Protein–RNA interactions for Protein: Q9JI57

Gtf2ird1, General transcription factor II-I repeat domain-containing protein 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,104 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gtf2ird1Q9JI57 Klf13-202ENSMUST00000183817 599 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Gtf2ird1Q9JI57 Rps2-ps2-201ENSMUST00000194305 881 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
Gtf2ird1Q9JI57 Vsig10l-204ENSMUST00000203769 2473 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Gtf2ird1Q9JI57 Ino80e-201ENSMUST00000050833 1944 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Gtf2ird1Q9JI57 Ecel1-201ENSMUST00000027463 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Gtf2ird1Q9JI57 Foxp4-204ENSMUST00000113265 3999 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Gtf2ird1Q9JI57 Asnsd1-201ENSMUST00000027264 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Gtf2ird1Q9JI57 Col15a1-202ENSMUST00000102917 5172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
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Gtf2ird1Q9JI57 Mmp11-201ENSMUST00000000924 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
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Gtf2ird1Q9JI57 Atp8b2-201ENSMUST00000069805 5559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
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Gtf2ird1Q9JI57 Hilpda-202ENSMUST00000115289 658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
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Gtf2ird1Q9JI57 Fndc11-201ENSMUST00000050026 1387 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Gtf2ird1Q9JI57 Gm45623-201ENSMUST00000210744 1457 ntAPPRIS P1 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Gtf2ird1Q9JI57 Hikeshi-206ENSMUST00000153470 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Gtf2ird1Q9JI57 Mipol1-201ENSMUST00000123498 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Gtf2ird1Q9JI57 Myh7b-201ENSMUST00000092995 6163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Gtf2ird1Q9JI57 0610012G03Rik-201ENSMUST00000202722 1445 ntAPPRIS P1 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Gtf2ird1Q9JI57 Klhdc8a-201ENSMUST00000046071 4269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Gtf2ird1Q9JI57 Zar1-201ENSMUST00000073528 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Gtf2ird1Q9JI57 Myb-201ENSMUST00000020158 3074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Gtf2ird1Q9JI57 Ppme1-201ENSMUST00000032963 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Gtf2ird1Q9JI57 Map3k7-202ENSMUST00000080933 5669 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Gtf2ird1Q9JI57 Gm19554-201ENSMUST00000220934 2076 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Gtf2ird1Q9JI57 Apba1-201ENSMUST00000025830 6632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Gtf2ird1Q9JI57 Rpl18-ps2-201ENSMUST00000118863 567 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
Gtf2ird1Q9JI57 Gm11539-201ENSMUST00000119837 557 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
Gtf2ird1Q9JI57 Gm13436-201ENSMUST00000120418 567 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
Gtf2ird1Q9JI57 4833413E03Rik-201ENSMUST00000013706 1091 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Gtf2ird1Q9JI57 Ddah2-204ENSMUST00000174493 1254 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Gtf2ird1Q9JI57 Gm27463-201ENSMUST00000183569 57 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
Gtf2ird1Q9JI57 Gm45618-201ENSMUST00000209890 660 ntAPPRIS P1 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Gtf2ird1Q9JI57 Krt88-201ENSMUST00000023781 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Gtf2ird1Q9JI57 Bax-201ENSMUST00000033093 867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Gtf2ird1Q9JI57 Eps8-201ENSMUST00000058210 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
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Gtf2ird1Q9JI57 Coil-201ENSMUST00000036649 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
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Gtf2ird1Q9JI57 Synm-205ENSMUST00000208815 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Gtf2ird1Q9JI57 Pced1a-202ENSMUST00000110277 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
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Gtf2ird1Q9JI57 Yipf3-201ENSMUST00000095263 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Gtf2ird1Q9JI57 Faap20-201ENSMUST00000097747 1479 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
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Gtf2ird1Q9JI57 Naa60-212ENSMUST00000186375 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
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Gtf2ird1Q9JI57 Lrp3-201ENSMUST00000118444 3877 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
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Gtf2ird1Q9JI57 Rtn4-204ENSMUST00000102842 2257 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Gtf2ird1Q9JI57 Acss2-201ENSMUST00000029135 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Gtf2ird1Q9JI57 Gm29994-201ENSMUST00000195495 1193 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
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Gtf2ird1Q9JI57 Nsg1-204ENSMUST00000201363 820 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Gtf2ird1Q9JI57 Fuz-209ENSMUST00000208179 1164 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Gtf2ird1Q9JI57 4933406B15Rik-201ENSMUST00000220065 1182 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Gtf2ird1Q9JI57 AC122465.1-201ENSMUST00000220813 1209 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Gtf2ird1Q9JI57 Agbl4-205ENSMUST00000106591 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Gtf2ird1Q9JI57 Gm8668-201ENSMUST00000120559 1447 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
Gtf2ird1Q9JI57 Lancl2-202ENSMUST00000072954 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Gtf2ird1Q9JI57 Meg3-201ENSMUST00000124106 1988 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Gtf2ird1Q9JI57 Mtmr3-202ENSMUST00000109943 5674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Gtf2ird1Q9JI57 Trappc3-201ENSMUST00000030660 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Gtf2ird1Q9JI57 Ddx28-201ENSMUST00000058579 2262 ntAPPRIS P1 BASIC18.46■□□□□ 0.54
Gtf2ird1Q9JI57 Gpr180-201ENSMUST00000022728 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.54
Gtf2ird1Q9JI57 Gm6093-201ENSMUST00000221792 1623 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Gtf2ird1Q9JI57 Senp2-201ENSMUST00000023561 4499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Gtf2ird1Q9JI57 Gaa-202ENSMUST00000106258 1369 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
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