Protein–RNA interactions for Protein: Q9DCD6

Gabarap, Gamma-aminobutyric acid receptor-associated protein, mousemouse

Predictions only

Length 117 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GabarapQ9DCD6 Rtcb-201ENSMUST00000001834 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
GabarapQ9DCD6 Car9-201ENSMUST00000030183 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
GabarapQ9DCD6 Ptges2-201ENSMUST00000028162 4978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
GabarapQ9DCD6 Crem-239ENSMUST00000165086 2778 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
GabarapQ9DCD6 Clip2-202ENSMUST00000100647 4994 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
GabarapQ9DCD6 Otp-201ENSMUST00000022195 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
GabarapQ9DCD6 Ppt1-201ENSMUST00000030412 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
GabarapQ9DCD6 Hhatl-201ENSMUST00000035110 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
GabarapQ9DCD6 Chpf-201ENSMUST00000079205 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
GabarapQ9DCD6 Cadps2-201ENSMUST00000018122 4723 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
GabarapQ9DCD6 Tmem117-201ENSMUST00000080141 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
GabarapQ9DCD6 Lman2l-202ENSMUST00000115011 2290 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
GabarapQ9DCD6 Senp7-211ENSMUST00000202000 3218 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
GabarapQ9DCD6 Krt83-201ENSMUST00000023718 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
GabarapQ9DCD6 Art5-201ENSMUST00000094128 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
GabarapQ9DCD6 Gm12922-201ENSMUST00000120626 809 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
GabarapQ9DCD6 Gm43137-201ENSMUST00000198052 594 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
GabarapQ9DCD6 Ckm-201ENSMUST00000003643 1235 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
GabarapQ9DCD6 Dnajb2-201ENSMUST00000055223 1199 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
GabarapQ9DCD6 Tjap1-214ENSMUST00000225413 2189 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
GabarapQ9DCD6 Zfp384-207ENSMUST00000112427 3072 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
GabarapQ9DCD6 Crem-203ENSMUST00000082141 2820 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
GabarapQ9DCD6 Taf5-201ENSMUST00000026027 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
GabarapQ9DCD6 Myo5a-214ENSMUST00000155282 6372 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
GabarapQ9DCD6 Rpf1-201ENSMUST00000029838 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
GabarapQ9DCD6 Ivns1abp-203ENSMUST00000111887 2783 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
GabarapQ9DCD6 Rchy1-204ENSMUST00000169948 1417 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
GabarapQ9DCD6 Ly6e-201ENSMUST00000051698 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
GabarapQ9DCD6 Asic4-201ENSMUST00000037708 2464 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
GabarapQ9DCD6 Tmem80-201ENSMUST00000026578 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
GabarapQ9DCD6 Lsp1-204ENSMUST00000105967 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
GabarapQ9DCD6 Kazald1-201ENSMUST00000026234 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
GabarapQ9DCD6 Chuk-202ENSMUST00000119591 3481 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
GabarapQ9DCD6 Tbx18-201ENSMUST00000034991 4679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
GabarapQ9DCD6 B3galnt2-204ENSMUST00000221300 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
GabarapQ9DCD6 Klhl25-203ENSMUST00000205612 1343 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
GabarapQ9DCD6 AC153526.5-201ENSMUST00000218661 2147 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
GabarapQ9DCD6 Gm37812-201ENSMUST00000195216 2475 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
GabarapQ9DCD6 Rab7-203ENSMUST00000113597 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
GabarapQ9DCD6 Ddx51-201ENSMUST00000031478 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
GabarapQ9DCD6 Gm11837-201ENSMUST00000136992 876 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
GabarapQ9DCD6 D630002J18Rik-201ENSMUST00000181854 1115 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
GabarapQ9DCD6 AC138214.1-201ENSMUST00000223838 420 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
GabarapQ9DCD6 Sfrp1-201ENSMUST00000033952 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
GabarapQ9DCD6 Tap1-201ENSMUST00000041633 2614 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
GabarapQ9DCD6 Dlx1-201ENSMUST00000037119 4111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
GabarapQ9DCD6 Fam160a2-203ENSMUST00000118726 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
GabarapQ9DCD6 2310015A10Rik-201ENSMUST00000180643 1399 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
GabarapQ9DCD6 H2afx-201ENSMUST00000052686 1384 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
GabarapQ9DCD6 Cachd1-202ENSMUST00000097955 4277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
GabarapQ9DCD6 Mydgf-201ENSMUST00000019723 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
GabarapQ9DCD6 Snx30-201ENSMUST00000030080 7314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
GabarapQ9DCD6 Dnajc25-201ENSMUST00000095070 4023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
GabarapQ9DCD6 Acads-201ENSMUST00000031524 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
GabarapQ9DCD6 Galnt16-204ENSMUST00000218943 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
GabarapQ9DCD6 9530080O11Rik-201ENSMUST00000137239 1475 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
GabarapQ9DCD6 Tubgcp4-202ENSMUST00000110657 1992 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
GabarapQ9DCD6 Slc46a1-201ENSMUST00000001126 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
GabarapQ9DCD6 Lgr6-202ENSMUST00000137968 2820 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
GabarapQ9DCD6 Dcaf17-203ENSMUST00000112159 2490 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
GabarapQ9DCD6 Mccc1-201ENSMUST00000029259 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
GabarapQ9DCD6 Nkx6-2-202ENSMUST00000106095 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
GabarapQ9DCD6 Taf3-203ENSMUST00000114907 695 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
GabarapQ9DCD6 Gpx1-202ENSMUST00000191997 787 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
GabarapQ9DCD6 AC161180.2-201ENSMUST00000222567 1015 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
GabarapQ9DCD6 Cst3-201ENSMUST00000028938 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
GabarapQ9DCD6 Spaca1-201ENSMUST00000029927 1197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
GabarapQ9DCD6 Ptrh1-201ENSMUST00000066352 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
GabarapQ9DCD6 Gm9959-201ENSMUST00000068277 390 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
GabarapQ9DCD6 Hikeshi-201ENSMUST00000075010 715 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
GabarapQ9DCD6 Gpx1-201ENSMUST00000082429 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
GabarapQ9DCD6 Spaca1-202ENSMUST00000084734 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
GabarapQ9DCD6 Braf-201ENSMUST00000002487 9728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
GabarapQ9DCD6 Cct6b-201ENSMUST00000021040 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
GabarapQ9DCD6 Hnrnpll-201ENSMUST00000061331 3116 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
GabarapQ9DCD6 Rbck1-201ENSMUST00000028964 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
GabarapQ9DCD6 Tbc1d9-201ENSMUST00000034145 4631 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
GabarapQ9DCD6 Zbtb24-202ENSMUST00000213797 2734 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
GabarapQ9DCD6 Tpra1-223ENSMUST00000204765 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
GabarapQ9DCD6 Pola2-202ENSMUST00000165143 2397 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
GabarapQ9DCD6 Rasal2-201ENSMUST00000078308 10047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
GabarapQ9DCD6 Yes1-205ENSMUST00000202543 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
GabarapQ9DCD6 Wdr91-201ENSMUST00000081214 2682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
GabarapQ9DCD6 Mbp-201ENSMUST00000047865 2492 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
GabarapQ9DCD6 Ino80e-203ENSMUST00000106343 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
GabarapQ9DCD6 Nisch-208ENSMUST00000165981 2415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
GabarapQ9DCD6 Ptpa-201ENSMUST00000042055 2586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
GabarapQ9DCD6 Cant1-205ENSMUST00000106289 1600 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
GabarapQ9DCD6 Rgl3-201ENSMUST00000045726 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
GabarapQ9DCD6 Hsd17b4-201ENSMUST00000025385 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
GabarapQ9DCD6 Tarbp2-202ENSMUST00000100168 1278 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
GabarapQ9DCD6 BC004004-202ENSMUST00000120346 1297 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
GabarapQ9DCD6 Gm14281-201ENSMUST00000121700 1294 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
GabarapQ9DCD6 Chrac1-202ENSMUST00000134353 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
GabarapQ9DCD6 Gm15202-201ENSMUST00000154188 393 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
GabarapQ9DCD6 Mettl26-205ENSMUST00000169308 1026 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
GabarapQ9DCD6 Fbxl15-202ENSMUST00000177667 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
GabarapQ9DCD6 Gnai2-203ENSMUST00000192837 421 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
GabarapQ9DCD6 Lrrc36-206ENSMUST00000216765 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
GabarapQ9DCD6 Il3ra-203ENSMUST00000224163 2315 ntAPPRIS P2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.4 ms