Protein–RNA interactions for Protein: Q9JL18

Bace2, Beta-secretase 2, mousemouse

Predictions only

Length 514 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Bace2Q9JL18 A930029G22Rik-201ENSMUST00000181032 1710 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Bace2Q9JL18 Irf3-213ENSMUST00000209066 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Bace2Q9JL18 4930447C04Rik-202ENSMUST00000110489 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Bace2Q9JL18 Spata18-202ENSMUST00000071077 1978 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Bace2Q9JL18 Spi1-201ENSMUST00000002180 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Bace2Q9JL18 Zfyve19-201ENSMUST00000090174 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Bace2Q9JL18 Scarf2-201ENSMUST00000012161 3302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Bace2Q9JL18 Satb1-211ENSMUST00000152830 5993 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Bace2Q9JL18 Scaf8-201ENSMUST00000076734 4869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Bace2Q9JL18 2310022A10Rik-201ENSMUST00000067386 2701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Bace2Q9JL18 Gm3488-202ENSMUST00000181562 1945 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Bace2Q9JL18 Cct6b-201ENSMUST00000021040 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Bace2Q9JL18 Scamp3-201ENSMUST00000029684 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Bace2Q9JL18 Fam71e1-202ENSMUST00000205359 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Bace2Q9JL18 Gm16105-201ENSMUST00000156926 697 ntTSL 3 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Bace2Q9JL18 Cox7a2l-202ENSMUST00000167741 1147 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Bace2Q9JL18 Ramp1-203ENSMUST00000188475 711 ntTSL 3 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Bace2Q9JL18 Gm38027-201ENSMUST00000192315 235 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
Bace2Q9JL18 Rps2-ps2-201ENSMUST00000194305 881 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
Bace2Q9JL18 Gm5297-201ENSMUST00000198555 1171 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
Bace2Q9JL18 Lysmd2-201ENSMUST00000034702 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Bace2Q9JL18 Fam167b-201ENSMUST00000052835 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Bace2Q9JL18 1700020N01Rik-201ENSMUST00000057341 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Bace2Q9JL18 Guca1a-201ENSMUST00000059348 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Bace2Q9JL18 Coro7-202ENSMUST00000090480 1147 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Bace2Q9JL18 Cpox-201ENSMUST00000060077 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Bace2Q9JL18 Xpr1-202ENSMUST00000111774 2753 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Bace2Q9JL18 Foxp4-204ENSMUST00000113265 3999 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Bace2Q9JL18 4732440D04Rik-203ENSMUST00000191825 5428 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
Bace2Q9JL18 Vkorc1l1-203ENSMUST00000201855 4809 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Bace2Q9JL18 Cacng6-202ENSMUST00000183200 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Bace2Q9JL18 Atg4c-201ENSMUST00000030279 3178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Bace2Q9JL18 Phb-204ENSMUST00000125172 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Bace2Q9JL18 Hoxb2-201ENSMUST00000100523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Bace2Q9JL18 Capzb-202ENSMUST00000042675 1604 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Bace2Q9JL18 Lin9-203ENSMUST00000192561 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Bace2Q9JL18 Tedc2-201ENSMUST00000024930 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Bace2Q9JL18 Nsmf-203ENSMUST00000100334 2957 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Bace2Q9JL18 Mrps18c-203ENSMUST00000112901 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Bace2Q9JL18 Snx12-204ENSMUST00000156473 1114 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Bace2Q9JL18 2310033P09Rik-201ENSMUST00000020719 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Bace2Q9JL18 Tpsg1-201ENSMUST00000024999 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Bace2Q9JL18 Agpat3-203ENSMUST00000105388 3681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Bace2Q9JL18 Sorcs2-201ENSMUST00000037370 5707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Bace2Q9JL18 Acads-201ENSMUST00000031524 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Bace2Q9JL18 Zfp697-202ENSMUST00000178372 4703 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Bace2Q9JL18 Kctd9-205ENSMUST00000152243 2528 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Bace2Q9JL18 Sfrp4-201ENSMUST00000002883 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Bace2Q9JL18 Slc35e3-201ENSMUST00000079041 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Bace2Q9JL18 Fam46c-201ENSMUST00000061455 5640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Bace2Q9JL18 Gm45623-201ENSMUST00000210744 1457 ntAPPRIS P1 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Bace2Q9JL18 Ankrd9-202ENSMUST00000128353 2577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Bace2Q9JL18 Arid3b-202ENSMUST00000098686 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Bace2Q9JL18 Hmgxb3-201ENSMUST00000091884 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Bace2Q9JL18 Dok7-202ENSMUST00000101298 2443 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Bace2Q9JL18 Taf6l-201ENSMUST00000003777 1869 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Bace2Q9JL18 Ube2z-201ENSMUST00000100528 3997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Bace2Q9JL18 Trim45-202ENSMUST00000094048 1815 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Bace2Q9JL18 Cenps-202ENSMUST00000105695 544 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Bace2Q9JL18 Tex30-204ENSMUST00000128190 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Bace2Q9JL18 Mir5122-201ENSMUST00000175004 89 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
Bace2Q9JL18 Rex1bd-201ENSMUST00000075175 671 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Bace2Q9JL18 Cap1-202ENSMUST00000106255 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Bace2Q9JL18 Krt13-201ENSMUST00000007275 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Bace2Q9JL18 Slc39a10-201ENSMUST00000027131 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Bace2Q9JL18 2610301B20Rik-201ENSMUST00000080517 2116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Bace2Q9JL18 Tril-201ENSMUST00000127748 5363 ntAPPRIS P1 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Bace2Q9JL18 Tax1bp3-201ENSMUST00000040687 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Bace2Q9JL18 Gm16835-201ENSMUST00000140488 2809 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Bace2Q9JL18 Fam46a-202ENSMUST00000187711 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Bace2Q9JL18 Dpep3-201ENSMUST00000034371 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Bace2Q9JL18 Gm7638-201ENSMUST00000121348 967 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
Bace2Q9JL18 Gm15556-201ENSMUST00000122904 663 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Bace2Q9JL18 Phgr1-202ENSMUST00000130293 542 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Bace2Q9JL18 1110046J04Rik-201ENSMUST00000147622 397 ntTSL 3 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Bace2Q9JL18 Gm17661-201ENSMUST00000170317 270 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
Bace2Q9JL18 Sae1-203ENSMUST00000210999 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Bace2Q9JL18 Arhgef33-211ENSMUST00000225658 473 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
Bace2Q9JL18 Dctn3-201ENSMUST00000030158 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Bace2Q9JL18 Evx2-201ENSMUST00000001867 4191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Bace2Q9JL18 Tmem163-203ENSMUST00000160616 2657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Bace2Q9JL18 Tfdp2-206ENSMUST00000185644 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Bace2Q9JL18 Farp1-201ENSMUST00000026635 4885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Bace2Q9JL18 Zfp668-203ENSMUST00000106262 3169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Bace2Q9JL18 Zfp746-201ENSMUST00000073124 3651 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Bace2Q9JL18 Atp6v1c1-201ENSMUST00000022904 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Bace2Q9JL18 Dip2c-203ENSMUST00000174552 8023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Bace2Q9JL18 Ppan-201ENSMUST00000004203 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Bace2Q9JL18 Prrt4-201ENSMUST00000159200 3411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Bace2Q9JL18 Taf6l-205ENSMUST00000176496 2224 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Bace2Q9JL18 Utf1-201ENSMUST00000168457 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Bace2Q9JL18 Ccnd2-204ENSMUST00000201637 1006 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Bace2Q9JL18 Gm3375-201ENSMUST00000203929 796 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
Bace2Q9JL18 Arhgef4-208ENSMUST00000211073 171 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
Bace2Q9JL18 Rps2-ps3-201ENSMUST00000213102 832 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
Bace2Q9JL18 Timm23-208ENSMUST00000226683 750 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
Bace2Q9JL18 AC156016.1-201ENSMUST00000227190 1035 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
Bace2Q9JL18 Ppic-201ENSMUST00000025419 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Bace2Q9JL18 Gm10273-201ENSMUST00000092511 1126 ntAPPRIS P1 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Bace2Q9JL18 Gm7579-201ENSMUST00000097943 732 ntAPPRIS P1 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44 ms