Protein–RNA interactions for Protein: Q9JJF6

Efcc1, EF-hand and coiled-coil domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 558 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Efcc1Q9JJF6 Aifm1-201ENSMUST00000037349 2237 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Efcc1Q9JJF6 Prickle4-201ENSMUST00000113299 990 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Efcc1Q9JJF6 Prickle4-202ENSMUST00000113300 1110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Efcc1Q9JJF6 Raver2-201ENSMUST00000038463 4045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Efcc1Q9JJF6 Diaph1-205ENSMUST00000115634 5666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Efcc1Q9JJF6 Arpc4-201ENSMUST00000156898 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Efcc1Q9JJF6 Lrch3-201ENSMUST00000023491 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Efcc1Q9JJF6 Mbp-201ENSMUST00000047865 2492 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Efcc1Q9JJF6 Ddx41-201ENSMUST00000021956 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Efcc1Q9JJF6 Lancl2-202ENSMUST00000072954 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Efcc1Q9JJF6 Gm16863-201ENSMUST00000181476 2431 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Efcc1Q9JJF6 Pomp-201ENSMUST00000031654 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Efcc1Q9JJF6 Sfrp4-201ENSMUST00000002883 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Efcc1Q9JJF6 Kmt5c-201ENSMUST00000098853 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Efcc1Q9JJF6 Mfsd10-202ENSMUST00000114329 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Efcc1Q9JJF6 Eepd1-201ENSMUST00000040677 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Efcc1Q9JJF6 Zc3hav1l-201ENSMUST00000058524 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Efcc1Q9JJF6 Gm43808-201ENSMUST00000202534 2065 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
Efcc1Q9JJF6 Psmd13-209ENSMUST00000164681 726 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Efcc1Q9JJF6 Banf1-201ENSMUST00000025762 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Efcc1Q9JJF6 Ly6h-202ENSMUST00000065417 985 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Efcc1Q9JJF6 Ccdc17-201ENSMUST00000051869 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Efcc1Q9JJF6 Sh2b2-203ENSMUST00000196397 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Efcc1Q9JJF6 Gm26795-201ENSMUST00000180993 1952 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Efcc1Q9JJF6 Zkscan14-201ENSMUST00000031632 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Efcc1Q9JJF6 Dnajc2-201ENSMUST00000030771 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Efcc1Q9JJF6 Nr4a1-201ENSMUST00000023779 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Efcc1Q9JJF6 Snx14-205ENSMUST00000173011 2238 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Efcc1Q9JJF6 Gm37519-201ENSMUST00000191687 2210 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
Efcc1Q9JJF6 Bdkrb1-202ENSMUST00000182899 1313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Efcc1Q9JJF6 Bdkrb1-201ENSMUST00000041229 1338 ntAPPRIS P1 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Efcc1Q9JJF6 Igfbp2-201ENSMUST00000047328 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Efcc1Q9JJF6 Ptpa-202ENSMUST00000113601 1838 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Efcc1Q9JJF6 Gm16061-201ENSMUST00000122167 857 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
Efcc1Q9JJF6 Gm5577-203ENSMUST00000153372 815 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Efcc1Q9JJF6 Rfesd-202ENSMUST00000167271 595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Efcc1Q9JJF6 Gm3272-201ENSMUST00000181181 1229 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
Efcc1Q9JJF6 Gm10566-201ENSMUST00000086739 996 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
Efcc1Q9JJF6 Npw-201ENSMUST00000095544 638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Efcc1Q9JJF6 Tsc22d1-201ENSMUST00000022587 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Efcc1Q9JJF6 Man1c1-201ENSMUST00000038628 4285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Efcc1Q9JJF6 Stam2-202ENSMUST00000127316 1928 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Efcc1Q9JJF6 Nr1h2-213ENSMUST00000167197 1944 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Efcc1Q9JJF6 Bmi1-201ENSMUST00000028071 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Efcc1Q9JJF6 2010016I18Rik-204ENSMUST00000190356 1562 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Efcc1Q9JJF6 Eomes-202ENSMUST00000111763 2869 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Efcc1Q9JJF6 Nrros-203ENSMUST00000115165 2389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Efcc1Q9JJF6 S1pr5-201ENSMUST00000122088 2500 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Efcc1Q9JJF6 Gm9774-202ENSMUST00000192538 1392 ntAPPRIS P1 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Efcc1Q9JJF6 Rimklb-201ENSMUST00000068242 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Efcc1Q9JJF6 Fiz1-203ENSMUST00000167804 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Efcc1Q9JJF6 Cep57-208ENSMUST00000147115 2262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Efcc1Q9JJF6 Spsb2-203ENSMUST00000112473 1322 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
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Efcc1Q9JJF6 Arl1-202ENSMUST00000116234 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
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Efcc1Q9JJF6 Ppp2r1b-204ENSMUST00000174628 2195 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Efcc1Q9JJF6 Sharpin-201ENSMUST00000023211 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
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Efcc1Q9JJF6 Dscam-201ENSMUST00000056102 7498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
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Efcc1Q9JJF6 Dbn1-202ENSMUST00000109921 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
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Efcc1Q9JJF6 Il17re-208ENSMUST00000204774 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Efcc1Q9JJF6 Dleu2-208ENSMUST00000182768 1442 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Efcc1Q9JJF6 Ccdc126-201ENSMUST00000055559 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Efcc1Q9JJF6 Prmt9-202ENSMUST00000118622 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
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Efcc1Q9JJF6 Rapgef3os1-201ENSMUST00000149373 483 ntTSL 3 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Efcc1Q9JJF6 Gm6659-201ENSMUST00000174752 547 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
Efcc1Q9JJF6 Gm20033-201ENSMUST00000180470 572 ntTSL 3 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Efcc1Q9JJF6 Arpc4-204ENSMUST00000204802 794 ntTSL 3 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Efcc1Q9JJF6 Ttc32-203ENSMUST00000219488 768 ntTSL 3 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Efcc1Q9JJF6 Htr6-202ENSMUST00000105802 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
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Efcc1Q9JJF6 Skp1a-203ENSMUST00000109072 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Efcc1Q9JJF6 Hmbox1-203ENSMUST00000175744 1771 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Efcc1Q9JJF6 Nptn-212ENSMUST00000177292 1390 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Efcc1Q9JJF6 Kcnab3-201ENSMUST00000018614 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Efcc1Q9JJF6 Cspg5-205ENSMUST00000199736 2107 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Efcc1Q9JJF6 Tm7sf2-201ENSMUST00000025713 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Efcc1Q9JJF6 Arhgef16-201ENSMUST00000030898 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Efcc1Q9JJF6 Gm44832-201ENSMUST00000208849 2303 ntBASIC20.04■□□□□ 0.8
Efcc1Q9JJF6 Mtrf1l-201ENSMUST00000019908 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Efcc1Q9JJF6 Ddx59-201ENSMUST00000027655 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Efcc1Q9JJF6 Dcps-202ENSMUST00000119847 1445 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Efcc1Q9JJF6 Trim54-201ENSMUST00000013771 1434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Efcc1Q9JJF6 Hmga1-206ENSMUST00000119486 1003 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Efcc1Q9JJF6 Smim1-205ENSMUST00000131325 842 ntTSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Efcc1Q9JJF6 Rpl39l-201ENSMUST00000044103 805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Efcc1Q9JJF6 Hist1h2aj-201ENSMUST00000091710 352 ntBASIC20.04■□□□□ 0.8
Efcc1Q9JJF6 Ssc4d-204ENSMUST00000111153 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.4 ms