Protein–RNA interactions for Protein: Q9JHK4

Rabggta, Geranylgeranyl transferase type-2 subunit alpha, mousemouse

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Length 567 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RabggtaQ9JHK4 Slc9a5-201ENSMUST00000073149 3499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
RabggtaQ9JHK4 Wnk2-202ENSMUST00000049265 6738 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
RabggtaQ9JHK4 Actl10-201ENSMUST00000104928 1501 ntAPPRIS P1 BASIC20.22■□□□□ 0.83
RabggtaQ9JHK4 Acot7-206ENSMUST00000167926 1505 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
RabggtaQ9JHK4 Actl10-202ENSMUST00000226583 1501 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
RabggtaQ9JHK4 Gm21949-201ENSMUST00000182006 2369 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
RabggtaQ9JHK4 Ciz1-201ENSMUST00000048964 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
RabggtaQ9JHK4 Sox30-201ENSMUST00000049038 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
RabggtaQ9JHK4 Pgam1-ps2-201ENSMUST00000117129 765 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
RabggtaQ9JHK4 4930401G09Rik-201ENSMUST00000139500 637 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
RabggtaQ9JHK4 Aldoa-ps3-201ENSMUST00000217558 306 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
RabggtaQ9JHK4 Rilp-201ENSMUST00000042972 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
RabggtaQ9JHK4 Ngrn-201ENSMUST00000117989 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
RabggtaQ9JHK4 Zfp78-205ENSMUST00000208030 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
RabggtaQ9JHK4 Gm26697-201ENSMUST00000180898 1760 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
RabggtaQ9JHK4 Brms1l-201ENSMUST00000059250 2609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
RabggtaQ9JHK4 Prpsap1-201ENSMUST00000106391 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
RabggtaQ9JHK4 Zfyve9-202ENSMUST00000106657 6459 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
RabggtaQ9JHK4 Ssx2ip-204ENSMUST00000106153 3446 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
RabggtaQ9JHK4 Pfn2-201ENSMUST00000066882 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
RabggtaQ9JHK4 Tmem175-204ENSMUST00000146207 1686 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
RabggtaQ9JHK4 Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 1917 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
RabggtaQ9JHK4 Trpc4ap-202ENSMUST00000103140 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
RabggtaQ9JHK4 Elac2-203ENSMUST00000108697 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
RabggtaQ9JHK4 Pdx1-201ENSMUST00000085591 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
RabggtaQ9JHK4 Crct1-202ENSMUST00000107301 460 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
RabggtaQ9JHK4 Sap18-202ENSMUST00000111268 662 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
RabggtaQ9JHK4 Gpha2-202ENSMUST00000113526 762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
RabggtaQ9JHK4 Cyp4f41-ps-201ENSMUST00000126790 1077 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
RabggtaQ9JHK4 Srgn-205ENSMUST00000162161 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.2■□□□□ 0.82
RabggtaQ9JHK4 Mocs1-202ENSMUST00000165390 729 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
RabggtaQ9JHK4 Gpha2-201ENSMUST00000025698 609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
RabggtaQ9JHK4 Pdrg1-201ENSMUST00000028972 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
RabggtaQ9JHK4 Alkbh2-201ENSMUST00000053657 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
RabggtaQ9JHK4 C530025M09Rik-201ENSMUST00000099264 690 ntAPPRIS P1 BASIC20.2■□□□□ 0.82
RabggtaQ9JHK4 Spata18-202ENSMUST00000071077 1978 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
RabggtaQ9JHK4 Mbd6-202ENSMUST00000119078 4287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
RabggtaQ9JHK4 Bend3-202ENSMUST00000167488 6337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
RabggtaQ9JHK4 Agap3-205ENSMUST00000199856 2685 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
RabggtaQ9JHK4 Sim1-202ENSMUST00000219436 1687 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
RabggtaQ9JHK4 Camsap3-212ENSMUST00000208240 2572 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
RabggtaQ9JHK4 Asap2-203ENSMUST00000090834 5097 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
RabggtaQ9JHK4 Gm19554-201ENSMUST00000220934 2076 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
RabggtaQ9JHK4 Il9r-204ENSMUST00000142396 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
RabggtaQ9JHK4 Icam5-201ENSMUST00000019616 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
RabggtaQ9JHK4 Rpl14-201ENSMUST00000165532 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
RabggtaQ9JHK4 4930505N22Rik-201ENSMUST00000181820 945 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
RabggtaQ9JHK4 Snhg10-202ENSMUST00000222812 527 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
RabggtaQ9JHK4 Gm26709-203ENSMUST00000223260 715 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
RabggtaQ9JHK4 Ndufb8-201ENSMUST00000026222 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
RabggtaQ9JHK4 2810408A11Rik-203ENSMUST00000102580 1640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
RabggtaQ9JHK4 Eomes-202ENSMUST00000111763 2869 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
RabggtaQ9JHK4 Aurkb-201ENSMUST00000021277 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
RabggtaQ9JHK4 Nus1-201ENSMUST00000023830 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
RabggtaQ9JHK4 Tyw5-209ENSMUST00000162686 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
RabggtaQ9JHK4 Rtkn-201ENSMUST00000065512 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
RabggtaQ9JHK4 Alyref-201ENSMUST00000026125 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
RabggtaQ9JHK4 H2-Q7-202ENSMUST00000076256 1523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
RabggtaQ9JHK4 Trak1-209ENSMUST00000210798 5363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
RabggtaQ9JHK4 Gm14464-201ENSMUST00000119658 1254 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
RabggtaQ9JHK4 Aicda-202ENSMUST00000160685 1292 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
RabggtaQ9JHK4 Tctex1d4-201ENSMUST00000062206 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
RabggtaQ9JHK4 Arid1b-201ENSMUST00000092723 7150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
RabggtaQ9JHK4 Pced1a-202ENSMUST00000110277 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
RabggtaQ9JHK4 Fam71e1-202ENSMUST00000205359 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
RabggtaQ9JHK4 Gm16897-201ENSMUST00000180780 2492 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
RabggtaQ9JHK4 Ahcyl2-204ENSMUST00000115242 5152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
RabggtaQ9JHK4 Igsf9b-201ENSMUST00000115247 2857 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
RabggtaQ9JHK4 Gprc5c-203ENSMUST00000122967 1709 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
RabggtaQ9JHK4 Skp1a-203ENSMUST00000109072 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
RabggtaQ9JHK4 Ubald1-201ENSMUST00000037843 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
RabggtaQ9JHK4 Gas2-201ENSMUST00000051912 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
RabggtaQ9JHK4 Gm15952-201ENSMUST00000122858 490 ntTSL 3 BASIC20.17■□□□□ 0.82
RabggtaQ9JHK4 Gm18958-201ENSMUST00000174258 762 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
RabggtaQ9JHK4 Gm45631-201ENSMUST00000210318 1244 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
RabggtaQ9JHK4 Gm11373-201ENSMUST00000129791 2819 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
RabggtaQ9JHK4 Sema6d-203ENSMUST00000077847 6444 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
RabggtaQ9JHK4 Isyna1-201ENSMUST00000019283 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
RabggtaQ9JHK4 Gm26884-201ENSMUST00000181207 3074 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
RabggtaQ9JHK4 Hoxa10-201ENSMUST00000121043 1436 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
RabggtaQ9JHK4 Cep170b-202ENSMUST00000101018 6641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
RabggtaQ9JHK4 Gpd1-203ENSMUST00000162194 1515 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
RabggtaQ9JHK4 Hsf4-202ENSMUST00000163734 1630 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
RabggtaQ9JHK4 Tbc1d13-201ENSMUST00000044556 3595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
RabggtaQ9JHK4 Gm5414-201ENSMUST00000062879 1659 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
RabggtaQ9JHK4 Itsn2-201ENSMUST00000062580 5987 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
RabggtaQ9JHK4 Keap1-206ENSMUST00000216436 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
RabggtaQ9JHK4 Ccdc91-201ENSMUST00000032441 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
RabggtaQ9JHK4 Spout1-201ENSMUST00000100220 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
RabggtaQ9JHK4 Cxcl14-201ENSMUST00000021970 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
RabggtaQ9JHK4 Zdhhc16-201ENSMUST00000026154 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
RabggtaQ9JHK4 A730056A06Rik-201ENSMUST00000181299 2689 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
RabggtaQ9JHK4 Nr1h2-202ENSMUST00000107910 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
RabggtaQ9JHK4 Gm26620-201ENSMUST00000180542 817 ntAPPRIS P1 BASIC20.16■□□□□ 0.82
RabggtaQ9JHK4 Gm28033-201ENSMUST00000184224 96 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
RabggtaQ9JHK4 Gmnn-201ENSMUST00000006898 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
RabggtaQ9JHK4 Hist1h2af-201ENSMUST00000073261 399 ntAPPRIS P1 BASIC20.16■□□□□ 0.82
RabggtaQ9JHK4 Tacc3-203ENSMUST00000114426 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
RabggtaQ9JHK4 Alkbh5-201ENSMUST00000044250 5730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
RabggtaQ9JHK4 Htr6-202ENSMUST00000105802 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
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