Protein–RNA interactions for Protein: Q9JJT2

Gfra4, GDNF family receptor alpha-4, mousemouse

Predictions only

Length 260 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gfra4Q9JJT2 Gpsm3-201ENSMUST00000038244 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Gfra4Q9JJT2 Mapre3-201ENSMUST00000031058 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Gfra4Q9JJT2 Fbxo45-201ENSMUST00000042732 4179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Gfra4Q9JJT2 Sh3yl1-202ENSMUST00000110880 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Gfra4Q9JJT2 Gtf3a-201ENSMUST00000132102 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Gfra4Q9JJT2 Adcy3-202ENSMUST00000124505 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Gfra4Q9JJT2 Commd6-201ENSMUST00000100339 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Gfra4Q9JJT2 Gm9694-201ENSMUST00000193347 1189 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
Gfra4Q9JJT2 Gm34391-201ENSMUST00000203706 907 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
Gfra4Q9JJT2 Lancl2-202ENSMUST00000072954 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Gfra4Q9JJT2 Gm19721-201ENSMUST00000195284 1764 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
Gfra4Q9JJT2 Tubb4b-ps1-201ENSMUST00000179460 1336 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
Gfra4Q9JJT2 Lrp5-202ENSMUST00000176867 2759 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Gfra4Q9JJT2 Arl1-202ENSMUST00000116234 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Gfra4Q9JJT2 Krt82-201ENSMUST00000023713 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Gfra4Q9JJT2 Etnk1-204ENSMUST00000205256 2647 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Gfra4Q9JJT2 Elavl1-201ENSMUST00000098950 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Gfra4Q9JJT2 Lrig1-202ENSMUST00000101126 4951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Gfra4Q9JJT2 Ddx59-201ENSMUST00000027655 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Gfra4Q9JJT2 Ccdc105-201ENSMUST00000105383 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Gfra4Q9JJT2 Gprc5c-203ENSMUST00000122967 1709 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Gfra4Q9JJT2 Kcnk4-201ENSMUST00000025908 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Gfra4Q9JJT2 Zscan25-201ENSMUST00000094116 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Gfra4Q9JJT2 Ptpa-202ENSMUST00000113601 1838 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Gfra4Q9JJT2 Cd164l2-201ENSMUST00000105910 986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Gfra4Q9JJT2 Gm9013-201ENSMUST00000132939 882 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
Gfra4Q9JJT2 Rhox13-201ENSMUST00000152730 876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Gfra4Q9JJT2 Gm27357-201ENSMUST00000183754 135 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
Gfra4Q9JJT2 Gm17808-201ENSMUST00000200859 894 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
Gfra4Q9JJT2 Gm42738-201ENSMUST00000201813 439 ntTSL 3 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Gfra4Q9JJT2 Gm5864-201ENSMUST00000202263 970 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
Gfra4Q9JJT2 Tssc4-208ENSMUST00000208779 647 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Gfra4Q9JJT2 Ntpcr-201ENSMUST00000034313 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Gfra4Q9JJT2 Fam167b-201ENSMUST00000052835 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Gfra4Q9JJT2 Asnsd1-201ENSMUST00000027264 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Gfra4Q9JJT2 Gab2-201ENSMUST00000004622 6168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Gfra4Q9JJT2 Bdkrb1-202ENSMUST00000182899 1313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Gfra4Q9JJT2 Bdkrb1-201ENSMUST00000041229 1338 ntAPPRIS P1 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Gfra4Q9JJT2 Slc12a2-201ENSMUST00000115366 6520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Gfra4Q9JJT2 Cpsf4-207ENSMUST00000162244 1387 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Gfra4Q9JJT2 Rogdi-207ENSMUST00000202281 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Gfra4Q9JJT2 Gm37194-201ENSMUST00000193092 3031 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
Gfra4Q9JJT2 Nkiras2-201ENSMUST00000017981 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
Gfra4Q9JJT2 Tia1-203ENSMUST00000095754 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.5
Gfra4Q9JJT2 Rps27a-202ENSMUST00000102845 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Gfra4Q9JJT2 Gm11906-201ENSMUST00000124792 680 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Gfra4Q9JJT2 5430402O13Rik-201ENSMUST00000126537 869 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Gfra4Q9JJT2 Srgn-205ENSMUST00000162161 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Gfra4Q9JJT2 Gm26829-201ENSMUST00000180581 934 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Gfra4Q9JJT2 Krtap1-5-201ENSMUST00000054532 1041 ntAPPRIS P1 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Gfra4Q9JJT2 Taar2-201ENSMUST00000079134 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Gfra4Q9JJT2 Gm19569-202ENSMUST00000184658 1305 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Gfra4Q9JJT2 Snrnp48-201ENSMUST00000091641 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Gfra4Q9JJT2 Cep57-208ENSMUST00000147115 2262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Gfra4Q9JJT2 Negr1-203ENSMUST00000106065 1953 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Gfra4Q9JJT2 2010016I18Rik-204ENSMUST00000190356 1562 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Gfra4Q9JJT2 Cyth2-201ENSMUST00000056820 2527 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Gfra4Q9JJT2 Kcnj4-201ENSMUST00000057801 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Gfra4Q9JJT2 Chst1-201ENSMUST00000065797 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Gfra4Q9JJT2 Fam131a-202ENSMUST00000118919 2262 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Gfra4Q9JJT2 Tmc6-202ENSMUST00000103025 1279 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Gfra4Q9JJT2 Fgf20-202ENSMUST00000118639 587 ntTSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Gfra4Q9JJT2 Mrpl43-201ENSMUST00000097715 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Gfra4Q9JJT2 Sept8-203ENSMUST00000120878 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Gfra4Q9JJT2 Stk32c-202ENSMUST00000165870 1883 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Gfra4Q9JJT2 Apbb1-209ENSMUST00000188368 1970 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Gfra4Q9JJT2 Agbl4-205ENSMUST00000106591 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Gfra4Q9JJT2 Anxa2-201ENSMUST00000034756 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Gfra4Q9JJT2 Nsmf-205ENSMUST00000114386 2685 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Gfra4Q9JJT2 Ankrd22-201ENSMUST00000025686 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Gfra4Q9JJT2 Vps53-202ENSMUST00000094015 2645 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Gfra4Q9JJT2 Pou2f2-205ENSMUST00000108417 1937 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Gfra4Q9JJT2 Smad7-201ENSMUST00000026999 4278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Gfra4Q9JJT2 Acbd4-201ENSMUST00000024492 2075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Gfra4Q9JJT2 Crct1-202ENSMUST00000107301 460 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Gfra4Q9JJT2 Gm21586-201ENSMUST00000107988 264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Gfra4Q9JJT2 Gm21953-201ENSMUST00000108002 264 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Gfra4Q9JJT2 Epsti1-202ENSMUST00000169978 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Gfra4Q9JJT2 Gm20878-208ENSMUST00000181518 264 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Gfra4Q9JJT2 Pagr1a-203ENSMUST00000206416 558 ntTSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Gfra4Q9JJT2 Rpl18a-206ENSMUST00000212709 700 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Gfra4Q9JJT2 Epsti1-203ENSMUST00000227903 1178 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Gfra4Q9JJT2 Upk3a-201ENSMUST00000023070 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Gfra4Q9JJT2 Acvr2b-205ENSMUST00000215746 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Gfra4Q9JJT2 Prss33-201ENSMUST00000059906 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Gfra4Q9JJT2 Fmnl2-204ENSMUST00000127122 5508 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Gfra4Q9JJT2 Foxo3-204ENSMUST00000175881 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Gfra4Q9JJT2 Nsg1-201ENSMUST00000031009 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Gfra4Q9JJT2 Ssc4d-204ENSMUST00000111153 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Gfra4Q9JJT2 Prps1l3-201ENSMUST00000139049 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Gfra4Q9JJT2 Itgb1bp1-201ENSMUST00000076260 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Gfra4Q9JJT2 Rtkn-201ENSMUST00000065512 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Gfra4Q9JJT2 Dhx32-203ENSMUST00000106139 2233 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Gfra4Q9JJT2 Gm29514-202ENSMUST00000186665 2214 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Gfra4Q9JJT2 Zfp706-201ENSMUST00000078976 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Gfra4Q9JJT2 Vps9d1-203ENSMUST00000122363 2952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Gfra4Q9JJT2 Slc30a4-202ENSMUST00000099457 3170 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Gfra4Q9JJT2 Psma3-204ENSMUST00000160864 859 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Gfra4Q9JJT2 2310001K24Rik-202ENSMUST00000186760 740 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Gfra4Q9JJT2 Gm38027-201ENSMUST00000192315 235 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.7 ms