Protein–RNA interactions for Protein: Q9EQ08

Sgsh, Heparan N-sulfatase, mousemouse

Predictions only

Length 502 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SgshQ9EQ08 Sgta-201ENSMUST00000005067 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
SgshQ9EQ08 2810459M11Rik-202ENSMUST00000165824 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
SgshQ9EQ08 Mindy2-201ENSMUST00000049031 8081 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
SgshQ9EQ08 Aebp2-202ENSMUST00000087614 3727 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
SgshQ9EQ08 Donson-201ENSMUST00000023682 2360 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
SgshQ9EQ08 Agfg1-206ENSMUST00000189220 8044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
SgshQ9EQ08 Prkci-201ENSMUST00000108249 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
SgshQ9EQ08 Spsb2-203ENSMUST00000112473 1322 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
SgshQ9EQ08 Trim45-202ENSMUST00000094048 1815 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
SgshQ9EQ08 Acbd4-201ENSMUST00000024492 2075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
SgshQ9EQ08 Jph1-201ENSMUST00000038382 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
SgshQ9EQ08 Pomp-201ENSMUST00000031654 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
SgshQ9EQ08 Gmcl1-202ENSMUST00000113679 960 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
SgshQ9EQ08 Gm20033-201ENSMUST00000180470 572 ntTSL 3 BASIC17.72■□□□□ 0.43
SgshQ9EQ08 Gm3272-201ENSMUST00000181181 1229 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
SgshQ9EQ08 Gm10566-201ENSMUST00000086739 996 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
SgshQ9EQ08 Tmem131-201ENSMUST00000027290 6546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
SgshQ9EQ08 Cdk19-201ENSMUST00000044672 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
SgshQ9EQ08 Rprd1b-207ENSMUST00000152452 1910 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
SgshQ9EQ08 Sept10-203ENSMUST00000220156 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
SgshQ9EQ08 Tesk1-201ENSMUST00000060864 3947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
SgshQ9EQ08 Ttc39a-201ENSMUST00000064129 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
SgshQ9EQ08 Itgb1bp1-201ENSMUST00000076260 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
SgshQ9EQ08 Cdc14b-201ENSMUST00000039318 5859 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
SgshQ9EQ08 Myo1b-203ENSMUST00000114537 4618 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
SgshQ9EQ08 Tm2d3-202ENSMUST00000065574 1478 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
SgshQ9EQ08 Lrch2-201ENSMUST00000112819 4892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
SgshQ9EQ08 Spout1-201ENSMUST00000100220 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
SgshQ9EQ08 Gpaa1-210ENSMUST00000172281 1809 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
SgshQ9EQ08 Hist1h2bf-201ENSMUST00000105106 461 ntAPPRIS P1 BASIC17.71■□□□□ 0.43
SgshQ9EQ08 Arnt-204ENSMUST00000107160 783 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
SgshQ9EQ08 Gm22697-201ENSMUST00000175194 63 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
SgshQ9EQ08 Vkorc1-203ENSMUST00000206053 606 ntTSL 3 BASIC17.71■□□□□ 0.43
SgshQ9EQ08 AC134329.2-201ENSMUST00000217897 428 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
SgshQ9EQ08 Ttc32-203ENSMUST00000219488 768 ntTSL 3 BASIC17.71■□□□□ 0.43
SgshQ9EQ08 Fam92a-201ENSMUST00000087052 1292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
SgshQ9EQ08 Ccdc149-201ENSMUST00000059428 3295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
SgshQ9EQ08 Dgke-202ENSMUST00000107894 8347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
SgshQ9EQ08 Eme2-202ENSMUST00000121542 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
SgshQ9EQ08 Ttc34-203ENSMUST00000207854 4733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
SgshQ9EQ08 Trim25-202ENSMUST00000100627 1433 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
SgshQ9EQ08 Dhx32-203ENSMUST00000106139 2233 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
SgshQ9EQ08 Rhobtb3-201ENSMUST00000022078 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
SgshQ9EQ08 Scaf8-201ENSMUST00000076734 4869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
SgshQ9EQ08 Stam2-202ENSMUST00000127316 1928 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
SgshQ9EQ08 Dhx15-201ENSMUST00000031061 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
SgshQ9EQ08 9930012K11Rik-205ENSMUST00000153871 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
SgshQ9EQ08 9930012K11Rik-201ENSMUST00000058240 1986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
SgshQ9EQ08 Ric3-202ENSMUST00000120876 1633 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
SgshQ9EQ08 Hist1h4a-201ENSMUST00000102964 539 ntAPPRIS P1 BASIC17.7■□□□□ 0.42
SgshQ9EQ08 Hmga1-206ENSMUST00000119486 1003 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
SgshQ9EQ08 Cdc34-202ENSMUST00000166603 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
SgshQ9EQ08 Grtp1-204ENSMUST00000209691 1030 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
SgshQ9EQ08 Sfrp4-201ENSMUST00000002883 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
SgshQ9EQ08 Mmd-202ENSMUST00000107887 1654 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
SgshQ9EQ08 Disc1-208ENSMUST00000122389 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
SgshQ9EQ08 Nr1h2-213ENSMUST00000167197 1944 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
SgshQ9EQ08 Clcn2-202ENSMUST00000120099 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
SgshQ9EQ08 Fam104a-201ENSMUST00000120194 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
SgshQ9EQ08 Zfp644-205ENSMUST00000112698 5689 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
SgshQ9EQ08 Gm21974-201ENSMUST00000126662 2037 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
SgshQ9EQ08 Ccdc17-201ENSMUST00000051869 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
SgshQ9EQ08 Gm10013-201ENSMUST00000106074 672 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
SgshQ9EQ08 Tlcd2-202ENSMUST00000108435 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
SgshQ9EQ08 Bpnt1-202ENSMUST00000110965 1046 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
SgshQ9EQ08 Pabpc1l2b-ps-201ENSMUST00000124538 690 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
SgshQ9EQ08 Ccdc125-202ENSMUST00000170347 1216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
SgshQ9EQ08 Gm17949-201ENSMUST00000210548 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
SgshQ9EQ08 Aga-203ENSMUST00000211424 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
SgshQ9EQ08 Gm7213-201ENSMUST00000215977 950 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
SgshQ9EQ08 Lce1h-201ENSMUST00000051521 706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
SgshQ9EQ08 Vpreb1-201ENSMUST00000075017 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
SgshQ9EQ08 Zfp768-201ENSMUST00000060783 2356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
SgshQ9EQ08 Smap2-201ENSMUST00000043200 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
SgshQ9EQ08 Cyth2-201ENSMUST00000056820 2527 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
SgshQ9EQ08 Ppp1r3f-201ENSMUST00000115742 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
SgshQ9EQ08 Dnajc2-201ENSMUST00000030771 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
SgshQ9EQ08 Usp21-202ENSMUST00000111305 2278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
SgshQ9EQ08 Sharpin-201ENSMUST00000023211 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
SgshQ9EQ08 Hmg20b-213ENSMUST00000167481 1321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
SgshQ9EQ08 Cdk10-201ENSMUST00000036880 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
SgshQ9EQ08 Prmt2-202ENSMUST00000099571 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
SgshQ9EQ08 Card10-203ENSMUST00000170584 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
SgshQ9EQ08 Gm5414-201ENSMUST00000062879 1659 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
SgshQ9EQ08 Zkscan14-201ENSMUST00000031632 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
SgshQ9EQ08 Chd5-202ENSMUST00000030775 9486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
SgshQ9EQ08 Gne-202ENSMUST00000102936 2920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
SgshQ9EQ08 Mafg-202ENSMUST00000106180 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
SgshQ9EQ08 Mafg-204ENSMUST00000106182 1104 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
SgshQ9EQ08 Pigw-202ENSMUST00000108080 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
SgshQ9EQ08 Gm13474-201ENSMUST00000122466 815 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
SgshQ9EQ08 4930526A20Rik-201ENSMUST00000134228 941 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
SgshQ9EQ08 Rapgef3os1-201ENSMUST00000149373 483 ntTSL 3 BASIC17.68■□□□□ 0.42
SgshQ9EQ08 Gm23634-201ENSMUST00000175071 91 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
SgshQ9EQ08 Dleu2-208ENSMUST00000182768 1442 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
SgshQ9EQ08 2010016I18Rik-204ENSMUST00000190356 1562 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
SgshQ9EQ08 Gm18101-201ENSMUST00000215769 548 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
SgshQ9EQ08 Fam149b-216ENSMUST00000225942 2151 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
SgshQ9EQ08 Olfr317-201ENSMUST00000075607 1128 ntAPPRIS P1 BASIC17.68■□□□□ 0.42
SgshQ9EQ08 Ldlrad1-201ENSMUST00000094916 1093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.9 ms