Protein–RNA interactions for Protein: Q9QXN3

Trip4, Activating signal cointegrator 1, mousemouse

Predictions only

Length 581 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trip4Q9QXN3 Mapk8ip3-221ENSMUST00000178969 5579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.41
Trip4Q9QXN3 Carmn-201ENSMUST00000181155 1778 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.41
Trip4Q9QXN3 Snrnp48-201ENSMUST00000091641 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Trip4Q9QXN3 Tia1-203ENSMUST00000095754 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.41
Trip4Q9QXN3 Pdlim5-211ENSMUST00000198381 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.41
Trip4Q9QXN3 Plac9a-201ENSMUST00000052286 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Trip4Q9QXN3 Gas2-201ENSMUST00000051912 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Trip4Q9QXN3 Ptf1aos-201ENSMUST00000122978 916 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Trip4Q9QXN3 1810062O18Rik-202ENSMUST00000128848 745 ntTSL 3 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Trip4Q9QXN3 Gm2274-201ENSMUST00000184539 609 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
Trip4Q9QXN3 4732471J01Rik-202ENSMUST00000205787 991 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Trip4Q9QXN3 Chmp2a-203ENSMUST00000210587 930 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Trip4Q9QXN3 Serac1-201ENSMUST00000024570 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Trip4Q9QXN3 Tmed4-201ENSMUST00000004508 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Trip4Q9QXN3 Igsf23-201ENSMUST00000043440 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Trip4Q9QXN3 Mff-202ENSMUST00000078332 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Trip4Q9QXN3 Tmem79-201ENSMUST00000001456 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Trip4Q9QXN3 Fam46c-201ENSMUST00000061455 5640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Trip4Q9QXN3 Syncrip-205ENSMUST00000173801 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Trip4Q9QXN3 Prss54-205ENSMUST00000213096 1501 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Trip4Q9QXN3 Itpkb-201ENSMUST00000070181 6235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Trip4Q9QXN3 Gas1-201ENSMUST00000065086 2961 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Trip4Q9QXN3 Larp1b-202ENSMUST00000048490 2354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Trip4Q9QXN3 Cxcl14-201ENSMUST00000021970 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Trip4Q9QXN3 Syt8-202ENSMUST00000105976 1289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Trip4Q9QXN3 Syt8-205ENSMUST00000122393 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Trip4Q9QXN3 Dcxr-201ENSMUST00000026144 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Trip4Q9QXN3 Zscan12-201ENSMUST00000053293 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Trip4Q9QXN3 Ncoa1-201ENSMUST00000085814 7329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Trip4Q9QXN3 Mapk1-202ENSMUST00000069107 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Trip4Q9QXN3 Mff-208ENSMUST00000160786 1645 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Trip4Q9QXN3 Lca5l-201ENSMUST00000054855 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Trip4Q9QXN3 Iqsec2-203ENSMUST00000112605 6017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Trip4Q9QXN3 Rarb-207ENSMUST00000225921 2756 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
Trip4Q9QXN3 Adat2-201ENSMUST00000019944 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Trip4Q9QXN3 Alg5-201ENSMUST00000044567 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Trip4Q9QXN3 Tmem47-203ENSMUST00000171953 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Trip4Q9QXN3 Nespas-203ENSMUST00000151472 2248 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Trip4Q9QXN3 Best2-203ENSMUST00000209421 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Trip4Q9QXN3 Klf13-201ENSMUST00000063694 6396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Trip4Q9QXN3 Gm14453-201ENSMUST00000139677 553 ntTSL 3 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Trip4Q9QXN3 Gm18959-201ENSMUST00000208954 655 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
Trip4Q9QXN3 AC120002.2-201ENSMUST00000220205 773 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
Trip4Q9QXN3 Gadd45b-203ENSMUST00000220246 732 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Trip4Q9QXN3 Klhl33-201ENSMUST00000164415 1602 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Trip4Q9QXN3 Slc25a3-201ENSMUST00000076694 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Trip4Q9QXN3 Podxl2-201ENSMUST00000038409 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Trip4Q9QXN3 Epn1-202ENSMUST00000098845 2565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Trip4Q9QXN3 Tbx20-202ENSMUST00000166018 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Trip4Q9QXN3 Tspan9-201ENSMUST00000032503 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Trip4Q9QXN3 Klf16-201ENSMUST00000038558 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Trip4Q9QXN3 Map3k5-201ENSMUST00000095806 5450 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Trip4Q9QXN3 Plekha4-206ENSMUST00000211155 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Trip4Q9QXN3 Gm10300-201ENSMUST00000094662 2296 ntAPPRIS P1 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Trip4Q9QXN3 Fam98a-201ENSMUST00000112507 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Trip4Q9QXN3 Atp8b1-201ENSMUST00000025482 6440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Trip4Q9QXN3 Tmem80-202ENSMUST00000126510 959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Trip4Q9QXN3 Pih1d2-201ENSMUST00000000171 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Trip4Q9QXN3 4930579K19Rik-202ENSMUST00000190541 632 ntTSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Trip4Q9QXN3 Prok1-201ENSMUST00000049852 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Trip4Q9QXN3 Ocel1-203ENSMUST00000110052 5285 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Trip4Q9QXN3 Lhx6-208ENSMUST00000148852 1481 ntTSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Trip4Q9QXN3 Rbm11-202ENSMUST00000114249 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Trip4Q9QXN3 Dut-201ENSMUST00000051605 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Trip4Q9QXN3 Tmem136-202ENSMUST00000213544 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Trip4Q9QXN3 Pagr1a-202ENSMUST00000200948 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Trip4Q9QXN3 Gm42742-205ENSMUST00000202798 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Trip4Q9QXN3 Mmp23-201ENSMUST00000030937 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Trip4Q9QXN3 Vps9d1-203ENSMUST00000122363 2952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Trip4Q9QXN3 Prss53-202ENSMUST00000205300 1662 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Trip4Q9QXN3 Krt13-201ENSMUST00000007275 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Trip4Q9QXN3 Trp73-203ENSMUST00000105643 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Trip4Q9QXN3 Ankrd17-202ENSMUST00000081914 8057 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Trip4Q9QXN3 Ccdc102a-201ENSMUST00000077955 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Trip4Q9QXN3 Exoc3l2-202ENSMUST00000137613 4016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Trip4Q9QXN3 Mycbp-202ENSMUST00000106202 1536 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Trip4Q9QXN3 Odf2-211ENSMUST00000113767 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Trip4Q9QXN3 Gm16731-201ENSMUST00000132432 922 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Trip4Q9QXN3 Gm8969-201ENSMUST00000199694 526 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
Trip4Q9QXN3 Gm45058-201ENSMUST00000205810 766 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
Trip4Q9QXN3 Ptges2-201ENSMUST00000028162 4978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Trip4Q9QXN3 Cmip-202ENSMUST00000166750 2408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Trip4Q9QXN3 Igsf9b-201ENSMUST00000115247 2857 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Trip4Q9QXN3 Atp2a2-201ENSMUST00000031423 4486 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Trip4Q9QXN3 Tmem198-202ENSMUST00000113575 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Trip4Q9QXN3 AC125311.2-201ENSMUST00000227477 1940 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
Trip4Q9QXN3 Fam109a-201ENSMUST00000056654 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Trip4Q9QXN3 Rbm33-204ENSMUST00000114884 6256 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Trip4Q9QXN3 Timm29-201ENSMUST00000062125 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Trip4Q9QXN3 Ep300-201ENSMUST00000068387 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Trip4Q9QXN3 Itgb5-201ENSMUST00000069345 3056 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Trip4Q9QXN3 Bmt2-201ENSMUST00000045235 4143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Trip4Q9QXN3 Rtkn-201ENSMUST00000065512 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Trip4Q9QXN3 A930029G22Rik-201ENSMUST00000181032 1710 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Trip4Q9QXN3 Cacna1a-201ENSMUST00000121390 7926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Trip4Q9QXN3 Shq1-202ENSMUST00000113312 6816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Trip4Q9QXN3 Ptges3l-202ENSMUST00000103102 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Trip4Q9QXN3 Hist1h4a-201ENSMUST00000102964 539 ntAPPRIS P1 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Trip4Q9QXN3 Spata25-201ENSMUST00000017911 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Trip4Q9QXN3 BC048679-201ENSMUST00000073406 522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.4 ms