Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z238

Ccne2, G1/S-specific cyclin-E2, mousemouse

Predictions only

Length 404 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccne2Q9Z238 Pi4k2b-201ENSMUST00000031081 3139 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Ccne2Q9Z238 2010016I18Rik-204ENSMUST00000190356 1562 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Ccne2Q9Z238 Ngrn-201ENSMUST00000117989 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Ccne2Q9Z238 4933402J07Rik-201ENSMUST00000093342 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Ccne2Q9Z238 Arfip2-202ENSMUST00000084782 2254 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Ccne2Q9Z238 Tm7sf2-201ENSMUST00000025713 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Ccne2Q9Z238 Lce1j-201ENSMUST00000107304 420 ntAPPRIS P1 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Ccne2Q9Z238 Gm38282-201ENSMUST00000192751 695 ntTSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Ccne2Q9Z238 Gm43791-201ENSMUST00000202914 468 ntTSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Ccne2Q9Z238 AC154471.1-201ENSMUST00000224418 436 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
Ccne2Q9Z238 Nthl1-201ENSMUST00000047611 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Ccne2Q9Z238 Olfr315-201ENSMUST00000081533 998 ntAPPRIS P1 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Ccne2Q9Z238 Dhx15-201ENSMUST00000031061 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Ccne2Q9Z238 Hmbox1-203ENSMUST00000175744 1771 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Ccne2Q9Z238 Igf2bp2-201ENSMUST00000100052 3899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Ccne2Q9Z238 Cklf-208ENSMUST00000212433 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Ccne2Q9Z238 Zfp768-201ENSMUST00000060783 2356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Ccne2Q9Z238 Cyth2-201ENSMUST00000056820 2527 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Ccne2Q9Z238 Rasd1-201ENSMUST00000062405 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Ccne2Q9Z238 Gm15545-202ENSMUST00000141011 899 ntTSL 3 BASIC20.58■□□□□ 0.89
Ccne2Q9Z238 Gm33142-201ENSMUST00000193913 867 ntBASIC20.58■□□□□ 0.89
Ccne2Q9Z238 Gm7367-201ENSMUST00000057611 492 ntBASIC20.58■□□□□ 0.89
Ccne2Q9Z238 Ccdc126-201ENSMUST00000055559 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Ccne2Q9Z238 Sars2-201ENSMUST00000094632 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Ccne2Q9Z238 Fam53a-201ENSMUST00000045329 2346 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Ccne2Q9Z238 Ptpa-202ENSMUST00000113601 1838 ntTSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Ccne2Q9Z238 Auh-202ENSMUST00000110031 3235 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Ccne2Q9Z238 Tmcc1-202ENSMUST00000088896 5838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Ccne2Q9Z238 Ltbp3-201ENSMUST00000081496 5190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Ccne2Q9Z238 Cog6-204ENSMUST00000193432 2078 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Ccne2Q9Z238 Aebp2-202ENSMUST00000087614 3727 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Ccne2Q9Z238 Rpl14-201ENSMUST00000165532 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Ccne2Q9Z238 Spata33-206ENSMUST00000212637 569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Ccne2Q9Z238 Gm10358-201ENSMUST00000212864 1250 ntAPPRIS P1 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Ccne2Q9Z238 Pdrg1-201ENSMUST00000028972 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Ccne2Q9Z238 Nt5c1a-201ENSMUST00000068262 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Ccne2Q9Z238 Ccdc149-201ENSMUST00000059428 3295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Ccne2Q9Z238 Il9r-204ENSMUST00000142396 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Ccne2Q9Z238 Gm43808-201ENSMUST00000202534 2065 ntBASIC20.57■□□□□ 0.88
Ccne2Q9Z238 Aldh7a1-201ENSMUST00000066208 1914 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Ccne2Q9Z238 Mbp-201ENSMUST00000047865 2492 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Ccne2Q9Z238 Gm26592-201ENSMUST00000180870 1730 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Ccne2Q9Z238 Msl1-204ENSMUST00000107487 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Ccne2Q9Z238 Dap-201ENSMUST00000044524 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Ccne2Q9Z238 Ppp1r3f-201ENSMUST00000115742 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Ccne2Q9Z238 St3gal3-203ENSMUST00000106410 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Ccne2Q9Z238 Ndufaf8-201ENSMUST00000106223 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Ccne2Q9Z238 Tm4sf19-201ENSMUST00000115149 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Ccne2Q9Z238 Gm5587-201ENSMUST00000206270 674 ntBASIC20.56■□□□□ 0.88
Ccne2Q9Z238 Stx3-208ENSMUST00000211641 1018 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Ccne2Q9Z238 Psma6-201ENSMUST00000021412 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Ccne2Q9Z238 Irak1bp1-201ENSMUST00000034783 1159 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Ccne2Q9Z238 Il17rb-202ENSMUST00000122205 2094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Ccne2Q9Z238 Farsa-202ENSMUST00000109754 1795 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Ccne2Q9Z238 Rbm24-201ENSMUST00000037923 3086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Ccne2Q9Z238 Panx2-203ENSMUST00000162424 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Ccne2Q9Z238 Matn4-202ENSMUST00000103104 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Ccne2Q9Z238 Lancl2-202ENSMUST00000072954 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Ccne2Q9Z238 Adamts18-201ENSMUST00000093113 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Ccne2Q9Z238 Gpd1l-201ENSMUST00000084853 1436 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Ccne2Q9Z238 March3-202ENSMUST00000102912 1754 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Ccne2Q9Z238 A930012L18Rik-201ENSMUST00000181094 2364 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Ccne2Q9Z238 1700024G13Rik-201ENSMUST00000100723 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Ccne2Q9Z238 Mzt2-202ENSMUST00000117136 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Ccne2Q9Z238 Mir142hg-201ENSMUST00000123700 269 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Ccne2Q9Z238 Lmbrd1-202ENSMUST00000186096 688 ntTSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Ccne2Q9Z238 Shc3-203ENSMUST00000223543 1241 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Ccne2Q9Z238 Nudt1-201ENSMUST00000050205 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Ccne2Q9Z238 Tsr3-201ENSMUST00000063574 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Ccne2Q9Z238 Nudt1-202ENSMUST00000071881 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Ccne2Q9Z238 Fam110a-204ENSMUST00000109865 1853 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Ccne2Q9Z238 Ptgis-202ENSMUST00000088041 1711 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Ccne2Q9Z238 Ube2q2-201ENSMUST00000059555 3456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Ccne2Q9Z238 3110002H16Rik-201ENSMUST00000025276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Ccne2Q9Z238 Kmt5c-201ENSMUST00000098853 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Ccne2Q9Z238 Fnbp1-205ENSMUST00000113552 1910 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Ccne2Q9Z238 Stambpl1-201ENSMUST00000054956 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Ccne2Q9Z238 2610301B20Rik-201ENSMUST00000080517 2116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Ccne2Q9Z238 Pdss2-201ENSMUST00000095725 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Ccne2Q9Z238 Bub3-201ENSMUST00000084502 2218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Ccne2Q9Z238 Xxylt1-201ENSMUST00000055389 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Ccne2Q9Z238 Zdhhc6-209ENSMUST00000225495 1711 ntBASIC20.54■□□□□ 0.88
Ccne2Q9Z238 Pagr1a-203ENSMUST00000206416 558 ntTSL 3 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Ccne2Q9Z238 Dbn1-202ENSMUST00000109921 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Ccne2Q9Z238 Adsl-204ENSMUST00000164806 1595 ntTSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Ccne2Q9Z238 Pea15a-201ENSMUST00000013842 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Ccne2Q9Z238 Snrpd2-201ENSMUST00000049294 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Ccne2Q9Z238 Fam131c-201ENSMUST00000006380 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Ccne2Q9Z238 Bend6-202ENSMUST00000115161 2231 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Ccne2Q9Z238 Kcnab3-201ENSMUST00000018614 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Ccne2Q9Z238 Tekt5-202ENSMUST00000115831 1277 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Ccne2Q9Z238 Pym1-201ENSMUST00000065210 1156 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Ccne2Q9Z238 Lce1i-201ENSMUST00000090866 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Ccne2Q9Z238 Olfr1232-201ENSMUST00000099785 936 ntAPPRIS P1 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Ccne2Q9Z238 Tsc22d1-201ENSMUST00000022587 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Ccne2Q9Z238 Pacsin1-204ENSMUST00000114873 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Ccne2Q9Z238 Ern1-204ENSMUST00000106801 1957 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Ccne2Q9Z238 Rhbdd3-202ENSMUST00000101610 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Ccne2Q9Z238 Bud23-202ENSMUST00000085984 1516 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Ccne2Q9Z238 Adcy3-202ENSMUST00000124505 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.9 ms