Protein–RNA interactions for Protein: Q9JIG7

Ccdc22, Coiled-coil domain-containing protein 22, mousemouse

Predictions only

Length 627 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc22Q9JIG7 Tmprss5-201ENSMUST00000070390 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Ccdc22Q9JIG7 Eva1a-201ENSMUST00000042974 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Ccdc22Q9JIG7 Trip10-201ENSMUST00000019631 2224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Ccdc22Q9JIG7 Hps6-201ENSMUST00000099393 2696 ntAPPRIS P1 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Ccdc22Q9JIG7 Arf1-202ENSMUST00000163300 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Ccdc22Q9JIG7 Gm11650-201ENSMUST00000141271 1145 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Ccdc22Q9JIG7 Nt5c-201ENSMUST00000021082 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Ccdc22Q9JIG7 Uts2r-201ENSMUST00000039044 1703 ntAPPRIS P1 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Ccdc22Q9JIG7 Parg-201ENSMUST00000022470 4413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Ccdc22Q9JIG7 Nrm-201ENSMUST00000074259 1466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Ccdc22Q9JIG7 Ado-201ENSMUST00000075686 4445 ntAPPRIS P1 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Ccdc22Q9JIG7 Rtn3-201ENSMUST00000025667 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Ccdc22Q9JIG7 Zic1-202ENSMUST00000065360 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Ccdc22Q9JIG7 Kat14-208ENSMUST00000147747 3299 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Ccdc22Q9JIG7 Ermp1-203ENSMUST00000159692 7058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Ccdc22Q9JIG7 Galnt18-201ENSMUST00000049430 2575 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Ccdc22Q9JIG7 F830208F22Rik-202ENSMUST00000143732 2891 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Ccdc22Q9JIG7 Parg-204ENSMUST00000164137 3013 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Ccdc22Q9JIG7 Trhde-201ENSMUST00000061632 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Ccdc22Q9JIG7 Wapl-201ENSMUST00000048263 6351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Ccdc22Q9JIG7 Stard7-202ENSMUST00000110375 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Ccdc22Q9JIG7 Rbm12b1-202ENSMUST00000069128 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Ccdc22Q9JIG7 Htr3a-201ENSMUST00000003826 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Ccdc22Q9JIG7 Gm12821-201ENSMUST00000120022 600 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
Ccdc22Q9JIG7 Ss18l2-201ENSMUST00000035113 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Ccdc22Q9JIG7 Acbd6-202ENSMUST00000080138 993 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Ccdc22Q9JIG7 Prkar2b-202ENSMUST00000036497 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Ccdc22Q9JIG7 Chn1-209ENSMUST00000166199 3876 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Ccdc22Q9JIG7 Arntl-201ENSMUST00000047321 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Ccdc22Q9JIG7 Bcr-201ENSMUST00000164107 6839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Ccdc22Q9JIG7 Prdm11-201ENSMUST00000111272 3012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.31
Ccdc22Q9JIG7 Zbtb11os1-201ENSMUST00000186480 1350 ntBASIC17.02■□□□□ 0.31
Ccdc22Q9JIG7 Gm43034-201ENSMUST00000198678 1364 ntBASIC17.02■□□□□ 0.31
Ccdc22Q9JIG7 Isca1-201ENSMUST00000057115 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Ccdc22Q9JIG7 Soga3-201ENSMUST00000092629 4105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.31
Ccdc22Q9JIG7 Gm16835-201ENSMUST00000140488 2809 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Ccdc22Q9JIG7 Igsf8-201ENSMUST00000039506 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Ccdc22Q9JIG7 Tpra1-223ENSMUST00000204765 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Ccdc22Q9JIG7 Tmem170-201ENSMUST00000034431 3878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Ccdc22Q9JIG7 Chsy3-201ENSMUST00000080721 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Ccdc22Q9JIG7 Epm2a-201ENSMUST00000069106 3287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Ccdc22Q9JIG7 Cap1-202ENSMUST00000106255 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Ccdc22Q9JIG7 Tmem80-201ENSMUST00000026578 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Ccdc22Q9JIG7 Sox1ot-201ENSMUST00000080795 5064 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Ccdc22Q9JIG7 Abhd5-204ENSMUST00000156520 3157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Ccdc22Q9JIG7 Gm10418-201ENSMUST00000100943 576 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
Ccdc22Q9JIG7 Tmem120b-202ENSMUST00000111619 1256 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Ccdc22Q9JIG7 Gemin7-203ENSMUST00000119912 653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Ccdc22Q9JIG7 Tsen2-203ENSMUST00000130425 638 ntTSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Ccdc22Q9JIG7 Rgs7-203ENSMUST00000192227 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Ccdc22Q9JIG7 Gp1bb-201ENSMUST00000051160 645 ntAPPRIS P3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Ccdc22Q9JIG7 Ferd3l-201ENSMUST00000061035 886 ntAPPRIS P1 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Ccdc22Q9JIG7 Kctd17-201ENSMUST00000089414 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Ccdc22Q9JIG7 Gm1043-204ENSMUST00000207866 4296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Ccdc22Q9JIG7 Zfp943-202ENSMUST00000153985 1598 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Ccdc22Q9JIG7 Gm10655-201ENSMUST00000098658 1397 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
Ccdc22Q9JIG7 Urgcp-201ENSMUST00000053427 5527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Ccdc22Q9JIG7 Fads3-201ENSMUST00000115995 3269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Ccdc22Q9JIG7 Slmap-212ENSMUST00000139075 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Ccdc22Q9JIG7 Ptgis-201ENSMUST00000018113 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Ccdc22Q9JIG7 Gm26995-201ENSMUST00000182216 1306 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Ccdc22Q9JIG7 Gm26646-201ENSMUST00000180715 1490 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Ccdc22Q9JIG7 Tmem229a-201ENSMUST00000127247 5157 ntAPPRIS P1 BASIC17■□□□□ 0.31
Ccdc22Q9JIG7 Ttc13-202ENSMUST00000117624 3096 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Ccdc22Q9JIG7 Rpusd3-204ENSMUST00000129047 1045 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Ccdc22Q9JIG7 AI480526-205ENSMUST00000160255 1095 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Ccdc22Q9JIG7 Dlx1-201ENSMUST00000037119 4111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Ccdc22Q9JIG7 Rpusd3-201ENSMUST00000060634 1224 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Ccdc22Q9JIG7 Akr7a5-201ENSMUST00000073787 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Ccdc22Q9JIG7 Endov-203ENSMUST00000106245 5126 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Ccdc22Q9JIG7 Nsmf-207ENSMUST00000116574 2863 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Ccdc22Q9JIG7 Ubap1-202ENSMUST00000108060 2514 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Ccdc22Q9JIG7 Nptx2-201ENSMUST00000071782 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Ccdc22Q9JIG7 Gch1-201ENSMUST00000089959 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Ccdc22Q9JIG7 Tor3a-207ENSMUST00000188964 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Ccdc22Q9JIG7 Gm10516-201ENSMUST00000180598 2615 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Ccdc22Q9JIG7 Cnksr1-201ENSMUST00000030645 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ccdc22Q9JIG7 Sgsm2-201ENSMUST00000057631 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ccdc22Q9JIG7 Nepro-201ENSMUST00000048788 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ccdc22Q9JIG7 Hsd17b2-201ENSMUST00000034304 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ccdc22Q9JIG7 Tnfsf14-201ENSMUST00000005976 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ccdc22Q9JIG7 Dmgdh-201ENSMUST00000048001 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ccdc22Q9JIG7 Cend1-202ENSMUST00000124444 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ccdc22Q9JIG7 Zcchc17-202ENSMUST00000134159 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ccdc22Q9JIG7 Kctd9-205ENSMUST00000152243 2528 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ccdc22Q9JIG7 Hist1h2bp-201ENSMUST00000102982 469 ntAPPRIS P1 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ccdc22Q9JIG7 Smox-206ENSMUST00000110183 1159 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ccdc22Q9JIG7 Ikzf5-203ENSMUST00000128432 714 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ccdc22Q9JIG7 Pop5-201ENSMUST00000081497 1025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ccdc22Q9JIG7 Tbc1d12-201ENSMUST00000037302 4209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ccdc22Q9JIG7 Dnajc3-201ENSMUST00000022734 5141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ccdc22Q9JIG7 Inppl1-201ENSMUST00000035836 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ccdc22Q9JIG7 Syngap1-204ENSMUST00000194598 6011 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ccdc22Q9JIG7 Dnajc25-201ENSMUST00000095070 4023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ccdc22Q9JIG7 Tmem260-201ENSMUST00000111735 5485 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ccdc22Q9JIG7 Gm16499-203ENSMUST00000204633 2177 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
Ccdc22Q9JIG7 Sfrp2-201ENSMUST00000029625 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ccdc22Q9JIG7 Sphk1-206ENSMUST00000106388 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ccdc22Q9JIG7 Was-201ENSMUST00000033505 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ccdc22Q9JIG7 Bicdl1-201ENSMUST00000055408 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.3 ms