Protein–RNA interactions for Protein: Q9D883

U2af1, Splicing factor U2AF 35 kDa subunit, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 239 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
U2af1Q9D883 Mmd-202ENSMUST00000107887 1654 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
U2af1Q9D883 Gm16061-201ENSMUST00000122167 857 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
U2af1Q9D883 Auh-202ENSMUST00000110031 3235 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
U2af1Q9D883 Ahcyl2-202ENSMUST00000102995 5155 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
U2af1Q9D883 Ago4-201ENSMUST00000084289 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
U2af1Q9D883 Panx2-203ENSMUST00000162424 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
U2af1Q9D883 Nptn-212ENSMUST00000177292 1390 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
U2af1Q9D883 Irf3-213ENSMUST00000209066 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
U2af1Q9D883 Nova2-202ENSMUST00000220302 8372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
U2af1Q9D883 Nova2-201ENSMUST00000032571 8372 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
U2af1Q9D883 Derl3-201ENSMUST00000009236 1321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
U2af1Q9D883 Sept10-203ENSMUST00000220156 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
U2af1Q9D883 Trim45-202ENSMUST00000094048 1815 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
U2af1Q9D883 Tm7sf2-201ENSMUST00000025713 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
U2af1Q9D883 Prickle4-201ENSMUST00000113299 990 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
U2af1Q9D883 Prickle4-202ENSMUST00000113300 1110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
U2af1Q9D883 Gm34933-201ENSMUST00000203245 1067 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
U2af1Q9D883 Gm9745-201ENSMUST00000021573 684 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
U2af1Q9D883 Banf1-201ENSMUST00000025762 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
U2af1Q9D883 Slc25a47-202ENSMUST00000221080 1890 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
U2af1Q9D883 Sim1-202ENSMUST00000219436 1687 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
U2af1Q9D883 Tm9sf2-203ENSMUST00000171318 1494 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
U2af1Q9D883 Gm26781-201ENSMUST00000181385 1477 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
U2af1Q9D883 Thegl-202ENSMUST00000117880 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
U2af1Q9D883 Fbxw5-201ENSMUST00000015239 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
U2af1Q9D883 Gm1673-202ENSMUST00000114382 451 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
U2af1Q9D883 2010016I18Rik-204ENSMUST00000190356 1562 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
U2af1Q9D883 Ankrd39-202ENSMUST00000194894 664 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
U2af1Q9D883 Arpc4-204ENSMUST00000204802 794 ntTSL 3 BASIC22.61■■□□□ 1.21
U2af1Q9D883 AC122335.2-201ENSMUST00000213901 6181 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
U2af1Q9D883 Zkscan14-201ENSMUST00000031632 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
U2af1Q9D883 Ptpa-202ENSMUST00000113601 1838 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
U2af1Q9D883 Xxylt1-201ENSMUST00000055389 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
U2af1Q9D883 Msl1-204ENSMUST00000107487 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
U2af1Q9D883 Klhl25-201ENSMUST00000092073 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
U2af1Q9D883 Lancl2-202ENSMUST00000072954 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
U2af1Q9D883 Il17rb-202ENSMUST00000122205 2094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
U2af1Q9D883 Mfsd10-202ENSMUST00000114329 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
U2af1Q9D883 Scrib-201ENSMUST00000002603 5599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
U2af1Q9D883 Fam53a-201ENSMUST00000045329 2346 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
U2af1Q9D883 4930448E22Rik-201ENSMUST00000181712 1581 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
U2af1Q9D883 Mtg2-202ENSMUST00000108901 1444 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
U2af1Q9D883 Slc30a9-201ENSMUST00000113676 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
U2af1Q9D883 Hcn2-202ENSMUST00000099513 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
U2af1Q9D883 Ddx41-201ENSMUST00000021956 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
U2af1Q9D883 Asap2-204ENSMUST00000101562 5552 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
U2af1Q9D883 Serf1-205ENSMUST00000152286 465 ntTSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
U2af1Q9D883 4930544I03Rik-201ENSMUST00000181184 1276 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
U2af1Q9D883 Gm17949-201ENSMUST00000210548 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
U2af1Q9D883 Cenps-201ENSMUST00000030813 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
U2af1Q9D883 Olfr279-201ENSMUST00000050451 933 ntAPPRIS P1 BASIC22.6■■□□□ 1.21
U2af1Q9D883 Unc13a-208ENSMUST00000177517 5654 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
U2af1Q9D883 Fbrsl1-206ENSMUST00000198834 2571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
U2af1Q9D883 Hmbox1-203ENSMUST00000175744 1771 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
U2af1Q9D883 Cdk10-201ENSMUST00000036880 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
U2af1Q9D883 Pea15a-201ENSMUST00000013842 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
U2af1Q9D883 Snx14-205ENSMUST00000173011 2238 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
U2af1Q9D883 Adsl-204ENSMUST00000164806 1595 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
U2af1Q9D883 Zfp697-202ENSMUST00000178372 4703 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
U2af1Q9D883 Fam57b-201ENSMUST00000079423 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
U2af1Q9D883 Trim25-202ENSMUST00000100627 1433 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
U2af1Q9D883 Gm7854-202ENSMUST00000187409 1433 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
U2af1Q9D883 Gm21974-201ENSMUST00000126662 2037 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
U2af1Q9D883 Sort1-201ENSMUST00000102632 6796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
U2af1Q9D883 Atp2c1-201ENSMUST00000038118 4876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
U2af1Q9D883 Nr1h2-213ENSMUST00000167197 1944 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
U2af1Q9D883 Ccdc17-201ENSMUST00000051869 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
U2af1Q9D883 Gm29514-202ENSMUST00000186665 2214 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
U2af1Q9D883 Usp13-202ENSMUST00000108228 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
U2af1Q9D883 Eme2-202ENSMUST00000121542 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
U2af1Q9D883 Sgta-201ENSMUST00000005067 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
U2af1Q9D883 Bola2-203ENSMUST00000130498 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
U2af1Q9D883 Gm18032-201ENSMUST00000222541 538 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
U2af1Q9D883 Spout1-201ENSMUST00000100220 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
U2af1Q9D883 D1Ertd622e-204ENSMUST00000153115 3495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
U2af1Q9D883 Rragd-201ENSMUST00000029946 5055 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.2
U2af1Q9D883 Cspg5-205ENSMUST00000199736 2107 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
U2af1Q9D883 Aifm1-201ENSMUST00000037349 2237 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
U2af1Q9D883 Tnfrsf25-201ENSMUST00000025706 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
U2af1Q9D883 Cog2-201ENSMUST00000034460 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
U2af1Q9D883 Spsb2-203ENSMUST00000112473 1322 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
U2af1Q9D883 Cacul1-201ENSMUST00000081790 5790 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
U2af1Q9D883 Dcps-202ENSMUST00000119847 1445 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
U2af1Q9D883 Raver2-201ENSMUST00000038463 4045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
U2af1Q9D883 Rcn1-201ENSMUST00000006128 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
U2af1Q9D883 Clcn2-202ENSMUST00000120099 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
U2af1Q9D883 Hmga1-206ENSMUST00000119486 1003 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
U2af1Q9D883 Gm13474-201ENSMUST00000122466 815 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
U2af1Q9D883 Psmd13-209ENSMUST00000164681 726 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
U2af1Q9D883 Wdr74-202ENSMUST00000210512 1078 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
U2af1Q9D883 Zbtb32-202ENSMUST00000108151 1775 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
U2af1Q9D883 Matn4-204ENSMUST00000109359 2179 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
U2af1Q9D883 St3gal2-201ENSMUST00000034197 4396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
U2af1Q9D883 Htr6-202ENSMUST00000105802 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
U2af1Q9D883 St3gal3-203ENSMUST00000106410 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
U2af1Q9D883 Tle4-201ENSMUST00000052011 4555 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
U2af1Q9D883 Arpc4-201ENSMUST00000156898 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
U2af1Q9D883 Rfx7-201ENSMUST00000093820 7988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
U2af1Q9D883 Nkiras2-201ENSMUST00000017981 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
U2af1Q9D883 Fam110a-204ENSMUST00000109865 1853 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 7.3 ms