Protein–RNA interactions for Protein: Q9D8E6

Rpl4, 60S ribosomal protein L4, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 419 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rpl4Q9D8E6 Zc3h14-202ENSMUST00000057000 3046 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Rpl4Q9D8E6 Hmg20b-204ENSMUST00000122993 1502 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Rpl4Q9D8E6 Ngrn-201ENSMUST00000117989 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.38
Rpl4Q9D8E6 Dus3l-201ENSMUST00000007747 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.38
Rpl4Q9D8E6 Adcy2-201ENSMUST00000022013 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Rpl4Q9D8E6 Psme3-201ENSMUST00000019470 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Rpl4Q9D8E6 Ddx39b-203ENSMUST00000173731 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Rpl4Q9D8E6 Bcl9l-206ENSMUST00000220303 5760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Rpl4Q9D8E6 Ncor1-203ENSMUST00000069456 3171 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Rpl4Q9D8E6 Fst-202ENSMUST00000223640 2612 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
Rpl4Q9D8E6 Fdps-203ENSMUST00000196709 1382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Rpl4Q9D8E6 Tmem81-201ENSMUST00000058167 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Rpl4Q9D8E6 4930447C04Rik-201ENSMUST00000044000 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Rpl4Q9D8E6 Tmc6-202ENSMUST00000103025 1279 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Rpl4Q9D8E6 1810010H24Rik-201ENSMUST00000106767 1100 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Rpl4Q9D8E6 Has3-202ENSMUST00000175987 1154 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Rpl4Q9D8E6 Gm21057-201ENSMUST00000206022 670 ntTSL 3 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Rpl4Q9D8E6 Fbxo36-201ENSMUST00000097672 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Rpl4Q9D8E6 Chka-201ENSMUST00000025760 2319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Rpl4Q9D8E6 Actl10-201ENSMUST00000104928 1501 ntAPPRIS P1 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Rpl4Q9D8E6 Il9r-204ENSMUST00000142396 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Rpl4Q9D8E6 Prss54-205ENSMUST00000213096 1501 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Rpl4Q9D8E6 Actl10-202ENSMUST00000226583 1501 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
Rpl4Q9D8E6 Baiap2-202ENSMUST00000075180 3518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Rpl4Q9D8E6 Lifr-202ENSMUST00000164529 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Rpl4Q9D8E6 Cdh4-201ENSMUST00000000314 6388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Rpl4Q9D8E6 Plekha4-206ENSMUST00000211155 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Rpl4Q9D8E6 Magix-201ENSMUST00000115695 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Rpl4Q9D8E6 Diaph1-205ENSMUST00000115634 5666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Rpl4Q9D8E6 Tbc1d13-201ENSMUST00000044556 3595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Rpl4Q9D8E6 Brpf1-204ENSMUST00000113122 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Rpl4Q9D8E6 Asap2-202ENSMUST00000064595 5678 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Rpl4Q9D8E6 Coq5-201ENSMUST00000040421 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Rpl4Q9D8E6 Acot7-206ENSMUST00000167926 1505 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Rpl4Q9D8E6 Nptx1-201ENSMUST00000026670 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Rpl4Q9D8E6 Gm24589-201ENSMUST00000116692 94 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
Rpl4Q9D8E6 Cyp4f41-ps-201ENSMUST00000126790 1077 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
Rpl4Q9D8E6 Mgarp-201ENSMUST00000038154 1232 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Rpl4Q9D8E6 Pafah1b3-201ENSMUST00000005583 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Rpl4Q9D8E6 Gm5953-201ENSMUST00000220644 2616 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
Rpl4Q9D8E6 Hsf4-202ENSMUST00000163734 1630 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Rpl4Q9D8E6 Nudt11-201ENSMUST00000103007 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Rpl4Q9D8E6 Hspb6-201ENSMUST00000044048 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Rpl4Q9D8E6 Rnf44-204ENSMUST00000125871 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Rpl4Q9D8E6 Krt13-201ENSMUST00000007275 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Rpl4Q9D8E6 Gm26798-201ENSMUST00000181384 2837 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Rpl4Q9D8E6 Atp5g1-202ENSMUST00000107684 596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Rpl4Q9D8E6 Tpm2-203ENSMUST00000107914 1164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Rpl4Q9D8E6 Odf3b-201ENSMUST00000049968 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Rpl4Q9D8E6 Man1c1-201ENSMUST00000038628 4285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Rpl4Q9D8E6 Mtch2-205ENSMUST00000136872 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Rpl4Q9D8E6 Gm45606-201ENSMUST00000209836 2795 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
Rpl4Q9D8E6 Tia1-203ENSMUST00000095754 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Rpl4Q9D8E6 Lrrc75b-201ENSMUST00000051129 4601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Rpl4Q9D8E6 Gls-204ENSMUST00000114513 4966 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Rpl4Q9D8E6 Spata2l-202ENSMUST00000166768 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Rpl4Q9D8E6 Hhat-203ENSMUST00000128619 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Rpl4Q9D8E6 C630004M23Rik-201ENSMUST00000194765 1682 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
Rpl4Q9D8E6 Dlgap2-209ENSMUST00000152652 3842 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Rpl4Q9D8E6 Itgb5-202ENSMUST00000115028 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Rpl4Q9D8E6 Nmnat3-202ENSMUST00000112937 1898 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Rpl4Q9D8E6 Wbp2-202ENSMUST00000106444 1012 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Rpl4Q9D8E6 Smim1-210ENSMUST00000146054 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Rpl4Q9D8E6 Spr-ps1-201ENSMUST00000089584 605 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
Rpl4Q9D8E6 Tmem35b-201ENSMUST00000094712 1120 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Rpl4Q9D8E6 Gm43213-201ENSMUST00000151866 1790 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
Rpl4Q9D8E6 Wtap-205ENSMUST00000160781 2442 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Rpl4Q9D8E6 Tdrd12-201ENSMUST00000032701 1620 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Rpl4Q9D8E6 Herpud2-201ENSMUST00000008573 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Rpl4Q9D8E6 Nck2-201ENSMUST00000086421 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Rpl4Q9D8E6 Sept9-201ENSMUST00000019038 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Rpl4Q9D8E6 Fam71e1-202ENSMUST00000205359 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Rpl4Q9D8E6 Polr3d-201ENSMUST00000000793 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Rpl4Q9D8E6 Mark2-203ENSMUST00000051711 2867 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Rpl4Q9D8E6 Kcnk4-201ENSMUST00000025908 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Rpl4Q9D8E6 Mthfd2-201ENSMUST00000005810 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Rpl4Q9D8E6 Proc-201ENSMUST00000171765 1566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Rpl4Q9D8E6 Antxr1-201ENSMUST00000042025 5253 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Rpl4Q9D8E6 Rasl10b-202ENSMUST00000108140 3156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Rpl4Q9D8E6 Cnpy1-201ENSMUST00000117098 2661 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Rpl4Q9D8E6 Atp8b2-202ENSMUST00000107396 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Rpl4Q9D8E6 Prkcz-203ENSMUST00000105624 694 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Rpl4Q9D8E6 Echdc2-203ENSMUST00000116307 893 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Rpl4Q9D8E6 Sqor-201ENSMUST00000005953 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Rpl4Q9D8E6 Larp1b-202ENSMUST00000048490 2354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Rpl4Q9D8E6 Scrib-203ENSMUST00000109946 5545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Rpl4Q9D8E6 Erlin1-202ENSMUST00000112028 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Rpl4Q9D8E6 Col4a3bp-202ENSMUST00000109444 5285 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Rpl4Q9D8E6 Ccser1-203ENSMUST00000126214 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Rpl4Q9D8E6 Ppt2-205ENSMUST00000169067 1392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Rpl4Q9D8E6 Nipsnap3b-201ENSMUST00000015391 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Rpl4Q9D8E6 Tpbgl-201ENSMUST00000178124 3022 ntAPPRIS P1 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Rpl4Q9D8E6 Naa60-212ENSMUST00000186375 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Rpl4Q9D8E6 4833445I07Rik-201ENSMUST00000193193 1642 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
Rpl4Q9D8E6 Klhdc8b-214ENSMUST00000195435 1612 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Rpl4Q9D8E6 Rfx7-201ENSMUST00000093820 7988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Rpl4Q9D8E6 Azi2-207ENSMUST00000134433 2499 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Rpl4Q9D8E6 Zfp282-201ENSMUST00000061890 5573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Rpl4Q9D8E6 9330171B17Rik-201ENSMUST00000035939 2073 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
Rpl4Q9D8E6 Adgrl1-207ENSMUST00000141158 8181 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.3 ms