Protein–RNA interactions for Protein: Q9EQR4

Clca3a2, Chloride channel accessory 3A2, mousemouse

Predictions only

Length 902 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Clca3a2Q9EQR4 4930426L09Rik-201ENSMUST00000028069 1459 ntAPPRIS P1 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Clca3a2Q9EQR4 Large1-202ENSMUST00000119826 4647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Clca3a2Q9EQR4 D730003I15Rik-202ENSMUST00000194375 1667 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Clca3a2Q9EQR4 Fam57b-207ENSMUST00000207020 1777 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Clca3a2Q9EQR4 Nxnl1-201ENSMUST00000048243 2285 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Clca3a2Q9EQR4 Mirt1-201ENSMUST00000180489 5292 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Clca3a2Q9EQR4 Atad3a-201ENSMUST00000030903 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Clca3a2Q9EQR4 Nagpa-203ENSMUST00000147567 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Clca3a2Q9EQR4 P2ry1-203ENSMUST00000193943 2203 ntAPPRIS P1 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Clca3a2Q9EQR4 Scamp4-201ENSMUST00000079883 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Clca3a2Q9EQR4 Csf3-201ENSMUST00000038886 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Clca3a2Q9EQR4 Praf2-201ENSMUST00000033489 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Clca3a2Q9EQR4 Snx21-201ENSMUST00000056181 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Clca3a2Q9EQR4 Dbn1-202ENSMUST00000109921 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Clca3a2Q9EQR4 Donson-201ENSMUST00000023682 2360 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Clca3a2Q9EQR4 Cdipt-201ENSMUST00000032920 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Clca3a2Q9EQR4 Kcnab3-201ENSMUST00000018614 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Clca3a2Q9EQR4 Tm4sf19-201ENSMUST00000115149 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Clca3a2Q9EQR4 Ubtf-207ENSMUST00000128016 1062 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Clca3a2Q9EQR4 Gm16127-201ENSMUST00000131619 234 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Clca3a2Q9EQR4 B430219N15Rik-201ENSMUST00000147230 835 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Clca3a2Q9EQR4 Arhgef4-208ENSMUST00000211073 171 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Clca3a2Q9EQR4 Stk11-210ENSMUST00000213772 1239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Clca3a2Q9EQR4 Rps12-206ENSMUST00000218221 460 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Clca3a2Q9EQR4 Stambpl1-201ENSMUST00000054956 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Clca3a2Q9EQR4 Lcorl-202ENSMUST00000045586 5708 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Clca3a2Q9EQR4 Tcf7l2-203ENSMUST00000111646 2839 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Clca3a2Q9EQR4 Zkscan14-201ENSMUST00000031632 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Clca3a2Q9EQR4 Smim3-201ENSMUST00000042710 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Clca3a2Q9EQR4 Tbx2-201ENSMUST00000000095 3626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Clca3a2Q9EQR4 Tnfsf14-201ENSMUST00000005976 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Clca3a2Q9EQR4 Fam71e1-202ENSMUST00000205359 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Clca3a2Q9EQR4 Carmn-201ENSMUST00000181155 1778 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Clca3a2Q9EQR4 Tmem175-204ENSMUST00000146207 1686 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Clca3a2Q9EQR4 Krt13-201ENSMUST00000007275 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Clca3a2Q9EQR4 Slc35g1-201ENSMUST00000054098 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Clca3a2Q9EQR4 Nr1h2-213ENSMUST00000167197 1944 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Clca3a2Q9EQR4 Prss12-201ENSMUST00000029603 2602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Clca3a2Q9EQR4 Grk6-201ENSMUST00000001115 2994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Clca3a2Q9EQR4 Ggt6-202ENSMUST00000100903 1387 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Clca3a2Q9EQR4 Tbc1d9-202ENSMUST00000093393 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Clca3a2Q9EQR4 Gm7638-201ENSMUST00000121348 967 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Clca3a2Q9EQR4 Gng2-202ENSMUST00000159028 458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Clca3a2Q9EQR4 Lysmd2-201ENSMUST00000034702 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Clca3a2Q9EQR4 Ostm1-201ENSMUST00000040718 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Clca3a2Q9EQR4 Fst-201ENSMUST00000022287 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Clca3a2Q9EQR4 Prss54-205ENSMUST00000213096 1501 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Clca3a2Q9EQR4 Atp2a2-201ENSMUST00000031423 4486 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Clca3a2Q9EQR4 Rasl10b-204ENSMUST00000175848 3249 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Clca3a2Q9EQR4 Trpc4ap-201ENSMUST00000041059 3204 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Clca3a2Q9EQR4 Pgm3-202ENSMUST00000072585 1920 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Clca3a2Q9EQR4 Ntrk1-201ENSMUST00000029712 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Clca3a2Q9EQR4 Impdh1-210ENSMUST00000162739 2471 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Clca3a2Q9EQR4 Blmh-201ENSMUST00000021197 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Clca3a2Q9EQR4 Ube2z-201ENSMUST00000100528 3997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Clca3a2Q9EQR4 Sertad4-204ENSMUST00000155579 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Clca3a2Q9EQR4 Dnaja3-202ENSMUST00000115854 2505 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Clca3a2Q9EQR4 Nkx2-2-203ENSMUST00000109970 1053 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Clca3a2Q9EQR4 Echdc2-204ENSMUST00000116309 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Clca3a2Q9EQR4 Arfip2-212ENSMUST00000209550 1141 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Clca3a2Q9EQR4 Cnih3-204ENSMUST00000209607 564 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Clca3a2Q9EQR4 Arfip2-214ENSMUST00000210911 938 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Clca3a2Q9EQR4 Rps2-ps3-201ENSMUST00000213102 832 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Clca3a2Q9EQR4 AC124601.2-201ENSMUST00000222888 759 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Clca3a2Q9EQR4 Il3ra-202ENSMUST00000223589 738 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Clca3a2Q9EQR4 Otx2os1-204ENSMUST00000227221 751 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Clca3a2Q9EQR4 Fgfr1op2-202ENSMUST00000058245 918 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Clca3a2Q9EQR4 Wdr33-202ENSMUST00000082319 1152 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Clca3a2Q9EQR4 Crb3-202ENSMUST00000097299 1206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Clca3a2Q9EQR4 Gnao1-207ENSMUST00000138659 5526 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Clca3a2Q9EQR4 Fbrsl1-206ENSMUST00000198834 2571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Clca3a2Q9EQR4 Pagr1a-202ENSMUST00000200948 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Clca3a2Q9EQR4 Gm42742-205ENSMUST00000202798 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Clca3a2Q9EQR4 Nfkbib-201ENSMUST00000032815 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Clca3a2Q9EQR4 Tfap2a-209ENSMUST00000225180 1828 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Clca3a2Q9EQR4 Gnao1-201ENSMUST00000034198 2948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Clca3a2Q9EQR4 Frmd5-203ENSMUST00000121219 2262 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Clca3a2Q9EQR4 Sars2-201ENSMUST00000094632 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Clca3a2Q9EQR4 Ccdc17-201ENSMUST00000051869 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Clca3a2Q9EQR4 2810408A11Rik-203ENSMUST00000102580 1640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Clca3a2Q9EQR4 Slc25a3-201ENSMUST00000076694 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Clca3a2Q9EQR4 Ankra2-203ENSMUST00000123924 2328 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Clca3a2Q9EQR4 Tekt1-203ENSMUST00000108503 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Clca3a2Q9EQR4 Fxr1-201ENSMUST00000001620 2459 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Clca3a2Q9EQR4 Fiz1-203ENSMUST00000167804 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Clca3a2Q9EQR4 Wnt10b-207ENSMUST00000228594 1510 ntAPPRIS P1 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Clca3a2Q9EQR4 Gm9954-202ENSMUST00000198686 4725 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Clca3a2Q9EQR4 Atxn7-201ENSMUST00000022257 6853 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Clca3a2Q9EQR4 Trim37-201ENSMUST00000041282 5632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Clca3a2Q9EQR4 Mrps18c-203ENSMUST00000112901 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Clca3a2Q9EQR4 Akip1-201ENSMUST00000033335 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Clca3a2Q9EQR4 Mrps12-201ENSMUST00000056078 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Clca3a2Q9EQR4 Vrk2-201ENSMUST00000078362 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Clca3a2Q9EQR4 Zfyve19-201ENSMUST00000090174 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Clca3a2Q9EQR4 Fam57b-201ENSMUST00000079423 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Clca3a2Q9EQR4 9330160F10Rik-201ENSMUST00000101007 2766 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Clca3a2Q9EQR4 Tmed3-201ENSMUST00000058488 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Clca3a2Q9EQR4 Sprtn-201ENSMUST00000034467 4464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Clca3a2Q9EQR4 Eif4enif1-203ENSMUST00000110049 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Clca3a2Q9EQR4 Rpf1-201ENSMUST00000029838 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 69.9 ms