Protein–RNA interactions for Protein: Q9WTM4

Nfe2l3, Nuclear factor erythroid 2-related factor 3, mousemouse

Predictions only

Length 660 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nfe2l3Q9WTM4 Sh2b2-203ENSMUST00000196397 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Nfe2l3Q9WTM4 Gm14859-201ENSMUST00000117752 357 ntBASIC20.62■□□□□ 0.89
Nfe2l3Q9WTM4 Gm44973-201ENSMUST00000207050 1003 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.62■□□□□ 0.89
Nfe2l3Q9WTM4 Rpl18a-206ENSMUST00000212709 700 ntTSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
Nfe2l3Q9WTM4 1700022H01Rik-201ENSMUST00000219142 387 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Nfe2l3Q9WTM4 Gm26709-203ENSMUST00000223260 715 ntTSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
Nfe2l3Q9WTM4 Mrpl14-201ENSMUST00000024734 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Nfe2l3Q9WTM4 Mrps6-201ENSMUST00000047429 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Nfe2l3Q9WTM4 Ldlrad1-201ENSMUST00000094916 1093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
Nfe2l3Q9WTM4 Gm43272-201ENSMUST00000200599 1584 ntBASIC20.62■□□□□ 0.89
Nfe2l3Q9WTM4 Idnk-204ENSMUST00000226010 1898 ntBASIC20.62■□□□□ 0.89
Nfe2l3Q9WTM4 Dcaf8-206ENSMUST00000192704 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Nfe2l3Q9WTM4 Slc25a35-202ENSMUST00000102606 1828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Nfe2l3Q9WTM4 Ercc6l2-203ENSMUST00000067821 2743 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
Nfe2l3Q9WTM4 Ispd-201ENSMUST00000062041 2690 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Nfe2l3Q9WTM4 Taf6l-211ENSMUST00000177056 2006 ntTSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
Nfe2l3Q9WTM4 Gm6598-201ENSMUST00000202719 2615 ntBASIC20.61■□□□□ 0.89
Nfe2l3Q9WTM4 BC029722-201ENSMUST00000124586 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Nfe2l3Q9WTM4 Rnf44-204ENSMUST00000125871 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Nfe2l3Q9WTM4 Pdxdc1-202ENSMUST00000115802 2466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Nfe2l3Q9WTM4 Gm27029-202ENSMUST00000107259 1855 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
Nfe2l3Q9WTM4 Smim12-201ENSMUST00000142029 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Nfe2l3Q9WTM4 Taar2-201ENSMUST00000079134 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Nfe2l3Q9WTM4 Carmn-201ENSMUST00000181155 1778 ntTSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
Nfe2l3Q9WTM4 Tia1-203ENSMUST00000095754 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
Nfe2l3Q9WTM4 Ripor2-202ENSMUST00000058009 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
Nfe2l3Q9WTM4 Rilp-201ENSMUST00000042972 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Nfe2l3Q9WTM4 B3gnt9-202ENSMUST00000136822 2516 ntAPPRIS P1 BASIC20.61■□□□□ 0.89
Nfe2l3Q9WTM4 Maml1-201ENSMUST00000059458 5528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Nfe2l3Q9WTM4 Tbx2-201ENSMUST00000000095 3626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Nfe2l3Q9WTM4 Apbb1-209ENSMUST00000188368 1970 ntTSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Nfe2l3Q9WTM4 Gm9103-201ENSMUST00000119371 405 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
Nfe2l3Q9WTM4 Mocs1-202ENSMUST00000165390 729 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Nfe2l3Q9WTM4 Gm29518-201ENSMUST00000190858 372 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
Nfe2l3Q9WTM4 Pagr1a-203ENSMUST00000206416 558 ntTSL 3 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Nfe2l3Q9WTM4 Mterf1a-202ENSMUST00000117463 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Nfe2l3Q9WTM4 AC121598.2-201ENSMUST00000228376 2325 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
Nfe2l3Q9WTM4 Pacsin1-204ENSMUST00000114873 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Nfe2l3Q9WTM4 3110043O21Rik-203ENSMUST00000108127 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Nfe2l3Q9WTM4 Slc25a3-201ENSMUST00000076694 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Nfe2l3Q9WTM4 Synm-205ENSMUST00000208815 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Nfe2l3Q9WTM4 Dmap1-201ENSMUST00000102687 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Nfe2l3Q9WTM4 Krt27-201ENSMUST00000017732 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Nfe2l3Q9WTM4 A930029G22Rik-201ENSMUST00000181032 1710 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Nfe2l3Q9WTM4 Krt13-201ENSMUST00000007275 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Nfe2l3Q9WTM4 Mrpl37-201ENSMUST00000030365 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Nfe2l3Q9WTM4 Gm7284-201ENSMUST00000131667 944 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
Nfe2l3Q9WTM4 Gm43791-201ENSMUST00000202914 468 ntTSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Nfe2l3Q9WTM4 Insl3-201ENSMUST00000034261 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Nfe2l3Q9WTM4 Odf2-211ENSMUST00000113767 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Nfe2l3Q9WTM4 Nsg1-201ENSMUST00000031009 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Nfe2l3Q9WTM4 Rmnd1-201ENSMUST00000042251 3139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Nfe2l3Q9WTM4 Gpr84-201ENSMUST00000079824 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Nfe2l3Q9WTM4 Tfap2a-208ENSMUST00000224999 2058 ntAPPRIS ALT1 BASIC20.58■□□□□ 0.89
Nfe2l3Q9WTM4 Ppp2r5d-201ENSMUST00000002839 2926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Nfe2l3Q9WTM4 Eps8-203ENSMUST00000111878 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Nfe2l3Q9WTM4 Mycn-202ENSMUST00000130990 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Nfe2l3Q9WTM4 Lrrfip2-202ENSMUST00000098340 3191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Nfe2l3Q9WTM4 Nudt16-201ENSMUST00000035179 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Nfe2l3Q9WTM4 Dbndd2-204ENSMUST00000109350 1055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
Nfe2l3Q9WTM4 Pafah1b3-201ENSMUST00000005583 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Nfe2l3Q9WTM4 Kank3-201ENSMUST00000048560 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Nfe2l3Q9WTM4 Hoxa10-201ENSMUST00000121043 1436 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.88
Nfe2l3Q9WTM4 Gm20460-201ENSMUST00000168709 1572 ntTSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.88
Nfe2l3Q9WTM4 Mfsd13a-201ENSMUST00000086969 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Nfe2l3Q9WTM4 Rnf208-202ENSMUST00000114355 1333 ntAPPRIS P1 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Nfe2l3Q9WTM4 Apbb1-214ENSMUST00000189378 2878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Nfe2l3Q9WTM4 Gm3488-202ENSMUST00000181562 1945 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Nfe2l3Q9WTM4 Uri1-201ENSMUST00000085513 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Nfe2l3Q9WTM4 Nectin1-201ENSMUST00000034510 5653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Nfe2l3Q9WTM4 Sirt7-202ENSMUST00000106183 427 ntTSL 3 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Nfe2l3Q9WTM4 Gm11355-201ENSMUST00000121120 306 ntBASIC20.57■□□□□ 0.88
Nfe2l3Q9WTM4 Gm13025-201ENSMUST00000141469 1163 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Nfe2l3Q9WTM4 Gfod2-203ENSMUST00000155038 951 ntTSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Nfe2l3Q9WTM4 Surf1-201ENSMUST00000015934 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Nfe2l3Q9WTM4 Gm27741-201ENSMUST00000185060 237 ntBASIC20.57■□□□□ 0.88
Nfe2l3Q9WTM4 Gm21057-201ENSMUST00000206022 670 ntTSL 3 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Nfe2l3Q9WTM4 Piga-208ENSMUST00000208697 947 ntTSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Nfe2l3Q9WTM4 Shc3-203ENSMUST00000223543 1241 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Nfe2l3Q9WTM4 Gpr137-201ENSMUST00000025909 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Nfe2l3Q9WTM4 Tctex1d4-201ENSMUST00000062206 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Nfe2l3Q9WTM4 Fam131c-201ENSMUST00000006380 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Nfe2l3Q9WTM4 Fthl17f-201ENSMUST00000097029 847 ntAPPRIS P1 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Nfe2l3Q9WTM4 C530025M09Rik-201ENSMUST00000099264 690 ntAPPRIS P1 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Nfe2l3Q9WTM4 Mfsd6-205ENSMUST00000156876 4932 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Nfe2l3Q9WTM4 Aida-206ENSMUST00000193625 1810 ntTSL 3 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Nfe2l3Q9WTM4 Gm7008-201ENSMUST00000038121 1366 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Nfe2l3Q9WTM4 Agfg1-205ENSMUST00000187899 2078 ntTSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Nfe2l3Q9WTM4 Mroh5-201ENSMUST00000071419 2766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Nfe2l3Q9WTM4 Tubb4b-ps1-201ENSMUST00000179460 1336 ntBASIC20.56■□□□□ 0.88
Nfe2l3Q9WTM4 Zfp119b-201ENSMUST00000056147 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Nfe2l3Q9WTM4 Vegfc-201ENSMUST00000033919 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Nfe2l3Q9WTM4 Gm15635-204ENSMUST00000208024 2539 ntBASIC20.56■□□□□ 0.88
Nfe2l3Q9WTM4 Ube2d1-201ENSMUST00000020085 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Nfe2l3Q9WTM4 Ndufaf8-201ENSMUST00000106223 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Nfe2l3Q9WTM4 Bpifa3-202ENSMUST00000109746 1102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Nfe2l3Q9WTM4 Cyp4f41-ps-201ENSMUST00000126790 1077 ntBASIC20.56■□□□□ 0.88
Nfe2l3Q9WTM4 Gm44924-201ENSMUST00000138087 421 ntTSL 3 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Nfe2l3Q9WTM4 Gm27704-201ENSMUST00000185094 107 ntBASIC20.56■□□□□ 0.88
Nfe2l3Q9WTM4 Gm10358-201ENSMUST00000212864 1250 ntAPPRIS P1 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.6 ms