Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z1T1

Ap3b1, AP-3 complex subunit beta-1, mousemouse

Predictions only

Length 1,105 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ap3b1Q9Z1T1 Hbs1l-202ENSMUST00000061324 1998 ntTSL 3 BASIC26.64■■□□□ 1.86
Ap3b1Q9Z1T1 Gcat-202ENSMUST00000171999 1763 ntTSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
Ap3b1Q9Z1T1 Gm5414-201ENSMUST00000062879 1659 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.64■■□□□ 1.86
Ap3b1Q9Z1T1 Ppp1r2-202ENSMUST00000115233 958 ntTSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
Ap3b1Q9Z1T1 Gm11860-201ENSMUST00000122346 1010 ntBASIC26.64■■□□□ 1.86
Ap3b1Q9Z1T1 Gm6623-201ENSMUST00000173570 544 ntBASIC26.64■■□□□ 1.86
Ap3b1Q9Z1T1 Flg-207ENSMUST00000180293 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC26.64■■□□□ 1.86
Ap3b1Q9Z1T1 Gm37722-201ENSMUST00000193757 208 ntBASIC26.64■■□□□ 1.86
Ap3b1Q9Z1T1 Igsf9b-201ENSMUST00000115247 2857 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
Ap3b1Q9Z1T1 Ino80e-201ENSMUST00000050833 1944 ntTSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
Ap3b1Q9Z1T1 Ankle2-201ENSMUST00000031474 5215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
Ap3b1Q9Z1T1 4933427J07Rik-201ENSMUST00000156275 1533 ntTSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
Ap3b1Q9Z1T1 A530016L24Rik-202ENSMUST00000223266 1547 ntTSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
Ap3b1Q9Z1T1 Rragd-203ENSMUST00000098190 5008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.63■■□□□ 1.85
Ap3b1Q9Z1T1 Ism1-202ENSMUST00000184404 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
Ap3b1Q9Z1T1 Rasgrp2-224ENSMUST00000167240 2192 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.63■■□□□ 1.85
Ap3b1Q9Z1T1 Zdhhc6-207ENSMUST00000224897 2168 ntAPPRIS P1 BASIC26.63■■□□□ 1.85
Ap3b1Q9Z1T1 2810459M11Rik-202ENSMUST00000165824 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
Ap3b1Q9Z1T1 Gm11950-201ENSMUST00000121615 838 ntBASIC26.63■■□□□ 1.85
Ap3b1Q9Z1T1 Gm8797-201ENSMUST00000192045 490 ntAPPRIS P1 BASIC26.63■■□□□ 1.85
Ap3b1Q9Z1T1 Krt10-202ENSMUST00000211768 557 ntTSL 3 BASIC26.63■■□□□ 1.85
Ap3b1Q9Z1T1 Actrt3-201ENSMUST00000047630 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
Ap3b1Q9Z1T1 Fgfr2-211ENSMUST00000120187 4311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
Ap3b1Q9Z1T1 Hikeshi-206ENSMUST00000153470 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
Ap3b1Q9Z1T1 Hmg20b-204ENSMUST00000122993 1502 ntTSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
Ap3b1Q9Z1T1 Osbpl1a-203ENSMUST00000118313 2893 ntTSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
Ap3b1Q9Z1T1 Cxcl14-201ENSMUST00000021970 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
Ap3b1Q9Z1T1 Trim45-202ENSMUST00000094048 1815 ntTSL 5 BASIC26.62■■□□□ 1.85
Ap3b1Q9Z1T1 Il17rb-201ENSMUST00000016110 2061 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
Ap3b1Q9Z1T1 Zdhhc6-209ENSMUST00000225495 1711 ntBASIC26.62■■□□□ 1.85
Ap3b1Q9Z1T1 Smim3-201ENSMUST00000042710 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
Ap3b1Q9Z1T1 Diras1-201ENSMUST00000055125 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
Ap3b1Q9Z1T1 Kcnip2-209ENSMUST00000162528 2395 ntTSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
Ap3b1Q9Z1T1 Fndc11-202ENSMUST00000108835 1154 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.62■■□□□ 1.85
Ap3b1Q9Z1T1 Bpifa3-202ENSMUST00000109746 1102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
Ap3b1Q9Z1T1 AC159205.3-201ENSMUST00000224614 874 ntBASIC26.62■■□□□ 1.85
Ap3b1Q9Z1T1 AC154855.1-201ENSMUST00000227353 1458 ntBASIC26.62■■□□□ 1.85
Ap3b1Q9Z1T1 Peli2-201ENSMUST00000073150 5900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
Ap3b1Q9Z1T1 Rasd1-201ENSMUST00000062405 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
Ap3b1Q9Z1T1 Cckbr-201ENSMUST00000033189 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
Ap3b1Q9Z1T1 Tmtc1-202ENSMUST00000100772 8269 ntTSL 2 BASIC26.61■■□□□ 1.85
Ap3b1Q9Z1T1 St7l-201ENSMUST00000059271 5728 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
Ap3b1Q9Z1T1 Urah-202ENSMUST00000106050 719 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.61■■□□□ 1.85
Ap3b1Q9Z1T1 Cldn22-201ENSMUST00000038693 995 ntAPPRIS P1 BASIC26.61■■□□□ 1.85
Ap3b1Q9Z1T1 Tmem254b-201ENSMUST00000022418 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
Ap3b1Q9Z1T1 Pou2f2-202ENSMUST00000108413 1599 ntTSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
Ap3b1Q9Z1T1 Nlgn2-201ENSMUST00000056484 5003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
Ap3b1Q9Z1T1 B3gnt2-202ENSMUST00000062844 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
Ap3b1Q9Z1T1 Adgra2-202ENSMUST00000178514 5129 ntTSL 5 BASIC26.6■■□□□ 1.85
Ap3b1Q9Z1T1 Gm37194-201ENSMUST00000193092 3031 ntBASIC26.6■■□□□ 1.85
Ap3b1Q9Z1T1 Nsg1-201ENSMUST00000031009 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
Ap3b1Q9Z1T1 Rimklb-201ENSMUST00000068242 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
Ap3b1Q9Z1T1 Plekhm2-202ENSMUST00000084203 4136 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.6■■□□□ 1.85
Ap3b1Q9Z1T1 Ndufaf8-201ENSMUST00000106223 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
Ap3b1Q9Z1T1 Nme3-201ENSMUST00000024978 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
Ap3b1Q9Z1T1 Fbxo36-201ENSMUST00000097672 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
Ap3b1Q9Z1T1 Tmem44-204ENSMUST00000140402 2405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
Ap3b1Q9Z1T1 Ddhd2-206ENSMUST00000211688 2265 ntTSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
Ap3b1Q9Z1T1 Ssx2ip-204ENSMUST00000106153 3446 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
Ap3b1Q9Z1T1 Nsmf-204ENSMUST00000102931 2830 ntTSL 5 BASIC26.6■■□□□ 1.85
Ap3b1Q9Z1T1 Matn4-204ENSMUST00000109359 2179 ntTSL 5 BASIC26.6■■□□□ 1.85
Ap3b1Q9Z1T1 Rsph6a-201ENSMUST00000035521 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
Ap3b1Q9Z1T1 Abhd13-202ENSMUST00000139793 5191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.59■■□□□ 1.85
Ap3b1Q9Z1T1 Ptgis-202ENSMUST00000088041 1711 ntTSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
Ap3b1Q9Z1T1 Prmt2-202ENSMUST00000099571 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
Ap3b1Q9Z1T1 Adam22-205ENSMUST00000115385 2318 ntTSL 2 BASIC26.59■■□□□ 1.85
Ap3b1Q9Z1T1 C1ql3-201ENSMUST00000061545 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
Ap3b1Q9Z1T1 4833445I07Rik-201ENSMUST00000193193 1642 ntBASIC26.59■■□□□ 1.85
Ap3b1Q9Z1T1 Sirt7-202ENSMUST00000106183 427 ntTSL 3 BASIC26.59■■□□□ 1.85
Ap3b1Q9Z1T1 Gm38973-201ENSMUST00000206810 878 ntTSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
Ap3b1Q9Z1T1 Rln3-201ENSMUST00000061923 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
Ap3b1Q9Z1T1 Wnk2-210ENSMUST00000162403 6147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.59■■□□□ 1.85
Ap3b1Q9Z1T1 Rsu1-201ENSMUST00000028059 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
Ap3b1Q9Z1T1 Nrxn2-203ENSMUST00000113459 3285 ntTSL 2 BASIC26.59■■□□□ 1.85
Ap3b1Q9Z1T1 Caskin1-201ENSMUST00000024958 6172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.59■■□□□ 1.85
Ap3b1Q9Z1T1 Lrrc57-204ENSMUST00000102499 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
Ap3b1Q9Z1T1 Cdk10-201ENSMUST00000036880 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
Ap3b1Q9Z1T1 Foxp1-230ENSMUST00000177437 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
Ap3b1Q9Z1T1 Gab1-202ENSMUST00000210676 4985 ntTSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
Ap3b1Q9Z1T1 Bnip2-203ENSMUST00000117450 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
Ap3b1Q9Z1T1 Gfod2-203ENSMUST00000155038 951 ntTSL 2 BASIC26.58■■□□□ 1.85
Ap3b1Q9Z1T1 AC156576.2-201ENSMUST00000222752 503 ntTSL 5 BASIC26.58■■□□□ 1.85
Ap3b1Q9Z1T1 AC130713.1-201ENSMUST00000228853 1096 ntBASIC26.58■■□□□ 1.85
Ap3b1Q9Z1T1 Rpl36al-201ENSMUST00000054544 526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
Ap3b1Q9Z1T1 Spg21-202ENSMUST00000213957 1302 ntTSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
Ap3b1Q9Z1T1 Snrnp48-201ENSMUST00000091641 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
Ap3b1Q9Z1T1 Mapre3-201ENSMUST00000031058 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
Ap3b1Q9Z1T1 Fam69a-201ENSMUST00000031198 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.84
Ap3b1Q9Z1T1 Satb1-211ENSMUST00000152830 5993 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.58■■□□□ 1.84
Ap3b1Q9Z1T1 2810425M01Rik-201ENSMUST00000180790 1850 ntTSL 5 BASIC26.57■■□□□ 1.84
Ap3b1Q9Z1T1 Tnfrsf25-201ENSMUST00000025706 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
Ap3b1Q9Z1T1 Tmtc1-201ENSMUST00000060095 8383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
Ap3b1Q9Z1T1 Spsb4-201ENSMUST00000055433 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
Ap3b1Q9Z1T1 Glmn-201ENSMUST00000078021 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
Ap3b1Q9Z1T1 Fgf8-205ENSMUST00000111927 843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
Ap3b1Q9Z1T1 Echdc2-203ENSMUST00000116307 893 ntTSL 5 BASIC26.57■■□□□ 1.84
Ap3b1Q9Z1T1 Mras-203ENSMUST00000122384 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
Ap3b1Q9Z1T1 Has3-202ENSMUST00000175987 1154 ntTSL 5 BASIC26.57■■□□□ 1.84
Ap3b1Q9Z1T1 Tmem205-201ENSMUST00000046831 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
Ap3b1Q9Z1T1 1700003E16Rik-202ENSMUST00000203203 2070 ntTSL 2 BASIC26.57■■□□□ 1.84
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.5 ms