Protein–RNA interactions for Protein: Q9DCT5

Sdf2, Stromal cell-derived factor 2, mousemouse

Predictions only

Length 211 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sdf2Q9DCT5 Ulk1-201ENSMUST00000031490 5213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Sdf2Q9DCT5 Ccni-201ENSMUST00000058550 2804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Sdf2Q9DCT5 Cpsf4-207ENSMUST00000162244 1387 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Sdf2Q9DCT5 Wt1-205ENSMUST00000143043 3090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Sdf2Q9DCT5 Gm13816-201ENSMUST00000152230 715 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Sdf2Q9DCT5 Igflr1-202ENSMUST00000172251 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Sdf2Q9DCT5 Gm20544-201ENSMUST00000174338 690 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Sdf2Q9DCT5 Uqcr11-201ENSMUST00000020372 445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Sdf2Q9DCT5 Sbf1-205ENSMUST00000144585 6165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Sdf2Q9DCT5 Zfyve19-201ENSMUST00000090174 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Sdf2Q9DCT5 Nfatc3-201ENSMUST00000109308 5984 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Sdf2Q9DCT5 Trp73-203ENSMUST00000105643 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Sdf2Q9DCT5 Bcar1-201ENSMUST00000166232 3142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Sdf2Q9DCT5 BC029722-201ENSMUST00000124586 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Sdf2Q9DCT5 Igsf8-201ENSMUST00000039506 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Sdf2Q9DCT5 Nfkbib-201ENSMUST00000032815 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Sdf2Q9DCT5 Rbbp7-202ENSMUST00000112326 1430 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Sdf2Q9DCT5 Ap2a2-201ENSMUST00000003038 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Sdf2Q9DCT5 Fam171a2-201ENSMUST00000049057 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Sdf2Q9DCT5 Kmt5b-202ENSMUST00000052699 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Sdf2Q9DCT5 Lrrfip2-202ENSMUST00000098340 3191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Sdf2Q9DCT5 Mtmr3-202ENSMUST00000109943 5674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Sdf2Q9DCT5 Kcnd3-202ENSMUST00000098761 7169 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Sdf2Q9DCT5 Dlx3-201ENSMUST00000092768 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Sdf2Q9DCT5 Nek9-201ENSMUST00000040992 5386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Sdf2Q9DCT5 Larp4b-201ENSMUST00000091829 5720 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Sdf2Q9DCT5 Sharpin-201ENSMUST00000023211 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Sdf2Q9DCT5 Gm8520-201ENSMUST00000186517 868 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Sdf2Q9DCT5 Cerkl-205ENSMUST00000143974 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Sdf2Q9DCT5 Mlxip-202ENSMUST00000111596 2653 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Sdf2Q9DCT5 Slc22a12-201ENSMUST00000113451 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Sdf2Q9DCT5 Mirt1-201ENSMUST00000180489 5292 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Sdf2Q9DCT5 Il17re-208ENSMUST00000204774 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Sdf2Q9DCT5 Igsf11-201ENSMUST00000023478 3443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Sdf2Q9DCT5 Crk-203ENSMUST00000108425 4290 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Sdf2Q9DCT5 Acss2-202ENSMUST00000065973 2876 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Sdf2Q9DCT5 Sntg2-201ENSMUST00000021004 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Sdf2Q9DCT5 Whrn-206ENSMUST00000102867 4013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Sdf2Q9DCT5 Glcci1-201ENSMUST00000064285 6200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Sdf2Q9DCT5 Pik3r2-201ENSMUST00000034296 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Sdf2Q9DCT5 Bpifb4-203ENSMUST00000109759 2115 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Sdf2Q9DCT5 Rbbp7-203ENSMUST00000112327 1862 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Sdf2Q9DCT5 A930001A20Rik-201ENSMUST00000182586 1366 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Sdf2Q9DCT5 Tnfsf14-201ENSMUST00000005976 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Sdf2Q9DCT5 Gnao1-207ENSMUST00000138659 5526 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Sdf2Q9DCT5 Mindy2-201ENSMUST00000049031 8081 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Sdf2Q9DCT5 Bend4-204ENSMUST00000201972 8268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Sdf2Q9DCT5 Smim22-201ENSMUST00000178155 429 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Sdf2Q9DCT5 Prss56-201ENSMUST00000044533 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Sdf2Q9DCT5 Fignl2-201ENSMUST00000178140 4206 ntAPPRIS P1 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Sdf2Q9DCT5 Tmem151b-201ENSMUST00000180252 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Sdf2Q9DCT5 Hist1h2bh-201ENSMUST00000224359 1679 ntAPPRIS P1 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Sdf2Q9DCT5 Msx2-201ENSMUST00000021922 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Sdf2Q9DCT5 Mbp-201ENSMUST00000047865 2492 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Sdf2Q9DCT5 A430078I02Rik-202ENSMUST00000154066 2233 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Sdf2Q9DCT5 P2rx5-201ENSMUST00000006104 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Sdf2Q9DCT5 Mdfi-202ENSMUST00000066368 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Sdf2Q9DCT5 Trip10-205ENSMUST00000224885 2136 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Sdf2Q9DCT5 Map3k5-201ENSMUST00000095806 5450 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Sdf2Q9DCT5 Rap2a-201ENSMUST00000062117 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Sdf2Q9DCT5 Zcchc4-203ENSMUST00000113904 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Sdf2Q9DCT5 1810013L24Rik-201ENSMUST00000023150 4066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Sdf2Q9DCT5 Zkscan14-201ENSMUST00000031632 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Sdf2Q9DCT5 Cldn24-201ENSMUST00000079639 663 ntAPPRIS P1 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Sdf2Q9DCT5 Armc10-202ENSMUST00000095495 2700 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Sdf2Q9DCT5 Snap91-202ENSMUST00000074468 4336 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Sdf2Q9DCT5 Sars2-201ENSMUST00000094632 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Sdf2Q9DCT5 Diaph1-205ENSMUST00000115634 5666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Sdf2Q9DCT5 Slain2-201ENSMUST00000143829 4828 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Sdf2Q9DCT5 Acss2-201ENSMUST00000029135 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Sdf2Q9DCT5 Crebbp-201ENSMUST00000023165 10820 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Sdf2Q9DCT5 Jade1-202ENSMUST00000163764 5584 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Sdf2Q9DCT5 Ergic3-202ENSMUST00000088650 1349 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Sdf2Q9DCT5 Scamp3-201ENSMUST00000029684 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Sdf2Q9DCT5 Klhl33-201ENSMUST00000164415 1602 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Sdf2Q9DCT5 Nrbp1-207ENSMUST00000202576 2221 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Sdf2Q9DCT5 Nrbp1-201ENSMUST00000031034 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Sdf2Q9DCT5 Lonp1-201ENSMUST00000047226 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Sdf2Q9DCT5 Prdm11-201ENSMUST00000111272 3012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Sdf2Q9DCT5 Plekha4-206ENSMUST00000211155 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Sdf2Q9DCT5 Vrk2-201ENSMUST00000078362 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Sdf2Q9DCT5 Necab3-202ENSMUST00000109716 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Sdf2Q9DCT5 Josd2-206ENSMUST00000121922 684 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Sdf2Q9DCT5 Gm21863-201ENSMUST00000179133 336 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Sdf2Q9DCT5 Anapc13-204ENSMUST00000190279 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Sdf2Q9DCT5 Gm37939-201ENSMUST00000192309 447 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Sdf2Q9DCT5 Rab7-206ENSMUST00000203674 424 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Sdf2Q9DCT5 Amacr-201ENSMUST00000070877 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Sdf2Q9DCT5 Capzb-202ENSMUST00000042675 1604 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Sdf2Q9DCT5 Tbx21-201ENSMUST00000001484 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Sdf2Q9DCT5 Ppan-201ENSMUST00000004203 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Sdf2Q9DCT5 Gm7712-202ENSMUST00000222331 1510 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Sdf2Q9DCT5 Ttc14-203ENSMUST00000117915 4913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Sdf2Q9DCT5 Vps53-203ENSMUST00000108419 2209 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Sdf2Q9DCT5 Hnrnph1-201ENSMUST00000069304 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Sdf2Q9DCT5 Tmx1-201ENSMUST00000021471 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Sdf2Q9DCT5 Rbl2-201ENSMUST00000034091 4925 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Sdf2Q9DCT5 Uhmk1-202ENSMUST00000123399 7775 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Sdf2Q9DCT5 Gusb-202ENSMUST00000111307 932 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Sdf2Q9DCT5 2310001K24Rik-202ENSMUST00000186760 740 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.6 ms