Protein–RNA interactions for Protein: Q9JKP8

Chrac1, Chromatin accessibility complex protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 129 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Chrac1Q9JKP8 Ttc32-201ENSMUST00000085741 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Chrac1Q9JKP8 Col4a3bp-203ENSMUST00000179226 3040 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Chrac1Q9JKP8 Lrrtm1-203ENSMUST00000161677 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Chrac1Q9JKP8 Gnaz-201ENSMUST00000037813 3519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Chrac1Q9JKP8 9530068E07Rik-201ENSMUST00000036952 2467 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Chrac1Q9JKP8 Gm8839-201ENSMUST00000121279 1645 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
Chrac1Q9JKP8 Gm10654-201ENSMUST00000098653 1633 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
Chrac1Q9JKP8 Gpr150-201ENSMUST00000056130 2146 ntAPPRIS P1 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Chrac1Q9JKP8 Negr1-203ENSMUST00000106065 1953 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Chrac1Q9JKP8 Tubgcp4-203ENSMUST00000110658 4250 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Chrac1Q9JKP8 Gm36858-201ENSMUST00000194501 2391 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
Chrac1Q9JKP8 Josd2-203ENSMUST00000118493 922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Chrac1Q9JKP8 Dmrta2os-202ENSMUST00000141893 691 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Chrac1Q9JKP8 Bnip1-201ENSMUST00000015725 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Chrac1Q9JKP8 Sirpa-209ENSMUST00000160276 876 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Chrac1Q9JKP8 Moap1-202ENSMUST00000178384 1284 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Chrac1Q9JKP8 Cnppd1-208ENSMUST00000190679 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Chrac1Q9JKP8 Zscan29-203ENSMUST00000146243 2894 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Chrac1Q9JKP8 Slc25a23-201ENSMUST00000040280 3362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Chrac1Q9JKP8 Cct6b-201ENSMUST00000021040 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Chrac1Q9JKP8 1700066B19Rik-201ENSMUST00000097617 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Chrac1Q9JKP8 Dach1-202ENSMUST00000071533 5219 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Chrac1Q9JKP8 Epm2a-201ENSMUST00000069106 3287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Chrac1Q9JKP8 B3gnt6-201ENSMUST00000098278 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Chrac1Q9JKP8 Dock9-202ENSMUST00000100299 6476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Chrac1Q9JKP8 Esyt2-205ENSMUST00000220816 4287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Chrac1Q9JKP8 Zfp804a-201ENSMUST00000047527 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Chrac1Q9JKP8 Fam213a-202ENSMUST00000118466 1567 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Chrac1Q9JKP8 Mrpl15-205ENSMUST00000146665 1569 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Chrac1Q9JKP8 Dancr-204ENSMUST00000132389 2347 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
Chrac1Q9JKP8 1810013L24Rik-201ENSMUST00000023150 4066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Chrac1Q9JKP8 Il6st-206ENSMUST00000183886 3004 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Chrac1Q9JKP8 Dtx2-203ENSMUST00000111144 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Chrac1Q9JKP8 Impdh1-202ENSMUST00000159124 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Chrac1Q9JKP8 Tle4-201ENSMUST00000052011 4555 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Chrac1Q9JKP8 Zfp467-201ENSMUST00000101443 599 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Chrac1Q9JKP8 Gm7290-201ENSMUST00000104990 617 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
Chrac1Q9JKP8 Gpx4-202ENSMUST00000105372 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Chrac1Q9JKP8 Gm12918-201ENSMUST00000120234 636 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
Chrac1Q9JKP8 Gm15710-201ENSMUST00000121821 636 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
Chrac1Q9JKP8 Gm3331-201ENSMUST00000183423 1017 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Chrac1Q9JKP8 Klf13-202ENSMUST00000183817 599 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Chrac1Q9JKP8 Gm29241-201ENSMUST00000189260 1096 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
Chrac1Q9JKP8 Gm5075-201ENSMUST00000196916 622 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
Chrac1Q9JKP8 Gm45822-201ENSMUST00000212231 259 ntTSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Chrac1Q9JKP8 Rpl13-ps6-201ENSMUST00000079761 636 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
Chrac1Q9JKP8 Rpl13-ps3-201ENSMUST00000079960 624 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
Chrac1Q9JKP8 Sytl3-201ENSMUST00000097430 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Chrac1Q9JKP8 Nploc4-202ENSMUST00000103017 4025 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Chrac1Q9JKP8 Gldc-201ENSMUST00000025778 3754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Chrac1Q9JKP8 Mid1-206ENSMUST00000112107 3194 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Chrac1Q9JKP8 Fcho1-209ENSMUST00000146100 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Chrac1Q9JKP8 Gprc5c-203ENSMUST00000122967 1709 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Chrac1Q9JKP8 Prr14-201ENSMUST00000033095 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Chrac1Q9JKP8 Henmt1-202ENSMUST00000098680 1466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Chrac1Q9JKP8 Sh2b3-201ENSMUST00000040308 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Chrac1Q9JKP8 Ikbke-204ENSMUST00000161764 2867 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Chrac1Q9JKP8 Crtac1-201ENSMUST00000048630 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Chrac1Q9JKP8 Tsnax-201ENSMUST00000075896 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Chrac1Q9JKP8 Mmd-202ENSMUST00000107887 1654 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Chrac1Q9JKP8 Ruvbl1-201ENSMUST00000032165 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Chrac1Q9JKP8 Gata5os-201ENSMUST00000069943 1678 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Chrac1Q9JKP8 Ptgis-201ENSMUST00000018113 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Chrac1Q9JKP8 Ube2k-201ENSMUST00000142407 4893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Chrac1Q9JKP8 Carmil2-201ENSMUST00000062574 2526 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Chrac1Q9JKP8 Gm9954-202ENSMUST00000198686 4725 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
Chrac1Q9JKP8 Rpusd3-202ENSMUST00000113092 1269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Chrac1Q9JKP8 Gm13148-201ENSMUST00000118892 745 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
Chrac1Q9JKP8 Nsfl1c-203ENSMUST00000103160 1369 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Chrac1Q9JKP8 Gm4425-201ENSMUST00000172838 2857 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Chrac1Q9JKP8 Tex261-201ENSMUST00000014892 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Chrac1Q9JKP8 Rpf1-201ENSMUST00000029838 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Chrac1Q9JKP8 Acads-201ENSMUST00000031524 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Chrac1Q9JKP8 Chsy3-201ENSMUST00000080721 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Chrac1Q9JKP8 Pigz-201ENSMUST00000052174 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Chrac1Q9JKP8 Luc7l2-213ENSMUST00000163047 3141 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Chrac1Q9JKP8 Letm1-203ENSMUST00000148451 2478 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Chrac1Q9JKP8 Ccdc106-204ENSMUST00000207974 2492 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Chrac1Q9JKP8 Pde8b-202ENSMUST00000067082 2598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Chrac1Q9JKP8 Anapc7-201ENSMUST00000031422 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Chrac1Q9JKP8 Mdm1-204ENSMUST00000169817 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Chrac1Q9JKP8 Matn4-201ENSMUST00000103103 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Chrac1Q9JKP8 Kcns2-201ENSMUST00000072868 5456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Chrac1Q9JKP8 Hmga1-205ENSMUST00000118599 529 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Chrac1Q9JKP8 4930444P10Rik-203ENSMUST00000151004 1001 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Chrac1Q9JKP8 Prmt1-205ENSMUST00000207659 945 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Chrac1Q9JKP8 Arl6ip4-201ENSMUST00000031351 1192 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Chrac1Q9JKP8 Hmces-201ENSMUST00000032141 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Chrac1Q9JKP8 Gm42918-201ENSMUST00000199249 1580 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
Chrac1Q9JKP8 Atp6v1c1-201ENSMUST00000022904 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Chrac1Q9JKP8 Kcnh2-202ENSMUST00000115098 3193 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Chrac1Q9JKP8 Rgl2-201ENSMUST00000047503 3252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Chrac1Q9JKP8 Ano8-204ENSMUST00000213382 3785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Chrac1Q9JKP8 Nptx2-201ENSMUST00000071782 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Chrac1Q9JKP8 Nisch-208ENSMUST00000165981 2415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Chrac1Q9JKP8 Aste1-202ENSMUST00000123807 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.3
Chrac1Q9JKP8 Saysd1-201ENSMUST00000059666 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Chrac1Q9JKP8 Sh3yl1-202ENSMUST00000110880 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Chrac1Q9JKP8 Ppt2-204ENSMUST00000168391 1342 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.3
Chrac1Q9JKP8 C1qtnf12-201ENSMUST00000024338 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23 ms