Protein–RNA interactions for Protein: Q9QZ28

Six6, Homeobox protein SIX6, mousemouse

Predictions only

Length 246 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Six6Q9QZ28 Pias4-201ENSMUST00000005064 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Six6Q9QZ28 Zkscan3-204ENSMUST00000117721 5788 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Six6Q9QZ28 Agrn-206ENSMUST00000180572 6891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Six6Q9QZ28 Wrb-201ENSMUST00000023913 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Six6Q9QZ28 Pgls-205ENSMUST00000143441 1062 ntTSL 3 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Six6Q9QZ28 Golgb1-201ENSMUST00000023534 498 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Six6Q9QZ28 Sec61a2-201ENSMUST00000026926 756 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Six6Q9QZ28 Alyref2-201ENSMUST00000081527 1273 ntAPPRIS P1 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Six6Q9QZ28 Spsb3-203ENSMUST00000117890 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Six6Q9QZ28 Apoa5-202ENSMUST00000121598 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Six6Q9QZ28 Taf5l-202ENSMUST00000165628 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Six6Q9QZ28 Nedd4l-202ENSMUST00000163516 8163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Six6Q9QZ28 Tfeb-204ENSMUST00000113288 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Six6Q9QZ28 Nsun5-201ENSMUST00000000940 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Six6Q9QZ28 Sapcd2-202ENSMUST00000100323 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Six6Q9QZ28 Ggnbp2-201ENSMUST00000018547 2478 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Six6Q9QZ28 Mapk14-201ENSMUST00000004990 3547 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Six6Q9QZ28 Mapk14-202ENSMUST00000062694 3547 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Six6Q9QZ28 Gm21974-201ENSMUST00000126662 2037 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Six6Q9QZ28 Spi1-201ENSMUST00000002180 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Six6Q9QZ28 Zbtb16-202ENSMUST00000216150 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Six6Q9QZ28 Lhx3-202ENSMUST00000054099 2184 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Six6Q9QZ28 Zfp277-202ENSMUST00000069692 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Six6Q9QZ28 Specc1-210ENSMUST00000201723 2690 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Six6Q9QZ28 Lrch4-204ENSMUST00000176667 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Six6Q9QZ28 Pcsk6-201ENSMUST00000055576 4405 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Six6Q9QZ28 Mapk9-205ENSMUST00000109179 4682 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Six6Q9QZ28 Naa20-202ENSMUST00000110000 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Six6Q9QZ28 Mapk9-209ENSMUST00000164643 4682 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Six6Q9QZ28 Dctn3-203ENSMUST00000171641 885 ntTSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Six6Q9QZ28 Rps7-203ENSMUST00000221871 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Six6Q9QZ28 9430097D07Rik-201ENSMUST00000100190 1501 ntAPPRIS P1 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Six6Q9QZ28 Mef2d-203ENSMUST00000107559 1791 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Six6Q9QZ28 Slc32a1-201ENSMUST00000045738 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Six6Q9QZ28 Tmem234-201ENSMUST00000102591 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Six6Q9QZ28 Rprd1b-207ENSMUST00000152452 1910 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Six6Q9QZ28 Dynlt1c-201ENSMUST00000092966 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Six6Q9QZ28 Farsa-201ENSMUST00000003906 1826 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Six6Q9QZ28 Npffr1-201ENSMUST00000020287 3479 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Six6Q9QZ28 Klhl40-201ENSMUST00000098272 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Six6Q9QZ28 Hmg20b-201ENSMUST00000020454 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Six6Q9QZ28 Rock1-201ENSMUST00000067947 6187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Six6Q9QZ28 Mtx1-201ENSMUST00000073572 1617 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Six6Q9QZ28 AL591207.1-203ENSMUST00000222401 1380 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Six6Q9QZ28 Naa60-212ENSMUST00000186375 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Six6Q9QZ28 Kbtbd11-201ENSMUST00000069399 6973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Six6Q9QZ28 Hist1h4a-201ENSMUST00000102964 539 ntAPPRIS P1 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Six6Q9QZ28 Hopx-203ENSMUST00000120827 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Six6Q9QZ28 Zfp963-202ENSMUST00000154063 640 ntTSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Six6Q9QZ28 Rps2-208ENSMUST00000170715 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Six6Q9QZ28 Gm28417-201ENSMUST00000185218 785 ntTSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Six6Q9QZ28 Igfbp6-201ENSMUST00000023807 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Six6Q9QZ28 Rps2-201ENSMUST00000054289 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Six6Q9QZ28 Acbd6-203ENSMUST00000097529 1255 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Six6Q9QZ28 Zfp995-205ENSMUST00000190066 2221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Six6Q9QZ28 Actr8-201ENSMUST00000016115 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Six6Q9QZ28 Coch-202ENSMUST00000164782 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Six6Q9QZ28 Haspin-201ENSMUST00000052140 2810 ntAPPRIS P1 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Six6Q9QZ28 Rptor-201ENSMUST00000026671 6594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Six6Q9QZ28 Ikbip-202ENSMUST00000020150 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Six6Q9QZ28 F2rl1-201ENSMUST00000022185 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Six6Q9QZ28 Psen2-202ENSMUST00000111104 1475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Six6Q9QZ28 4833418N02Rik-202ENSMUST00000146560 1495 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Six6Q9QZ28 Msl1-201ENSMUST00000037915 4593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Six6Q9QZ28 Gm16262-201ENSMUST00000162306 1751 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Six6Q9QZ28 Arid4b-204ENSMUST00000110536 5783 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Six6Q9QZ28 Tcf3-206ENSMUST00000105342 2928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Six6Q9QZ28 Smad3-201ENSMUST00000034973 5090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Six6Q9QZ28 Efcab11-201ENSMUST00000046485 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Six6Q9QZ28 Sntb2-201ENSMUST00000047425 3225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Six6Q9QZ28 Gtf3c4-204ENSMUST00000171404 7127 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Six6Q9QZ28 Napa-201ENSMUST00000006181 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Six6Q9QZ28 Spint2-201ENSMUST00000098604 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Six6Q9QZ28 Safb-207ENSMUST00000182533 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Six6Q9QZ28 Zfp142-201ENSMUST00000027315 6480 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Six6Q9QZ28 Ttc13-203ENSMUST00000118134 3277 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Six6Q9QZ28 F12-201ENSMUST00000021948 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Six6Q9QZ28 Cmip-202ENSMUST00000166750 2408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Six6Q9QZ28 Mapk8ip3-208ENSMUST00000121787 5431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Six6Q9QZ28 Gm12251-201ENSMUST00000117893 792 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Six6Q9QZ28 Flvcr1-202ENSMUST00000191946 1216 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Six6Q9QZ28 Pawr-202ENSMUST00000218332 870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Six6Q9QZ28 Urgcp-206ENSMUST00000170116 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Six6Q9QZ28 Smox-209ENSMUST00000110189 1919 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Six6Q9QZ28 Adnp2-201ENSMUST00000066743 5012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Six6Q9QZ28 Fosl2-201ENSMUST00000031017 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Six6Q9QZ28 Syn1-201ENSMUST00000081893 3209 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Six6Q9QZ28 Zfp668-201ENSMUST00000054415 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Six6Q9QZ28 Mta1-203ENSMUST00000109723 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Six6Q9QZ28 Mta1-204ENSMUST00000109726 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Six6Q9QZ28 Mta1-205ENSMUST00000109727 2789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Six6Q9QZ28 Gm6209-202ENSMUST00000194629 1506 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Six6Q9QZ28 Sphk1-206ENSMUST00000106388 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Six6Q9QZ28 Nup85-201ENSMUST00000021085 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Six6Q9QZ28 Chgb-201ENSMUST00000028826 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Six6Q9QZ28 Cdk5-201ENSMUST00000030814 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Six6Q9QZ28 Ctf1-204ENSMUST00000206506 784 ntTSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Six6Q9QZ28 Znrf4-201ENSMUST00000052211 1236 ntAPPRIS P1 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Six6Q9QZ28 Fgf11-202ENSMUST00000102585 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Six6Q9QZ28 Rtkn-201ENSMUST00000065512 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.7 ms