Protein–RNA interactions for Protein: Q9DA73

Ccdc89, Coiled-coil domain-containing protein 89, mousemouse

Predictions only

Length 370 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc89Q9DA73 Arhgef10-201ENSMUST00000084207 5528 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Ccdc89Q9DA73 Ptprs-201ENSMUST00000067538 6855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Ccdc89Q9DA73 Klf14-201ENSMUST00000101589 3056 ntAPPRIS P1 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Ccdc89Q9DA73 Naa10-205ENSMUST00000114390 797 ntTSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Ccdc89Q9DA73 Mrpl39-201ENSMUST00000116584 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Ccdc89Q9DA73 Ankra2-203ENSMUST00000123924 2328 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Ccdc89Q9DA73 4930461C15Rik-201ENSMUST00000133622 1302 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Ccdc89Q9DA73 Lhfpl4-201ENSMUST00000162280 4762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Ccdc89Q9DA73 1700101I19Rik-202ENSMUST00000186712 510 ntBASIC18.87■□□□□ 0.61
Ccdc89Q9DA73 Vgll2-201ENSMUST00000058347 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Ccdc89Q9DA73 Senp3-202ENSMUST00000066760 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Ccdc89Q9DA73 Nfe2l1-202ENSMUST00000107657 3869 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Ccdc89Q9DA73 Tm7sf3-201ENSMUST00000037709 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Ccdc89Q9DA73 Appl2-201ENSMUST00000020500 3020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Ccdc89Q9DA73 Sarm1-202ENSMUST00000108287 4868 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Ccdc89Q9DA73 Cdipt-201ENSMUST00000032920 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Ccdc89Q9DA73 Aldh2-202ENSMUST00000129753 1799 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Ccdc89Q9DA73 Snrnp48-201ENSMUST00000091641 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Ccdc89Q9DA73 Kdm2a-202ENSMUST00000075856 7242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Ccdc89Q9DA73 Pitx3-201ENSMUST00000026259 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Ccdc89Q9DA73 4833428L15Rik-202ENSMUST00000215652 641 ntTSL 3 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Ccdc89Q9DA73 Itpkb-201ENSMUST00000070181 6235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Ccdc89Q9DA73 Rara-204ENSMUST00000107475 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Ccdc89Q9DA73 Ank1-203ENSMUST00000110688 7206 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Ccdc89Q9DA73 Donson-201ENSMUST00000023682 2360 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Ccdc89Q9DA73 Slc23a4-205ENSMUST00000201355 2003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Ccdc89Q9DA73 Ttc13-201ENSMUST00000041614 3038 ntTSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Ccdc89Q9DA73 Negr1-203ENSMUST00000106065 1953 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Ccdc89Q9DA73 Gm10649-203ENSMUST00000148066 1812 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Ccdc89Q9DA73 Prps1l3-201ENSMUST00000139049 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Ccdc89Q9DA73 Atp1b1-201ENSMUST00000027863 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Ccdc89Q9DA73 Bean1-201ENSMUST00000093245 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Ccdc89Q9DA73 9430097D07Rik-201ENSMUST00000100190 1501 ntAPPRIS P1 BASIC18.85■□□□□ 0.61
Ccdc89Q9DA73 Rnf146-202ENSMUST00000160144 4323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Ccdc89Q9DA73 Pitpnm1-201ENSMUST00000049658 4206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Ccdc89Q9DA73 Smpdl3b-201ENSMUST00000030709 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Ccdc89Q9DA73 Mettl4-ps1-202ENSMUST00000130218 1323 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Ccdc89Q9DA73 Rbm39-202ENSMUST00000109584 667 ntTSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
Ccdc89Q9DA73 Atp8a1-204ENSMUST00000113652 854 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Ccdc89Q9DA73 Gm4974-201ENSMUST00000209974 875 ntBASIC18.85■□□□□ 0.61
Ccdc89Q9DA73 CT025689.6-201ENSMUST00000224991 1104 ntBASIC18.85■□□□□ 0.61
Ccdc89Q9DA73 Ly6g6d-201ENSMUST00000007259 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Ccdc89Q9DA73 Syngr1-202ENSMUST00000009728 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Ccdc89Q9DA73 Cep135-202ENSMUST00000121979 5537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
Ccdc89Q9DA73 Tra2a-204ENSMUST00000204189 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Ccdc89Q9DA73 Tia1-203ENSMUST00000095754 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
Ccdc89Q9DA73 Gprc5c-203ENSMUST00000122967 1709 ntTSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
Ccdc89Q9DA73 Gm17055-201ENSMUST00000166951 2232 ntTSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
Ccdc89Q9DA73 Cep68-204ENSMUST00000162811 2788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Ccdc89Q9DA73 Ep300-201ENSMUST00000068387 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Ccdc89Q9DA73 Adrb2-201ENSMUST00000053640 2143 ntAPPRIS P1 BASIC18.85■□□□□ 0.61
Ccdc89Q9DA73 Glmn-201ENSMUST00000078021 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Ccdc89Q9DA73 2810425M01Rik-201ENSMUST00000180790 1850 ntTSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
Ccdc89Q9DA73 Rps6ka1-202ENSMUST00000105894 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Ccdc89Q9DA73 Ilk-212ENSMUST00000163389 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Ccdc89Q9DA73 Speg-203ENSMUST00000113588 1078 ntTSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
Ccdc89Q9DA73 Gm43183-201ENSMUST00000200632 547 ntBASIC18.84■□□□□ 0.61
Ccdc89Q9DA73 Gm34933-201ENSMUST00000203245 1067 ntTSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
Ccdc89Q9DA73 Elac2-202ENSMUST00000101049 2884 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
Ccdc89Q9DA73 Prkra-201ENSMUST00000002808 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Ccdc89Q9DA73 Ppp1r1b-201ENSMUST00000078694 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Ccdc89Q9DA73 Mink1-202ENSMUST00000072873 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
Ccdc89Q9DA73 Syt9-201ENSMUST00000073459 3817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Ccdc89Q9DA73 Fam181a-201ENSMUST00000179363 1406 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.61
Ccdc89Q9DA73 Esyt2-205ENSMUST00000220816 4287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
Ccdc89Q9DA73 Mpped2-202ENSMUST00000111063 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
Ccdc89Q9DA73 Fbxl15-201ENSMUST00000026256 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
Ccdc89Q9DA73 Crct1-202ENSMUST00000107301 460 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.6
Ccdc89Q9DA73 Gm5643-201ENSMUST00000117081 966 ntBASIC18.83■□□□□ 0.6
Ccdc89Q9DA73 Gm28914-201ENSMUST00000188115 667 ntTSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.6
Ccdc89Q9DA73 Gm10517-202ENSMUST00000192970 758 ntBASIC18.83■□□□□ 0.6
Ccdc89Q9DA73 Gm10638-201ENSMUST00000098532 905 ntAPPRIS P1 BASIC18.83■□□□□ 0.6
Ccdc89Q9DA73 Eva1c-202ENSMUST00000099543 1554 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Ccdc89Q9DA73 Tubgcp4-203ENSMUST00000110658 4250 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Ccdc89Q9DA73 Lrp5-201ENSMUST00000025856 5161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Ccdc89Q9DA73 Trip10-205ENSMUST00000224885 2136 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.83■□□□□ 0.6
Ccdc89Q9DA73 Klhdc8b-210ENSMUST00000193895 2718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.6
Ccdc89Q9DA73 Arhgef16-201ENSMUST00000030898 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Ccdc89Q9DA73 Atxn7l2-204ENSMUST00000119650 2274 ntTSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.6
Ccdc89Q9DA73 Ptges2-201ENSMUST00000028162 4978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Ccdc89Q9DA73 Sntg2-201ENSMUST00000021004 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Ccdc89Q9DA73 Rbbp7-203ENSMUST00000112327 1862 ntTSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
Ccdc89Q9DA73 A130014A01Rik-201ENSMUST00000183021 2323 ntBASIC18.82■□□□□ 0.6
Ccdc89Q9DA73 Txnl1-201ENSMUST00000025476 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Ccdc89Q9DA73 Wt1-205ENSMUST00000143043 3090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Ccdc89Q9DA73 D330023K18Rik-201ENSMUST00000133550 920 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Ccdc89Q9DA73 Rpl18-202ENSMUST00000209287 1027 ntTSL 3 BASIC18.82■□□□□ 0.6
Ccdc89Q9DA73 Tmem42-202ENSMUST00000213514 631 ntTSL 3 BASIC18.82■□□□□ 0.6
Ccdc89Q9DA73 Msx2-201ENSMUST00000021922 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Ccdc89Q9DA73 Zdhhc6-207ENSMUST00000224897 2168 ntAPPRIS P1 BASIC18.82■□□□□ 0.6
Ccdc89Q9DA73 Dlx3-201ENSMUST00000092768 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Ccdc89Q9DA73 Capg-202ENSMUST00000114071 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Ccdc89Q9DA73 Fam57b-201ENSMUST00000079423 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Ccdc89Q9DA73 C030014I23Rik-201ENSMUST00000080911 1810 ntBASIC18.81■□□□□ 0.6
Ccdc89Q9DA73 Adgrb2-204ENSMUST00000106015 4982 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Ccdc89Q9DA73 Btbd10-203ENSMUST00000119278 2394 ntTSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
Ccdc89Q9DA73 Hist1h4c-201ENSMUST00000102967 820 ntAPPRIS P1 BASIC18.81■□□□□ 0.6
Ccdc89Q9DA73 Mrpl10-202ENSMUST00000054252 744 ntTSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
Ccdc89Q9DA73 Eif2b5-201ENSMUST00000003320 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Ccdc89Q9DA73 Lrrfip2-202ENSMUST00000098340 3191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.3 ms