Protein–RNA interactions for Protein: Q9ERB5

Slco1c1, Solute carrier organic anion transporter family member 1C1, mousemouse

Predictions only

Length 715 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slco1c1Q9ERB5 Atp2c1-204ENSMUST00000112558 5642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Slco1c1Q9ERB5 Gprin1-202ENSMUST00000135343 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Slco1c1Q9ERB5 Afg1l-201ENSMUST00000041024 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Slco1c1Q9ERB5 A830073O21Rik-202ENSMUST00000205693 3096 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Slco1c1Q9ERB5 Pard3-226ENSMUST00000162907 4682 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Slco1c1Q9ERB5 Gpr137b-201ENSMUST00000021738 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Slco1c1Q9ERB5 Hmga1-202ENSMUST00000117254 1328 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Slco1c1Q9ERB5 Josd2-205ENSMUST00000120852 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Slco1c1Q9ERB5 Gm11527-201ENSMUST00000153795 596 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Slco1c1Q9ERB5 Gm10698-201ENSMUST00000182663 604 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Slco1c1Q9ERB5 Gm37055-201ENSMUST00000191866 133 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Slco1c1Q9ERB5 Atp5c1-201ENSMUST00000026887 1060 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Slco1c1Q9ERB5 Plpp1-202ENSMUST00000070951 1272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Slco1c1Q9ERB5 Fam57b-207ENSMUST00000207020 1777 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Slco1c1Q9ERB5 Meox1-201ENSMUST00000057054 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Slco1c1Q9ERB5 Zufsp-202ENSMUST00000218055 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Slco1c1Q9ERB5 9330151L19Rik-201ENSMUST00000181850 2545 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Slco1c1Q9ERB5 Dnajc19-201ENSMUST00000011029 2499 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Slco1c1Q9ERB5 Pitpnm2-210ENSMUST00000162812 6952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Slco1c1Q9ERB5 Ctsf-201ENSMUST00000119694 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Slco1c1Q9ERB5 Nek2-201ENSMUST00000027931 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Slco1c1Q9ERB5 Hand1-201ENSMUST00000036917 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Slco1c1Q9ERB5 Ube2k-201ENSMUST00000142407 4893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Slco1c1Q9ERB5 Ulk1-201ENSMUST00000031490 5213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Slco1c1Q9ERB5 Lrg1-201ENSMUST00000041357 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Slco1c1Q9ERB5 Gm38345-201ENSMUST00000192635 1748 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Slco1c1Q9ERB5 Dnajb9-201ENSMUST00000015049 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Slco1c1Q9ERB5 Col15a1-201ENSMUST00000082303 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Slco1c1Q9ERB5 5031425F14Rik-201ENSMUST00000127920 2098 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Slco1c1Q9ERB5 Zfp384-208ENSMUST00000112428 3132 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Slco1c1Q9ERB5 Gm2399-201ENSMUST00000104944 225 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Slco1c1Q9ERB5 Gm16127-201ENSMUST00000131619 234 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Slco1c1Q9ERB5 Ost4-201ENSMUST00000132034 576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Slco1c1Q9ERB5 Tnfaip8l2-201ENSMUST00000013851 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Slco1c1Q9ERB5 Gm20390-201ENSMUST00000170303 991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Slco1c1Q9ERB5 Fitm1-201ENSMUST00000022826 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Slco1c1Q9ERB5 Crybb1-201ENSMUST00000031286 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Slco1c1Q9ERB5 Acbd4-203ENSMUST00000107040 1959 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Slco1c1Q9ERB5 Adsl-204ENSMUST00000164806 1595 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Slco1c1Q9ERB5 A430078I02Rik-202ENSMUST00000154066 2233 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Slco1c1Q9ERB5 Dnaaf3-201ENSMUST00000094897 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Slco1c1Q9ERB5 Krt81-201ENSMUST00000061185 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Slco1c1Q9ERB5 Tor2a-201ENSMUST00000009707 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Slco1c1Q9ERB5 D17Wsu92e-203ENSMUST00000114863 3828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Slco1c1Q9ERB5 Sox14-201ENSMUST00000054819 2065 ntAPPRIS P1 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Slco1c1Q9ERB5 Tubgcp4-203ENSMUST00000110658 4250 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Slco1c1Q9ERB5 Galk1-201ENSMUST00000021114 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Slco1c1Q9ERB5 Gnao1-207ENSMUST00000138659 5526 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Slco1c1Q9ERB5 Gm44618-201ENSMUST00000208431 2262 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Slco1c1Q9ERB5 Add1-204ENSMUST00000114338 4007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Slco1c1Q9ERB5 Mdfic-202ENSMUST00000120512 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Slco1c1Q9ERB5 Homez-202ENSMUST00000142283 4713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Slco1c1Q9ERB5 Snca-201ENSMUST00000114268 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Slco1c1Q9ERB5 Gm15378-201ENSMUST00000121894 207 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Slco1c1Q9ERB5 Gm12979-201ENSMUST00000145488 405 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Slco1c1Q9ERB5 Arfip2-212ENSMUST00000209550 1141 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Slco1c1Q9ERB5 Arfip2-214ENSMUST00000210911 938 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Slco1c1Q9ERB5 2510002D24Rik-201ENSMUST00000055413 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Slco1c1Q9ERB5 2210016L21Rik-201ENSMUST00000031538 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Slco1c1Q9ERB5 Tsc22d1-214ENSMUST00000177207 1476 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Slco1c1Q9ERB5 Tub-201ENSMUST00000033341 5997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Slco1c1Q9ERB5 Nagpa-203ENSMUST00000147567 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Slco1c1Q9ERB5 Sphk1-201ENSMUST00000063396 2659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Slco1c1Q9ERB5 March11-203ENSMUST00000152841 1365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Slco1c1Q9ERB5 Dhrs7-201ENSMUST00000021512 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Slco1c1Q9ERB5 Katnbl1-201ENSMUST00000028552 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Slco1c1Q9ERB5 Ankrd13b-201ENSMUST00000037593 3105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Slco1c1Q9ERB5 Wdr1-201ENSMUST00000005234 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Slco1c1Q9ERB5 Rnpc3-203ENSMUST00000106536 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Slco1c1Q9ERB5 Kcmf1-201ENSMUST00000068697 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Slco1c1Q9ERB5 Arid3c-202ENSMUST00000150809 1327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Slco1c1Q9ERB5 Gm26803-201ENSMUST00000181705 2011 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Slco1c1Q9ERB5 Rab6a-202ENSMUST00000098252 3110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Slco1c1Q9ERB5 Neurl1a-202ENSMUST00000111808 4157 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Slco1c1Q9ERB5 Ntrk1-201ENSMUST00000029712 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Slco1c1Q9ERB5 Mmp28-201ENSMUST00000021020 2311 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Slco1c1Q9ERB5 Abhd5-204ENSMUST00000156520 3157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Slco1c1Q9ERB5 Ttc14-203ENSMUST00000117915 4913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Slco1c1Q9ERB5 Gclm-201ENSMUST00000029769 5589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Slco1c1Q9ERB5 Pcbp1-201ENSMUST00000053015 1830 ntAPPRIS P1 BASIC16.52■□□□□ 0.23
Slco1c1Q9ERB5 Matk-201ENSMUST00000105328 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Slco1c1Q9ERB5 Nsfl1c-203ENSMUST00000103160 1369 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Slco1c1Q9ERB5 A930003O13Rik-203ENSMUST00000199056 1955 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Slco1c1Q9ERB5 Clasrp-201ENSMUST00000086041 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Slco1c1Q9ERB5 Plxnd1-201ENSMUST00000015511 6907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Slco1c1Q9ERB5 Fmr1-205ENSMUST00000114656 4257 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Slco1c1Q9ERB5 Arhgef25-212ENSMUST00000222006 1896 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Slco1c1Q9ERB5 Pacsin3-201ENSMUST00000028694 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Slco1c1Q9ERB5 Pigp-202ENSMUST00000113906 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Slco1c1Q9ERB5 AC122465.1-201ENSMUST00000220813 1209 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Slco1c1Q9ERB5 Grrp1-201ENSMUST00000060050 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Slco1c1Q9ERB5 Hbs1l-203ENSMUST00000092674 2625 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Slco1c1Q9ERB5 Vps53-202ENSMUST00000094015 2645 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Slco1c1Q9ERB5 Map1s-201ENSMUST00000019405 3314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Slco1c1Q9ERB5 Rev1-201ENSMUST00000027251 4262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Slco1c1Q9ERB5 Ing1-202ENSMUST00000209565 1971 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Slco1c1Q9ERB5 Podxl2-201ENSMUST00000038409 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Slco1c1Q9ERB5 Etv6-201ENSMUST00000081028 5545 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Slco1c1Q9ERB5 Phb-204ENSMUST00000125172 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Slco1c1Q9ERB5 Relt-201ENSMUST00000008462 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.6 ms