166S4R181 Aida-206ENSMUST00000193625 1810 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.23
Ccdc166S4R181 Fiz1-202ENSMUST00000165320 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Ccdc166S4R181 1300014J16Rik-201ENSMUST00000219015 1337 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Ccdc166S4R181 Myo5a-214ENSMUST00000155282 6372 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ccdc166S4R181 Lsm10-201ENSMUST00000055575 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ccdc166S4R181 Gfra4-202ENSMUST00000066958 783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ccdc166S4R181 Zfp524-201ENSMUST00000086349 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ccdc166S4R181 Pkn1-201ENSMUST00000005616 6662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ccdc166S4R181 Yipf3-201ENSMUST00000095263 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ccdc166S4R181 Klf13-201ENSMUST00000063694 6396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ccdc166S4R181 Dtnb-222ENSMUST00000174479 3689 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ccdc166S4R181 Lrp5-201ENSMUST00000025856 5161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ccdc166S4R181 Cyth2-202ENSMUST00000107729 2519 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ccdc166S4R181 Prmt3-201ENSMUST00000032715 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ccdc166S4R181 Nsmf-204ENSMUST00000102931 2830 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ccdc166S4R181 She-201ENSMUST00000050401 5733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ccdc166S4R181 Otud7a-201ENSMUST00000058476 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ccdc166S4R181 Dscc1-201ENSMUST00000023059 1324 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ccdc166S4R181 Fam166b-201ENSMUST00000052829 1349 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ccdc166S4R181 Ispd-207ENSMUST00000223205 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ccdc166S4R181 Inpp4a-201ENSMUST00000027287 5691 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ccdc166S4R181 1700096K18Rik-201ENSMUST00000188465 1454 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Ccdc166S4R181 Btbd2-201ENSMUST00000003434 3026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ccdc166S4R181 Nectin2-202ENSMUST00000108450 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ccdc166S4R181 Clstn2-201ENSMUST00000035027 4365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ccdc166S4R181 Gm10013-201ENSMUST00000106074 672 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Ccdc166S4R181 Cutc-202ENSMUST00000112047 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ccdc166S4R181 Lyzl4-202ENSMUST00000120918 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ccdc166S4R181 Mir8112-201ENSMUST00000184382 131 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Ccdc166S4R181 4933406B15Rik-201ENSMUST00000220065 1182 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ccdc166S4R181 Grk6-206ENSMUST00000224995 2971 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Ccdc166S4R181 Dctn3-201ENSMUST00000030158 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ccdc166S4R181 Sapcd2-202ENSMUST00000100323 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ccdc166S4R181 Csf3-201ENSMUST00000038886 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ccdc166S4R181 Rtkn-203ENSMUST00000121093 2597 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ccdc166S4R181 Proc-201ENSMUST00000171765 1566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ccdc166S4R181 Prex1-201ENSMUST00000036719 6533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ccdc166S4R181 BC029722-201ENSMUST00000124586 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ccdc166S4R181 Sox30-201ENSMUST00000049038 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ccdc166S4R181 AA414768-201ENSMUST00000121924 1257 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Ccdc166S4R181 Nipsnap3b-201ENSMUST00000015391 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ccdc166S4R181 Gm43272-201ENSMUST00000200599 1584 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Ccdc166S4R181 Gm9731-201ENSMUST00000209480 747 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Ccdc166S4R181 Ripply2-201ENSMUST00000058846 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ccdc166S4R181 Pfn2-201ENSMUST00000066882 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ccdc166S4R181 BC048679-201ENSMUST00000073406 522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ccdc166S4R181 Snap91-201ENSMUST00000036347 4237 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ccdc166S4R181 Smarcd2-201ENSMUST00000021052 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ccdc166S4R181 Meg3-201ENSMUST00000124106 1988 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ccdc166S4R181 Zic1-201ENSMUST00000034927 5606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ccdc166S4R181 Sarm1-202ENSMUST00000108287 4868 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ccdc166S4R181 Fam171a1-204ENSMUST00000115099 4149 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ccdc166S4R181 B3galnt2-204ENSMUST00000221300 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ccdc166S4R181 Fam222a-201ENSMUST00000043650 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ccdc166S4R181 Foxp1-230ENSMUST00000177437 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ccdc166S4R181 Plppr4-201ENSMUST00000061071 5696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ccdc166S4R181 Fez2-202ENSMUST00000112487 2020 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ccdc166S4R181 Tmem125-201ENSMUST00000060214 1864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ccdc166S4R181 Cacna1h-202ENSMUST00000159048 8174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ccdc166S4R181 Nudt17-204ENSMUST00000200387 2108 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ccdc166S4R181 Ric1-201ENSMUST00000043610 7190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ccdc166S4R181 Ttc6-203ENSMUST00000172939 5782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ccdc166S4R181 1810062O18Rik-202ENSMUST00000128848 745 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ccdc166S4R181 Snx15-207ENSMUST00000154601 767 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ccdc166S4R181 Fxyd5-208ENSMUST00000161805 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ccdc166S4R181 Grtp1-204ENSMUST00000209691 1030 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ccdc166S4R181 Gm7791-201ENSMUST00000219066 539 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Ccdc166S4R181 Gm8994-201ENSMUST00000077886 1236 ntAPPRIS P1 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ccdc166S4R181 Med14-201ENSMUST00000076016 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ccdc166S4R181 Glra1-203ENSMUST00000108853 1797 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ccdc166S4R181 Apbb1-219ENSMUST00000191601 2690 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ccdc166S4R181 Sh3yl1-202ENSMUST00000110880 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ccdc166S4R181 A830018L16Rik-208ENSMUST00000171690 6158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ccdc166S4R181 Tmem51os1-202ENSMUST00000141769 2131 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ccdc166S4R181 Acbd4-203ENSMUST00000107040 1959 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ccdc166S4R181 Tubb4b-ps1-201ENSMUST00000179460 1336 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Ccdc166S4R181 Nectin3-202ENSMUST00000023335 9116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ccdc166S4R181 U2af2-201ENSMUST00000005041 2183 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ccdc166S4R181 Trim24-201ENSMUST00000031859 4042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ccdc166S4R181 Tpd52-205ENSMUST00000120143 6317 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ccdc166S4R181 Tmc6-202ENSMUST00000103025 1279 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ccdc166S4R181 Dbndd2-204ENSMUST00000109350 1055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ccdc166S4R181 H2-Q6-201ENSMUST00000113879 981 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ccdc166S4R181 Gm4316-202ENSMUST00000212490 1115 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ccdc166S4R181 Prss27-201ENSMUST00000059482 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ccdc166S4R181 Grk2-202ENSMUST00000088737 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ccdc166S4R181 Socs4-201ENSMUST00000065562 6877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ccdc166S4R181 Kcnn2-208ENSMUST00000211323 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ccdc166S4R181 Eno1-202ENSMUST00000080926 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ccdc166S4R181 Icam5-201ENSMUST00000019616 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.2 ms