Protein–RNA interactions for Protein: Q9WV85

Nme3, Nucleoside diphosphate kinase 3, mousemouse

Predictions only

Length 169 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nme3Q9WV85 Flywch2-201ENSMUST00000024704 694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Nme3Q9WV85 Cox4i1-201ENSMUST00000034276 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Nme3Q9WV85 Gm10638-201ENSMUST00000098532 905 ntAPPRIS P1 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Nme3Q9WV85 Ube3c-201ENSMUST00000049453 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Nme3Q9WV85 Dbn1-202ENSMUST00000109921 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Nme3Q9WV85 Trabd-201ENSMUST00000081702 2439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Nme3Q9WV85 Rara-204ENSMUST00000107475 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Nme3Q9WV85 Cacfd1-205ENSMUST00000114007 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Nme3Q9WV85 Adgrb2-204ENSMUST00000106015 4982 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Nme3Q9WV85 Gm5643-201ENSMUST00000117081 966 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
Nme3Q9WV85 Gm12669-201ENSMUST00000122162 1009 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
Nme3Q9WV85 Sp3os-201ENSMUST00000123087 583 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Nme3Q9WV85 Zfp560-202ENSMUST00000143992 608 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Nme3Q9WV85 Ccdc58-202ENSMUST00000163352 970 ntTSL 3 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Nme3Q9WV85 Ccdc58-203ENSMUST00000164916 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Nme3Q9WV85 Gm43183-201ENSMUST00000200632 547 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
Nme3Q9WV85 Cdk2ap2-201ENSMUST00000025779 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Nme3Q9WV85 Theg-202ENSMUST00000077433 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Nme3Q9WV85 Mettl4-ps1-202ENSMUST00000130218 1323 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Nme3Q9WV85 Lrrc73-201ENSMUST00000095262 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Nme3Q9WV85 Cacna1c-216ENSMUST00000188522 7338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Nme3Q9WV85 Myo5a-214ENSMUST00000155282 6372 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Nme3Q9WV85 Kcnab3-201ENSMUST00000018614 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Nme3Q9WV85 Cep135-202ENSMUST00000121979 5537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Nme3Q9WV85 Eif2b5-201ENSMUST00000003320 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Nme3Q9WV85 Plppr2-201ENSMUST00000046371 2626 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Nme3Q9WV85 Zdhhc24-201ENSMUST00000006632 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Nme3Q9WV85 Tspoap1-202ENSMUST00000100644 7390 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Nme3Q9WV85 Sfrp2-201ENSMUST00000029625 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Nme3Q9WV85 Acot8-202ENSMUST00000103094 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Nme3Q9WV85 Rpl36al-202ENSMUST00000110619 1276 ntAPPRIS P1 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Nme3Q9WV85 Acot8-201ENSMUST00000017451 1055 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Nme3Q9WV85 D130020L05Rik-202ENSMUST00000220889 769 ntTSL 3 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Nme3Q9WV85 Tnnt2-201ENSMUST00000027671 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Nme3Q9WV85 Cebpg-201ENSMUST00000070191 914 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Nme3Q9WV85 Ly6g6d-201ENSMUST00000007259 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Nme3Q9WV85 Syngr1-202ENSMUST00000009728 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Nme3Q9WV85 Fam171a2-201ENSMUST00000049057 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Nme3Q9WV85 Dcaf12l2-201ENSMUST00000115057 2885 ntAPPRIS P1 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Nme3Q9WV85 Dnm1-216ENSMUST00000201494 2732 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Nme3Q9WV85 Nagpa-203ENSMUST00000147567 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Nme3Q9WV85 Sfrp1-201ENSMUST00000033952 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Nme3Q9WV85 Mrpl9-201ENSMUST00000029786 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Nme3Q9WV85 Cdh2-201ENSMUST00000025166 4843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Nme3Q9WV85 2900052L18Rik-201ENSMUST00000139014 1588 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Nme3Q9WV85 Atad3a-201ENSMUST00000030903 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Nme3Q9WV85 Capg-202ENSMUST00000114071 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Nme3Q9WV85 Pex6-201ENSMUST00000002840 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Nme3Q9WV85 Il4i1-202ENSMUST00000118125 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Nme3Q9WV85 Lbp-202ENSMUST00000109491 1322 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Nme3Q9WV85 Sox4-201ENSMUST00000067230 4795 ntAPPRIS P1 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Nme3Q9WV85 Plxdc1-202ENSMUST00000107564 619 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Nme3Q9WV85 Stmn1-201ENSMUST00000030636 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Nme3Q9WV85 Agpat3-203ENSMUST00000105388 3681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Nme3Q9WV85 Gm21974-201ENSMUST00000126662 2037 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Nme3Q9WV85 Mpped2-202ENSMUST00000111063 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Nme3Q9WV85 Sart3-201ENSMUST00000019118 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Nme3Q9WV85 C030014I23Rik-201ENSMUST00000080911 1810 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
Nme3Q9WV85 Aldh2-202ENSMUST00000129753 1799 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Nme3Q9WV85 Ilk-212ENSMUST00000163389 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Nme3Q9WV85 Wt1-205ENSMUST00000143043 3090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Nme3Q9WV85 Donson-201ENSMUST00000023682 2360 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Nme3Q9WV85 Prkra-201ENSMUST00000002808 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Nme3Q9WV85 Tmem131l-201ENSMUST00000052342 4815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Nme3Q9WV85 Mfsd13a-202ENSMUST00000128041 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Nme3Q9WV85 Aig1-205ENSMUST00000162610 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Nme3Q9WV85 Kmt5b-202ENSMUST00000052699 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Nme3Q9WV85 Elk4-202ENSMUST00000086556 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Nme3Q9WV85 Lrrc43-202ENSMUST00000121444 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Nme3Q9WV85 Foxa3-201ENSMUST00000036018 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Nme3Q9WV85 Cul4a-201ENSMUST00000016680 3728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Nme3Q9WV85 Ing1-202ENSMUST00000209565 1971 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Nme3Q9WV85 Ccdc124-201ENSMUST00000007865 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Nme3Q9WV85 Sncaip-205ENSMUST00000178011 3433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Nme3Q9WV85 Ctnnal1-202ENSMUST00000107612 850 ntTSL 3 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Nme3Q9WV85 Atp8a1-204ENSMUST00000113652 854 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Nme3Q9WV85 Sap30-201ENSMUST00000034022 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Nme3Q9WV85 Gm19721-201ENSMUST00000195284 1764 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
Nme3Q9WV85 6430573F11Rik-202ENSMUST00000135373 2573 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Nme3Q9WV85 Sh3yl1-202ENSMUST00000110880 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Nme3Q9WV85 Arpc1a-201ENSMUST00000031625 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Nme3Q9WV85 Plppr5-202ENSMUST00000106473 4294 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Nme3Q9WV85 Scly-201ENSMUST00000027532 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Nme3Q9WV85 Rmdn3-201ENSMUST00000094695 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Nme3Q9WV85 Prdm11-201ENSMUST00000111272 3012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Nme3Q9WV85 Txnl1-201ENSMUST00000025476 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Nme3Q9WV85 Prmt9-202ENSMUST00000118622 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Nme3Q9WV85 Glmn-201ENSMUST00000078021 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Nme3Q9WV85 Btbd10-203ENSMUST00000119278 2394 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Nme3Q9WV85 Nudt22-203ENSMUST00000180765 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Nme3Q9WV85 Gm10517-202ENSMUST00000192970 758 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
Nme3Q9WV85 Cadm1-201ENSMUST00000034581 1254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Nme3Q9WV85 Synm-205ENSMUST00000208815 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Nme3Q9WV85 Rhobtb1-202ENSMUST00000067908 4422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Nme3Q9WV85 Fbrsl1-202ENSMUST00000069483 4720 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Nme3Q9WV85 Pnck-202ENSMUST00000114472 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Nme3Q9WV85 U2af2-209ENSMUST00000209099 2088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Nme3Q9WV85 Slc23a4-205ENSMUST00000201355 2003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Nme3Q9WV85 Ubr3-202ENSMUST00000112251 8081 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Nme3Q9WV85 Cadps2-212ENSMUST00000163871 4969 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 108.4 ms