Protein–RNA interactions for Protein: Q9DBU5

Rnf6, E3 ubiquitin-protein ligase RNF6, mousemouse

Predictions only

Length 667 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnf6Q9DBU5 Cyr61-201ENSMUST00000029846 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Rnf6Q9DBU5 Rpf1-201ENSMUST00000029838 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Rnf6Q9DBU5 Pi4k2b-201ENSMUST00000031081 3139 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Rnf6Q9DBU5 Fgf4-201ENSMUST00000060336 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Rnf6Q9DBU5 Rev1-201ENSMUST00000027251 4262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Rnf6Q9DBU5 4930426L09Rik-201ENSMUST00000028069 1459 ntAPPRIS P1 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Rnf6Q9DBU5 Sars2-201ENSMUST00000094632 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Rnf6Q9DBU5 Lpgat1-202ENSMUST00000110856 2792 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Rnf6Q9DBU5 Carmn-201ENSMUST00000181155 1778 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Rnf6Q9DBU5 Tlx1os-201ENSMUST00000173437 620 ntTSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Rnf6Q9DBU5 Id1-201ENSMUST00000038368 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Rnf6Q9DBU5 Tacc3-203ENSMUST00000114426 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Rnf6Q9DBU5 Ppan-201ENSMUST00000004203 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Rnf6Q9DBU5 Gm26676-201ENSMUST00000181877 2226 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Rnf6Q9DBU5 Ext2-212ENSMUST00000184931 2629 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Rnf6Q9DBU5 Gm20604-201ENSMUST00000174651 2795 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Rnf6Q9DBU5 Fam71e1-202ENSMUST00000205359 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Rnf6Q9DBU5 Dkk4-201ENSMUST00000033936 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Rnf6Q9DBU5 Ttc14-203ENSMUST00000117915 4913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Rnf6Q9DBU5 Vrk2-201ENSMUST00000078362 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.54
Rnf6Q9DBU5 Slc23a4-205ENSMUST00000201355 2003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Rnf6Q9DBU5 Apba1-201ENSMUST00000025830 6632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Rnf6Q9DBU5 Ctsh-201ENSMUST00000034915 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Rnf6Q9DBU5 A130014A01Rik-201ENSMUST00000183021 2323 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
Rnf6Q9DBU5 Nfkbib-201ENSMUST00000032815 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Rnf6Q9DBU5 Scamp4-201ENSMUST00000079883 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Rnf6Q9DBU5 Tmem132e-201ENSMUST00000054245 4386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Rnf6Q9DBU5 Tbc1d9b-202ENSMUST00000101270 5213 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Rnf6Q9DBU5 1110046J04Rik-201ENSMUST00000147622 397 ntTSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Rnf6Q9DBU5 Snx12-204ENSMUST00000156473 1114 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Rnf6Q9DBU5 Gm17098-201ENSMUST00000166507 628 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Rnf6Q9DBU5 Gm9731-201ENSMUST00000209480 747 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
Rnf6Q9DBU5 Dctn3-201ENSMUST00000030158 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Rnf6Q9DBU5 Tm2d1-201ENSMUST00000030292 952 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Rnf6Q9DBU5 Tmem239-201ENSMUST00000055421 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Rnf6Q9DBU5 H13-204ENSMUST00000125366 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Rnf6Q9DBU5 Epn1-201ENSMUST00000045277 2334 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Rnf6Q9DBU5 Sec1-201ENSMUST00000040636 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Rnf6Q9DBU5 Vac14-201ENSMUST00000034190 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Rnf6Q9DBU5 Praf2-201ENSMUST00000033489 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Rnf6Q9DBU5 Phb-204ENSMUST00000125172 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Rnf6Q9DBU5 Nr1h2-213ENSMUST00000167197 1944 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Rnf6Q9DBU5 Zfp92-202ENSMUST00000086470 2050 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Rnf6Q9DBU5 Vgf-204ENSMUST00000190827 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Rnf6Q9DBU5 Hps4-201ENSMUST00000035279 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Rnf6Q9DBU5 Tfap2a-209ENSMUST00000225180 1828 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
Rnf6Q9DBU5 Krt13-201ENSMUST00000007275 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Rnf6Q9DBU5 Ppp1r1b-201ENSMUST00000078694 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Rnf6Q9DBU5 Mapkapk3-201ENSMUST00000035194 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Rnf6Q9DBU5 Nsmf-202ENSMUST00000074422 2824 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Rnf6Q9DBU5 Csf3-201ENSMUST00000038886 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Rnf6Q9DBU5 Cenps-202ENSMUST00000105695 544 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Rnf6Q9DBU5 Myl6-206ENSMUST00000218127 691 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Rnf6Q9DBU5 Smim15-206ENSMUST00000226042 1092 ntAPPRIS P1 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Rnf6Q9DBU5 Lat-201ENSMUST00000032997 1235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Rnf6Q9DBU5 Crabp1-201ENSMUST00000034830 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Rnf6Q9DBU5 Dnm1-216ENSMUST00000201494 2732 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Rnf6Q9DBU5 Mark3-202ENSMUST00000084953 3365 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Rnf6Q9DBU5 Amigo1-202ENSMUST00000106656 5482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Rnf6Q9DBU5 Ccdc17-201ENSMUST00000051869 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Rnf6Q9DBU5 Gprin1-202ENSMUST00000135343 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Rnf6Q9DBU5 Prss54-205ENSMUST00000213096 1501 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Rnf6Q9DBU5 Gna11-201ENSMUST00000043604 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Rnf6Q9DBU5 Cspg5-202ENSMUST00000196060 3790 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Rnf6Q9DBU5 Csnk2a2-203ENSMUST00000212214 6779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Rnf6Q9DBU5 Osgin2-201ENSMUST00000037198 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Rnf6Q9DBU5 AC121598.2-201ENSMUST00000228376 2325 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
Rnf6Q9DBU5 Nt5dc3-201ENSMUST00000099396 5952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Rnf6Q9DBU5 Gm13181-201ENSMUST00000120117 1069 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
Rnf6Q9DBU5 Gm7638-201ENSMUST00000121348 967 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
Rnf6Q9DBU5 Tex30-204ENSMUST00000128190 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Rnf6Q9DBU5 Gm28374-201ENSMUST00000162374 728 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Rnf6Q9DBU5 Casp3-203ENSMUST00000210534 583 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Rnf6Q9DBU5 Crb3-202ENSMUST00000097299 1206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Rnf6Q9DBU5 4833418N02Rik-202ENSMUST00000146560 1495 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Rnf6Q9DBU5 Mtmr3-202ENSMUST00000109943 5674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Rnf6Q9DBU5 Gm19439-201ENSMUST00000198195 2273 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
Rnf6Q9DBU5 Man2a1-201ENSMUST00000086723 6991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Rnf6Q9DBU5 Gm15635-204ENSMUST00000208024 2539 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
Rnf6Q9DBU5 Ggt6-202ENSMUST00000100903 1387 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Rnf6Q9DBU5 Cct6b-201ENSMUST00000021040 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Rnf6Q9DBU5 Gm16499-203ENSMUST00000204633 2177 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
Rnf6Q9DBU5 Spi1-201ENSMUST00000002180 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Rnf6Q9DBU5 Puf60-201ENSMUST00000002599 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Rnf6Q9DBU5 2810408A11Rik-203ENSMUST00000102580 1640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Rnf6Q9DBU5 Slc25a3-201ENSMUST00000076694 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Rnf6Q9DBU5 Eepd1-201ENSMUST00000040677 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Rnf6Q9DBU5 Clta-203ENSMUST00000107847 1121 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Rnf6Q9DBU5 Echdc2-204ENSMUST00000116309 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Rnf6Q9DBU5 Ubtf-207ENSMUST00000128016 1062 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Rnf6Q9DBU5 Nnat-205ENSMUST00000153739 1146 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Rnf6Q9DBU5 Nnat-206ENSMUST00000172487 404 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Rnf6Q9DBU5 C430014B12Rik-202ENSMUST00000186858 657 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Rnf6Q9DBU5 Zfp787-204ENSMUST00000207628 576 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Rnf6Q9DBU5 Kif7-202ENSMUST00000178048 4524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Rnf6Q9DBU5 Wnt10b-207ENSMUST00000228594 1510 ntAPPRIS P1 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Rnf6Q9DBU5 Elac2-202ENSMUST00000101049 2884 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Rnf6Q9DBU5 Scly-201ENSMUST00000027532 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Rnf6Q9DBU5 Gm43294-201ENSMUST00000202850 2490 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
Rnf6Q9DBU5 Kcnd3-202ENSMUST00000098761 7169 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.5 ms