Protein–RNA interactions for Protein: Q9JJY4

Ddx20, Probable ATP-dependent RNA helicase DDX20, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 825 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ddx20Q9JJY4 Mtch2-205ENSMUST00000136872 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Ddx20Q9JJY4 Rfesd-203ENSMUST00000179078 1436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Ddx20Q9JJY4 Eif3b-201ENSMUST00000100507 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Ddx20Q9JJY4 Tsc22d1-201ENSMUST00000022587 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Ddx20Q9JJY4 Crct1-202ENSMUST00000107301 460 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
Ddx20Q9JJY4 Nfs1-202ENSMUST00000109600 709 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Ddx20Q9JJY4 H2-T-ps-201ENSMUST00000172538 1067 ntBASIC19.94■□□□□ 0.78
Ddx20Q9JJY4 Gm18733-201ENSMUST00000173950 856 ntBASIC19.94■□□□□ 0.78
Ddx20Q9JJY4 Olfr572-203ENSMUST00000215782 1233 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
Ddx20Q9JJY4 Ifi27l2a-201ENSMUST00000055071 463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Ddx20Q9JJY4 Gm9991-201ENSMUST00000070048 1207 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Ddx20Q9JJY4 Rad23a-202ENSMUST00000109761 1842 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Ddx20Q9JJY4 Sox18-201ENSMUST00000054491 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Ddx20Q9JJY4 Gfra1-208ENSMUST00000152507 1937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
Ddx20Q9JJY4 Zfp746-203ENSMUST00000203609 3648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
Ddx20Q9JJY4 Xk-201ENSMUST00000015486 5076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Ddx20Q9JJY4 Spata18-202ENSMUST00000071077 1978 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
Ddx20Q9JJY4 AU019823-202ENSMUST00000145139 2805 ntTSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
Ddx20Q9JJY4 4933434E20Rik-209ENSMUST00000162114 1411 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Ddx20Q9JJY4 Rhbdd3-202ENSMUST00000101610 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Ddx20Q9JJY4 Tmem245-202ENSMUST00000107609 2643 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
Ddx20Q9JJY4 Dhodh-209ENSMUST00000143900 1455 ntTSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
Ddx20Q9JJY4 Agfg1-205ENSMUST00000187899 2078 ntTSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
Ddx20Q9JJY4 Tmem255b-201ENSMUST00000167071 1138 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Ddx20Q9JJY4 Tma7-201ENSMUST00000167504 944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Ddx20Q9JJY4 Mrpl36-202ENSMUST00000221730 717 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.93■□□□□ 0.78
Ddx20Q9JJY4 9330171B17Rik-201ENSMUST00000035939 2073 ntBASIC19.93■□□□□ 0.78
Ddx20Q9JJY4 Prmt2-202ENSMUST00000099571 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Ddx20Q9JJY4 Polr3h-201ENSMUST00000023113 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Ddx20Q9JJY4 Larp6-201ENSMUST00000038407 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Ddx20Q9JJY4 Fbxo30-201ENSMUST00000070300 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Ddx20Q9JJY4 Speg-202ENSMUST00000113587 1254 ntTSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
Ddx20Q9JJY4 Ism1-202ENSMUST00000184404 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Ddx20Q9JJY4 Sdhaf4-201ENSMUST00000027338 683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Ddx20Q9JJY4 Elmo2-204ENSMUST00000103088 3052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
Ddx20Q9JJY4 Lrrc25-201ENSMUST00000052437 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Ddx20Q9JJY4 Gnb2-203ENSMUST00000111023 1471 ntTSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
Ddx20Q9JJY4 Kctd15-201ENSMUST00000032709 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Ddx20Q9JJY4 Cetn4-205ENSMUST00000140956 2981 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Ddx20Q9JJY4 Adprh-201ENSMUST00000002923 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Ddx20Q9JJY4 Cdk10-201ENSMUST00000036880 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Ddx20Q9JJY4 Bhlhe22-201ENSMUST00000026120 3344 ntAPPRIS P1 BASIC19.91■□□□□ 0.78
Ddx20Q9JJY4 C630004M23Rik-201ENSMUST00000194765 1682 ntBASIC19.91■□□□□ 0.78
Ddx20Q9JJY4 Il17rc-201ENSMUST00000058300 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Ddx20Q9JJY4 Gm19721-201ENSMUST00000195284 1764 ntBASIC19.91■□□□□ 0.78
Ddx20Q9JJY4 Lca5l-201ENSMUST00000054855 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Ddx20Q9JJY4 Gm15889-201ENSMUST00000159142 1083 ntTSL 3 BASIC19.91■□□□□ 0.78
Ddx20Q9JJY4 Ssr2-205ENSMUST00000193934 569 ntTSL 3 BASIC19.91■□□□□ 0.78
Ddx20Q9JJY4 AC140264.2-201ENSMUST00000219668 289 ntTSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
Ddx20Q9JJY4 4931422A03Rik-201ENSMUST00000056170 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Ddx20Q9JJY4 Fam129b-201ENSMUST00000028135 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Ddx20Q9JJY4 Map6-206ENSMUST00000208605 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Ddx20Q9JJY4 Tgds-201ENSMUST00000022727 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Ddx20Q9JJY4 Spout1-201ENSMUST00000100220 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Ddx20Q9JJY4 Idnk-204ENSMUST00000226010 1898 ntBASIC19.9■□□□□ 0.78
Ddx20Q9JJY4 Fndc4-202ENSMUST00000172435 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Ddx20Q9JJY4 Hnrnpa1l2-ps-201ENSMUST00000129154 964 ntBASIC19.9■□□□□ 0.78
Ddx20Q9JJY4 2210408F21Rik-212ENSMUST00000152157 490 ntTSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
Ddx20Q9JJY4 Gm10052-201ENSMUST00000168019 960 ntBASIC19.9■□□□□ 0.78
Ddx20Q9JJY4 Gm19553-201ENSMUST00000175723 494 ntTSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
Ddx20Q9JJY4 Syne4-208ENSMUST00000176304 1006 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
Ddx20Q9JJY4 Mir8112-201ENSMUST00000184382 131 ntBASIC19.9■□□□□ 0.78
Ddx20Q9JJY4 Npw-202ENSMUST00000213213 531 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Ddx20Q9JJY4 Gm7729-201ENSMUST00000050143 801 ntBASIC19.9■□□□□ 0.78
Ddx20Q9JJY4 Hist1h2ad-201ENSMUST00000090776 572 ntAPPRIS P1 BASIC19.9■□□□□ 0.78
Ddx20Q9JJY4 4933402J07Rik-201ENSMUST00000093342 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Ddx20Q9JJY4 Gm26627-201ENSMUST00000181540 1487 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Ddx20Q9JJY4 Negr1-203ENSMUST00000106065 1953 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Ddx20Q9JJY4 Gm43231-201ENSMUST00000202960 2258 ntBASIC19.9■□□□□ 0.78
Ddx20Q9JJY4 Cacnb3-201ENSMUST00000003442 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.78
Ddx20Q9JJY4 Smc6-201ENSMUST00000020931 5603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Ddx20Q9JJY4 Fam43b-201ENSMUST00000105032 2437 ntAPPRIS P1 BASIC19.89■□□□□ 0.77
Ddx20Q9JJY4 Oraov1-203ENSMUST00000105895 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.89■□□□□ 0.77
Ddx20Q9JJY4 Inip-202ENSMUST00000107526 1438 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Ddx20Q9JJY4 Gmnn-202ENSMUST00000110382 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Ddx20Q9JJY4 Lcn12-202ENSMUST00000114245 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Ddx20Q9JJY4 Gm11336-201ENSMUST00000118168 334 ntBASIC19.89■□□□□ 0.77
Ddx20Q9JJY4 Prmt9-202ENSMUST00000118622 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
Ddx20Q9JJY4 Mras-202ENSMUST00000119472 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Ddx20Q9JJY4 Pafah1b3-207ENSMUST00000155118 679 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Ddx20Q9JJY4 Gm43272-201ENSMUST00000200599 1584 ntBASIC19.89■□□□□ 0.77
Ddx20Q9JJY4 Hikeshi-207ENSMUST00000207309 835 ntTSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
Ddx20Q9JJY4 Gm45669-201ENSMUST00000209808 459 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Ddx20Q9JJY4 AC159301.1-201ENSMUST00000225130 1182 ntBASIC19.89■□□□□ 0.77
Ddx20Q9JJY4 Zkscan4-202ENSMUST00000225845 1506 ntBASIC19.89■□□□□ 0.77
Ddx20Q9JJY4 Prdx6-201ENSMUST00000051925 959 ntTSL 2 BASIC19.89■□□□□ 0.77
Ddx20Q9JJY4 Nipa2-202ENSMUST00000117812 3039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.89■□□□□ 0.77
Ddx20Q9JJY4 Rbm18-201ENSMUST00000028251 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Ddx20Q9JJY4 Gga2-201ENSMUST00000033160 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Ddx20Q9JJY4 Chka-201ENSMUST00000025760 2319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
Ddx20Q9JJY4 Cyp4f16-201ENSMUST00000003416 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Ddx20Q9JJY4 Grk6-202ENSMUST00000099482 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Ddx20Q9JJY4 Erich2-201ENSMUST00000100041 1749 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Ddx20Q9JJY4 Dtnbp1-203ENSMUST00000220555 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
Ddx20Q9JJY4 H2-DMb1-201ENSMUST00000114232 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Ddx20Q9JJY4 Psme3-201ENSMUST00000019470 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Ddx20Q9JJY4 Pih1d1-202ENSMUST00000107811 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Ddx20Q9JJY4 Scpep1os-201ENSMUST00000139592 811 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Ddx20Q9JJY4 Fbxo6-208ENSMUST00000168503 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
Ddx20Q9JJY4 Gm18195-201ENSMUST00000207604 706 ntBASIC19.88■□□□□ 0.77
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.8 ms