Protein–RNA interactions for Protein: Q9EQH7

Ndst3, Bifunctional heparan sulfate N-deacetylase/N-sulfotransferase 3, mousemouse

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Length 873 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ndst3Q9EQH7 Arhgef17-204ENSMUST00000209041 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Ndst3Q9EQH7 Lpin2-213ENSMUST00000156570 1586 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Ndst3Q9EQH7 Gm13168-201ENSMUST00000121771 632 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
Ndst3Q9EQH7 Gm17041-201ENSMUST00000163196 479 ntTSL 3 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Ndst3Q9EQH7 Atp23-202ENSMUST00000168520 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Ndst3Q9EQH7 Aprt-204ENSMUST00000212093 723 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Ndst3Q9EQH7 Dusp8-201ENSMUST00000039926 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Ndst3Q9EQH7 Gclm-201ENSMUST00000029769 5589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Ndst3Q9EQH7 Clcn2-202ENSMUST00000120099 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Ndst3Q9EQH7 Lhx6-208ENSMUST00000148852 1481 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Ndst3Q9EQH7 Nfib-204ENSMUST00000107246 3075 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Ndst3Q9EQH7 Cadm3-201ENSMUST00000005470 2518 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Ndst3Q9EQH7 Zkscan14-201ENSMUST00000031632 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Ndst3Q9EQH7 Tmem131-201ENSMUST00000027290 6546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Ndst3Q9EQH7 Klhl33-201ENSMUST00000164415 1602 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Ndst3Q9EQH7 Chpt1-201ENSMUST00000020253 3898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Ndst3Q9EQH7 Il17re-208ENSMUST00000204774 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Ndst3Q9EQH7 Vrk2-201ENSMUST00000078362 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Ndst3Q9EQH7 Zbtb9-201ENSMUST00000120016 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Ndst3Q9EQH7 Spi1-201ENSMUST00000002180 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Ndst3Q9EQH7 Fbxo33-201ENSMUST00000043204 3688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Ndst3Q9EQH7 BC051019-202ENSMUST00000106735 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Ndst3Q9EQH7 Matk-202ENSMUST00000117488 1980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Ndst3Q9EQH7 Rpf1-203ENSMUST00000199079 1978 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
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Ndst3Q9EQH7 Igflr1-202ENSMUST00000172251 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
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Ndst3Q9EQH7 Card10-202ENSMUST00000164826 4726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Ndst3Q9EQH7 Mirt1-201ENSMUST00000180489 5292 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Ndst3Q9EQH7 Nfkbib-201ENSMUST00000032815 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Ndst3Q9EQH7 Cerkl-205ENSMUST00000143974 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Ndst3Q9EQH7 Arhgef16-201ENSMUST00000030898 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Ndst3Q9EQH7 Mdfi-202ENSMUST00000066368 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Ndst3Q9EQH7 Itsn1-201ENSMUST00000056482 5364 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Ndst3Q9EQH7 Rnf157-201ENSMUST00000100202 4619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Ndst3Q9EQH7 Baiap2-204ENSMUST00000106231 4005 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Ndst3Q9EQH7 Dnaaf5-203ENSMUST00000196441 2426 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Ndst3Q9EQH7 Map4k5-210ENSMUST00000171211 4334 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.31
Ndst3Q9EQH7 Trim37-201ENSMUST00000041282 5632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
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Ndst3Q9EQH7 Cct6b-201ENSMUST00000021040 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
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Ndst3Q9EQH7 Nrbp1-201ENSMUST00000031034 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Ndst3Q9EQH7 Ppp2r5d-201ENSMUST00000002839 2926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
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Ndst3Q9EQH7 Cep68-204ENSMUST00000162811 2788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Ndst3Q9EQH7 Plekha4-206ENSMUST00000211155 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Ndst3Q9EQH7 Zufsp-202ENSMUST00000218055 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
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Ndst3Q9EQH7 Car9-201ENSMUST00000030183 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Ndst3Q9EQH7 Acads-201ENSMUST00000031524 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Ndst3Q9EQH7 Ccdc17-201ENSMUST00000051869 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Ndst3Q9EQH7 Slc2a13-202ENSMUST00000109283 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Ndst3Q9EQH7 Stambp-206ENSMUST00000206400 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
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Ndst3Q9EQH7 Rnf157-202ENSMUST00000106398 4553 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Ndst3Q9EQH7 Nsun5-201ENSMUST00000000940 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
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Ndst3Q9EQH7 Neurl1b-201ENSMUST00000053020 6195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Ndst3Q9EQH7 Pigu-201ENSMUST00000077626 1636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ndst3Q9EQH7 Gm26548-201ENSMUST00000181165 2029 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ndst3Q9EQH7 Cbarp-201ENSMUST00000105369 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ndst3Q9EQH7 Slc2a8-201ENSMUST00000028129 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ndst3Q9EQH7 Gm8520-201ENSMUST00000186517 868 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
Ndst3Q9EQH7 Gm37025-201ENSMUST00000195159 829 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
Ndst3Q9EQH7 Ppic-201ENSMUST00000025419 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ndst3Q9EQH7 Tmem175-204ENSMUST00000146207 1686 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ndst3Q9EQH7 Gm7712-202ENSMUST00000222331 1510 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
Ndst3Q9EQH7 Fxyd6-201ENSMUST00000085939 1788 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ndst3Q9EQH7 Uso1-204ENSMUST00000202155 3707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ndst3Q9EQH7 Eral1-201ENSMUST00000021183 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ndst3Q9EQH7 Scarf2-201ENSMUST00000012161 3302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ndst3Q9EQH7 2810408A11Rik-203ENSMUST00000102580 1640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ndst3Q9EQH7 Gabbr1-202ENSMUST00000172789 1460 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
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