Protein–RNA interactions for Protein: Q9DB90

Smg9, Protein SMG9, mousemouse

Predictions only

Length 520 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smg9Q9DB90 Txnl4b-201ENSMUST00000034159 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Smg9Q9DB90 Tmem175-204ENSMUST00000146207 1686 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Smg9Q9DB90 Matk-201ENSMUST00000105328 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Smg9Q9DB90 Tle4-201ENSMUST00000052011 4555 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Smg9Q9DB90 Mras-203ENSMUST00000122384 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Smg9Q9DB90 Gm28033-201ENSMUST00000184224 96 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
Smg9Q9DB90 Snhg10-202ENSMUST00000222812 527 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Smg9Q9DB90 Hist1h2af-201ENSMUST00000073261 399 ntAPPRIS P1 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Smg9Q9DB90 Smarcd2-201ENSMUST00000021052 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Smg9Q9DB90 Klhdc8b-214ENSMUST00000195435 1612 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Smg9Q9DB90 Nsmf-204ENSMUST00000102931 2830 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Smg9Q9DB90 Abcd4-210ENSMUST00000223107 2410 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Smg9Q9DB90 Pdgfa-203ENSMUST00000110896 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Smg9Q9DB90 Rsu1-201ENSMUST00000028059 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Smg9Q9DB90 Dtnb-222ENSMUST00000174479 3689 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Smg9Q9DB90 Phf20l1-201ENSMUST00000048188 6670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Smg9Q9DB90 Socs6-203ENSMUST00000125362 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Smg9Q9DB90 Ythdf3-201ENSMUST00000108345 5102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Smg9Q9DB90 Yif1b-203ENSMUST00000108238 1126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Smg9Q9DB90 Tmsb10-202ENSMUST00000114049 690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Smg9Q9DB90 Gm16295-201ENSMUST00000139512 643 ntTSL 3 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Smg9Q9DB90 Gm26620-201ENSMUST00000180542 817 ntAPPRIS P1 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Smg9Q9DB90 Gm8797-201ENSMUST00000192045 490 ntAPPRIS P1 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Smg9Q9DB90 Gm21057-201ENSMUST00000206022 670 ntTSL 3 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Smg9Q9DB90 AC130713.1-201ENSMUST00000228853 1096 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
Smg9Q9DB90 Fam213b-201ENSMUST00000030935 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Smg9Q9DB90 Fbxo24-202ENSMUST00000111002 2306 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.43
Smg9Q9DB90 Ccdc6-203ENSMUST00000147545 5511 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.43
Smg9Q9DB90 Il9r-204ENSMUST00000142396 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Smg9Q9DB90 Gpd1-203ENSMUST00000162194 1515 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.43
Smg9Q9DB90 Hhipl1-201ENSMUST00000021685 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Smg9Q9DB90 Mfsd4a-203ENSMUST00000112370 2565 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Smg9Q9DB90 Cers1-202ENSMUST00000140239 2711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Smg9Q9DB90 Hmgxb3-201ENSMUST00000091884 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Smg9Q9DB90 Stam2-202ENSMUST00000127316 1928 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Smg9Q9DB90 Lhx6-208ENSMUST00000148852 1481 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Smg9Q9DB90 Gm5953-201ENSMUST00000220644 2616 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
Smg9Q9DB90 Atp5c1-202ENSMUST00000114896 1735 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Smg9Q9DB90 Gm37711-201ENSMUST00000194907 1749 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Smg9Q9DB90 Ncam2-202ENSMUST00000067602 3563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Smg9Q9DB90 Gm11950-201ENSMUST00000121615 838 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
Smg9Q9DB90 Cyp4f41-ps-201ENSMUST00000126790 1077 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
Smg9Q9DB90 Rpl14-201ENSMUST00000165532 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Smg9Q9DB90 4930505N22Rik-201ENSMUST00000181820 945 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Smg9Q9DB90 Krt10-202ENSMUST00000211768 557 ntTSL 3 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Smg9Q9DB90 S100a16-202ENSMUST00000098911 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Smg9Q9DB90 4930452B06Rik-201ENSMUST00000102996 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Smg9Q9DB90 Racgap1-213ENSMUST00000171702 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Smg9Q9DB90 Actl10-201ENSMUST00000104928 1501 ntAPPRIS P1 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Smg9Q9DB90 4933427J07Rik-201ENSMUST00000156275 1533 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Smg9Q9DB90 Actl10-202ENSMUST00000226583 1501 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
Smg9Q9DB90 Mtmr1-201ENSMUST00000015358 4634 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Smg9Q9DB90 Slc43a1-202ENSMUST00000111624 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Smg9Q9DB90 Klhl33-201ENSMUST00000164415 1602 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Smg9Q9DB90 Bnip2-203ENSMUST00000117450 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Smg9Q9DB90 Serinc2-201ENSMUST00000105996 1878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Smg9Q9DB90 Negr1-203ENSMUST00000106065 1953 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Smg9Q9DB90 Atp6v0a2-201ENSMUST00000037865 5345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Smg9Q9DB90 Nfkbib-201ENSMUST00000032815 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Smg9Q9DB90 Hoxa10-201ENSMUST00000121043 1436 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Smg9Q9DB90 Fam181a-203ENSMUST00000191218 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Smg9Q9DB90 Tmem254b-201ENSMUST00000022418 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Smg9Q9DB90 Mir770-201ENSMUST00000103252 94 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
Smg9Q9DB90 Ppp1r2-202ENSMUST00000115233 958 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Smg9Q9DB90 Gm6623-201ENSMUST00000173570 544 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
Smg9Q9DB90 Gm38973-201ENSMUST00000206810 878 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Smg9Q9DB90 Pdcd2l-201ENSMUST00000002710 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Smg9Q9DB90 Gm26697-201ENSMUST00000180898 1760 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Smg9Q9DB90 Gm19721-201ENSMUST00000195284 1764 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
Smg9Q9DB90 Cdkl3-207ENSMUST00000109080 2749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Smg9Q9DB90 Unc13a-208ENSMUST00000177517 5654 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Smg9Q9DB90 Irf3-213ENSMUST00000209066 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Smg9Q9DB90 Gnb1-202ENSMUST00000105616 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Smg9Q9DB90 Map4k4-201ENSMUST00000163854 5782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Smg9Q9DB90 Gpc6-204ENSMUST00000125435 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Smg9Q9DB90 Scrib-201ENSMUST00000002603 5599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Smg9Q9DB90 Tgds-201ENSMUST00000022727 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Smg9Q9DB90 Abhd13-201ENSMUST00000048216 5074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Smg9Q9DB90 Zfp623-201ENSMUST00000037260 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Smg9Q9DB90 Hmg20b-204ENSMUST00000122993 1502 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Smg9Q9DB90 Cyp4f16-201ENSMUST00000003416 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Smg9Q9DB90 Hsf4-202ENSMUST00000163734 1630 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Smg9Q9DB90 Sirt7-202ENSMUST00000106183 427 ntTSL 3 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Smg9Q9DB90 Ndufaf8-201ENSMUST00000106223 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Smg9Q9DB90 Mrps18c-203ENSMUST00000112901 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Smg9Q9DB90 Gfod2-203ENSMUST00000155038 951 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Smg9Q9DB90 Gm17092-201ENSMUST00000166606 698 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Smg9Q9DB90 Flg-207ENSMUST00000180293 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Smg9Q9DB90 Mir8112-201ENSMUST00000184382 131 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
Smg9Q9DB90 Nme3-201ENSMUST00000024978 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Smg9Q9DB90 Gm7461-201ENSMUST00000058918 827 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
Smg9Q9DB90 Stxbp5-209ENSMUST00000141722 4702 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Smg9Q9DB90 Tmem131-201ENSMUST00000027290 6546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Smg9Q9DB90 Chd5-205ENSMUST00000164662 9375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Smg9Q9DB90 Gpn3-201ENSMUST00000031420 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Smg9Q9DB90 Nfil3-201ENSMUST00000071065 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Smg9Q9DB90 Lrrc43-201ENSMUST00000094327 2046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Smg9Q9DB90 Tbc1d2b-202ENSMUST00000128874 3473 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Smg9Q9DB90 Tmem51os1-202ENSMUST00000141769 2131 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Smg9Q9DB90 Ttc19-201ENSMUST00000050646 3410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31 ms