Protein–RNA interactions for Protein: Q9ERT2

Trhr2, Thyrotropin-releasing hormone receptor 2, mousemouse

Predictions only

Length 382 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trhr2Q9ERT2 Kcnb1-201ENSMUST00000059826 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Trhr2Q9ERT2 Odf2-211ENSMUST00000113767 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Trhr2Q9ERT2 Fbxo45-201ENSMUST00000042732 4179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Trhr2Q9ERT2 Erich2-201ENSMUST00000100041 1749 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Trhr2Q9ERT2 Tpm2-203ENSMUST00000107914 1164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Trhr2Q9ERT2 Gm17092-201ENSMUST00000166606 698 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Trhr2Q9ERT2 Gm34933-201ENSMUST00000203245 1067 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Trhr2Q9ERT2 Aldoa-ps3-201ENSMUST00000217558 306 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
Trhr2Q9ERT2 Pomp-201ENSMUST00000031654 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Trhr2Q9ERT2 Tbcb-201ENSMUST00000006254 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Trhr2Q9ERT2 Usp21-201ENSMUST00000065941 2219 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Trhr2Q9ERT2 Htr5b-201ENSMUST00000055884 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Trhr2Q9ERT2 Nrxn2-208ENSMUST00000137166 6314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
Trhr2Q9ERT2 March3-202ENSMUST00000102912 1754 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Trhr2Q9ERT2 Runx2-204ENSMUST00000159943 2316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Trhr2Q9ERT2 Tmem164-201ENSMUST00000087333 5149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Trhr2Q9ERT2 Gpsm3-201ENSMUST00000038244 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Trhr2Q9ERT2 Stk32c-202ENSMUST00000165870 1883 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Trhr2Q9ERT2 Fbxo17-203ENSMUST00000108279 1563 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Trhr2Q9ERT2 Gm3468-201ENSMUST00000165193 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Trhr2Q9ERT2 Gm2956-201ENSMUST00000177786 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Trhr2Q9ERT2 Ccdc85c-202ENSMUST00000222310 4298 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Trhr2Q9ERT2 Paqr7-201ENSMUST00000081525 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Trhr2Q9ERT2 Srpx-202ENSMUST00000115543 1218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Trhr2Q9ERT2 Gm27742-201ENSMUST00000184667 60 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
Trhr2Q9ERT2 Fuz-206ENSMUST00000207485 1140 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Trhr2Q9ERT2 Otx2os1-206ENSMUST00000228153 787 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
Trhr2Q9ERT2 Ncoa5-203ENSMUST00000122070 3117 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Trhr2Q9ERT2 AU019823-202ENSMUST00000145139 2805 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Trhr2Q9ERT2 4930503L19Rik-201ENSMUST00000067556 2291 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Trhr2Q9ERT2 Osbpl1a-207ENSMUST00000121808 3030 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Trhr2Q9ERT2 Gm37194-201ENSMUST00000193092 3031 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
Trhr2Q9ERT2 Donson-201ENSMUST00000023682 2360 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Trhr2Q9ERT2 Hdhd2-202ENSMUST00000097521 1716 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Trhr2Q9ERT2 Arid3b-202ENSMUST00000098686 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Trhr2Q9ERT2 Lrch2-201ENSMUST00000112819 4892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Trhr2Q9ERT2 Cog6-204ENSMUST00000193432 2078 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Trhr2Q9ERT2 Gls2-201ENSMUST00000044776 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Trhr2Q9ERT2 Syncrip-205ENSMUST00000173801 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Trhr2Q9ERT2 Rprd1b-207ENSMUST00000152452 1910 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Trhr2Q9ERT2 Gm38534-201ENSMUST00000206566 1909 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Trhr2Q9ERT2 Surf4-201ENSMUST00000015011 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Trhr2Q9ERT2 Fam78b-205ENSMUST00000165874 4986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Trhr2Q9ERT2 Rsu1-201ENSMUST00000028059 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Trhr2Q9ERT2 Pde7a-202ENSMUST00000099195 6298 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Trhr2Q9ERT2 Gm16075-201ENSMUST00000135873 361 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
Trhr2Q9ERT2 Cd70-201ENSMUST00000019633 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Trhr2Q9ERT2 Upk3a-201ENSMUST00000023070 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Trhr2Q9ERT2 Hist1h2ai-201ENSMUST00000070124 393 ntAPPRIS P1 BASIC18■□□□□ 0.47
Trhr2Q9ERT2 Hist1h2an-201ENSMUST00000091751 393 ntAPPRIS P1 BASIC18■□□□□ 0.47
Trhr2Q9ERT2 Akt2-205ENSMUST00000108344 4544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Trhr2Q9ERT2 Ythdf1-201ENSMUST00000037299 3184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Trhr2Q9ERT2 Smim15-205ENSMUST00000225972 2097 ntAPPRIS P1 BASIC18■□□□□ 0.47
Trhr2Q9ERT2 4932702P03Rik-201ENSMUST00000138447 1482 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Trhr2Q9ERT2 Cxcl14-202ENSMUST00000224801 1467 ntBASIC18■□□□□ 0.47
Trhr2Q9ERT2 Uchl5-201ENSMUST00000018333 1845 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Trhr2Q9ERT2 3110002H16Rik-201ENSMUST00000025276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Trhr2Q9ERT2 Mprip-202ENSMUST00000072031 8718 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Trhr2Q9ERT2 Isyna1-204ENSMUST00000210005 1914 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Trhr2Q9ERT2 Dap-201ENSMUST00000044524 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Trhr2Q9ERT2 Cyb5d2-201ENSMUST00000079681 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Trhr2Q9ERT2 Gm19569-202ENSMUST00000184658 1305 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Trhr2Q9ERT2 Lysmd4-209ENSMUST00000208998 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Trhr2Q9ERT2 Map3k21-201ENSMUST00000034316 5693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Trhr2Q9ERT2 Gm26592-201ENSMUST00000180870 1730 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Trhr2Q9ERT2 Kcns1-201ENSMUST00000045196 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Trhr2Q9ERT2 Hist1h4a-201ENSMUST00000102964 539 ntAPPRIS P1 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Trhr2Q9ERT2 Tm4sf19-201ENSMUST00000115149 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Trhr2Q9ERT2 4933412L11Rik-201ENSMUST00000203702 1044 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
Trhr2Q9ERT2 Gm18669-201ENSMUST00000216049 778 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
Trhr2Q9ERT2 AC122351.1-201ENSMUST00000220467 126 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
Trhr2Q9ERT2 Ift74-201ENSMUST00000030311 2139 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Trhr2Q9ERT2 Lhfp-201ENSMUST00000059562 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Trhr2Q9ERT2 9930012K11Rik-205ENSMUST00000153871 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Trhr2Q9ERT2 9930012K11Rik-201ENSMUST00000058240 1986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Trhr2Q9ERT2 Zic1-202ENSMUST00000065360 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Trhr2Q9ERT2 Fam109a-201ENSMUST00000056654 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Trhr2Q9ERT2 Irx5-201ENSMUST00000034184 2450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Trhr2Q9ERT2 Magi2-202ENSMUST00000101558 6530 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Trhr2Q9ERT2 L3hypdh-201ENSMUST00000019862 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Trhr2Q9ERT2 Dnaaf5-203ENSMUST00000196441 2426 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Trhr2Q9ERT2 Rps27a-202ENSMUST00000102845 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Trhr2Q9ERT2 Wbp2-202ENSMUST00000106444 1012 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Trhr2Q9ERT2 Olfr129-201ENSMUST00000122318 993 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
Trhr2Q9ERT2 Gm16295-201ENSMUST00000139512 643 ntTSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Trhr2Q9ERT2 Rerg-204ENSMUST00000149100 635 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Trhr2Q9ERT2 1500009L16Rik-201ENSMUST00000150459 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Trhr2Q9ERT2 Hist1h2bc-201ENSMUST00000018246 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Trhr2Q9ERT2 Hist1h2ba-201ENSMUST00000052776 384 ntAPPRIS P1 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Trhr2Q9ERT2 BC049762-201ENSMUST00000054226 760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Trhr2Q9ERT2 Gm15408-201ENSMUST00000124198 1379 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Trhr2Q9ERT2 Ppt2-205ENSMUST00000169067 1392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Trhr2Q9ERT2 Bnip2-203ENSMUST00000117450 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Trhr2Q9ERT2 Platr31-201ENSMUST00000180653 1466 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Trhr2Q9ERT2 Cryl1-201ENSMUST00000022517 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Trhr2Q9ERT2 Haus4-201ENSMUST00000022784 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Trhr2Q9ERT2 Vrk2-201ENSMUST00000078362 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Trhr2Q9ERT2 Nsg1-201ENSMUST00000031009 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Trhr2Q9ERT2 Pigw-201ENSMUST00000067058 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Trhr2Q9ERT2 Pds5a-209ENSMUST00000201948 8934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.7 ms