Protein–RNA interactions for Protein: Q9WVQ0

Pmfbp1, Polyamine-modulated factor 1-binding protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,022 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pmfbp1Q9WVQ0 Nr1h2-213ENSMUST00000167197 1944 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Pmfbp1Q9WVQ0 Dlgap1-206ENSMUST00000133717 2355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Pmfbp1Q9WVQ0 Josd2-206ENSMUST00000121922 684 ntTSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Pmfbp1Q9WVQ0 Mrpl13-205ENSMUST00000172387 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Pmfbp1Q9WVQ0 Ripor2-202ENSMUST00000058009 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Pmfbp1Q9WVQ0 Senp2-201ENSMUST00000023561 4499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Pmfbp1Q9WVQ0 Abtb1-201ENSMUST00000032169 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Pmfbp1Q9WVQ0 Hspa8-201ENSMUST00000015800 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Pmfbp1Q9WVQ0 Rbpms-201ENSMUST00000033994 2375 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Pmfbp1Q9WVQ0 Lrrfip2-202ENSMUST00000098340 3191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Pmfbp1Q9WVQ0 Gabbr1-202ENSMUST00000172789 1460 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Pmfbp1Q9WVQ0 Spi1-201ENSMUST00000002180 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Pmfbp1Q9WVQ0 Klhl5-204ENSMUST00000204097 3149 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Pmfbp1Q9WVQ0 Rpf1-203ENSMUST00000199079 1978 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Pmfbp1Q9WVQ0 AC175538.1-201ENSMUST00000225343 1269 ntBASIC20.56■□□□□ 0.88
Pmfbp1Q9WVQ0 Cldn24-201ENSMUST00000079639 663 ntAPPRIS P1 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Pmfbp1Q9WVQ0 Tmem233-201ENSMUST00000111997 2477 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Pmfbp1Q9WVQ0 A930001A20Rik-201ENSMUST00000182586 1366 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Pmfbp1Q9WVQ0 Gm26548-201ENSMUST00000181165 2029 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Pmfbp1Q9WVQ0 BC029722-201ENSMUST00000124586 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Pmfbp1Q9WVQ0 Ddhd2-206ENSMUST00000211688 2265 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Pmfbp1Q9WVQ0 Atp2a2-201ENSMUST00000031423 4486 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Pmfbp1Q9WVQ0 Rragd-201ENSMUST00000029946 5055 ntTSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Pmfbp1Q9WVQ0 Asph-204ENSMUST00000084915 2884 ntTSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Pmfbp1Q9WVQ0 Htr5b-201ENSMUST00000055884 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Pmfbp1Q9WVQ0 Amfr-201ENSMUST00000053766 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Pmfbp1Q9WVQ0 Ccdc17-201ENSMUST00000051869 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Pmfbp1Q9WVQ0 Gm7712-202ENSMUST00000222331 1510 ntBASIC20.55■□□□□ 0.88
Pmfbp1Q9WVQ0 Gm27011-201ENSMUST00000182352 972 ntBASIC20.55■□□□□ 0.88
Pmfbp1Q9WVQ0 Gm42738-201ENSMUST00000201813 439 ntTSL 3 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Pmfbp1Q9WVQ0 Acads-201ENSMUST00000031524 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Pmfbp1Q9WVQ0 Gm17055-201ENSMUST00000166951 2232 ntTSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Pmfbp1Q9WVQ0 Naxd-201ENSMUST00000033901 1359 ntTSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Pmfbp1Q9WVQ0 Sharpin-201ENSMUST00000023211 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Pmfbp1Q9WVQ0 Nkpd1-201ENSMUST00000078908 2753 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Pmfbp1Q9WVQ0 Pick1-206ENSMUST00000166155 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Pmfbp1Q9WVQ0 Slc2a8-201ENSMUST00000028129 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Pmfbp1Q9WVQ0 Rbbp7-202ENSMUST00000112326 1430 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Pmfbp1Q9WVQ0 Matk-202ENSMUST00000117488 1980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Pmfbp1Q9WVQ0 Dok7-202ENSMUST00000101298 2443 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Pmfbp1Q9WVQ0 Chka-202ENSMUST00000072055 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Pmfbp1Q9WVQ0 Pigu-201ENSMUST00000077626 1636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Pmfbp1Q9WVQ0 Mdfi-202ENSMUST00000066368 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Pmfbp1Q9WVQ0 Igflr1-202ENSMUST00000172251 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Pmfbp1Q9WVQ0 Creb1-207ENSMUST00000187811 1255 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Pmfbp1Q9WVQ0 Gm37939-201ENSMUST00000192309 447 ntTSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Pmfbp1Q9WVQ0 Uqcr11-201ENSMUST00000020372 445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Pmfbp1Q9WVQ0 Gm11273-201ENSMUST00000044043 390 ntAPPRIS P1 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Pmfbp1Q9WVQ0 Pusl1-201ENSMUST00000097737 1243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Pmfbp1Q9WVQ0 Msmo1-201ENSMUST00000034015 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Pmfbp1Q9WVQ0 Lhx6-208ENSMUST00000148852 1481 ntTSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Pmfbp1Q9WVQ0 Cct6b-201ENSMUST00000021040 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Pmfbp1Q9WVQ0 Scrib-202ENSMUST00000063747 5440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Pmfbp1Q9WVQ0 Enpp1-202ENSMUST00000105520 6777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Pmfbp1Q9WVQ0 Rybp-201ENSMUST00000101118 4503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Pmfbp1Q9WVQ0 Pex6-201ENSMUST00000002840 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Pmfbp1Q9WVQ0 Gm26829-201ENSMUST00000180581 934 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Pmfbp1Q9WVQ0 AC153881.1-201ENSMUST00000214448 284 ntBASIC20.53■□□□□ 0.88
Pmfbp1Q9WVQ0 4930412O13Rik-201ENSMUST00000026889 1187 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Pmfbp1Q9WVQ0 Cpsf4-207ENSMUST00000162244 1387 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Pmfbp1Q9WVQ0 Atp2c1-204ENSMUST00000112558 5642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Pmfbp1Q9WVQ0 Krt6a-201ENSMUST00000023788 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Pmfbp1Q9WVQ0 Itsn1-201ENSMUST00000056482 5364 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Pmfbp1Q9WVQ0 Aspscr1-204ENSMUST00000106159 1615 ntTSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Pmfbp1Q9WVQ0 Slc2a13-202ENSMUST00000109283 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Pmfbp1Q9WVQ0 Ppp2r1b-204ENSMUST00000174628 2195 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Pmfbp1Q9WVQ0 Tedc2-201ENSMUST00000024930 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Pmfbp1Q9WVQ0 Zbtb24-201ENSMUST00000080771 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Pmfbp1Q9WVQ0 A930017K11Rik-201ENSMUST00000162431 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Pmfbp1Q9WVQ0 Eral1-201ENSMUST00000021183 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Pmfbp1Q9WVQ0 Crebbp-201ENSMUST00000023165 10820 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Pmfbp1Q9WVQ0 Pkp4-202ENSMUST00000102754 4614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Pmfbp1Q9WVQ0 Tfdp2-206ENSMUST00000185644 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
Pmfbp1Q9WVQ0 Taf6l-201ENSMUST00000003777 1869 ntTSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.87
Pmfbp1Q9WVQ0 Wbp1-202ENSMUST00000113936 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
Pmfbp1Q9WVQ0 Carmn-201ENSMUST00000181155 1778 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Pmfbp1Q9WVQ0 Tmem175-204ENSMUST00000146207 1686 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Pmfbp1Q9WVQ0 Rpf1-201ENSMUST00000029838 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Pmfbp1Q9WVQ0 Dpep3-201ENSMUST00000034371 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Pmfbp1Q9WVQ0 Col13a1-204ENSMUST00000105453 2935 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Pmfbp1Q9WVQ0 Rbpj-203ENSMUST00000113865 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Pmfbp1Q9WVQ0 Ccdc126-201ENSMUST00000055559 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Pmfbp1Q9WVQ0 Scamp3-201ENSMUST00000029684 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Pmfbp1Q9WVQ0 Zfp277-201ENSMUST00000069637 2188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Pmfbp1Q9WVQ0 Krt15-201ENSMUST00000107411 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Pmfbp1Q9WVQ0 Mir1199-201ENSMUST00000117015 119 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
Pmfbp1Q9WVQ0 Spcs1-201ENSMUST00000186131 1005 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Pmfbp1Q9WVQ0 Ntpcr-201ENSMUST00000034313 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Pmfbp1Q9WVQ0 Dvl3-204ENSMUST00000171774 2319 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Pmfbp1Q9WVQ0 Aifm1-201ENSMUST00000037349 2237 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Pmfbp1Q9WVQ0 P2rx2-201ENSMUST00000058016 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Pmfbp1Q9WVQ0 Arfip2-202ENSMUST00000084782 2254 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Pmfbp1Q9WVQ0 Fam71e1-202ENSMUST00000205359 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Pmfbp1Q9WVQ0 Gm6093-201ENSMUST00000221792 1623 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Pmfbp1Q9WVQ0 Inpp4a-201ENSMUST00000027287 5691 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Pmfbp1Q9WVQ0 Prss54-205ENSMUST00000213096 1501 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Pmfbp1Q9WVQ0 Vopp1-201ENSMUST00000114297 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Pmfbp1Q9WVQ0 Rint1-204ENSMUST00000117783 560 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Pmfbp1Q9WVQ0 Gm12085-201ENSMUST00000119263 940 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
Pmfbp1Q9WVQ0 Gm8520-201ENSMUST00000186517 868 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.7 ms