Protein–RNA interactions for Protein: Q9DAT5

Trmu, Mitochondrial tRNA-specific 2-thiouridylase 1, mousemouse

Predictions only

Length 417 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TrmuQ9DAT5 Tead3-201ENSMUST00000114799 2448 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
TrmuQ9DAT5 Golga7b-201ENSMUST00000087123 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
TrmuQ9DAT5 Mycl-201ENSMUST00000030407 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
TrmuQ9DAT5 Plekha4-202ENSMUST00000209517 2577 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
TrmuQ9DAT5 Xpo6-213ENSMUST00000168189 4552 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
TrmuQ9DAT5 Klc3-202ENSMUST00000108457 1632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
TrmuQ9DAT5 AW011738-201ENSMUST00000105140 1848 ntAPPRIS P1 BASIC16.19■□□□□ 0.18
TrmuQ9DAT5 Sphk1-202ENSMUST00000063446 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
TrmuQ9DAT5 Gabra5-202ENSMUST00000206382 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
TrmuQ9DAT5 Dync1li2-201ENSMUST00000041769 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
TrmuQ9DAT5 Gm10435-202ENSMUST00000162526 2878 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
TrmuQ9DAT5 Proc-201ENSMUST00000171765 1566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
TrmuQ9DAT5 Rrp9-201ENSMUST00000047721 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
TrmuQ9DAT5 Plbd2-201ENSMUST00000031597 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
TrmuQ9DAT5 AC121965.1-201ENSMUST00000221422 861 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
TrmuQ9DAT5 Nudt14-201ENSMUST00000002881 734 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
TrmuQ9DAT5 Zfp783-201ENSMUST00000095946 670 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
TrmuQ9DAT5 Afg1l-201ENSMUST00000041024 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
TrmuQ9DAT5 Glmn-201ENSMUST00000078021 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
TrmuQ9DAT5 Hipk2-206ENSMUST00000161779 7684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
TrmuQ9DAT5 Itpripl2-201ENSMUST00000178344 6865 ntAPPRIS P1 BASIC16.19■□□□□ 0.18
TrmuQ9DAT5 Tuba3a-201ENSMUST00000088246 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
TrmuQ9DAT5 Letm1-203ENSMUST00000148451 2478 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
TrmuQ9DAT5 Rpf1-201ENSMUST00000029838 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
TrmuQ9DAT5 Cdk12-203ENSMUST00000107539 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
TrmuQ9DAT5 Brpf1-203ENSMUST00000113121 4603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
TrmuQ9DAT5 Ggnbp2-201ENSMUST00000018547 2478 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
TrmuQ9DAT5 Zfp318-201ENSMUST00000113481 7850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
TrmuQ9DAT5 Aurkaip1-203ENSMUST00000105592 1029 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
TrmuQ9DAT5 a-202ENSMUST00000109697 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
TrmuQ9DAT5 1810059H22Rik-205ENSMUST00000204570 690 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
TrmuQ9DAT5 Nenf-201ENSMUST00000046770 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
TrmuQ9DAT5 Snrpc-201ENSMUST00000071006 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
TrmuQ9DAT5 Dtx2-203ENSMUST00000111144 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
TrmuQ9DAT5 Sh2b3-201ENSMUST00000040308 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
TrmuQ9DAT5 Gldc-201ENSMUST00000025778 3754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
TrmuQ9DAT5 Itgb7-201ENSMUST00000001327 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
TrmuQ9DAT5 Mef2d-203ENSMUST00000107559 1791 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
TrmuQ9DAT5 Hpn-209ENSMUST00000168884 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
TrmuQ9DAT5 Lrriq4-203ENSMUST00000172350 1797 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
TrmuQ9DAT5 Glis1-201ENSMUST00000046005 2906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
TrmuQ9DAT5 Kcmf1-201ENSMUST00000068697 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
TrmuQ9DAT5 Ccdc85c-201ENSMUST00000136175 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
TrmuQ9DAT5 Cnksr2-201ENSMUST00000026750 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
TrmuQ9DAT5 Gm5421-201ENSMUST00000181698 2354 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
TrmuQ9DAT5 Pnpt1-201ENSMUST00000020756 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
TrmuQ9DAT5 Nipsnap1-201ENSMUST00000038570 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
TrmuQ9DAT5 Mpig6b-201ENSMUST00000097337 2252 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
TrmuQ9DAT5 Klf13-201ENSMUST00000063694 6396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
TrmuQ9DAT5 Ina-201ENSMUST00000037636 3240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
TrmuQ9DAT5 Bambi-201ENSMUST00000025075 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
TrmuQ9DAT5 Dvl3-204ENSMUST00000171774 2319 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
TrmuQ9DAT5 Ell2-201ENSMUST00000001583 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
TrmuQ9DAT5 Tbc1d9-201ENSMUST00000034145 4631 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
TrmuQ9DAT5 Mgll-203ENSMUST00000113582 1034 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
TrmuQ9DAT5 Nfu1-201ENSMUST00000032060 948 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
TrmuQ9DAT5 Dph1-201ENSMUST00000044949 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
TrmuQ9DAT5 Gnb5-201ENSMUST00000076889 1188 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
TrmuQ9DAT5 Zscan25-201ENSMUST00000094116 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
TrmuQ9DAT5 Col11a2-202ENSMUST00000114252 5620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
TrmuQ9DAT5 Camk2n1-201ENSMUST00000050918 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
TrmuQ9DAT5 Ikbke-204ENSMUST00000161764 2867 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
TrmuQ9DAT5 Dgkz-202ENSMUST00000099709 3512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
TrmuQ9DAT5 Fam219b-202ENSMUST00000114200 3017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
TrmuQ9DAT5 Snx27-201ENSMUST00000029783 6261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
TrmuQ9DAT5 Pde8b-208ENSMUST00000162292 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
TrmuQ9DAT5 Snapc2-201ENSMUST00000011981 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
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TrmuQ9DAT5 Vax2-201ENSMUST00000037807 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
TrmuQ9DAT5 Gm10493-201ENSMUST00000097270 612 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
TrmuQ9DAT5 Shank3-203ENSMUST00000109309 7365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
TrmuQ9DAT5 Prr14-201ENSMUST00000033095 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
TrmuQ9DAT5 Pld2-203ENSMUST00000108557 3655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
TrmuQ9DAT5 Rab37-202ENSMUST00000067754 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
TrmuQ9DAT5 1810010K12Rik-201ENSMUST00000070378 1324 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
TrmuQ9DAT5 Lrrn2-201ENSMUST00000027706 3428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
TrmuQ9DAT5 Ebf1-203ENSMUST00000109268 2864 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
TrmuQ9DAT5 Dancr-204ENSMUST00000132389 2347 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
TrmuQ9DAT5 Nos1ap-207ENSMUST00000161966 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
TrmuQ9DAT5 Mepce-201ENSMUST00000031740 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
TrmuQ9DAT5 Gpr161-202ENSMUST00000178700 1827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
TrmuQ9DAT5 Map1s-201ENSMUST00000019405 3314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
TrmuQ9DAT5 Cdh24-201ENSMUST00000067784 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
TrmuQ9DAT5 Vangl2-203ENSMUST00000111264 2349 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
TrmuQ9DAT5 Tomm6-202ENSMUST00000113302 749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
TrmuQ9DAT5 4930505A04Rik-201ENSMUST00000041763 904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
TrmuQ9DAT5 Adnp2-201ENSMUST00000066743 5012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
TrmuQ9DAT5 Acap3-201ENSMUST00000079031 4301 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
TrmuQ9DAT5 Ccnyl1-202ENSMUST00000114077 3281 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
TrmuQ9DAT5 Lrp12-202ENSMUST00000110305 4244 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
TrmuQ9DAT5 Large1-204ENSMUST00000212459 4746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
TrmuQ9DAT5 Fmnl3-203ENSMUST00000120633 4290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
TrmuQ9DAT5 Glt28d2-201ENSMUST00000033643 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 66.4 ms