Protein–RNA interactions for Protein: Q9JLC6

Tef, Thyrotroph embryonic factor, mousemouse

Predictions only

Length 301 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TefQ9JLC6 Has3-202ENSMUST00000175987 1154 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
TefQ9JLC6 Gm45631-201ENSMUST00000210318 1244 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
TefQ9JLC6 Alkbh2-201ENSMUST00000053657 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
TefQ9JLC6 Agpat3-201ENSMUST00000001240 5980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
TefQ9JLC6 Gm10489-201ENSMUST00000180511 1466 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
TefQ9JLC6 Zfp523-202ENSMUST00000073534 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
TefQ9JLC6 Gpd1-203ENSMUST00000162194 1515 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
TefQ9JLC6 Gm16897-201ENSMUST00000180780 2492 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
TefQ9JLC6 Adgrv1-207ENSMUST00000128585 2580 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
TefQ9JLC6 Krtap1-4-201ENSMUST00000100479 593 ntAPPRIS P1 BASIC21.69■■□□□ 1.06
TefQ9JLC6 H2-Q6-201ENSMUST00000113879 981 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
TefQ9JLC6 Ccnd3-202ENSMUST00000171031 2113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
TefQ9JLC6 Mrps12-204ENSMUST00000171183 883 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
TefQ9JLC6 Gm6623-201ENSMUST00000173570 544 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
TefQ9JLC6 Gm27741-201ENSMUST00000185060 237 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
TefQ9JLC6 AC130713.1-201ENSMUST00000228853 1096 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
TefQ9JLC6 Imp3-201ENSMUST00000034827 924 ntAPPRIS P1 BASIC21.69■■□□□ 1.06
TefQ9JLC6 Tmem205-201ENSMUST00000046831 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
TefQ9JLC6 Spg21-202ENSMUST00000213957 1302 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
TefQ9JLC6 Adgra2-201ENSMUST00000033876 5760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
TefQ9JLC6 Sort1-201ENSMUST00000102632 6796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
TefQ9JLC6 Zfp623-201ENSMUST00000037260 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
TefQ9JLC6 4833445I07Rik-201ENSMUST00000193193 1642 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
TefQ9JLC6 Zbtb25-201ENSMUST00000167011 1681 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
TefQ9JLC6 Tbx20-202ENSMUST00000166018 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
TefQ9JLC6 Hhipl1-201ENSMUST00000021685 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
TefQ9JLC6 Cmip-202ENSMUST00000166750 2408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
TefQ9JLC6 Sos1-201ENSMUST00000068714 8919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
TefQ9JLC6 Six3os1-206ENSMUST00000175921 2737 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
TefQ9JLC6 Cacnb3-201ENSMUST00000003442 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
TefQ9JLC6 Trim44-201ENSMUST00000102573 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
TefQ9JLC6 Mir770-201ENSMUST00000103252 94 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
TefQ9JLC6 Bpifa3-202ENSMUST00000109746 1102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
TefQ9JLC6 Mrpl36-203ENSMUST00000222030 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.68■■□□□ 1.06
TefQ9JLC6 Rab11b-203ENSMUST00000173860 1544 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
TefQ9JLC6 AC125311.2-201ENSMUST00000227477 1940 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
TefQ9JLC6 Podxl2-201ENSMUST00000038409 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
TefQ9JLC6 P2ry2-204ENSMUST00000207916 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
TefQ9JLC6 Rsph6a-201ENSMUST00000035521 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
TefQ9JLC6 Fam222a-201ENSMUST00000043650 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
TefQ9JLC6 Kansl1l-201ENSMUST00000068168 4459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
TefQ9JLC6 Cers1-202ENSMUST00000140239 2711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
TefQ9JLC6 Ccdc105-201ENSMUST00000105383 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
TefQ9JLC6 2810408A11Rik-204ENSMUST00000108621 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
TefQ9JLC6 4933402J07Rik-201ENSMUST00000093342 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
TefQ9JLC6 Urah-202ENSMUST00000106050 719 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
TefQ9JLC6 Sirt7-202ENSMUST00000106183 427 ntTSL 3 BASIC21.67■■□□□ 1.06
TefQ9JLC6 4930401G09Rik-201ENSMUST00000139500 637 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
TefQ9JLC6 Flg-207ENSMUST00000180293 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
TefQ9JLC6 AC122351.1-201ENSMUST00000220467 126 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
TefQ9JLC6 Snhg10-202ENSMUST00000222812 527 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
TefQ9JLC6 Ndufb8-201ENSMUST00000026222 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
TefQ9JLC6 Fam213b-201ENSMUST00000030935 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
TefQ9JLC6 Rln3-201ENSMUST00000061923 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
TefQ9JLC6 Plekhg3-201ENSMUST00000075249 5138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
TefQ9JLC6 Larp6-201ENSMUST00000038407 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
TefQ9JLC6 Mff-202ENSMUST00000078332 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
TefQ9JLC6 Zdhhc6-209ENSMUST00000225495 1711 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
TefQ9JLC6 Ffar3-201ENSMUST00000094583 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
TefQ9JLC6 Anapc5-208ENSMUST00000197719 2383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
TefQ9JLC6 Ythdf3-201ENSMUST00000108345 5102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
TefQ9JLC6 Matn4-202ENSMUST00000103104 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
TefQ9JLC6 Hist1h4a-201ENSMUST00000102964 539 ntAPPRIS P1 BASIC21.66■■□□□ 1.06
TefQ9JLC6 Gm27000-201ENSMUST00000182943 842 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
TefQ9JLC6 Gm17807-201ENSMUST00000186869 298 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
TefQ9JLC6 Nudt21-204ENSMUST00000212981 1184 ntTSL 3 BASIC21.66■■□□□ 1.06
TefQ9JLC6 AC159205.3-201ENSMUST00000224614 874 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
TefQ9JLC6 Snrnp35-201ENSMUST00000031349 1115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
TefQ9JLC6 Igsf23-201ENSMUST00000043440 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
TefQ9JLC6 1600012H06Rik-202ENSMUST00000164837 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
TefQ9JLC6 Mtss1l-201ENSMUST00000052457 4717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
TefQ9JLC6 Zdhhc6-207ENSMUST00000224897 2168 ntAPPRIS P1 BASIC21.65■■□□□ 1.06
TefQ9JLC6 Il17rb-201ENSMUST00000016110 2061 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
TefQ9JLC6 Nrxn2-204ENSMUST00000113461 5505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
TefQ9JLC6 Mapre3-201ENSMUST00000031058 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
TefQ9JLC6 Scarb1-201ENSMUST00000086075 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
TefQ9JLC6 Plpbp-202ENSMUST00000098851 1368 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
TefQ9JLC6 Znhit6-201ENSMUST00000098534 2339 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
TefQ9JLC6 Tmsb10-202ENSMUST00000114049 690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
TefQ9JLC6 Pld6-202ENSMUST00000125307 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
TefQ9JLC6 S100a16-202ENSMUST00000098911 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
TefQ9JLC6 Atxn2-201ENSMUST00000051950 4472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
TefQ9JLC6 Slc30a9-204ENSMUST00000162372 5711 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
TefQ9JLC6 Cenpw-201ENSMUST00000099985 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
TefQ9JLC6 Nr2f1-201ENSMUST00000091458 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
TefQ9JLC6 Nr1h2-213ENSMUST00000167197 1944 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
TefQ9JLC6 Gm15408-201ENSMUST00000124198 1379 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
TefQ9JLC6 Dexi-203ENSMUST00000184863 2537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.06
TefQ9JLC6 Zswim8-208ENSMUST00000224751 5951 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.64■■□□□ 1.06
TefQ9JLC6 Kcnb1-201ENSMUST00000059826 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
TefQ9JLC6 Tyk2-205ENSMUST00000214864 1662 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
TefQ9JLC6 Camta1-204ENSMUST00000105670 4961 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
TefQ9JLC6 Ppp1r2-202ENSMUST00000115233 958 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
TefQ9JLC6 Blvrb-204ENSMUST00000133750 509 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
TefQ9JLC6 Psme2-208ENSMUST00000161807 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
TefQ9JLC6 Smim3-201ENSMUST00000042710 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
TefQ9JLC6 2310035C23Rik-202ENSMUST00000086721 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
TefQ9JLC6 March3-202ENSMUST00000102912 1754 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
TefQ9JLC6 Trim54-202ENSMUST00000202769 1408 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
TefQ9JLC6 Tmed4-201ENSMUST00000004508 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.4 ms