Protein–RNA interactions for Protein: Q9DCB1

Hmgn3, High mobility group nucleosome-binding domain-containing protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 99 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hmgn3Q9DCB1 Rpusd3-204ENSMUST00000129047 1045 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Hmgn3Q9DCB1 Mettl26-205ENSMUST00000169308 1026 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Hmgn3Q9DCB1 Uncx-202ENSMUST00000174792 1196 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Hmgn3Q9DCB1 Pet117-201ENSMUST00000183618 693 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Hmgn3Q9DCB1 CT010467.1-202ENSMUST00000205406 714 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Hmgn3Q9DCB1 Snrpd3-203ENSMUST00000220229 442 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Hmgn3Q9DCB1 Ckm-201ENSMUST00000003643 1235 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Hmgn3Q9DCB1 Rpusd3-201ENSMUST00000060634 1224 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Hmgn3Q9DCB1 Zbtb2-201ENSMUST00000100077 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Hmgn3Q9DCB1 2210016F16Rik-201ENSMUST00000022032 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Hmgn3Q9DCB1 Cenpa-205ENSMUST00000144742 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Hmgn3Q9DCB1 Agxt-201ENSMUST00000027491 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Hmgn3Q9DCB1 Chtf8-206ENSMUST00000177068 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Hmgn3Q9DCB1 Rgl1-202ENSMUST00000111857 3037 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Hmgn3Q9DCB1 Sfrp1-201ENSMUST00000033952 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Hmgn3Q9DCB1 Rhobtb1-202ENSMUST00000067908 4422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Hmgn3Q9DCB1 Fcho1-209ENSMUST00000146100 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Hmgn3Q9DCB1 Jade2-202ENSMUST00000109090 6230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Hmgn3Q9DCB1 Pacsin3-202ENSMUST00000059566 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Hmgn3Q9DCB1 Rassf1-202ENSMUST00000093786 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Hmgn3Q9DCB1 Tspan10-201ENSMUST00000044105 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Hmgn3Q9DCB1 Lrig3-201ENSMUST00000074807 4016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Hmgn3Q9DCB1 Gm14281-201ENSMUST00000121700 1294 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Hmgn3Q9DCB1 A830035A12Rik-201ENSMUST00000147445 861 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Hmgn3Q9DCB1 Gnai2-203ENSMUST00000192837 421 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Hmgn3Q9DCB1 Gm29791-202ENSMUST00000207888 369 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Hmgn3Q9DCB1 AC164441.1-202ENSMUST00000223430 442 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Hmgn3Q9DCB1 Rasl10a-201ENSMUST00000037218 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Hmgn3Q9DCB1 Acbd6-202ENSMUST00000080138 993 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Hmgn3Q9DCB1 Zmiz1-201ENSMUST00000007961 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Hmgn3Q9DCB1 Prdm11-201ENSMUST00000111272 3012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Hmgn3Q9DCB1 E130307A14Rik-213ENSMUST00000155482 2803 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Hmgn3Q9DCB1 Atp8b1-201ENSMUST00000025482 6440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Hmgn3Q9DCB1 P2rx4-201ENSMUST00000031429 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Hmgn3Q9DCB1 Igdcc3-203ENSMUST00000217371 3183 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Hmgn3Q9DCB1 Rchy1-204ENSMUST00000169948 1417 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Hmgn3Q9DCB1 Cox18-202ENSMUST00000118816 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Hmgn3Q9DCB1 Fscn1-207ENSMUST00000198017 2157 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Hmgn3Q9DCB1 Tbc1d9-201ENSMUST00000034145 4631 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Hmgn3Q9DCB1 Ano8-204ENSMUST00000213382 3785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Hmgn3Q9DCB1 Gm28372-201ENSMUST00000188900 1876 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Hmgn3Q9DCB1 Apoa5-202ENSMUST00000121598 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Hmgn3Q9DCB1 Chn1-209ENSMUST00000166199 3876 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Hmgn3Q9DCB1 Nfkbid-202ENSMUST00000108175 2000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Hmgn3Q9DCB1 Sybu-202ENSMUST00000110267 3127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Hmgn3Q9DCB1 Lsp1-204ENSMUST00000105967 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Hmgn3Q9DCB1 1810022K09Rik-201ENSMUST00000108365 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Hmgn3Q9DCB1 Wdr4-203ENSMUST00000167419 813 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Hmgn3Q9DCB1 Dnajb5-201ENSMUST00000037872 3291 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Hmgn3Q9DCB1 Kctd15-203ENSMUST00000108070 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Hmgn3Q9DCB1 Syn1-201ENSMUST00000081893 3209 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Hmgn3Q9DCB1 Cbx8-201ENSMUST00000026663 3580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Hmgn3Q9DCB1 Slc13a3-202ENSMUST00000109279 3131 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Hmgn3Q9DCB1 Higd1a-201ENSMUST00000060251 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Hmgn3Q9DCB1 Stox2-208ENSMUST00000211737 4573 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Hmgn3Q9DCB1 Fhl2-201ENSMUST00000008280 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Hmgn3Q9DCB1 Man2a1-201ENSMUST00000086723 6991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Hmgn3Q9DCB1 Taf6l-212ENSMUST00000177216 2167 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Hmgn3Q9DCB1 Nosip-201ENSMUST00000003513 1814 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Hmgn3Q9DCB1 Cdc123-201ENSMUST00000043864 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Hmgn3Q9DCB1 Adamtsl1-201ENSMUST00000048885 1842 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Hmgn3Q9DCB1 Bambi-201ENSMUST00000025075 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Hmgn3Q9DCB1 Col11a2-202ENSMUST00000114252 5620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Hmgn3Q9DCB1 Fubp3-202ENSMUST00000113482 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Hmgn3Q9DCB1 Mxd4-201ENSMUST00000042701 3872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Hmgn3Q9DCB1 Ankrd23-201ENSMUST00000054665 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Hmgn3Q9DCB1 Lca5l-202ENSMUST00000113804 3162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Hmgn3Q9DCB1 Mob2-205ENSMUST00000211000 1646 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Hmgn3Q9DCB1 Fmnl3-203ENSMUST00000120633 4290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Hmgn3Q9DCB1 Hist1h2bp-201ENSMUST00000102982 469 ntAPPRIS P1 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Hmgn3Q9DCB1 Gpx1-202ENSMUST00000191997 787 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Hmgn3Q9DCB1 Kiss1-204ENSMUST00000194044 583 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Hmgn3Q9DCB1 Gm43060-201ENSMUST00000200621 289 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Hmgn3Q9DCB1 Hes3-202ENSMUST00000218045 962 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Hmgn3Q9DCB1 Ptrh1-201ENSMUST00000066352 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Hmgn3Q9DCB1 Gpx1-201ENSMUST00000082429 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Hmgn3Q9DCB1 Gm36858-201ENSMUST00000194501 2391 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Hmgn3Q9DCB1 Rtcb-201ENSMUST00000001834 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Hmgn3Q9DCB1 Stambpl1-201ENSMUST00000054956 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Hmgn3Q9DCB1 Ripk1-201ENSMUST00000021844 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Hmgn3Q9DCB1 Grtp1-207ENSMUST00000211128 1416 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Hmgn3Q9DCB1 Rpf1-201ENSMUST00000029838 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Hmgn3Q9DCB1 Abhd16a-201ENSMUST00000007251 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Hmgn3Q9DCB1 Zfp326-201ENSMUST00000031227 2667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Hmgn3Q9DCB1 Scin-201ENSMUST00000002640 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Hmgn3Q9DCB1 Knl1-201ENSMUST00000028799 5527 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Hmgn3Q9DCB1 Rae1-201ENSMUST00000029013 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Hmgn3Q9DCB1 Crtac1-201ENSMUST00000048630 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Hmgn3Q9DCB1 Rbck1-202ENSMUST00000109847 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Hmgn3Q9DCB1 Snap91-204ENSMUST00000098495 4150 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Hmgn3Q9DCB1 Asph-210ENSMUST00000108337 2836 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Hmgn3Q9DCB1 Atp6v1g2-201ENSMUST00000068261 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Hmgn3Q9DCB1 Pex12-205ENSMUST00000175741 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Hmgn3Q9DCB1 Mff-212ENSMUST00000162003 2087 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Hmgn3Q9DCB1 Ppp1r12b-203ENSMUST00000112163 828 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Hmgn3Q9DCB1 Gm13429-202ENSMUST00000128242 692 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Hmgn3Q9DCB1 0610010K14Rik-202ENSMUST00000021181 779 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Hmgn3Q9DCB1 Akr7a5-201ENSMUST00000073787 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Hmgn3Q9DCB1 Trmt112-201ENSMUST00000088257 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Hmgn3Q9DCB1 Gm10306-201ENSMUST00000094969 533 ntAPPRIS P1 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.7 ms