Protein–RNA interactions for Protein: Q9JHB3

Timp4, Metalloproteinase inhibitor 4, mousemouse

Predictions only

Length 224 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Timp4Q9JHB3 Zfp524-201ENSMUST00000086349 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Timp4Q9JHB3 Ube2d1-201ENSMUST00000020085 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Timp4Q9JHB3 Pacsin1-204ENSMUST00000114873 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Timp4Q9JHB3 Sars2-201ENSMUST00000094632 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Timp4Q9JHB3 Bub3-201ENSMUST00000084502 2218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Timp4Q9JHB3 Nus1-201ENSMUST00000023830 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Timp4Q9JHB3 Dap3-201ENSMUST00000090938 4760 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Timp4Q9JHB3 Ube2q2-201ENSMUST00000059555 3456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Timp4Q9JHB3 Gnb1-202ENSMUST00000105616 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Timp4Q9JHB3 St3gal3-203ENSMUST00000106410 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Timp4Q9JHB3 Hist1h2bj-201ENSMUST00000110452 463 ntAPPRIS P1 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Timp4Q9JHB3 Hist1h2bp-202ENSMUST00000110473 621 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Timp4Q9JHB3 Lmo4-203ENSMUST00000121796 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Timp4Q9JHB3 Gm13563-202ENSMUST00000150375 851 ntTSL 3 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Timp4Q9JHB3 Panx2-203ENSMUST00000162424 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Timp4Q9JHB3 Gm17349-201ENSMUST00000163472 300 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Timp4Q9JHB3 Tppp3-202ENSMUST00000176419 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Timp4Q9JHB3 Krt27-201ENSMUST00000017732 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Timp4Q9JHB3 Kiss1r-202ENSMUST00000219745 979 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Timp4Q9JHB3 Hist1h2bm-201ENSMUST00000224651 524 ntAPPRIS P1 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Timp4Q9JHB3 Mrpl37-201ENSMUST00000030365 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Timp4Q9JHB3 Gm8258-201ENSMUST00000055593 1449 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
Timp4Q9JHB3 Mrpl43-201ENSMUST00000097715 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Timp4Q9JHB3 Cachd1-201ENSMUST00000030257 5765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Timp4Q9JHB3 Mmp15-201ENSMUST00000034243 5135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Timp4Q9JHB3 Auh-202ENSMUST00000110031 3235 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Timp4Q9JHB3 Rbm24-201ENSMUST00000037923 3086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Timp4Q9JHB3 Nlgn2-202ENSMUST00000108634 5568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Timp4Q9JHB3 Kcnt1-203ENSMUST00000114172 5219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Timp4Q9JHB3 Dap-201ENSMUST00000044524 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Timp4Q9JHB3 Galnt1-206ENSMUST00000170243 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Timp4Q9JHB3 Auh-201ENSMUST00000021913 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Timp4Q9JHB3 4933402J07Rik-201ENSMUST00000093342 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Timp4Q9JHB3 Znhit1-203ENSMUST00000111090 698 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Timp4Q9JHB3 Rab3d-202ENSMUST00000119055 694 ntTSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Timp4Q9JHB3 Cdpf1-204ENSMUST00000144067 761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Timp4Q9JHB3 Gm15545-203ENSMUST00000150613 1059 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Timp4Q9JHB3 Gm26039-201ENSMUST00000158152 144 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
Timp4Q9JHB3 Spata33-206ENSMUST00000212637 569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Timp4Q9JHB3 Iscu-201ENSMUST00000026937 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Timp4Q9JHB3 Il17a-201ENSMUST00000027061 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Timp4Q9JHB3 Hint2-201ENSMUST00000030192 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Timp4Q9JHB3 Grcc10-201ENSMUST00000004389 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Timp4Q9JHB3 2310039H08Rik-201ENSMUST00000071430 773 ntAPPRIS P1 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Timp4Q9JHB3 Pea15a-201ENSMUST00000013842 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Timp4Q9JHB3 Dapk1-207ENSMUST00000226059 5009 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
Timp4Q9JHB3 Arl1-202ENSMUST00000116234 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Timp4Q9JHB3 Stambpl1-201ENSMUST00000054956 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Timp4Q9JHB3 Ern1-204ENSMUST00000106801 1957 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Timp4Q9JHB3 Farsa-202ENSMUST00000109754 1795 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Timp4Q9JHB3 Gm26592-201ENSMUST00000180870 1730 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Timp4Q9JHB3 Ccdc126-201ENSMUST00000055559 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Timp4Q9JHB3 Cep57-208ENSMUST00000147115 2262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Timp4Q9JHB3 Arpc4-201ENSMUST00000156898 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Timp4Q9JHB3 Dennd2a-201ENSMUST00000036877 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Timp4Q9JHB3 Xxylt1-201ENSMUST00000055389 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Timp4Q9JHB3 Matn4-202ENSMUST00000103104 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Timp4Q9JHB3 Snx14-205ENSMUST00000173011 2238 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
Timp4Q9JHB3 Cog6-204ENSMUST00000193432 2078 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Timp4Q9JHB3 Dab2-208ENSMUST00000160134 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
Timp4Q9JHB3 Rnf208-202ENSMUST00000114355 1333 ntAPPRIS P1 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Timp4Q9JHB3 Ngrn-201ENSMUST00000117989 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Timp4Q9JHB3 Hnrnph3-203ENSMUST00000119814 682 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Timp4Q9JHB3 Zfp629-206ENSMUST00000132524 215 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Timp4Q9JHB3 Utp23-204ENSMUST00000161651 582 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Timp4Q9JHB3 Gm43791-201ENSMUST00000202914 468 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Timp4Q9JHB3 4930465K10Rik-201ENSMUST00000056675 1238 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
Timp4Q9JHB3 Olfr315-201ENSMUST00000081533 998 ntAPPRIS P1 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Timp4Q9JHB3 Mbp-201ENSMUST00000047865 2492 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Timp4Q9JHB3 Dbn1-202ENSMUST00000109921 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Timp4Q9JHB3 March3-202ENSMUST00000102912 1754 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Timp4Q9JHB3 Gm29514-202ENSMUST00000186665 2214 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Timp4Q9JHB3 Gm37519-201ENSMUST00000191687 2210 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
Timp4Q9JHB3 Ogg1-201ENSMUST00000032406 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Timp4Q9JHB3 Gga2-201ENSMUST00000033160 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Timp4Q9JHB3 Aldh7a1-201ENSMUST00000066208 1914 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Timp4Q9JHB3 Slc25a47-202ENSMUST00000221080 1890 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Timp4Q9JHB3 Arhgef25-212ENSMUST00000222006 1896 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Timp4Q9JHB3 Atp10a-201ENSMUST00000168747 5419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Timp4Q9JHB3 Bend6-202ENSMUST00000115161 2231 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Timp4Q9JHB3 Ndufaf8-201ENSMUST00000106223 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Timp4Q9JHB3 Rpl14-201ENSMUST00000165532 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Timp4Q9JHB3 Pdrg1-201ENSMUST00000028972 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Timp4Q9JHB3 Prss27-201ENSMUST00000059482 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Timp4Q9JHB3 2610301B20Rik-201ENSMUST00000080517 2116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Timp4Q9JHB3 Kcnab3-201ENSMUST00000018614 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Timp4Q9JHB3 Rasd1-201ENSMUST00000062405 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Timp4Q9JHB3 Asnsd1-201ENSMUST00000027264 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Timp4Q9JHB3 Cog2-201ENSMUST00000034460 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Timp4Q9JHB3 Usp13-202ENSMUST00000108228 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Timp4Q9JHB3 Dpy19l1-203ENSMUST00000142064 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Timp4Q9JHB3 Lrig1-202ENSMUST00000101126 4951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Timp4Q9JHB3 Cspg5-205ENSMUST00000199736 2107 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Timp4Q9JHB3 Pdss2-201ENSMUST00000095725 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Timp4Q9JHB3 Anapc5-218ENSMUST00000200645 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Timp4Q9JHB3 F12-201ENSMUST00000021948 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Timp4Q9JHB3 Med9-201ENSMUST00000081980 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Timp4Q9JHB3 Gm38282-201ENSMUST00000192751 695 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Timp4Q9JHB3 Olfr1232-201ENSMUST00000099785 936 ntAPPRIS P1 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Timp4Q9JHB3 Plekhm2-202ENSMUST00000084203 4136 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31 ms