Protein–RNA interactions for Protein: Q9JM99

Prg4, Proteoglycan 4, mousemouse

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Length 1,054 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prg4Q9JM99 Nudt16-201ENSMUST00000035179 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Prg4Q9JM99 Exog-202ENSMUST00000164213 2627 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.1
Prg4Q9JM99 Adgrl1-207ENSMUST00000141158 8181 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.1
Prg4Q9JM99 Arnt-204ENSMUST00000107160 783 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Prg4Q9JM99 Gm1673-202ENSMUST00000114382 451 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Prg4Q9JM99 Cldn18-203ENSMUST00000131922 860 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Prg4Q9JM99 Surf1-201ENSMUST00000015934 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Prg4Q9JM99 Gm17349-201ENSMUST00000163472 300 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Prg4Q9JM99 Gm6659-201ENSMUST00000174752 547 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
Prg4Q9JM99 Gm27389-201ENSMUST00000183622 195 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
Prg4Q9JM99 Gm21057-201ENSMUST00000206022 670 ntTSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Prg4Q9JM99 Chd5-202ENSMUST00000030775 9486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Prg4Q9JM99 Pigw-201ENSMUST00000067058 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Prg4Q9JM99 Lca5l-201ENSMUST00000054855 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Prg4Q9JM99 Bend6-202ENSMUST00000115161 2231 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Prg4Q9JM99 Snx14-205ENSMUST00000173011 2238 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Prg4Q9JM99 Tfap2a-208ENSMUST00000224999 2058 ntAPPRIS ALT1 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Prg4Q9JM99 Gm26697-201ENSMUST00000180898 1760 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Prg4Q9JM99 Atad2b-201ENSMUST00000045664 8035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Prg4Q9JM99 Derl3-201ENSMUST00000009236 1321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Prg4Q9JM99 Lman2l-202ENSMUST00000115011 2290 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Prg4Q9JM99 Cspg5-205ENSMUST00000199736 2107 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Prg4Q9JM99 Smim3-201ENSMUST00000042710 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Prg4Q9JM99 4930474N05Rik-203ENSMUST00000226305 2313 ntAPPRIS P1 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Prg4Q9JM99 Actl10-201ENSMUST00000104928 1501 ntAPPRIS P1 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Prg4Q9JM99 Actl10-202ENSMUST00000226583 1501 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Prg4Q9JM99 Dap-201ENSMUST00000044524 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Prg4Q9JM99 Ssx2ip-204ENSMUST00000106153 3446 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Prg4Q9JM99 Smim1-205ENSMUST00000131325 842 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Prg4Q9JM99 U2af1-201ENSMUST00000014684 907 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Prg4Q9JM99 U2af1-202ENSMUST00000166526 907 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Prg4Q9JM99 Rab28-205ENSMUST00000202913 863 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Prg4Q9JM99 Tmem205-201ENSMUST00000046831 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Prg4Q9JM99 Tfap2a-209ENSMUST00000225180 1828 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Prg4Q9JM99 Glmn-201ENSMUST00000078021 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Prg4Q9JM99 Lancl2-202ENSMUST00000072954 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Prg4Q9JM99 Rbm11-202ENSMUST00000114249 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Prg4Q9JM99 Pkp4-210ENSMUST00000168631 4484 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Prg4Q9JM99 Nsfl1c-201ENSMUST00000028949 1364 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Prg4Q9JM99 Krt27-201ENSMUST00000017732 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Prg4Q9JM99 Gm21974-201ENSMUST00000126662 2037 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Prg4Q9JM99 Ankrd39-202ENSMUST00000194894 664 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Prg4Q9JM99 Gm21559-201ENSMUST00000220638 855 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
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Prg4Q9JM99 Gm8587-201ENSMUST00000076538 843 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Prg4Q9JM99 Tbpl1-201ENSMUST00000095794 1195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Prg4Q9JM99 Sars2-201ENSMUST00000094632 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Prg4Q9JM99 Rnf112-203ENSMUST00000102661 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Prg4Q9JM99 Rfx7-201ENSMUST00000093820 7988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Prg4Q9JM99 Kcnj4-201ENSMUST00000057801 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Prg4Q9JM99 Dcun1d1-201ENSMUST00000108182 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Prg4Q9JM99 Dbndd2-201ENSMUST00000017878 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Prg4Q9JM99 Larp1-201ENSMUST00000071487 6614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Prg4Q9JM99 Gm26795-201ENSMUST00000180993 1952 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Prg4Q9JM99 Sfrp4-201ENSMUST00000002883 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Prg4Q9JM99 Slc9a5-201ENSMUST00000073149 3499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Prg4Q9JM99 Slc30a9-201ENSMUST00000113676 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Prg4Q9JM99 Nr4a1-201ENSMUST00000023779 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Prg4Q9JM99 Hirip3-201ENSMUST00000037248 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Prg4Q9JM99 Mrpl28-201ENSMUST00000025014 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Prg4Q9JM99 Ewsr1-204ENSMUST00000093365 1290 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Prg4Q9JM99 Mrpl43-201ENSMUST00000097715 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Prg4Q9JM99 9430097D07Rik-201ENSMUST00000100190 1501 ntAPPRIS P1 BASIC15.61■□□□□ 0.09
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Prg4Q9JM99 Nptxr-201ENSMUST00000023057 5004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Prg4Q9JM99 Slc16a7-205ENSMUST00000210780 2562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
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Prg4Q9JM99 Asnsd1-201ENSMUST00000027264 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Prg4Q9JM99 Bcl9l-206ENSMUST00000220303 5760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Prg4Q9JM99 Disc1-208ENSMUST00000122389 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Prg4Q9JM99 Aifm1-201ENSMUST00000037349 2237 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Prg4Q9JM99 Bub3-201ENSMUST00000084502 2218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Prg4Q9JM99 Taf6l-211ENSMUST00000177056 2006 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Prg4Q9JM99 Brpf1-204ENSMUST00000113122 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Prg4Q9JM99 Acot7-206ENSMUST00000167926 1505 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Prg4Q9JM99 Ttc39a-201ENSMUST00000064129 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Prg4Q9JM99 Arrdc4-202ENSMUST00000118110 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Prg4Q9JM99 Ppdpf-201ENSMUST00000016488 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Prg4Q9JM99 Rpl14-201ENSMUST00000165532 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Prg4Q9JM99 Tcta-202ENSMUST00000192886 1094 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Prg4Q9JM99 A430033K04Rik-204ENSMUST00000200521 1110 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Prg4Q9JM99 Pdrg1-201ENSMUST00000028972 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Prg4Q9JM99 A430033K04Rik-201ENSMUST00000032590 1109 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Prg4Q9JM99 Hist3h2ba-201ENSMUST00000078267 614 ntAPPRIS P1 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Prg4Q9JM99 Trim14-202ENSMUST00000102924 1582 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Prg4Q9JM99 Nkd1-201ENSMUST00000034086 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Prg4Q9JM99 Zcchc6-207ENSMUST00000225576 2499 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Prg4Q9JM99 Adgra2-201ENSMUST00000033876 5760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Prg4Q9JM99 Ddx39b-203ENSMUST00000173731 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Prg4Q9JM99 Ttc19-201ENSMUST00000050646 3410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Prg4Q9JM99 Fam129c-208ENSMUST00000143662 2267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Prg4Q9JM99 Rpf1-201ENSMUST00000029838 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Prg4Q9JM99 Adam22-205ENSMUST00000115385 2318 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Prg4Q9JM99 Stambpl1-201ENSMUST00000054956 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Prg4Q9JM99 Ctnnbip1-201ENSMUST00000030839 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Prg4Q9JM99 Farsa-202ENSMUST00000109754 1795 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Prg4Q9JM99 Pea15a-202ENSMUST00000111247 2435 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Prg4Q9JM99 Fiz1-202ENSMUST00000165320 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Prg4Q9JM99 Htr6-202ENSMUST00000105802 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Prg4Q9JM99 1700024G13Rik-201ENSMUST00000100723 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
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