Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z320

Krt27, Keratin, type I cytoskeletal 27, mousemouse

Predictions only

Length 448 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Krt27Q9Z320 Tra2a-204ENSMUST00000204189 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
Krt27Q9Z320 Tm2d3-202ENSMUST00000065574 1478 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
Krt27Q9Z320 Hmga1-204ENSMUST00000118570 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Krt27Q9Z320 Tmem125-201ENSMUST00000060214 1864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Krt27Q9Z320 Cep57-208ENSMUST00000147115 2262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Krt27Q9Z320 AC125311.2-201ENSMUST00000227477 1940 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
Krt27Q9Z320 Sh3yl1-202ENSMUST00000110880 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Krt27Q9Z320 Rgs19-207ENSMUST00000108779 642 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Krt27Q9Z320 Zfp629-207ENSMUST00000134446 670 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Krt27Q9Z320 Smim22-201ENSMUST00000178155 429 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Krt27Q9Z320 Gm5297-201ENSMUST00000198555 1171 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
Krt27Q9Z320 AC153881.1-201ENSMUST00000214448 284 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
Krt27Q9Z320 Cck-201ENSMUST00000035120 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Krt27Q9Z320 Gm10812-201ENSMUST00000099864 546 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
Krt27Q9Z320 Adam33-201ENSMUST00000052104 2795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Krt27Q9Z320 Cmip-202ENSMUST00000166750 2408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Krt27Q9Z320 Smim10l1-201ENSMUST00000100864 2842 ntAPPRIS P1 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Krt27Q9Z320 Tubb4b-ps1-201ENSMUST00000179460 1336 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
Krt27Q9Z320 Mark3-201ENSMUST00000075281 3321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Krt27Q9Z320 Gm45736-201ENSMUST00000210592 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Krt27Q9Z320 Rtkn-201ENSMUST00000065512 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Krt27Q9Z320 Ntng1-204ENSMUST00000106571 1446 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Krt27Q9Z320 Ntng1-210ENSMUST00000138953 1443 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Krt27Q9Z320 Slc16a3-201ENSMUST00000070653 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Krt27Q9Z320 Itgb1bp1-201ENSMUST00000076260 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Krt27Q9Z320 4930474N05Rik-203ENSMUST00000226305 2313 ntAPPRIS P1 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Krt27Q9Z320 Usp21-202ENSMUST00000111305 2278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Krt27Q9Z320 Ankrd22-201ENSMUST00000025686 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Krt27Q9Z320 Ern1-203ENSMUST00000106800 654 ntTSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Krt27Q9Z320 Ccnd2-202ENSMUST00000201066 983 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Krt27Q9Z320 Vps37d-202ENSMUST00000076203 1286 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Krt27Q9Z320 Fam53a-201ENSMUST00000045329 2346 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Krt27Q9Z320 Arhgef7-205ENSMUST00000110909 4926 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Krt27Q9Z320 Arhgef19-201ENSMUST00000006618 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Krt27Q9Z320 Nadk2-202ENSMUST00000100789 3578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Krt27Q9Z320 Gm15635-204ENSMUST00000208024 2539 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
Krt27Q9Z320 BC051019-202ENSMUST00000106735 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Krt27Q9Z320 9930012K11Rik-205ENSMUST00000153871 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Krt27Q9Z320 Adnp-202ENSMUST00000088001 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Krt27Q9Z320 Myo5b-201ENSMUST00000074157 6745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Krt27Q9Z320 Fbxo7-203ENSMUST00000120344 1655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Krt27Q9Z320 Ube3c-201ENSMUST00000049453 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Krt27Q9Z320 Vac14-201ENSMUST00000034190 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Krt27Q9Z320 Haus8-201ENSMUST00000035960 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Krt27Q9Z320 Mturn-203ENSMUST00000190641 5303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Krt27Q9Z320 Il17rb-202ENSMUST00000122205 2094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Krt27Q9Z320 Tlcd1-203ENSMUST00000108338 714 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Krt27Q9Z320 Mir1199-201ENSMUST00000117015 119 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
Krt27Q9Z320 Gm17035-201ENSMUST00000170557 419 ntTSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Krt27Q9Z320 2510002D24Rik-204ENSMUST00000191388 995 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Krt27Q9Z320 Gm37939-201ENSMUST00000192309 447 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Krt27Q9Z320 Rpl18a-206ENSMUST00000212709 700 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Krt27Q9Z320 Ppic-201ENSMUST00000025419 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Krt27Q9Z320 Gm11273-201ENSMUST00000044043 390 ntAPPRIS P1 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Krt27Q9Z320 Cldn24-201ENSMUST00000079639 663 ntAPPRIS P1 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Krt27Q9Z320 Pusl1-201ENSMUST00000097737 1243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Krt27Q9Z320 Gm5421-201ENSMUST00000181698 2354 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
Krt27Q9Z320 Map4k5-201ENSMUST00000049239 4452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Krt27Q9Z320 Mink1-202ENSMUST00000072873 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Krt27Q9Z320 Dock3-201ENSMUST00000044532 9063 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Krt27Q9Z320 Ccdc105-201ENSMUST00000105383 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Krt27Q9Z320 Gm19721-201ENSMUST00000195284 1764 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
Krt27Q9Z320 Zscan25-201ENSMUST00000094116 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Krt27Q9Z320 Csnk1g3-201ENSMUST00000069597 4394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Krt27Q9Z320 Ikzf1-203ENSMUST00000065433 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Krt27Q9Z320 Gm16201-202ENSMUST00000139218 2330 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Krt27Q9Z320 Trap1-201ENSMUST00000006137 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Krt27Q9Z320 Pdxdc1-202ENSMUST00000115802 2466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Krt27Q9Z320 Alcam-201ENSMUST00000023312 6036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Krt27Q9Z320 Ttc13-201ENSMUST00000041614 3038 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Krt27Q9Z320 Rasl10b-204ENSMUST00000175848 3249 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Krt27Q9Z320 Ost4-201ENSMUST00000132034 576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Krt27Q9Z320 2810405F15Rik-201ENSMUST00000195368 932 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
Krt27Q9Z320 AC175538.1-201ENSMUST00000225343 1269 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
Krt27Q9Z320 2010016I18Rik-204ENSMUST00000190356 1562 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Krt27Q9Z320 Cerkl-205ENSMUST00000143974 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Krt27Q9Z320 Stk32c-202ENSMUST00000165870 1883 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Krt27Q9Z320 Tigd3-201ENSMUST00000055911 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Krt27Q9Z320 Atp8b1-201ENSMUST00000025482 6440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Krt27Q9Z320 P2rx5-201ENSMUST00000006104 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Krt27Q9Z320 Ttc39a-201ENSMUST00000064129 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Krt27Q9Z320 Zrsr2-202ENSMUST00000112289 2735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Krt27Q9Z320 Esyt2-205ENSMUST00000220816 4287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Krt27Q9Z320 Kif7-202ENSMUST00000178048 4524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Krt27Q9Z320 S1pr5-201ENSMUST00000122088 2500 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Krt27Q9Z320 Aldh2-202ENSMUST00000129753 1799 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Krt27Q9Z320 Cpsf4-207ENSMUST00000162244 1387 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Krt27Q9Z320 Wbp1-202ENSMUST00000113936 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Krt27Q9Z320 Ergic3-202ENSMUST00000088650 1349 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Krt27Q9Z320 Crct1-202ENSMUST00000107301 460 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Krt27Q9Z320 Gm13816-201ENSMUST00000152230 715 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Krt27Q9Z320 Gm20544-201ENSMUST00000174338 690 ntTSL 3 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Krt27Q9Z320 Gm20695-202ENSMUST00000176233 1012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Krt27Q9Z320 Fam167b-201ENSMUST00000052835 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Krt27Q9Z320 Aprt-201ENSMUST00000006764 849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Krt27Q9Z320 Cep83-201ENSMUST00000020212 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Krt27Q9Z320 Cux1-206ENSMUST00000176172 4882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Krt27Q9Z320 Gm20604-201ENSMUST00000174651 2795 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Krt27Q9Z320 Myo5a-214ENSMUST00000155282 6372 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Krt27Q9Z320 Socs4-201ENSMUST00000065562 6877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.9 ms