Protein–RNA interactions for Protein: Q9QXA7

Trim44, Tripartite motif-containing protein 44, mousemouse

Predictions only

Length 346 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim44Q9QXA7 Mib1-201ENSMUST00000052838 10231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Trim44Q9QXA7 Prss56-201ENSMUST00000044533 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Trim44Q9QXA7 Crtap-201ENSMUST00000084881 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Trim44Q9QXA7 Atxn7-202ENSMUST00000223714 2954 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Trim44Q9QXA7 Bicd2-203ENSMUST00000110085 4588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Trim44Q9QXA7 Tspyl2-201ENSMUST00000044509 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Trim44Q9QXA7 Polg2-201ENSMUST00000021060 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Trim44Q9QXA7 Matk-201ENSMUST00000105328 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Trim44Q9QXA7 Slc39a7-201ENSMUST00000025186 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Trim44Q9QXA7 Pick1-206ENSMUST00000166155 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Trim44Q9QXA7 Trmt2a-203ENSMUST00000115640 2367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Trim44Q9QXA7 Ttll11-202ENSMUST00000112976 3077 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Trim44Q9QXA7 1700023F06Rik-202ENSMUST00000107026 1127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Trim44Q9QXA7 Bex1-202ENSMUST00000113118 754 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Trim44Q9QXA7 D630036H23Rik-201ENSMUST00000171007 940 ntAPPRIS P1 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Trim44Q9QXA7 Tbc1d19-201ENSMUST00000037337 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Trim44Q9QXA7 Zc3h13-203ENSMUST00000227049 6144 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Trim44Q9QXA7 Atxn7l2-202ENSMUST00000117409 2321 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Trim44Q9QXA7 Btaf1-201ENSMUST00000099494 7204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Trim44Q9QXA7 Mvk-201ENSMUST00000043760 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Trim44Q9QXA7 Ier2-201ENSMUST00000060427 1522 ntAPPRIS P1 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Trim44Q9QXA7 Sh2b1-203ENSMUST00000205440 3089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Trim44Q9QXA7 Kri1-205ENSMUST00000184326 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Trim44Q9QXA7 Plcb1-205ENSMUST00000131552 7202 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Trim44Q9QXA7 Krt90-201ENSMUST00000023714 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Trim44Q9QXA7 Fiz1-201ENSMUST00000077385 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Trim44Q9QXA7 Fbxo2-201ENSMUST00000047951 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Trim44Q9QXA7 Gm13327-201ENSMUST00000133391 2741 ntTSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Trim44Q9QXA7 H2-Q4-201ENSMUST00000081435 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Trim44Q9QXA7 Klf9-201ENSMUST00000036884 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Trim44Q9QXA7 Rnpc3-203ENSMUST00000106536 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Trim44Q9QXA7 Mier2-203ENSMUST00000165028 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Trim44Q9QXA7 Brd3os-202ENSMUST00000209765 1898 ntAPPRIS P1 BASIC19.96■□□□□ 0.79
Trim44Q9QXA7 Itgb1bp1-201ENSMUST00000076260 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Trim44Q9QXA7 Kri1-201ENSMUST00000038671 2598 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Trim44Q9QXA7 Il17rb-202ENSMUST00000122205 2094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
Trim44Q9QXA7 Bmp8a-202ENSMUST00000102641 1917 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Trim44Q9QXA7 Smarcc1-204ENSMUST00000197984 3538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Trim44Q9QXA7 Igdcc3-203ENSMUST00000217371 3183 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Trim44Q9QXA7 Prdm12-201ENSMUST00000113470 2471 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
Trim44Q9QXA7 Rps2-ps6-201ENSMUST00000095471 855 ntBASIC19.96■□□□□ 0.79
Trim44Q9QXA7 Dok4-201ENSMUST00000046461 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Trim44Q9QXA7 Lrfn1-201ENSMUST00000055110 1479 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
Trim44Q9QXA7 Zfp995-205ENSMUST00000190066 2221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
Trim44Q9QXA7 Twist2-201ENSMUST00000007949 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Trim44Q9QXA7 Zhx1-201ENSMUST00000070143 4764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Trim44Q9QXA7 Arhgef12-202ENSMUST00000165665 10752 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Trim44Q9QXA7 Casp8ap2-201ENSMUST00000029950 6799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Trim44Q9QXA7 Kcnab3-201ENSMUST00000018614 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Trim44Q9QXA7 Spint2-201ENSMUST00000098604 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.79
Trim44Q9QXA7 Cstf2-201ENSMUST00000033609 4502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Trim44Q9QXA7 Zbtb45-201ENSMUST00000051390 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Trim44Q9QXA7 Adamts17-201ENSMUST00000098382 6025 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
Trim44Q9QXA7 Kbtbd2-202ENSMUST00000114323 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Trim44Q9QXA7 Ube2r2-201ENSMUST00000040008 3600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Trim44Q9QXA7 Tmem150b-202ENSMUST00000086364 2822 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Trim44Q9QXA7 Tgfbr2-202ENSMUST00000061101 8092 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Trim44Q9QXA7 Snx15-201ENSMUST00000025702 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Trim44Q9QXA7 Prcc-201ENSMUST00000005015 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Trim44Q9QXA7 Nefh-201ENSMUST00000093369 3994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
Trim44Q9QXA7 Pnkd-204ENSMUST00000113805 740 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Trim44Q9QXA7 Rras-201ENSMUST00000044111 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Trim44Q9QXA7 Avp-201ENSMUST00000046001 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Trim44Q9QXA7 Med7-209ENSMUST00000170928 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Trim44Q9QXA7 Hspa1b-201ENSMUST00000172753 2803 ntAPPRIS P1 BASIC19.95■□□□□ 0.78
Trim44Q9QXA7 Efr3b-201ENSMUST00000111178 6547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Trim44Q9QXA7 Pitpnm2-209ENSMUST00000161938 5866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Trim44Q9QXA7 Trmt2a-202ENSMUST00000100099 2235 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Trim44Q9QXA7 Lrriq3-201ENSMUST00000029833 2652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Trim44Q9QXA7 Nipa2-201ENSMUST00000032635 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Trim44Q9QXA7 Gm10649-203ENSMUST00000148066 1812 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Trim44Q9QXA7 Bend5-201ENSMUST00000030274 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Trim44Q9QXA7 Esx1-201ENSMUST00000074698 1600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Trim44Q9QXA7 Akp3-201ENSMUST00000044878 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Trim44Q9QXA7 Zfp277-202ENSMUST00000069692 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Trim44Q9QXA7 Lrp4-201ENSMUST00000028689 7926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Trim44Q9QXA7 Gnaz-201ENSMUST00000037813 3519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Trim44Q9QXA7 Ppp2r1b-205ENSMUST00000175640 1523 ntTSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
Trim44Q9QXA7 Gm9922-201ENSMUST00000066461 435 ntAPPRIS P1 BASIC19.94■□□□□ 0.78
Trim44Q9QXA7 Tfeb-204ENSMUST00000113288 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Trim44Q9QXA7 Ppm1m-203ENSMUST00000140761 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Trim44Q9QXA7 2810410L24Rik-202ENSMUST00000155681 2615 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Trim44Q9QXA7 Shc1-202ENSMUST00000094378 2617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Trim44Q9QXA7 Foxp4-202ENSMUST00000113262 3198 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Trim44Q9QXA7 Crb2-201ENSMUST00000050372 6372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
Trim44Q9QXA7 Usp27x-201ENSMUST00000115744 3240 ntAPPRIS P1 BASIC19.94■□□□□ 0.78
Trim44Q9QXA7 Agtr1a-201ENSMUST00000066412 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Trim44Q9QXA7 Tmem56-203ENSMUST00000128909 6696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Trim44Q9QXA7 Rassf1-201ENSMUST00000010211 1727 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Trim44Q9QXA7 Spdef-205ENSMUST00000167489 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
Trim44Q9QXA7 Srpr-201ENSMUST00000034541 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Trim44Q9QXA7 Cap1-202ENSMUST00000106255 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Trim44Q9QXA7 F2rl1-201ENSMUST00000022185 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Trim44Q9QXA7 Ift74-201ENSMUST00000030311 2139 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
Trim44Q9QXA7 Zfp382-201ENSMUST00000098596 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Trim44Q9QXA7 Nox4-202ENSMUST00000068829 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Trim44Q9QXA7 Kctd9-205ENSMUST00000152243 2528 ntTSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
Trim44Q9QXA7 Polr3e-203ENSMUST00000207481 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Trim44Q9QXA7 Usf2-211ENSMUST00000172417 648 ntTSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
Trim44Q9QXA7 Copz2-201ENSMUST00000018816 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.4 ms