Protein–RNA interactions for Protein: Q9DBZ9

Syde1, Rho GTPase-activating protein SYDE1, mousemouse

Predictions only

Length 737 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Syde1Q9DBZ9 Etnk1-204ENSMUST00000205256 2647 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Syde1Q9DBZ9 Rbm24-201ENSMUST00000037923 3086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Syde1Q9DBZ9 Prdm6-203ENSMUST00000115399 2227 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Syde1Q9DBZ9 Fkbp5-201ENSMUST00000079413 3542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Syde1Q9DBZ9 Ldlrad4-201ENSMUST00000063775 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Syde1Q9DBZ9 Hoxa10-201ENSMUST00000121043 1436 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Syde1Q9DBZ9 Ncor1-203ENSMUST00000069456 3171 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Syde1Q9DBZ9 Adgrv1-207ENSMUST00000128585 2580 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Syde1Q9DBZ9 Rnf208-202ENSMUST00000114355 1333 ntAPPRIS P1 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Syde1Q9DBZ9 Hes6-201ENSMUST00000086851 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Syde1Q9DBZ9 H2-Q7-202ENSMUST00000076256 1523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Syde1Q9DBZ9 9030624G23Rik-201ENSMUST00000101538 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Syde1Q9DBZ9 Hmga1-206ENSMUST00000119486 1003 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Syde1Q9DBZ9 4930401G09Rik-201ENSMUST00000139500 637 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Syde1Q9DBZ9 Surf1-201ENSMUST00000015934 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Syde1Q9DBZ9 AC120002.2-201ENSMUST00000220205 773 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
Syde1Q9DBZ9 Ddx39b-203ENSMUST00000173731 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Syde1Q9DBZ9 Snrpd2-201ENSMUST00000049294 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Syde1Q9DBZ9 Plekhg3-207ENSMUST00000219063 4535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Syde1Q9DBZ9 Aqp5-202ENSMUST00000169082 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Syde1Q9DBZ9 F2rl3-201ENSMUST00000058099 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Syde1Q9DBZ9 Nsg1-201ENSMUST00000031009 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Syde1Q9DBZ9 Rragd-203ENSMUST00000098190 5008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Syde1Q9DBZ9 Gm19554-201ENSMUST00000220934 2076 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Syde1Q9DBZ9 Gm7153-201ENSMUST00000117092 455 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
Syde1Q9DBZ9 Srgn-205ENSMUST00000162161 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Syde1Q9DBZ9 Ppdpf-201ENSMUST00000016488 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Syde1Q9DBZ9 Mrps12-204ENSMUST00000171183 883 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Syde1Q9DBZ9 Gm17949-201ENSMUST00000210548 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Syde1Q9DBZ9 Pdcd2l-201ENSMUST00000002710 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Syde1Q9DBZ9 Ciz1-201ENSMUST00000048964 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Syde1Q9DBZ9 Rpp25-201ENSMUST00000080514 1423 ntAPPRIS P1 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Syde1Q9DBZ9 Mef2d-202ENSMUST00000107558 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Syde1Q9DBZ9 Gm44832-201ENSMUST00000208849 2303 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
Syde1Q9DBZ9 Krt27-201ENSMUST00000017732 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Syde1Q9DBZ9 Galk2-202ENSMUST00000094604 1928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Syde1Q9DBZ9 Ndufv3-201ENSMUST00000046288 1537 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Syde1Q9DBZ9 Fam109a-201ENSMUST00000056654 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Syde1Q9DBZ9 Spata2l-201ENSMUST00000098327 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Syde1Q9DBZ9 Itsn1-206ENSMUST00000113999 5393 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Syde1Q9DBZ9 Snx3-202ENSMUST00000105499 1057 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Syde1Q9DBZ9 Gm26620-201ENSMUST00000180542 817 ntAPPRIS P1 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Syde1Q9DBZ9 Krt10-202ENSMUST00000211768 557 ntTSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Syde1Q9DBZ9 Ldlrad1-201ENSMUST00000094916 1093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Syde1Q9DBZ9 S100a16-202ENSMUST00000098911 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Syde1Q9DBZ9 Gm38534-201ENSMUST00000206566 1909 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Syde1Q9DBZ9 Naa60-212ENSMUST00000186375 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Syde1Q9DBZ9 Soga1-201ENSMUST00000069098 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Syde1Q9DBZ9 Mtmr1-202ENSMUST00000114601 4640 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Syde1Q9DBZ9 A930001A20Rik-201ENSMUST00000182586 1366 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Syde1Q9DBZ9 Yipf2-201ENSMUST00000034700 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Syde1Q9DBZ9 U2af2-201ENSMUST00000005041 2183 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Syde1Q9DBZ9 Eme2-202ENSMUST00000121542 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Syde1Q9DBZ9 Lrch2-201ENSMUST00000112819 4892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Syde1Q9DBZ9 Mmp11-201ENSMUST00000000924 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Syde1Q9DBZ9 St7l-201ENSMUST00000059271 5728 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Syde1Q9DBZ9 Bnip2-203ENSMUST00000117450 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Syde1Q9DBZ9 Gm37194-201ENSMUST00000193092 3031 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
Syde1Q9DBZ9 Rimklb-201ENSMUST00000068242 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Syde1Q9DBZ9 Nr1h2-202ENSMUST00000107910 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Syde1Q9DBZ9 4930526A20Rik-201ENSMUST00000134228 941 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
Syde1Q9DBZ9 Flt3l-206ENSMUST00000210197 834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Syde1Q9DBZ9 Calm2-201ENSMUST00000040440 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Syde1Q9DBZ9 Etfb-201ENSMUST00000004729 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Syde1Q9DBZ9 Cnn2-201ENSMUST00000004784 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Syde1Q9DBZ9 Nudt1-201ENSMUST00000050205 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Syde1Q9DBZ9 4933427E11Rik-201ENSMUST00000056711 1214 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
Syde1Q9DBZ9 Cebpg-201ENSMUST00000070191 914 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Syde1Q9DBZ9 Nudt1-202ENSMUST00000071881 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Syde1Q9DBZ9 Rps6ka2-201ENSMUST00000024575 5404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Syde1Q9DBZ9 Col9a3-203ENSMUST00000132527 3046 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Syde1Q9DBZ9 Kmt2b-201ENSMUST00000006470 8469 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
Syde1Q9DBZ9 Fbxw5-201ENSMUST00000015239 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Syde1Q9DBZ9 Ppp1r3f-201ENSMUST00000115742 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Syde1Q9DBZ9 Pmpcb-201ENSMUST00000030882 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Syde1Q9DBZ9 Nudt16-201ENSMUST00000035179 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Syde1Q9DBZ9 Clasp2-204ENSMUST00000213663 2727 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Syde1Q9DBZ9 Hmga1-204ENSMUST00000118570 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Syde1Q9DBZ9 Tmem81-201ENSMUST00000058167 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Syde1Q9DBZ9 Khdrbs2-201ENSMUST00000027226 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Syde1Q9DBZ9 Ctnnal1-202ENSMUST00000107612 850 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Syde1Q9DBZ9 Zkscan8-202ENSMUST00000110481 728 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Syde1Q9DBZ9 Zfp524-203ENSMUST00000209030 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Syde1Q9DBZ9 Umpk-ps-201ENSMUST00000211897 827 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
Syde1Q9DBZ9 Alyref-201ENSMUST00000026125 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Syde1Q9DBZ9 4933427J07Rik-201ENSMUST00000156275 1533 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Syde1Q9DBZ9 Bud23-202ENSMUST00000085984 1516 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Syde1Q9DBZ9 Pdx1-201ENSMUST00000085591 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Syde1Q9DBZ9 Tlk2-201ENSMUST00000015107 3212 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Syde1Q9DBZ9 Mag-207ENSMUST00000191081 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Syde1Q9DBZ9 Cebpg-202ENSMUST00000130491 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Syde1Q9DBZ9 Lysmd4-209ENSMUST00000208998 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Syde1Q9DBZ9 Gabbr1-202ENSMUST00000172789 1460 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Syde1Q9DBZ9 Atxn2-201ENSMUST00000051950 4472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Syde1Q9DBZ9 Kdelr2-201ENSMUST00000110731 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Syde1Q9DBZ9 Sema3c-201ENSMUST00000030568 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Syde1Q9DBZ9 Pdzd8-201ENSMUST00000099274 7076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Syde1Q9DBZ9 Ino80e-201ENSMUST00000050833 1944 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Syde1Q9DBZ9 Eva1c-201ENSMUST00000037539 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Syde1Q9DBZ9 Mtg2-202ENSMUST00000108901 1444 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.9 ms