Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z2A0

Pdpk1, 3-phosphoinositide-dependent protein kinase 1, mousemouse

Predictions only

Length 559 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pdpk1Q9Z2A0 Adrb3-202ENSMUST00000117565 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Pdpk1Q9Z2A0 Mturn-203ENSMUST00000190641 5303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Pdpk1Q9Z2A0 CT010444.2-201ENSMUST00000217877 1629 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
Pdpk1Q9Z2A0 Eif4g3-202ENSMUST00000084214 6139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Pdpk1Q9Z2A0 Dag1-201ENSMUST00000080435 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Pdpk1Q9Z2A0 Acbd4-201ENSMUST00000024492 2075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Pdpk1Q9Z2A0 Plekhh3-201ENSMUST00000043397 3056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Pdpk1Q9Z2A0 Sbf1-205ENSMUST00000144585 6165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Pdpk1Q9Z2A0 Cacng6-202ENSMUST00000183200 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Pdpk1Q9Z2A0 Rpf1-203ENSMUST00000199079 1978 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Pdpk1Q9Z2A0 Atp5g1-203ENSMUST00000107686 691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Pdpk1Q9Z2A0 Tlcd1-203ENSMUST00000108338 714 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Pdpk1Q9Z2A0 Ost4-201ENSMUST00000132034 576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Pdpk1Q9Z2A0 Arntl-204ENSMUST00000210238 2976 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Pdpk1Q9Z2A0 Tmem14c-201ENSMUST00000021790 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Pdpk1Q9Z2A0 Arhgef33-211ENSMUST00000225658 473 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
Pdpk1Q9Z2A0 Cdk2ap2-201ENSMUST00000025779 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Pdpk1Q9Z2A0 Mpst-201ENSMUST00000043865 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Pdpk1Q9Z2A0 Dusp4-201ENSMUST00000033930 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Pdpk1Q9Z2A0 Plppr2-203ENSMUST00000190387 2608 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Pdpk1Q9Z2A0 Fxyd6-201ENSMUST00000085939 1788 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Pdpk1Q9Z2A0 Mfsd10-202ENSMUST00000114329 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Pdpk1Q9Z2A0 Atg4c-201ENSMUST00000030279 3178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Pdpk1Q9Z2A0 Arf1-202ENSMUST00000163300 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Pdpk1Q9Z2A0 A230050P20Rik-201ENSMUST00000043911 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Pdpk1Q9Z2A0 A330009N23Rik-201ENSMUST00000180639 1392 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Pdpk1Q9Z2A0 Trim37-201ENSMUST00000041282 5632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Pdpk1Q9Z2A0 Dvl2-201ENSMUST00000019362 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Pdpk1Q9Z2A0 Atp11a-201ENSMUST00000033818 7549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Pdpk1Q9Z2A0 Trmo-202ENSMUST00000086563 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Pdpk1Q9Z2A0 Tlcd1-204ENSMUST00000127587 1412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Pdpk1Q9Z2A0 Hrh3-202ENSMUST00000163215 1401 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Pdpk1Q9Z2A0 Gm6576-201ENSMUST00000169678 883 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
Pdpk1Q9Z2A0 Mrpl13-205ENSMUST00000172387 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Pdpk1Q9Z2A0 Ly6g6d-201ENSMUST00000007259 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Pdpk1Q9Z2A0 Pusl1-201ENSMUST00000097737 1243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Pdpk1Q9Z2A0 Podnl1-201ENSMUST00000093380 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Pdpk1Q9Z2A0 Homez-202ENSMUST00000142283 4713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Pdpk1Q9Z2A0 Lzts2-203ENSMUST00000179108 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Pdpk1Q9Z2A0 Rev1-201ENSMUST00000027251 4262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Pdpk1Q9Z2A0 Ppp1r3f-205ENSMUST00000150787 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Pdpk1Q9Z2A0 Tmed4-201ENSMUST00000004508 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Pdpk1Q9Z2A0 Btbd10-203ENSMUST00000119278 2394 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Pdpk1Q9Z2A0 Erlin1-201ENSMUST00000071698 3228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Pdpk1Q9Z2A0 Tle2-213ENSMUST00000146358 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Pdpk1Q9Z2A0 Tubgcp4-203ENSMUST00000110658 4250 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Pdpk1Q9Z2A0 Mfsd13a-202ENSMUST00000128041 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Pdpk1Q9Z2A0 Igsf11-201ENSMUST00000023478 3443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Pdpk1Q9Z2A0 Gm26774-201ENSMUST00000181534 2401 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Pdpk1Q9Z2A0 Mal-202ENSMUST00000028854 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Pdpk1Q9Z2A0 Smurf2-201ENSMUST00000092517 3125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Pdpk1Q9Z2A0 Acbd3-201ENSMUST00000027780 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Pdpk1Q9Z2A0 Arhgef17-204ENSMUST00000209041 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Pdpk1Q9Z2A0 Samd8-201ENSMUST00000022292 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Pdpk1Q9Z2A0 Gpn3-201ENSMUST00000031420 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Pdpk1Q9Z2A0 Clk4-201ENSMUST00000093132 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Pdpk1Q9Z2A0 Gpr20-201ENSMUST00000064166 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Pdpk1Q9Z2A0 Gm17484-201ENSMUST00000167899 2322 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Pdpk1Q9Z2A0 Ric3-202ENSMUST00000120876 1633 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Pdpk1Q9Z2A0 Prkra-201ENSMUST00000002808 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Pdpk1Q9Z2A0 Klhdc8b-210ENSMUST00000193895 2718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Pdpk1Q9Z2A0 Nfib-205ENSMUST00000107247 3267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Pdpk1Q9Z2A0 Gm13181-201ENSMUST00000120117 1069 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
Pdpk1Q9Z2A0 Gm3331-201ENSMUST00000183423 1017 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Pdpk1Q9Z2A0 AC175538.1-201ENSMUST00000225343 1269 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
Pdpk1Q9Z2A0 Smim15-206ENSMUST00000226042 1092 ntAPPRIS P1 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Pdpk1Q9Z2A0 Prss21-201ENSMUST00000024928 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Pdpk1Q9Z2A0 Ttc39a-201ENSMUST00000064129 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Pdpk1Q9Z2A0 Evx2-201ENSMUST00000001867 4191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Pdpk1Q9Z2A0 Plxnd1-201ENSMUST00000015511 6907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Pdpk1Q9Z2A0 Aire-204ENSMUST00000128241 1938 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Pdpk1Q9Z2A0 Aire-205ENSMUST00000130972 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Pdpk1Q9Z2A0 Aire-212ENSMUST00000145975 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Pdpk1Q9Z2A0 Aire-201ENSMUST00000019257 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Pdpk1Q9Z2A0 Slc35e3-201ENSMUST00000079041 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Pdpk1Q9Z2A0 Ddx19a-201ENSMUST00000040416 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Pdpk1Q9Z2A0 Agfg1-206ENSMUST00000189220 8044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Pdpk1Q9Z2A0 Zmynd15-203ENSMUST00000108563 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Pdpk1Q9Z2A0 Isyna1-201ENSMUST00000019283 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Pdpk1Q9Z2A0 Serbp1-203ENSMUST00000203077 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Pdpk1Q9Z2A0 Gm45774-201ENSMUST00000211992 2665 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
Pdpk1Q9Z2A0 Tasp1-201ENSMUST00000046656 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Pdpk1Q9Z2A0 Rbbp7-203ENSMUST00000112327 1862 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Pdpk1Q9Z2A0 Tdh-201ENSMUST00000022522 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Pdpk1Q9Z2A0 H2-D1-202ENSMUST00000172785 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Pdpk1Q9Z2A0 Gm20695-202ENSMUST00000176233 1012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Pdpk1Q9Z2A0 Nudt22-203ENSMUST00000180765 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Pdpk1Q9Z2A0 Gm45337-201ENSMUST00000210537 1267 ntAPPRIS P1 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Pdpk1Q9Z2A0 4930505A04Rik-201ENSMUST00000041763 904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Pdpk1Q9Z2A0 Wisp2-201ENSMUST00000029188 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Pdpk1Q9Z2A0 Tmem94-202ENSMUST00000103033 5238 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Pdpk1Q9Z2A0 Krt86-201ENSMUST00000088049 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Pdpk1Q9Z2A0 Snx25-203ENSMUST00000110378 3445 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Pdpk1Q9Z2A0 Idnk-204ENSMUST00000226010 1898 ntBASIC17.39■□□□□ 0.38
Pdpk1Q9Z2A0 Gbe1-201ENSMUST00000023393 2846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.38
Pdpk1Q9Z2A0 Capg-202ENSMUST00000114071 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
Pdpk1Q9Z2A0 Grina-201ENSMUST00000023225 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Pdpk1Q9Z2A0 Tnrc6c-202ENSMUST00000106344 8847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Pdpk1Q9Z2A0 Nup85-201ENSMUST00000021085 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Pdpk1Q9Z2A0 Lrrc47-205ENSMUST00000169622 3468 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.6 ms