Protein–RNA interactions for Protein: Q9JKS4

Ldb3, LIM domain-binding protein 3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 723 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ldb3Q9JKS4 Ptpre-201ENSMUST00000073961 5410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ldb3Q9JKS4 9330160F10Rik-201ENSMUST00000101007 2766 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Ldb3Q9JKS4 Ppme1-201ENSMUST00000032963 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ldb3Q9JKS4 Sprtn-201ENSMUST00000034467 4464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ldb3Q9JKS4 Opa3-202ENSMUST00000161711 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ldb3Q9JKS4 Fam46c-201ENSMUST00000061455 5640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ldb3Q9JKS4 Rbmxl1-201ENSMUST00000049245 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ldb3Q9JKS4 0610012G03Rik-201ENSMUST00000202722 1445 ntAPPRIS P1 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ldb3Q9JKS4 Fgf4-201ENSMUST00000060336 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ldb3Q9JKS4 Atp5c1-202ENSMUST00000114896 1735 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ldb3Q9JKS4 Nsmf-202ENSMUST00000074422 2824 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ldb3Q9JKS4 Ccdc17-201ENSMUST00000051869 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ldb3Q9JKS4 Epn1-202ENSMUST00000098845 2565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ldb3Q9JKS4 Zfp282-201ENSMUST00000061890 5573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ldb3Q9JKS4 9430097D07Rik-201ENSMUST00000100190 1501 ntAPPRIS P1 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ldb3Q9JKS4 Scrn2-201ENSMUST00000021249 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ldb3Q9JKS4 Prlh-201ENSMUST00000166281 276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ldb3Q9JKS4 Sct-202ENSMUST00000167790 507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ldb3Q9JKS4 Cacna2d1-207ENSMUST00000196750 1272 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ldb3Q9JKS4 Ndufa12-201ENSMUST00000020209 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ldb3Q9JKS4 4930554C24Rik-202ENSMUST00000216019 1159 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ldb3Q9JKS4 Lce1m-201ENSMUST00000029520 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ldb3Q9JKS4 Sct-201ENSMUST00000046156 534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ldb3Q9JKS4 Fxn-201ENSMUST00000081333 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ldb3Q9JKS4 Blmh-201ENSMUST00000021197 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ldb3Q9JKS4 Hoxb2-201ENSMUST00000100523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ldb3Q9JKS4 Nr1h2-213ENSMUST00000167197 1944 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ldb3Q9JKS4 Dnaja3-202ENSMUST00000115854 2505 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ldb3Q9JKS4 Meis2-202ENSMUST00000074285 2844 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ldb3Q9JKS4 Med18-201ENSMUST00000102567 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ldb3Q9JKS4 A130014A01Rik-201ENSMUST00000183021 2323 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Ldb3Q9JKS4 Krt15-201ENSMUST00000107411 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ldb3Q9JKS4 Mapk7-203ENSMUST00000108714 3069 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ldb3Q9JKS4 Lpgat1-202ENSMUST00000110856 2792 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ldb3Q9JKS4 Il17re-208ENSMUST00000204774 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ldb3Q9JKS4 Vgf-204ENSMUST00000190827 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ldb3Q9JKS4 Col15a1-202ENSMUST00000102917 5172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ldb3Q9JKS4 Sars2-201ENSMUST00000094632 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ldb3Q9JKS4 Spata18-202ENSMUST00000071077 1978 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ldb3Q9JKS4 Mrps18c-203ENSMUST00000112901 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ldb3Q9JKS4 Nsl1-203ENSMUST00000139340 837 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ldb3Q9JKS4 Cpne1-217ENSMUST00000184265 871 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ldb3Q9JKS4 Cib1-207ENSMUST00000206084 772 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ldb3Q9JKS4 AC135963.1-201ENSMUST00000211640 717 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Ldb3Q9JKS4 Krt88-201ENSMUST00000023781 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ldb3Q9JKS4 Arl2-201ENSMUST00000025893 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ldb3Q9JKS4 Cmtm7-201ENSMUST00000035009 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ldb3Q9JKS4 Cib1-202ENSMUST00000071457 702 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ldb3Q9JKS4 Ube2k-201ENSMUST00000142407 4893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ldb3Q9JKS4 Atp2c1-201ENSMUST00000038118 4876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ldb3Q9JKS4 Fst-201ENSMUST00000022287 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ldb3Q9JKS4 Ext2-212ENSMUST00000184931 2629 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ldb3Q9JKS4 Il17re-201ENSMUST00000053569 1898 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ldb3Q9JKS4 Vrk2-201ENSMUST00000078362 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ldb3Q9JKS4 Edn2-201ENSMUST00000030384 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ldb3Q9JKS4 Phf20l1-201ENSMUST00000048188 6670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
Ldb3Q9JKS4 Il17re-203ENSMUST00000101065 1973 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Ldb3Q9JKS4 Pitx1-201ENSMUST00000021968 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Ldb3Q9JKS4 Gm16499-203ENSMUST00000204633 2177 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Ldb3Q9JKS4 A930029G22Rik-201ENSMUST00000181032 1710 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ldb3Q9JKS4 Irf3-213ENSMUST00000209066 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ldb3Q9JKS4 Kmt5b-203ENSMUST00000113968 3216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ldb3Q9JKS4 Gm20604-201ENSMUST00000174651 2795 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ldb3Q9JKS4 Frmd5-203ENSMUST00000121219 2262 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ldb3Q9JKS4 Anapc13-203ENSMUST00000188398 727 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ldb3Q9JKS4 Gm7791-201ENSMUST00000219066 539 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Ldb3Q9JKS4 Il3ra-202ENSMUST00000223589 738 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Ldb3Q9JKS4 Camk2d-228ENSMUST00000200171 5396 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ldb3Q9JKS4 Ankra2-203ENSMUST00000123924 2328 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ldb3Q9JKS4 Gm10649-203ENSMUST00000148066 1812 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ldb3Q9JKS4 Fam166b-201ENSMUST00000052829 1349 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ldb3Q9JKS4 Pagr1a-202ENSMUST00000200948 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ldb3Q9JKS4 Gm42742-205ENSMUST00000202798 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ldb3Q9JKS4 Whrn-205ENSMUST00000095038 2665 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ldb3Q9JKS4 Rassf7-201ENSMUST00000046890 1525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ldb3Q9JKS4 2210016L21Rik-201ENSMUST00000031538 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ldb3Q9JKS4 Nmnat3-203ENSMUST00000112938 848 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ldb3Q9JKS4 Gm14968-201ENSMUST00000155528 769 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ldb3Q9JKS4 Steap1-201ENSMUST00000015796 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ldb3Q9JKS4 Gm3264-202ENSMUST00000166776 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ldb3Q9JKS4 Cldn14-205ENSMUST00000177648 1266 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ldb3Q9JKS4 Fxyd1-208ENSMUST00000205807 539 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ldb3Q9JKS4 Fitm1-201ENSMUST00000022826 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ldb3Q9JKS4 Gm8994-201ENSMUST00000077886 1236 ntAPPRIS P1 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ldb3Q9JKS4 Gzmd-201ENSMUST00000082093 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ldb3Q9JKS4 Ddx28-201ENSMUST00000058579 2262 ntAPPRIS P1 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ldb3Q9JKS4 Mmp23-201ENSMUST00000030937 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ldb3Q9JKS4 Epha10-201ENSMUST00000059343 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ldb3Q9JKS4 Aspscr1-205ENSMUST00000106160 1550 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ldb3Q9JKS4 Plppr2-201ENSMUST00000046371 2626 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ldb3Q9JKS4 Trim45-202ENSMUST00000094048 1815 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ldb3Q9JKS4 Tnfsf14-201ENSMUST00000005976 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ldb3Q9JKS4 Mark3-202ENSMUST00000084953 3365 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ldb3Q9JKS4 Gm5898-201ENSMUST00000121016 2071 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Ldb3Q9JKS4 Vps53-203ENSMUST00000108419 2209 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ldb3Q9JKS4 Slc22a12-201ENSMUST00000113451 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ldb3Q9JKS4 Sri-205ENSMUST00000148633 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ldb3Q9JKS4 Igsf8-201ENSMUST00000039506 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ldb3Q9JKS4 Epn1-201ENSMUST00000045277 2334 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ldb3Q9JKS4 Nin-203ENSMUST00000095666 7183 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 64.6 ms