Protein–RNA interactions for Protein: Q9ESG4

Tmem27, Collectrin, mousemouse

Predictions only

Length 222 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmem27Q9ESG4 Agfg1-206ENSMUST00000189220 8044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Tmem27Q9ESG4 Pde8b-214ENSMUST00000172104 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Tmem27Q9ESG4 Kcmf1-201ENSMUST00000068697 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Tmem27Q9ESG4 Cacna1c-216ENSMUST00000188522 7338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Tmem27Q9ESG4 Sh2b1-202ENSMUST00000205340 3366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Tmem27Q9ESG4 Cdk17-201ENSMUST00000069965 3615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Tmem27Q9ESG4 Ppp1r8-202ENSMUST00000105919 1090 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Tmem27Q9ESG4 Immp2l-203ENSMUST00000134965 977 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Tmem27Q9ESG4 1700007L15Rik-201ENSMUST00000180923 737 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Tmem27Q9ESG4 Gm29241-201ENSMUST00000189260 1096 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Tmem27Q9ESG4 Dtnbp1-208ENSMUST00000222805 1231 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Tmem27Q9ESG4 Nfkbid-201ENSMUST00000046177 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Tmem27Q9ESG4 Nploc4-202ENSMUST00000103017 4025 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Tmem27Q9ESG4 Zfp691-204ENSMUST00000179290 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Tmem27Q9ESG4 Gm26526-201ENSMUST00000181075 2927 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Tmem27Q9ESG4 Nsmf-207ENSMUST00000116574 2863 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Tmem27Q9ESG4 Mmd-202ENSMUST00000107887 1654 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Tmem27Q9ESG4 Bcs1l-202ENSMUST00000113732 1679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Tmem27Q9ESG4 Gm26917-202ENSMUST00000192833 3329 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Tmem27Q9ESG4 Pacsin3-202ENSMUST00000059566 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Tmem27Q9ESG4 Synpo-201ENSMUST00000097566 5060 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Tmem27Q9ESG4 1700066B19Rik-201ENSMUST00000097617 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Tmem27Q9ESG4 Zic1-201ENSMUST00000034927 5606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Tmem27Q9ESG4 Car2-201ENSMUST00000029078 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Tmem27Q9ESG4 Tubb4b-ps1-201ENSMUST00000179460 1336 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Tmem27Q9ESG4 Npnt-202ENSMUST00000042744 4619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Tmem27Q9ESG4 Cds2-202ENSMUST00000103181 8396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Tmem27Q9ESG4 Pigp-202ENSMUST00000113906 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Tmem27Q9ESG4 Josd2-203ENSMUST00000118493 922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Tmem27Q9ESG4 Moap1-202ENSMUST00000178384 1284 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Tmem27Q9ESG4 Tcap-201ENSMUST00000008021 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Tmem27Q9ESG4 Fcho1-209ENSMUST00000146100 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Tmem27Q9ESG4 Zdhhc2-201ENSMUST00000049389 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Tmem27Q9ESG4 Qprt-201ENSMUST00000032912 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Tmem27Q9ESG4 Rgs9-201ENSMUST00000020920 2434 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Tmem27Q9ESG4 Inpp5e-202ENSMUST00000114090 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Tmem27Q9ESG4 Gm36858-201ENSMUST00000194501 2391 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Tmem27Q9ESG4 Atg5-201ENSMUST00000039286 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Tmem27Q9ESG4 Zfp512b-201ENSMUST00000108789 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Tmem27Q9ESG4 Mycl-201ENSMUST00000030407 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Tmem27Q9ESG4 Matn4-201ENSMUST00000103103 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Tmem27Q9ESG4 Was-201ENSMUST00000033505 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Tmem27Q9ESG4 Gldc-201ENSMUST00000025778 3754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Tmem27Q9ESG4 Tm7sf2-202ENSMUST00000113543 1498 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Tmem27Q9ESG4 Slc16a3-202ENSMUST00000100130 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Tmem27Q9ESG4 Cxcl14-201ENSMUST00000021970 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Tmem27Q9ESG4 Wdfy1-202ENSMUST00000113510 704 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Tmem27Q9ESG4 Wdfy1-203ENSMUST00000113511 704 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Tmem27Q9ESG4 Gadd45b-201ENSMUST00000015456 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Tmem27Q9ESG4 Gm18671-201ENSMUST00000214826 683 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Tmem27Q9ESG4 Tmem270-201ENSMUST00000047305 932 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Tmem27Q9ESG4 Wdfy1-201ENSMUST00000048820 717 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Tmem27Q9ESG4 Pigz-201ENSMUST00000052174 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Tmem27Q9ESG4 Mrpl57-201ENSMUST00000022538 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Tmem27Q9ESG4 Zfp326-201ENSMUST00000031227 2667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Tmem27Q9ESG4 Bicdl1-201ENSMUST00000055408 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Tmem27Q9ESG4 Elk4-202ENSMUST00000086556 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Tmem27Q9ESG4 Large2-215ENSMUST00000176810 2477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Tmem27Q9ESG4 Gopc-202ENSMUST00000105475 4317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Tmem27Q9ESG4 Dclk2-208ENSMUST00000194452 2066 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Tmem27Q9ESG4 Cyb5a-204ENSMUST00000160180 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Tmem27Q9ESG4 Krt84-201ENSMUST00000023720 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Tmem27Q9ESG4 Dtx2-201ENSMUST00000005072 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Tmem27Q9ESG4 Sphk1-206ENSMUST00000106388 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Tmem27Q9ESG4 Vrk2-201ENSMUST00000078362 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Tmem27Q9ESG4 Nosip-201ENSMUST00000003513 1814 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Tmem27Q9ESG4 Gm26657-201ENSMUST00000181745 1308 ntAPPRIS P1 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Tmem27Q9ESG4 Iqgap2-201ENSMUST00000068603 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Tmem27Q9ESG4 Shc1-202ENSMUST00000094378 2617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Tmem27Q9ESG4 Gm11696-201ENSMUST00000070956 2765 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Tmem27Q9ESG4 Jmy-201ENSMUST00000065537 8776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Tmem27Q9ESG4 Txndc11-201ENSMUST00000038424 3095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Tmem27Q9ESG4 Eif1a-202ENSMUST00000168382 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Tmem27Q9ESG4 Crct1-202ENSMUST00000107301 460 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Tmem27Q9ESG4 Gm11643-201ENSMUST00000119578 864 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Tmem27Q9ESG4 Gm3331-201ENSMUST00000183423 1017 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Tmem27Q9ESG4 Gm40460-201ENSMUST00000211591 735 ntAPPRIS P1 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Tmem27Q9ESG4 Psmb5-201ENSMUST00000022803 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Tmem27Q9ESG4 Sds-201ENSMUST00000066540 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Tmem27Q9ESG4 Hist2h2aa2-201ENSMUST00000074976 528 ntAPPRIS P1 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Tmem27Q9ESG4 Hist2h2aa1-201ENSMUST00000078756 586 ntAPPRIS P1 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Tmem27Q9ESG4 Ube2j2-213ENSMUST00000166489 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Tmem27Q9ESG4 Klhl40-201ENSMUST00000098272 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Tmem27Q9ESG4 B3gnt6-201ENSMUST00000098278 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Tmem27Q9ESG4 4430402I18Rik-205ENSMUST00000162110 1559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Tmem27Q9ESG4 Ddhd1-201ENSMUST00000051310 5012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Tmem27Q9ESG4 Impdh1-202ENSMUST00000159124 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Tmem27Q9ESG4 Rab11fip3-202ENSMUST00000120691 5103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Tmem27Q9ESG4 Plxnd1-201ENSMUST00000015511 6907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Tmem27Q9ESG4 Lhfpl4-201ENSMUST00000162280 4762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Tmem27Q9ESG4 Shh-201ENSMUST00000002708 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Tmem27Q9ESG4 Pigs-201ENSMUST00000048073 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Tmem27Q9ESG4 Ankra2-204ENSMUST00000150352 2217 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Tmem27Q9ESG4 Tnfrsf13c-201ENSMUST00000089161 1906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Tmem27Q9ESG4 Fbrsl1-202ENSMUST00000069483 4720 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Tmem27Q9ESG4 Hmces-201ENSMUST00000032141 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Tmem27Q9ESG4 Fam213a-202ENSMUST00000118466 1567 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Tmem27Q9ESG4 Fmr1-205ENSMUST00000114656 4257 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Tmem27Q9ESG4 Gm16386-201ENSMUST00000181397 1423 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Tmem27Q9ESG4 Gm45472-201ENSMUST00000211295 1426 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.4 ms