Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z1P4

Lgr5, Leucine-rich repeat-containing G-protein coupled receptor 5, mousemouse

Predictions only

Length 907 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lgr5Q9Z1P4 Naa10-204ENSMUST00000114389 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Lgr5Q9Z1P4 Mpst-202ENSMUST00000167140 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
Lgr5Q9Z1P4 Slc19a2-204ENSMUST00000169394 894 ntTSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
Lgr5Q9Z1P4 Cklf-201ENSMUST00000034342 667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Lgr5Q9Z1P4 Gm9857-201ENSMUST00000050914 393 ntAPPRIS P1 BASIC20.62■□□□□ 0.89
Lgr5Q9Z1P4 Bcap29-201ENSMUST00000020979 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Lgr5Q9Z1P4 Pdzd3-201ENSMUST00000034618 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Lgr5Q9Z1P4 Sept8-203ENSMUST00000120878 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
Lgr5Q9Z1P4 Marcks-201ENSMUST00000092584 4048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Lgr5Q9Z1P4 Babam1-201ENSMUST00000002473 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Lgr5Q9Z1P4 Acads-201ENSMUST00000031524 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Lgr5Q9Z1P4 Mff-202ENSMUST00000078332 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Lgr5Q9Z1P4 Rnf5-201ENSMUST00000015622 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Lgr5Q9Z1P4 Tulp3-205ENSMUST00000157005 1053 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Lgr5Q9Z1P4 Gm10616-201ENSMUST00000205285 2127 ntBASIC20.61■□□□□ 0.89
Lgr5Q9Z1P4 AC124569.2-201ENSMUST00000225998 818 ntBASIC20.61■□□□□ 0.89
Lgr5Q9Z1P4 Gab1-201ENSMUST00000034150 4870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Lgr5Q9Z1P4 Abhd5-202ENSMUST00000111497 2576 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Lgr5Q9Z1P4 Tmem39b-201ENSMUST00000102588 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Lgr5Q9Z1P4 Tbx20-202ENSMUST00000166018 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Lgr5Q9Z1P4 Rab40c-207ENSMUST00000167626 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Lgr5Q9Z1P4 Kcnn2-208ENSMUST00000211323 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Lgr5Q9Z1P4 Rnf141-201ENSMUST00000106682 1101 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Lgr5Q9Z1P4 Gm12359-202ENSMUST00000141696 713 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Lgr5Q9Z1P4 Gm12359-203ENSMUST00000153181 680 ntTSL 3 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Lgr5Q9Z1P4 Ankrd40-201ENSMUST00000021227 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Lgr5Q9Z1P4 A730089K16Rik-201ENSMUST00000194526 2427 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
Lgr5Q9Z1P4 Dnaaf5-203ENSMUST00000196441 2426 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Lgr5Q9Z1P4 Gnb2-203ENSMUST00000111023 1471 ntTSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Lgr5Q9Z1P4 Donson-201ENSMUST00000023682 2360 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Lgr5Q9Z1P4 Adam15-203ENSMUST00000107446 1686 ntTSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Lgr5Q9Z1P4 Lman2l-202ENSMUST00000115011 2290 ntTSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Lgr5Q9Z1P4 Ascl2-201ENSMUST00000009392 1605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Lgr5Q9Z1P4 Spg7-209ENSMUST00000149248 2896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Lgr5Q9Z1P4 Gnb1-202ENSMUST00000105616 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Lgr5Q9Z1P4 Dok5-201ENSMUST00000029075 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Lgr5Q9Z1P4 Ern1-204ENSMUST00000106801 1957 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Lgr5Q9Z1P4 Klhl2-201ENSMUST00000034017 3412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Lgr5Q9Z1P4 Hsd17b1-201ENSMUST00000019445 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Lgr5Q9Z1P4 Znhit6-201ENSMUST00000098534 2339 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Lgr5Q9Z1P4 Kat14-208ENSMUST00000147747 3299 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Lgr5Q9Z1P4 Vrk2-201ENSMUST00000078362 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Lgr5Q9Z1P4 Tm4sf19-201ENSMUST00000115149 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Lgr5Q9Z1P4 Mis18bp1-202ENSMUST00000124201 717 ntTSL 3 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Lgr5Q9Z1P4 Hrh3-204ENSMUST00000165248 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Lgr5Q9Z1P4 Gm44771-201ENSMUST00000206975 626 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
Lgr5Q9Z1P4 Pnmt-201ENSMUST00000041301 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Lgr5Q9Z1P4 Sult2b1-201ENSMUST00000075571 1193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Lgr5Q9Z1P4 Cldn19-201ENSMUST00000084309 924 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Lgr5Q9Z1P4 Mid1-203ENSMUST00000079443 2815 ntTSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Lgr5Q9Z1P4 Cdk11b-202ENSMUST00000105598 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Lgr5Q9Z1P4 Rpl3l-202ENSMUST00000170239 1375 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Lgr5Q9Z1P4 Sirt1-207ENSMUST00000177694 3353 ntTSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Lgr5Q9Z1P4 Vps53-202ENSMUST00000094015 2645 ntTSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
Lgr5Q9Z1P4 Lrp5-202ENSMUST00000176867 2759 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Lgr5Q9Z1P4 2810468N07Rik-201ENSMUST00000163493 1349 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Lgr5Q9Z1P4 Nat8f3-202ENSMUST00000168531 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Lgr5Q9Z1P4 Ppp2r1b-204ENSMUST00000174628 2195 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Lgr5Q9Z1P4 Cep57-209ENSMUST00000148086 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Lgr5Q9Z1P4 Psma3-204ENSMUST00000160864 859 ntTSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
Lgr5Q9Z1P4 Gm17112-201ENSMUST00000163194 432 ntTSL 3 BASIC20.58■□□□□ 0.89
Lgr5Q9Z1P4 Gm26871-202ENSMUST00000180774 695 ntTSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
Lgr5Q9Z1P4 Gm26644-201ENSMUST00000181365 958 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Lgr5Q9Z1P4 Rpl19-ps10-201ENSMUST00000205555 330 ntBASIC20.58■□□□□ 0.89
Lgr5Q9Z1P4 Gm44930-202ENSMUST00000208733 689 ntTSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
Lgr5Q9Z1P4 Rab1a-203ENSMUST00000109602 2626 ntTSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
Lgr5Q9Z1P4 Anapc5-208ENSMUST00000197719 2383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Lgr5Q9Z1P4 Stk32c-202ENSMUST00000165870 1883 ntTSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.88
Lgr5Q9Z1P4 Ipmk-201ENSMUST00000079252 5447 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Lgr5Q9Z1P4 Map6-202ENSMUST00000107100 2335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Lgr5Q9Z1P4 Actrt3-201ENSMUST00000047630 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Lgr5Q9Z1P4 Farsa-202ENSMUST00000109754 1795 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Lgr5Q9Z1P4 Vps53-203ENSMUST00000108419 2209 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Lgr5Q9Z1P4 Gpr142-202ENSMUST00000106584 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Lgr5Q9Z1P4 Flg-202ENSMUST00000178008 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Lgr5Q9Z1P4 Flg-205ENSMUST00000179250 765 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Lgr5Q9Z1P4 Flg-206ENSMUST00000179477 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Lgr5Q9Z1P4 Gm34933-201ENSMUST00000203245 1067 ntTSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Lgr5Q9Z1P4 Gm40457-201ENSMUST00000205319 1174 ntTSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Lgr5Q9Z1P4 Gm19935-201ENSMUST00000209208 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Lgr5Q9Z1P4 Gpr142-201ENSMUST00000045319 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Lgr5Q9Z1P4 Ifi27l2a-201ENSMUST00000055071 463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Lgr5Q9Z1P4 Arfip2-202ENSMUST00000084782 2254 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Lgr5Q9Z1P4 Acvrl1-203ENSMUST00000119063 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Lgr5Q9Z1P4 Irf5-205ENSMUST00000167252 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Lgr5Q9Z1P4 Tmcc1-202ENSMUST00000088896 5838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Lgr5Q9Z1P4 Zdhhc6-201ENSMUST00000076891 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Lgr5Q9Z1P4 Pdss2-201ENSMUST00000095725 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Lgr5Q9Z1P4 Pomp-201ENSMUST00000031654 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Lgr5Q9Z1P4 Tm6sf2-201ENSMUST00000049197 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Lgr5Q9Z1P4 Tsacc-202ENSMUST00000107556 584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Lgr5Q9Z1P4 Fgf20-202ENSMUST00000118639 587 ntTSL 3 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Lgr5Q9Z1P4 Taco1os-201ENSMUST00000140736 644 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Lgr5Q9Z1P4 Ppib-201ENSMUST00000034947 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Lgr5Q9Z1P4 Gpr6-201ENSMUST00000061796 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Lgr5Q9Z1P4 Ybx2-202ENSMUST00000108601 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Lgr5Q9Z1P4 Ift74-201ENSMUST00000030311 2139 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Lgr5Q9Z1P4 Pcolce-202ENSMUST00000054564 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Lgr5Q9Z1P4 Grk2-202ENSMUST00000088737 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Lgr5Q9Z1P4 Nr2f1-201ENSMUST00000091458 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.1 ms