Protein–RNA interactions for Protein: Q9D824

Fip1l1, Pre-mRNA 3'-end-processing factor FIP1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 581 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fip1l1Q9D824 Nrxn1-216ENSMUST00000174331 6282 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Fip1l1Q9D824 Dpys-201ENSMUST00000022915 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Fip1l1Q9D824 Atp8b2-210ENSMUST00000168276 4265 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Fip1l1Q9D824 Acaa1a-201ENSMUST00000039784 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Fip1l1Q9D824 Fgfr1-214ENSMUST00000178276 4741 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Fip1l1Q9D824 Arhgef16-201ENSMUST00000030898 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Fip1l1Q9D824 Pick1-206ENSMUST00000166155 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Fip1l1Q9D824 Pnpt1-201ENSMUST00000020756 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Fip1l1Q9D824 Gpr150-201ENSMUST00000056130 2146 ntAPPRIS P1 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Fip1l1Q9D824 Rasgrp1-207ENSMUST00000178884 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Fip1l1Q9D824 Tm2d3-202ENSMUST00000065574 1478 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Fip1l1Q9D824 Zdhhc2-201ENSMUST00000049389 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Fip1l1Q9D824 Dbn1-202ENSMUST00000109921 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Fip1l1Q9D824 Taf5-201ENSMUST00000026027 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Fip1l1Q9D824 Stum-201ENSMUST00000136521 6506 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Fip1l1Q9D824 Dlx1-201ENSMUST00000037119 4111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Fip1l1Q9D824 Prpsap1-201ENSMUST00000106391 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Fip1l1Q9D824 Kcnh2-202ENSMUST00000115098 3193 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Fip1l1Q9D824 Gna12-201ENSMUST00000000153 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Fip1l1Q9D824 Znfx1-201ENSMUST00000048988 7218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Fip1l1Q9D824 Urgcp-201ENSMUST00000053427 5527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Fip1l1Q9D824 Hist1h2ao-201ENSMUST00000091745 480 ntAPPRIS P1 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Fip1l1Q9D824 Sdk1-202ENSMUST00000085774 10352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Fip1l1Q9D824 Rimbp3-201ENSMUST00000169803 5787 ntAPPRIS P1 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Fip1l1Q9D824 Igsf23-201ENSMUST00000043440 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Fip1l1Q9D824 Dnajc25-201ENSMUST00000095070 4023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Fip1l1Q9D824 Gm10649-203ENSMUST00000148066 1812 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Fip1l1Q9D824 Dennd4b-202ENSMUST00000129564 5647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Fip1l1Q9D824 A230050P20Rik-201ENSMUST00000043911 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Fip1l1Q9D824 Gdf1-201ENSMUST00000207684 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Fip1l1Q9D824 Fam129c-208ENSMUST00000143662 2267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Fip1l1Q9D824 Gm10435-202ENSMUST00000162526 2878 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Fip1l1Q9D824 Hist1h4a-201ENSMUST00000102964 539 ntAPPRIS P1 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Fip1l1Q9D824 Tsc22d4-205ENSMUST00000110985 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Fip1l1Q9D824 Rps14-202ENSMUST00000118551 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Fip1l1Q9D824 Pop5-201ENSMUST00000081497 1025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Fip1l1Q9D824 Nrbp1-207ENSMUST00000202576 2221 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Fip1l1Q9D824 Nrbp1-201ENSMUST00000031034 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Fip1l1Q9D824 Hebp2-201ENSMUST00000020000 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Fip1l1Q9D824 Ano8-204ENSMUST00000213382 3785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Fip1l1Q9D824 Ube2i-207ENSMUST00000172868 2755 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Fip1l1Q9D824 Nat8f7-201ENSMUST00000160534 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Fip1l1Q9D824 Nat8f3-201ENSMUST00000050780 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Fip1l1Q9D824 Mms22l-202ENSMUST00000108222 4478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Fip1l1Q9D824 Eefsec-201ENSMUST00000165242 2679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Fip1l1Q9D824 Arrb2-205ENSMUST00000108568 1777 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Fip1l1Q9D824 Wdr41-203ENSMUST00000160115 2851 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Fip1l1Q9D824 Cachd1-202ENSMUST00000097955 4277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Fip1l1Q9D824 Cacna1h-202ENSMUST00000159048 8174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Fip1l1Q9D824 Nedd4l-202ENSMUST00000163516 8163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Fip1l1Q9D824 Pced1a-202ENSMUST00000110277 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Fip1l1Q9D824 Arhgap42-201ENSMUST00000093893 6116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Fip1l1Q9D824 Dhx32-203ENSMUST00000106139 2233 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Fip1l1Q9D824 Gpr137b-ps-203ENSMUST00000220758 1942 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Fip1l1Q9D824 H2afy2-201ENSMUST00000020283 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Fip1l1Q9D824 Stxbp6-201ENSMUST00000053768 4553 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Fip1l1Q9D824 Susd1-202ENSMUST00000107544 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Fip1l1Q9D824 Gm27029-201ENSMUST00000107257 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Fip1l1Q9D824 Elac2-203ENSMUST00000108697 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Fip1l1Q9D824 Zdhhc16-201ENSMUST00000026154 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Fip1l1Q9D824 Cnppd1-208ENSMUST00000190679 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Fip1l1Q9D824 Abcd4-201ENSMUST00000021666 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Fip1l1Q9D824 Rab35-201ENSMUST00000031492 2820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Fip1l1Q9D824 2510002D24Rik-202ENSMUST00000123146 361 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Fip1l1Q9D824 Nt5c-201ENSMUST00000021082 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Fip1l1Q9D824 Tmem145-202ENSMUST00000119703 1781 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Fip1l1Q9D824 Kcnab3-201ENSMUST00000018614 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Fip1l1Q9D824 Mlxip-202ENSMUST00000111596 2653 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Fip1l1Q9D824 Anapc7-201ENSMUST00000031422 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Fip1l1Q9D824 Gas6-201ENSMUST00000033828 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Fip1l1Q9D824 Dhfr-201ENSMUST00000022218 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Fip1l1Q9D824 Prss56-201ENSMUST00000044533 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Fip1l1Q9D824 Gm22325-201ENSMUST00000158904 308 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
Fip1l1Q9D824 Gm27027-201ENSMUST00000183110 547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Fip1l1Q9D824 Gm18671-201ENSMUST00000214826 683 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
Fip1l1Q9D824 Ift74-201ENSMUST00000030311 2139 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Fip1l1Q9D824 Tm9sf1-205ENSMUST00000122358 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Fip1l1Q9D824 Snrk-201ENSMUST00000118886 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Fip1l1Q9D824 Esx1-202ENSMUST00000113066 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Fip1l1Q9D824 Gm26596-201ENSMUST00000180464 2655 ntBASIC16.77■□□□□ 0.27
Fip1l1Q9D824 Emc8-201ENSMUST00000034277 4942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Fip1l1Q9D824 Mxd4-201ENSMUST00000042701 3872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Fip1l1Q9D824 Gramd4-204ENSMUST00000138134 4292 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Fip1l1Q9D824 Cdkl3-203ENSMUST00000109076 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Fip1l1Q9D824 Trip10-201ENSMUST00000019631 2224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Fip1l1Q9D824 Hbs1l-203ENSMUST00000092674 2625 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Fip1l1Q9D824 Sox4-201ENSMUST00000067230 4795 ntAPPRIS P1 BASIC16.77■□□□□ 0.27
Fip1l1Q9D824 Ccnl1-201ENSMUST00000029416 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Fip1l1Q9D824 Lgmn-201ENSMUST00000021607 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Fip1l1Q9D824 Slc29a1-202ENSMUST00000064889 1988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Fip1l1Q9D824 Hps5-202ENSMUST00000107653 4702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Fip1l1Q9D824 Disp3-201ENSMUST00000047720 5282 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Fip1l1Q9D824 Mepce-201ENSMUST00000031740 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Fip1l1Q9D824 Zfx-201ENSMUST00000088102 7002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Fip1l1Q9D824 Gpat3-203ENSMUST00000112887 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Fip1l1Q9D824 Pitpnm1-201ENSMUST00000049658 4206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Fip1l1Q9D824 I0C0044D17Rik-201ENSMUST00000097964 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Fip1l1Q9D824 Rabep1-201ENSMUST00000076270 5408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Fip1l1Q9D824 Trpc1-204ENSMUST00000189137 4559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Fip1l1Q9D824 Sumo2-205ENSMUST00000121185 911 ntTSL 3 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24 ms