Protein–RNA interactions for Protein: Q9JJZ4

Ube2j1, Ubiquitin-conjugating enzyme E2 J1, mousemouse

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Length 318 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ube2j1Q9JJZ4 Rims3-201ENSMUST00000071093 6505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Ube2j1Q9JJZ4 Epn1-201ENSMUST00000045277 2334 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Ube2j1Q9JJZ4 Zbtb22-201ENSMUST00000053429 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Ube2j1Q9JJZ4 Ostf1-201ENSMUST00000025631 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Ube2j1Q9JJZ4 Arntl-204ENSMUST00000210238 2976 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Ube2j1Q9JJZ4 Plekhh3-206ENSMUST00000164474 3010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Ube2j1Q9JJZ4 Atg4c-201ENSMUST00000030279 3178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Ube2j1Q9JJZ4 Speg-204ENSMUST00000113589 833 ntTSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Ube2j1Q9JJZ4 Spr-202ENSMUST00000174286 775 ntTSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Ube2j1Q9JJZ4 Nrn1l-201ENSMUST00000060167 617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Ube2j1Q9JJZ4 Rps16-201ENSMUST00000082134 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Ube2j1Q9JJZ4 Adamts17-202ENSMUST00000107478 6416 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Ube2j1Q9JJZ4 Agrn-206ENSMUST00000180572 6891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Ube2j1Q9JJZ4 Ppp2r1b-205ENSMUST00000175640 1523 ntTSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Ube2j1Q9JJZ4 Nedd4l-202ENSMUST00000163516 8163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Ube2j1Q9JJZ4 Mrpl9-202ENSMUST00000196143 1657 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Ube2j1Q9JJZ4 Pitx2-207ENSMUST00000174661 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Ube2j1Q9JJZ4 Lgmn-201ENSMUST00000021607 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Ube2j1Q9JJZ4 H2-D1-202ENSMUST00000172785 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Ube2j1Q9JJZ4 Tmtc4-209ENSMUST00000148661 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Ube2j1Q9JJZ4 Slc26a10-205ENSMUST00000222911 3067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Ube2j1Q9JJZ4 Zic5-201ENSMUST00000039118 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Ube2j1Q9JJZ4 Rimbp3-201ENSMUST00000169803 5787 ntAPPRIS P1 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Ube2j1Q9JJZ4 Pde5a-204ENSMUST00000200389 7603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Ube2j1Q9JJZ4 Lrrn2-201ENSMUST00000027706 3428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Ube2j1Q9JJZ4 Sar1a-201ENSMUST00000020285 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Ube2j1Q9JJZ4 Hikeshi-206ENSMUST00000153470 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Ube2j1Q9JJZ4 Hnrnph1-201ENSMUST00000069304 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Ube2j1Q9JJZ4 Smpdl3b-201ENSMUST00000030709 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Ube2j1Q9JJZ4 Tcf7l1-202ENSMUST00000114053 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Ube2j1Q9JJZ4 Knl1-201ENSMUST00000028799 5527 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Ube2j1Q9JJZ4 Col18a1-202ENSMUST00000081654 5063 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
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Ube2j1Q9JJZ4 Vstm2b-203ENSMUST00000205845 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Ube2j1Q9JJZ4 Fmnl3-203ENSMUST00000120633 4290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
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Ube2j1Q9JJZ4 Acp5-206ENSMUST00000217643 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
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Ube2j1Q9JJZ4 Shisa7-201ENSMUST00000066041 6006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Ube2j1Q9JJZ4 Dtx2-204ENSMUST00000111145 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Ube2j1Q9JJZ4 St7l-202ENSMUST00000106769 2428 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Ube2j1Q9JJZ4 Cacna1h-202ENSMUST00000159048 8174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Ube2j1Q9JJZ4 Nespas-203ENSMUST00000151472 2248 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Ube2j1Q9JJZ4 Rtcb-201ENSMUST00000001834 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Ube2j1Q9JJZ4 Acadvl-201ENSMUST00000018718 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Ube2j1Q9JJZ4 Trpc1-204ENSMUST00000189137 4559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Ube2j1Q9JJZ4 Idnk-204ENSMUST00000226010 1898 ntBASIC14.52□□□□□ -0.08
Ube2j1Q9JJZ4 Fam98b-201ENSMUST00000028825 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Ube2j1Q9JJZ4 Abtb1-201ENSMUST00000032169 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Ube2j1Q9JJZ4 Nat8l-201ENSMUST00000056355 6529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Ube2j1Q9JJZ4 Nsmf-201ENSMUST00000006646 2922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Ube2j1Q9JJZ4 Oxct2b-201ENSMUST00000102648 1735 ntAPPRIS P1 BASIC14.52□□□□□ -0.08
Ube2j1Q9JJZ4 Ppm1d-201ENSMUST00000020835 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Ube2j1Q9JJZ4 Nkpd1-201ENSMUST00000078908 2753 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Ube2j1Q9JJZ4 Gpn3-201ENSMUST00000031420 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Ube2j1Q9JJZ4 Ewsr1-203ENSMUST00000079949 2588 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Ube2j1Q9JJZ4 Sdsl-201ENSMUST00000031594 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Ube2j1Q9JJZ4 Pdap1-201ENSMUST00000031627 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Ube2j1Q9JJZ4 Ina-201ENSMUST00000037636 3240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Ube2j1Q9JJZ4 Snx11-202ENSMUST00000107661 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Ube2j1Q9JJZ4 Gm12896-201ENSMUST00000118430 226 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
Ube2j1Q9JJZ4 Pantr1-210ENSMUST00000185599 343 ntTSL 3 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Ube2j1Q9JJZ4 Hsbp1-201ENSMUST00000034300 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
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Ube2j1Q9JJZ4 Rab1b-201ENSMUST00000025804 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Ube2j1Q9JJZ4 Shank3-202ENSMUST00000066545 4702 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Ube2j1Q9JJZ4 Zfp384-208ENSMUST00000112428 3132 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Ube2j1Q9JJZ4 Timm17b-201ENSMUST00000033498 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Ube2j1Q9JJZ4 Fam109a-203ENSMUST00000198271 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Ube2j1Q9JJZ4 Lgr6-201ENSMUST00000044828 6675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Ube2j1Q9JJZ4 Kank3-202ENSMUST00000172649 2652 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
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Ube2j1Q9JJZ4 Mtfr1l-202ENSMUST00000116279 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Ube2j1Q9JJZ4 Cox18-201ENSMUST00000048363 1333 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Ube2j1Q9JJZ4 Evx1-201ENSMUST00000031787 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Ube2j1Q9JJZ4 Slc11a1-201ENSMUST00000027368 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Ube2j1Q9JJZ4 Gm38285-201ENSMUST00000192928 922 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
Ube2j1Q9JJZ4 Tmem54-201ENSMUST00000030575 1064 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Ube2j1Q9JJZ4 Park7-201ENSMUST00000030805 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Ube2j1Q9JJZ4 Poglut1-201ENSMUST00000036210 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Ube2j1Q9JJZ4 Krt19-201ENSMUST00000007317 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Ube2j1Q9JJZ4 Smad3-201ENSMUST00000034973 5090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Ube2j1Q9JJZ4 Bmp8a-201ENSMUST00000040496 2405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Ube2j1Q9JJZ4 Wdr86-201ENSMUST00000068693 2364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Ube2j1Q9JJZ4 Cdc25a-201ENSMUST00000094324 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Ube2j1Q9JJZ4 Add1-204ENSMUST00000114338 4007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Ube2j1Q9JJZ4 Gjb3-201ENSMUST00000046532 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Ube2j1Q9JJZ4 Wnk1-202ENSMUST00000060043 10575 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Ube2j1Q9JJZ4 Senp3-202ENSMUST00000066760 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Ube2j1Q9JJZ4 Zmynd15-203ENSMUST00000108563 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Ube2j1Q9JJZ4 Hivep3-201ENSMUST00000084306 2973 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Ube2j1Q9JJZ4 Dlgap1-209ENSMUST00000140728 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Ube2j1Q9JJZ4 Rilpl2-201ENSMUST00000031347 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
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