Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z2V5

Hdac6, Histone deacetylase 6, mousemouse

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Length 1,149 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hdac6Q9Z2V5 Mmp24-201ENSMUST00000029141 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Hdac6Q9Z2V5 Gm128-202ENSMUST00000107197 1289 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Hdac6Q9Z2V5 Gm15372-201ENSMUST00000120729 834 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
Hdac6Q9Z2V5 Tmem255b-201ENSMUST00000167071 1138 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Hdac6Q9Z2V5 Sh3glb1-205ENSMUST00000199854 1416 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Hdac6Q9Z2V5 Gm5867-201ENSMUST00000063197 592 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
Hdac6Q9Z2V5 Galnt3-201ENSMUST00000028378 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Hdac6Q9Z2V5 Cldn4-201ENSMUST00000051401 1816 ntAPPRIS P1 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Hdac6Q9Z2V5 H2-Q7-202ENSMUST00000076256 1523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Hdac6Q9Z2V5 Tmem64-201ENSMUST00000062684 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Hdac6Q9Z2V5 Kat14-201ENSMUST00000028911 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Hdac6Q9Z2V5 Aif1l-201ENSMUST00000001920 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Hdac6Q9Z2V5 Acads-201ENSMUST00000031524 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Hdac6Q9Z2V5 Ubald1-201ENSMUST00000037843 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Hdac6Q9Z2V5 Pxk-201ENSMUST00000036682 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Hdac6Q9Z2V5 Trmt11-201ENSMUST00000019927 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Hdac6Q9Z2V5 Acvrl1-203ENSMUST00000119063 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Hdac6Q9Z2V5 Aifm1-201ENSMUST00000037349 2237 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Hdac6Q9Z2V5 Klk12-202ENSMUST00000107970 1115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Hdac6Q9Z2V5 Gm11452-201ENSMUST00000122376 690 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
Hdac6Q9Z2V5 Scpep1os-201ENSMUST00000139592 811 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Hdac6Q9Z2V5 Syne4-208ENSMUST00000176304 1006 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Hdac6Q9Z2V5 1700019N19Rik-201ENSMUST00000028299 970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Hdac6Q9Z2V5 Ank1-201ENSMUST00000033947 1030 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Hdac6Q9Z2V5 Hist1h1a-201ENSMUST00000055770 741 ntAPPRIS P1 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Hdac6Q9Z2V5 Rad51d-203ENSMUST00000092844 1228 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Hdac6Q9Z2V5 Irf5-205ENSMUST00000167252 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Hdac6Q9Z2V5 Zfp3-201ENSMUST00000060444 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Hdac6Q9Z2V5 Fez2-201ENSMUST00000070039 1939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Hdac6Q9Z2V5 Hs2st1-201ENSMUST00000043325 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Hdac6Q9Z2V5 Pou3f1-201ENSMUST00000053491 3849 ntAPPRIS P1 BASIC21.58■■□□□ 1.04
Hdac6Q9Z2V5 Ppp2r2d-207ENSMUST00000155672 1938 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Hdac6Q9Z2V5 Ccdc17-201ENSMUST00000051869 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Hdac6Q9Z2V5 2210408F21Rik-212ENSMUST00000152157 490 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Hdac6Q9Z2V5 Gm13054-201ENSMUST00000154192 820 ntTSL 3 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Hdac6Q9Z2V5 4930519L02Rik-201ENSMUST00000197683 619 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Hdac6Q9Z2V5 Gm2270-201ENSMUST00000222858 797 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Hdac6Q9Z2V5 Ndufaf3-201ENSMUST00000074208 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Hdac6Q9Z2V5 Grk6-202ENSMUST00000099482 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Hdac6Q9Z2V5 Lman2l-202ENSMUST00000115011 2290 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Hdac6Q9Z2V5 Magi2-206ENSMUST00000197443 6578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Hdac6Q9Z2V5 3110002H16Rik-201ENSMUST00000025276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Hdac6Q9Z2V5 Irak2-203ENSMUST00000089023 1734 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Hdac6Q9Z2V5 Oraov1-203ENSMUST00000105895 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Hdac6Q9Z2V5 Pih1d1-202ENSMUST00000107811 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Hdac6Q9Z2V5 Hnrnpa1l2-ps-201ENSMUST00000129154 964 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
Hdac6Q9Z2V5 Cyhr1-204ENSMUST00000177359 1110 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Hdac6Q9Z2V5 Ino80dos-204ENSMUST00000188602 678 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Hdac6Q9Z2V5 Tecr-201ENSMUST00000019382 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Hdac6Q9Z2V5 Prdx6-201ENSMUST00000051925 959 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Hdac6Q9Z2V5 Dars-202ENSMUST00000064309 645 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Hdac6Q9Z2V5 Bcap29-201ENSMUST00000020979 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Hdac6Q9Z2V5 Hira-201ENSMUST00000004222 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Hdac6Q9Z2V5 Mapre3-201ENSMUST00000031058 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Hdac6Q9Z2V5 Plekhm2-201ENSMUST00000030751 4154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Hdac6Q9Z2V5 Lrriq4-203ENSMUST00000172350 1797 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Hdac6Q9Z2V5 Lrrc25-201ENSMUST00000052437 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Hdac6Q9Z2V5 Nfatc2-205ENSMUST00000137451 2369 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Hdac6Q9Z2V5 Tmem51os1-202ENSMUST00000141769 2131 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Hdac6Q9Z2V5 Bvht-202ENSMUST00000183087 588 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Hdac6Q9Z2V5 AC153556.1-201ENSMUST00000215135 794 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Hdac6Q9Z2V5 Olfr572-203ENSMUST00000215782 1233 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Hdac6Q9Z2V5 Timm13-204ENSMUST00000219896 542 ntTSL 3 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Hdac6Q9Z2V5 AC159301.1-201ENSMUST00000225130 1182 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
Hdac6Q9Z2V5 Ppp1r27-201ENSMUST00000026121 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Hdac6Q9Z2V5 4931422A03Rik-201ENSMUST00000056170 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Hdac6Q9Z2V5 Angptl8-201ENSMUST00000058777 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Hdac6Q9Z2V5 Rtkn-201ENSMUST00000065512 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Hdac6Q9Z2V5 Bhlhe22-201ENSMUST00000026120 3344 ntAPPRIS P1 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Hdac6Q9Z2V5 Rab40c-207ENSMUST00000167626 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Hdac6Q9Z2V5 Ascl2-201ENSMUST00000009392 1605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Hdac6Q9Z2V5 Vav3-201ENSMUST00000046864 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Hdac6Q9Z2V5 Grk6-206ENSMUST00000224995 2971 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
Hdac6Q9Z2V5 Gab2-201ENSMUST00000004622 6168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Hdac6Q9Z2V5 Zdhhc6-207ENSMUST00000224897 2168 ntAPPRIS P1 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Hdac6Q9Z2V5 Orai3-201ENSMUST00000061587 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Hdac6Q9Z2V5 Zfp385b-204ENSMUST00000111831 2734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Hdac6Q9Z2V5 Pcolce-202ENSMUST00000054564 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Hdac6Q9Z2V5 Ap1s1-201ENSMUST00000111080 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Hdac6Q9Z2V5 Gm15510-201ENSMUST00000123644 1172 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Hdac6Q9Z2V5 Gm16272-201ENSMUST00000128218 388 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Hdac6Q9Z2V5 Mkln1os-202ENSMUST00000144232 964 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Hdac6Q9Z2V5 Ctsg-201ENSMUST00000015583 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Hdac6Q9Z2V5 H2-T-ps-201ENSMUST00000172538 1067 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
Hdac6Q9Z2V5 Gm21887-202ENSMUST00000179760 483 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Hdac6Q9Z2V5 Olfr571-201ENSMUST00000061738 969 ntAPPRIS P1 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Hdac6Q9Z2V5 Ahcyl1-201ENSMUST00000029490 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Hdac6Q9Z2V5 Gm26892-201ENSMUST00000181695 1636 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Hdac6Q9Z2V5 Cog6-204ENSMUST00000193432 2078 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Hdac6Q9Z2V5 Nectin2-202ENSMUST00000108450 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Hdac6Q9Z2V5 Slc25a3-206ENSMUST00000170810 1341 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Hdac6Q9Z2V5 Nucb2-201ENSMUST00000032895 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Hdac6Q9Z2V5 Dap-201ENSMUST00000044524 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Hdac6Q9Z2V5 Gas2-201ENSMUST00000051912 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Hdac6Q9Z2V5 Crhbp-201ENSMUST00000045583 1701 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Hdac6Q9Z2V5 Slc25a16-201ENSMUST00000044977 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Hdac6Q9Z2V5 Upp1-205ENSMUST00000164791 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Hdac6Q9Z2V5 Gm10052-201ENSMUST00000168019 960 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
Hdac6Q9Z2V5 Gm18733-201ENSMUST00000173950 856 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
Hdac6Q9Z2V5 Gm38948-201ENSMUST00000210035 688 ntTSL 3 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36 ms