Protein–RNA interactions for Protein: Q9QXX8

Nufip1, Nuclear fragile X mental retardation-interacting protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 484 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nufip1Q9QXX8 Gm20878-202ENSMUST00000108028 339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Nufip1Q9QXX8 Bad-202ENSMUST00000113423 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Nufip1Q9QXX8 Gm27463-201ENSMUST00000183569 57 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
Nufip1Q9QXX8 Gm43799-201ENSMUST00000201845 579 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
Nufip1Q9QXX8 Mrps28-201ENSMUST00000042148 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Nufip1Q9QXX8 Atad3a-201ENSMUST00000030903 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Nufip1Q9QXX8 Slc35g1-201ENSMUST00000054098 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Nufip1Q9QXX8 E030042O20Rik-201ENSMUST00000135244 1427 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Nufip1Q9QXX8 Csf3-201ENSMUST00000038886 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Nufip1Q9QXX8 Apba1-201ENSMUST00000025830 6632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Nufip1Q9QXX8 Trappc3-201ENSMUST00000030660 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Nufip1Q9QXX8 Serac1-201ENSMUST00000024570 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Nufip1Q9QXX8 Mapk7-203ENSMUST00000108714 3069 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Nufip1Q9QXX8 Gna11-201ENSMUST00000043604 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Nufip1Q9QXX8 2810459M11Rik-202ENSMUST00000165824 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Nufip1Q9QXX8 AC125311.2-201ENSMUST00000227477 1940 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
Nufip1Q9QXX8 Gpaa1-210ENSMUST00000172281 1809 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Nufip1Q9QXX8 Map3k5-201ENSMUST00000095806 5450 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Nufip1Q9QXX8 Sertad4-204ENSMUST00000155579 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Nufip1Q9QXX8 Negr1-203ENSMUST00000106065 1953 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Nufip1Q9QXX8 Armc10-202ENSMUST00000095495 2700 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Nufip1Q9QXX8 Rpl18-ps2-201ENSMUST00000118863 567 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
Nufip1Q9QXX8 Gm11539-201ENSMUST00000119837 557 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
Nufip1Q9QXX8 Gm13436-201ENSMUST00000120418 567 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
Nufip1Q9QXX8 Mipol1-201ENSMUST00000123498 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Nufip1Q9QXX8 Prr23a1-201ENSMUST00000170349 883 ntAPPRIS P1 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Nufip1Q9QXX8 Gm26643-201ENSMUST00000180854 1274 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Nufip1Q9QXX8 Gm37025-201ENSMUST00000195159 829 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
Nufip1Q9QXX8 Stk11-210ENSMUST00000213772 1239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Nufip1Q9QXX8 AC153881.2-201ENSMUST00000214877 204 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
Nufip1Q9QXX8 Snapc3-202ENSMUST00000071544 942 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Nufip1Q9QXX8 Nkiras2-201ENSMUST00000017981 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Nufip1Q9QXX8 Mpst-203ENSMUST00000169133 1309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Nufip1Q9QXX8 Ppp1r9b-201ENSMUST00000038696 4508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Nufip1Q9QXX8 Ubtf-206ENSMUST00000107123 2759 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Nufip1Q9QXX8 Cmip-202ENSMUST00000166750 2408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Nufip1Q9QXX8 Matn4-204ENSMUST00000109359 2179 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Nufip1Q9QXX8 Crct1-202ENSMUST00000107301 460 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Nufip1Q9QXX8 Nmnat3-203ENSMUST00000112938 848 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Nufip1Q9QXX8 Gm14968-201ENSMUST00000155528 769 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Nufip1Q9QXX8 Slc25a41-202ENSMUST00000169012 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Nufip1Q9QXX8 Gm26879-201ENSMUST00000181127 1176 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Nufip1Q9QXX8 Mir9-3hg-206ENSMUST00000182937 636 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Nufip1Q9QXX8 Dctn3-201ENSMUST00000030158 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Nufip1Q9QXX8 Bax-201ENSMUST00000033093 867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Nufip1Q9QXX8 Capn1-202ENSMUST00000164843 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Nufip1Q9QXX8 A930012L18Rik-201ENSMUST00000181094 2364 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Nufip1Q9QXX8 Gm43548-201ENSMUST00000197139 2353 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
Nufip1Q9QXX8 Otud5-201ENSMUST00000033494 4259 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Nufip1Q9QXX8 Ctnnbip1-201ENSMUST00000030839 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Nufip1Q9QXX8 Lins1-203ENSMUST00000121777 2729 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Nufip1Q9QXX8 Rab11fip3-202ENSMUST00000120691 5103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Nufip1Q9QXX8 Frrs1l-201ENSMUST00000053681 6817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Nufip1Q9QXX8 Ndor1-202ENSMUST00000114349 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Nufip1Q9QXX8 AC121598.2-201ENSMUST00000228376 2325 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
Nufip1Q9QXX8 Vps53-202ENSMUST00000094015 2645 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Nufip1Q9QXX8 Pitx2-207ENSMUST00000174661 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Nufip1Q9QXX8 Fndc11-201ENSMUST00000050026 1387 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Nufip1Q9QXX8 Fjx1-201ENSMUST00000099678 3134 ntAPPRIS P1 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Nufip1Q9QXX8 Ulk1-201ENSMUST00000031490 5213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Nufip1Q9QXX8 Rnf112-202ENSMUST00000060255 3161 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Nufip1Q9QXX8 Gm13559-201ENSMUST00000120476 863 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
Nufip1Q9QXX8 4833413E03Rik-201ENSMUST00000013706 1091 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Nufip1Q9QXX8 Tpsg1-202ENSMUST00000160377 1040 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Nufip1Q9QXX8 Ddah2-204ENSMUST00000174493 1254 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Nufip1Q9QXX8 Gm43353-201ENSMUST00000199224 1295 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
Nufip1Q9QXX8 Gm8969-201ENSMUST00000199694 526 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
Nufip1Q9QXX8 Rprml-201ENSMUST00000057870 1010 ntAPPRIS P1 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Nufip1Q9QXX8 Faap20-201ENSMUST00000097747 1479 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Nufip1Q9QXX8 Mterf1a-202ENSMUST00000117463 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Nufip1Q9QXX8 Eml2-203ENSMUST00000120595 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Nufip1Q9QXX8 Map4k5-210ENSMUST00000171211 4334 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Nufip1Q9QXX8 4930519A11Rik-201ENSMUST00000181381 1523 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Nufip1Q9QXX8 Chst1-201ENSMUST00000065797 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Nufip1Q9QXX8 Dlgap4-205ENSMUST00000109567 4840 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Nufip1Q9QXX8 Agbl4-205ENSMUST00000106591 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Nufip1Q9QXX8 Carmn-201ENSMUST00000181155 1778 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Nufip1Q9QXX8 Snrnp48-201ENSMUST00000091641 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Nufip1Q9QXX8 Tia1-203ENSMUST00000095754 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Nufip1Q9QXX8 Hist1h4a-201ENSMUST00000102964 539 ntAPPRIS P1 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Nufip1Q9QXX8 1700025A08Rik-201ENSMUST00000200753 609 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Nufip1Q9QXX8 H2afz-201ENSMUST00000041045 1069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Nufip1Q9QXX8 Kat2b-ps-201ENSMUST00000128468 2490 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Nufip1Q9QXX8 Aldh5a1-201ENSMUST00000037615 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Nufip1Q9QXX8 Gabbr1-202ENSMUST00000172789 1460 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Nufip1Q9QXX8 Krt73-201ENSMUST00000063292 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Nufip1Q9QXX8 Plekha4-206ENSMUST00000211155 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Nufip1Q9QXX8 Tbx3os2-201ENSMUST00000135385 1345 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Nufip1Q9QXX8 Gprc5c-203ENSMUST00000122967 1709 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Nufip1Q9QXX8 Trp73-203ENSMUST00000105643 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Nufip1Q9QXX8 Cyp4f13-204ENSMUST00000139353 1389 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Nufip1Q9QXX8 4933428P19Rik-201ENSMUST00000199616 1376 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
Nufip1Q9QXX8 Zar1-201ENSMUST00000073528 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Nufip1Q9QXX8 Hoxb2-201ENSMUST00000100523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Nufip1Q9QXX8 Ints8-202ENSMUST00000108318 3169 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Nufip1Q9QXX8 Gm9731-201ENSMUST00000209480 747 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
Nufip1Q9QXX8 Gm45618-201ENSMUST00000209890 660 ntAPPRIS P1 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Nufip1Q9QXX8 Fkbp3-201ENSMUST00000021332 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Nufip1Q9QXX8 Sec11c-201ENSMUST00000025394 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Nufip1Q9QXX8 1700096K18Rik-201ENSMUST00000188465 1454 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20 ms