Protein–RNA interactions for Protein: Q9JKY0

Cnot9, CCR4-NOT transcription complex subunit 9, mousemouse

Predictions only

Length 299 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cnot9Q9JKY0 Sfrp2-201ENSMUST00000029625 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Cnot9Q9JKY0 Frrs1l-201ENSMUST00000053681 6817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Cnot9Q9JKY0 Sorcs3-201ENSMUST00000078880 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Cnot9Q9JKY0 Gbe1-206ENSMUST00000170464 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Cnot9Q9JKY0 Ykt6-201ENSMUST00000002818 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Cnot9Q9JKY0 Epn1-201ENSMUST00000045277 2334 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Cnot9Q9JKY0 Plxdc1-202ENSMUST00000107564 619 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Cnot9Q9JKY0 Sp3os-201ENSMUST00000123087 583 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Cnot9Q9JKY0 Cklf-203ENSMUST00000211809 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Cnot9Q9JKY0 D130020L05Rik-202ENSMUST00000220889 769 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Cnot9Q9JKY0 Tnnt2-201ENSMUST00000027671 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Cnot9Q9JKY0 Cebpg-201ENSMUST00000070191 914 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Cnot9Q9JKY0 Ly6g6d-201ENSMUST00000007259 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Cnot9Q9JKY0 Tm7sf3-201ENSMUST00000037709 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Cnot9Q9JKY0 Dbn1-202ENSMUST00000109921 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Cnot9Q9JKY0 Mettl4-ps1-202ENSMUST00000130218 1323 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Cnot9Q9JKY0 P2ry1-203ENSMUST00000193943 2203 ntAPPRIS P1 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Cnot9Q9JKY0 Rasgrp2-201ENSMUST00000035716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Cnot9Q9JKY0 Aig1-205ENSMUST00000162610 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Cnot9Q9JKY0 Usp6nl-202ENSMUST00000114937 7484 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Cnot9Q9JKY0 Cpox-201ENSMUST00000060077 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Cnot9Q9JKY0 Ccdc124-201ENSMUST00000007865 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Cnot9Q9JKY0 Prkra-201ENSMUST00000002808 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Cnot9Q9JKY0 Foxp4-204ENSMUST00000113265 3999 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Cnot9Q9JKY0 Plppr2-201ENSMUST00000046371 2626 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Cnot9Q9JKY0 Bean1-204ENSMUST00000171018 3386 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Cnot9Q9JKY0 Fam131b-203ENSMUST00000143278 4104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Cnot9Q9JKY0 Mcl1-201ENSMUST00000037947 3418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Cnot9Q9JKY0 Gm26676-201ENSMUST00000181877 2226 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Cnot9Q9JKY0 Appl2-201ENSMUST00000020500 3020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Cnot9Q9JKY0 Aldh2-202ENSMUST00000129753 1799 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Cnot9Q9JKY0 Gm19721-201ENSMUST00000195284 1764 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Cnot9Q9JKY0 Ctnnal1-202ENSMUST00000107612 850 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Cnot9Q9JKY0 Atp8a1-204ENSMUST00000113652 854 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Cnot9Q9JKY0 Gm10698-201ENSMUST00000182663 604 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Cnot9Q9JKY0 Cadm1-201ENSMUST00000034581 1254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Cnot9Q9JKY0 Syngr1-202ENSMUST00000009728 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Cnot9Q9JKY0 Slc26a10-205ENSMUST00000222911 3067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Cnot9Q9JKY0 Zdhhc24-201ENSMUST00000006632 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Cnot9Q9JKY0 Klhl31-201ENSMUST00000057781 6494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Cnot9Q9JKY0 Podnl1-201ENSMUST00000093380 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Cnot9Q9JKY0 Wnt4-201ENSMUST00000045747 4194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Cnot9Q9JKY0 Scube2-202ENSMUST00000106728 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Cnot9Q9JKY0 Sh3yl1-202ENSMUST00000110880 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Cnot9Q9JKY0 Arpc1a-201ENSMUST00000031625 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Cnot9Q9JKY0 Kcnab3-201ENSMUST00000018614 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Cnot9Q9JKY0 Zfp764-201ENSMUST00000059199 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Cnot9Q9JKY0 Lrrc43-202ENSMUST00000121444 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Cnot9Q9JKY0 Gm21974-201ENSMUST00000126662 2037 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Cnot9Q9JKY0 Ppp2r5d-201ENSMUST00000002839 2926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Cnot9Q9JKY0 Evx2-201ENSMUST00000001867 4191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Cnot9Q9JKY0 Stambp-206ENSMUST00000206400 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Cnot9Q9JKY0 C030014I23Rik-201ENSMUST00000080911 1810 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Cnot9Q9JKY0 Fbxo33-201ENSMUST00000043204 3688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Cnot9Q9JKY0 Adam33-201ENSMUST00000052104 2795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Cnot9Q9JKY0 Ptges2-201ENSMUST00000028162 4978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Cnot9Q9JKY0 2900052L18Rik-201ENSMUST00000139014 1588 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Cnot9Q9JKY0 Zfp512b-201ENSMUST00000108789 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Cnot9Q9JKY0 Gm15378-201ENSMUST00000121894 207 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Cnot9Q9JKY0 Nudt22-203ENSMUST00000180765 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Cnot9Q9JKY0 Tubb4b-ps1-201ENSMUST00000179460 1336 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Cnot9Q9JKY0 Rps6ka1-202ENSMUST00000105894 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Cnot9Q9JKY0 Snx27-201ENSMUST00000029783 6261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Cnot9Q9JKY0 Bean1-201ENSMUST00000093245 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Cnot9Q9JKY0 Capg-202ENSMUST00000114071 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Cnot9Q9JKY0 Cobll1-205ENSMUST00000112431 5024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Cnot9Q9JKY0 Iqgap2-201ENSMUST00000068603 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Cnot9Q9JKY0 Nagpa-203ENSMUST00000147567 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Cnot9Q9JKY0 Rmdn3-201ENSMUST00000094695 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Cnot9Q9JKY0 Taok3-203ENSMUST00000111978 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Cnot9Q9JKY0 Eml1-203ENSMUST00000109860 4160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Cnot9Q9JKY0 Cacfd1-205ENSMUST00000114007 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Cnot9Q9JKY0 Slc22a3-201ENSMUST00000024595 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Cnot9Q9JKY0 Mid2-202ENSMUST00000112990 6271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Cnot9Q9JKY0 Ing1-202ENSMUST00000209565 1971 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Cnot9Q9JKY0 Eif2b5-201ENSMUST00000003320 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Cnot9Q9JKY0 Kdm2a-202ENSMUST00000075856 7242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Cnot9Q9JKY0 Tnfaip8-208ENSMUST00000148989 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Cnot9Q9JKY0 Gm10517-202ENSMUST00000192970 758 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Cnot9Q9JKY0 Gm4974-201ENSMUST00000209974 875 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Cnot9Q9JKY0 Sap30-201ENSMUST00000034022 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Cnot9Q9JKY0 Tra2a-204ENSMUST00000204189 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Cnot9Q9JKY0 Il4i1-202ENSMUST00000118125 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Cnot9Q9JKY0 Clcn2-202ENSMUST00000120099 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Cnot9Q9JKY0 Axin1-203ENSMUST00000163421 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Cnot9Q9JKY0 Trabd-201ENSMUST00000081702 2439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Cnot9Q9JKY0 Camsap2-203ENSMUST00000192314 4916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Cnot9Q9JKY0 Negr1-203ENSMUST00000106065 1953 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Cnot9Q9JKY0 Fam120c-201ENSMUST00000073364 5463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Cnot9Q9JKY0 Pnck-202ENSMUST00000114472 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Cnot9Q9JKY0 Gm45244-201ENSMUST00000211328 2200 ntBASIC15.83■□□□□ 0.13
Cnot9Q9JKY0 Ppm1j-201ENSMUST00000002298 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Cnot9Q9JKY0 Lrriq4-203ENSMUST00000172350 1797 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Cnot9Q9JKY0 Donson-201ENSMUST00000023682 2360 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Cnot9Q9JKY0 Fezf1-201ENSMUST00000031709 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Cnot9Q9JKY0 Unc50-203ENSMUST00000118059 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Cnot9Q9JKY0 Serf1-204ENSMUST00000151821 570 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Cnot9Q9JKY0 Gm17041-201ENSMUST00000163196 479 ntTSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Cnot9Q9JKY0 Gm20760-201ENSMUST00000179197 648 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
Cnot9Q9JKY0 Gm28914-201ENSMUST00000188115 667 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.2 ms