Protein–RNA interactions for Protein: Q9ESM3

Hapln2, Hyaluronan and proteoglycan link protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 341 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hapln2Q9ESM3 Abcd4-201ENSMUST00000021666 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Hapln2Q9ESM3 Tmprss5-201ENSMUST00000070390 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Hapln2Q9ESM3 Sgsm1-204ENSMUST00000112325 2274 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Hapln2Q9ESM3 Gm45412-201ENSMUST00000210217 2275 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Hapln2Q9ESM3 Mycn-201ENSMUST00000043396 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Hapln2Q9ESM3 Mboat4-201ENSMUST00000095345 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Hapln2Q9ESM3 Rab37-202ENSMUST00000067754 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Hapln2Q9ESM3 Larp1-201ENSMUST00000071487 6614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Hapln2Q9ESM3 Sft2d2-201ENSMUST00000043338 5535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Hapln2Q9ESM3 H2-D1-202ENSMUST00000172785 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Hapln2Q9ESM3 Dhrs7-201ENSMUST00000021512 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Hapln2Q9ESM3 Gpr180-201ENSMUST00000022728 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Hapln2Q9ESM3 Snx25-203ENSMUST00000110378 3445 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Hapln2Q9ESM3 Svbp-203ENSMUST00000106345 684 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Hapln2Q9ESM3 Plxdc1-202ENSMUST00000107564 619 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Hapln2Q9ESM3 Gm13216-201ENSMUST00000117145 591 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Hapln2Q9ESM3 Tfam-203ENSMUST00000121685 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Hapln2Q9ESM3 Mrps18a-202ENSMUST00000123646 621 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Hapln2Q9ESM3 Fam98c-203ENSMUST00000134176 1189 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Hapln2Q9ESM3 Gm37292-201ENSMUST00000192062 758 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Hapln2Q9ESM3 Gm20049-201ENSMUST00000219950 730 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Hapln2Q9ESM3 Tmem54-201ENSMUST00000030575 1064 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Hapln2Q9ESM3 Tmem126a-201ENSMUST00000032844 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Hapln2Q9ESM3 Zfp446-202ENSMUST00000108535 2594 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Hapln2Q9ESM3 Rybp-201ENSMUST00000101118 4503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Hapln2Q9ESM3 Tlcd1-204ENSMUST00000127587 1412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Hapln2Q9ESM3 Atp6v1c1-201ENSMUST00000022904 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Hapln2Q9ESM3 Rbpms-203ENSMUST00000053251 2466 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Hapln2Q9ESM3 Chmp2b-201ENSMUST00000004965 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Hapln2Q9ESM3 Card10-202ENSMUST00000164826 4726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Hapln2Q9ESM3 Gas6-201ENSMUST00000033828 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Hapln2Q9ESM3 Gbx1-201ENSMUST00000088311 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Hapln2Q9ESM3 Dtwd2-203ENSMUST00000163590 2857 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Hapln2Q9ESM3 Akap8l-201ENSMUST00000050214 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Hapln2Q9ESM3 Wnt4-201ENSMUST00000045747 4194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Hapln2Q9ESM3 Gm26526-201ENSMUST00000181075 2927 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Hapln2Q9ESM3 Scrib-201ENSMUST00000002603 5599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Hapln2Q9ESM3 Dpep3-201ENSMUST00000034371 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Hapln2Q9ESM3 Wdr86-201ENSMUST00000068693 2364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Hapln2Q9ESM3 Nudt4-201ENSMUST00000020217 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Hapln2Q9ESM3 Nr1h2-204ENSMUST00000107912 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Hapln2Q9ESM3 Jtb-202ENSMUST00000119304 878 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Hapln2Q9ESM3 Gtf2a2-204ENSMUST00000119905 622 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Hapln2Q9ESM3 Gm20635-201ENSMUST00000176473 1287 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Hapln2Q9ESM3 H2-Eb1-201ENSMUST00000074557 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Hapln2Q9ESM3 Rpl38-202ENSMUST00000082092 345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Hapln2Q9ESM3 Snx16-201ENSMUST00000029047 2288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Hapln2Q9ESM3 Polr2c-201ENSMUST00000109521 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Hapln2Q9ESM3 Sharpin-201ENSMUST00000023211 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Hapln2Q9ESM3 Aipl1-201ENSMUST00000048207 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Hapln2Q9ESM3 Tssk6-201ENSMUST00000050373 1335 ntAPPRIS P1 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Hapln2Q9ESM3 9530080O11Rik-201ENSMUST00000137239 1475 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Hapln2Q9ESM3 Slc25a39-202ENSMUST00000107098 1606 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Hapln2Q9ESM3 Trp73-203ENSMUST00000105643 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Hapln2Q9ESM3 Katnbl1-201ENSMUST00000028552 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Hapln2Q9ESM3 Trim44-201ENSMUST00000102573 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Hapln2Q9ESM3 Mmp28-204ENSMUST00000119346 1517 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Hapln2Q9ESM3 Ppp2r1b-204ENSMUST00000174628 2195 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Hapln2Q9ESM3 Ccdc17-201ENSMUST00000051869 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Hapln2Q9ESM3 Shisa2-201ENSMUST00000053949 3119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Hapln2Q9ESM3 Ccdc126-201ENSMUST00000055559 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Hapln2Q9ESM3 D330023K18Rik-201ENSMUST00000133550 920 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Hapln2Q9ESM3 Ccdc58-202ENSMUST00000163352 970 ntTSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Hapln2Q9ESM3 Ccdc58-203ENSMUST00000164916 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Hapln2Q9ESM3 Park7-201ENSMUST00000030805 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Hapln2Q9ESM3 Htr5b-201ENSMUST00000055884 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Hapln2Q9ESM3 Dok4-201ENSMUST00000046461 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Hapln2Q9ESM3 Ube2i-207ENSMUST00000172868 2755 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Hapln2Q9ESM3 Stambp-206ENSMUST00000206400 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Hapln2Q9ESM3 Rassf8-203ENSMUST00000111704 5446 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Hapln2Q9ESM3 Ptpre-201ENSMUST00000073961 5410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Hapln2Q9ESM3 Gpr161-202ENSMUST00000178700 1827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Hapln2Q9ESM3 Arfip2-202ENSMUST00000084782 2254 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Hapln2Q9ESM3 Eva1c-202ENSMUST00000099543 1554 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Hapln2Q9ESM3 Chd5-202ENSMUST00000030775 9486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Hapln2Q9ESM3 Tle3-211ENSMUST00000161689 2836 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Hapln2Q9ESM3 AA465934-203ENSMUST00000177150 383 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Hapln2Q9ESM3 Mal-202ENSMUST00000028854 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Hapln2Q9ESM3 Dnaaf3-201ENSMUST00000094897 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Hapln2Q9ESM3 Zxdc-203ENSMUST00000113539 4864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Hapln2Q9ESM3 Opn4-202ENSMUST00000168444 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Hapln2Q9ESM3 Atp8b2-202ENSMUST00000107396 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Hapln2Q9ESM3 Mfsd4b1-201ENSMUST00000163705 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Hapln2Q9ESM3 Atad2b-201ENSMUST00000045664 8035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Hapln2Q9ESM3 Col15a1-202ENSMUST00000102917 5172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Hapln2Q9ESM3 Nr1h2-213ENSMUST00000167197 1944 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Hapln2Q9ESM3 Sytl3-201ENSMUST00000097430 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Hapln2Q9ESM3 Nfe2l3-201ENSMUST00000005103 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Hapln2Q9ESM3 Ccnl1-201ENSMUST00000029416 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Hapln2Q9ESM3 Fez2-202ENSMUST00000112487 2020 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Hapln2Q9ESM3 2810408A11Rik-203ENSMUST00000102580 1640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Hapln2Q9ESM3 2310002F09Rik-201ENSMUST00000181454 1607 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Hapln2Q9ESM3 Mrpl52-201ENSMUST00000010550 418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Hapln2Q9ESM3 Atp8a1-204ENSMUST00000113652 854 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Hapln2Q9ESM3 Gm12473-201ENSMUST00000137535 579 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Hapln2Q9ESM3 Tnfaip8l2-201ENSMUST00000013851 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Hapln2Q9ESM3 Gm28914-201ENSMUST00000188115 667 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Hapln2Q9ESM3 Gabarapl1-202ENSMUST00000204487 902 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Hapln2Q9ESM3 Gm4974-201ENSMUST00000209974 875 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Hapln2Q9ESM3 Dph1-201ENSMUST00000044949 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 71.1 ms