Protein–RNA interactions for Protein: Q9D7D7

Cldn23, Claudin-23, mousemouse

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn23Q9D7D7 Cnn1-203ENSMUST00000214601 1225 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Cldn23Q9D7D7 AC156016.1-201ENSMUST00000227190 1035 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
Cldn23Q9D7D7 Ubac2-201ENSMUST00000039803 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Cldn23Q9D7D7 Ocel1-202ENSMUST00000110051 2179 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Cldn23Q9D7D7 Yipf2-201ENSMUST00000034700 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Cldn23Q9D7D7 Fam98b-201ENSMUST00000028825 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Cldn23Q9D7D7 Timm17b-201ENSMUST00000033498 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Cldn23Q9D7D7 Rbpj-203ENSMUST00000113865 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Cldn23Q9D7D7 Ppm1b-202ENSMUST00000112304 3262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Cldn23Q9D7D7 Gm37812-201ENSMUST00000195216 2475 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
Cldn23Q9D7D7 Tmem57-201ENSMUST00000030628 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Cldn23Q9D7D7 Ptges3-202ENSMUST00000084771 1559 ntTSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Cldn23Q9D7D7 Mtmr3-202ENSMUST00000109943 5674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Cldn23Q9D7D7 Myh7b-201ENSMUST00000092995 6163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Cldn23Q9D7D7 Ifrd2-201ENSMUST00000010192 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Cldn23Q9D7D7 Ankib1-201ENSMUST00000043551 6426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Cldn23Q9D7D7 Coil-201ENSMUST00000036649 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Cldn23Q9D7D7 Tmem196-201ENSMUST00000058644 1678 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Cldn23Q9D7D7 Arpc4-201ENSMUST00000156898 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Cldn23Q9D7D7 Nxt1-202ENSMUST00000109961 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Cldn23Q9D7D7 Znhit1-203ENSMUST00000111090 698 ntTSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Cldn23Q9D7D7 Gm32151-201ENSMUST00000223521 915 ntTSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Cldn23Q9D7D7 Odf3b-204ENSMUST00000227834 930 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
Cldn23Q9D7D7 Nxt1-201ENSMUST00000047177 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Cldn23Q9D7D7 Zfp783-201ENSMUST00000095946 670 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
Cldn23Q9D7D7 Hps4-201ENSMUST00000035279 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Cldn23Q9D7D7 Slc11a1-201ENSMUST00000027368 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Cldn23Q9D7D7 8030462N17Rik-201ENSMUST00000074653 3418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Cldn23Q9D7D7 B3gnt9-202ENSMUST00000136822 2516 ntAPPRIS P1 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Cldn23Q9D7D7 Cnpy1-202ENSMUST00000118882 1984 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Cldn23Q9D7D7 Meg3-201ENSMUST00000124106 1988 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Cldn23Q9D7D7 Haus8-201ENSMUST00000035960 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Cldn23Q9D7D7 Senp2-201ENSMUST00000023561 4499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Cldn23Q9D7D7 Mindy2-201ENSMUST00000049031 8081 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Cldn23Q9D7D7 Kcnj4-201ENSMUST00000057801 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Cldn23Q9D7D7 Hspbp1-201ENSMUST00000079970 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Cldn23Q9D7D7 Cspg5-202ENSMUST00000196060 3790 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Cldn23Q9D7D7 Sprtn-201ENSMUST00000034467 4464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Cldn23Q9D7D7 Card10-203ENSMUST00000170584 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Cldn23Q9D7D7 Plppr2-203ENSMUST00000190387 2608 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Cldn23Q9D7D7 Atp2c1-201ENSMUST00000038118 4876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Cldn23Q9D7D7 Lrp5-202ENSMUST00000176867 2759 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Cldn23Q9D7D7 Mal-202ENSMUST00000028854 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Cldn23Q9D7D7 Gtpbp3-208ENSMUST00000168847 2803 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Cldn23Q9D7D7 Rybp-201ENSMUST00000101118 4503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Cldn23Q9D7D7 Nsmf-201ENSMUST00000006646 2922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Cldn23Q9D7D7 Snx3-202ENSMUST00000105499 1057 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Cldn23Q9D7D7 Tmem80-202ENSMUST00000126510 959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Cldn23Q9D7D7 Cdpf1-204ENSMUST00000144067 761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Cldn23Q9D7D7 Rcbtb2-217ENSMUST00000167401 868 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Cldn23Q9D7D7 Zfp428-203ENSMUST00000177205 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Cldn23Q9D7D7 Gm43183-201ENSMUST00000200632 547 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
Cldn23Q9D7D7 Gm10459-201ENSMUST00000202708 1155 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
Cldn23Q9D7D7 Cib1-207ENSMUST00000206084 772 ntTSL 3 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Cldn23Q9D7D7 Banf1-201ENSMUST00000025762 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Cldn23Q9D7D7 Atp5l-201ENSMUST00000043675 544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Cldn23Q9D7D7 Cib1-202ENSMUST00000071457 702 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Cldn23Q9D7D7 Dbndd2-201ENSMUST00000017878 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Cldn23Q9D7D7 Ergic3-202ENSMUST00000088650 1349 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Cldn23Q9D7D7 Ube2k-201ENSMUST00000142407 4893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Cldn23Q9D7D7 Hikeshi-206ENSMUST00000153470 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Cldn23Q9D7D7 4930503L19Rik-201ENSMUST00000067556 2291 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Cldn23Q9D7D7 Uhmk1-202ENSMUST00000123399 7775 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Cldn23Q9D7D7 Lcorl-202ENSMUST00000045586 5708 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Cldn23Q9D7D7 Guca1b-202ENSMUST00000145462 1556 ntTSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Cldn23Q9D7D7 Snx15-201ENSMUST00000025702 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Cldn23Q9D7D7 Amfr-201ENSMUST00000053766 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Cldn23Q9D7D7 Vegfa-201ENSMUST00000024747 2765 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Cldn23Q9D7D7 Gm16712-201ENSMUST00000181962 1960 ntTSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Cldn23Q9D7D7 Lancl2-202ENSMUST00000072954 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Cldn23Q9D7D7 Gm28756-202ENSMUST00000209405 2461 ntTSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Cldn23Q9D7D7 Camsap3-212ENSMUST00000208240 2572 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Cldn23Q9D7D7 Gm11696-201ENSMUST00000070956 2765 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Cldn23Q9D7D7 Larp4b-201ENSMUST00000091829 5720 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Cldn23Q9D7D7 Bpnt1-202ENSMUST00000110965 1046 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Cldn23Q9D7D7 Gm13559-201ENSMUST00000120476 863 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
Cldn23Q9D7D7 4930405A21Rik-202ENSMUST00000139042 994 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Cldn23Q9D7D7 Dusp13-213ENSMUST00000184703 902 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Cldn23Q9D7D7 Gm10138-203ENSMUST00000206952 366 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
Cldn23Q9D7D7 Metrn-201ENSMUST00000002344 987 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Cldn23Q9D7D7 Mpst-203ENSMUST00000169133 1309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Cldn23Q9D7D7 Gm16386-201ENSMUST00000181397 1423 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Cldn23Q9D7D7 Rhod-202ENSMUST00000117462 1495 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Cldn23Q9D7D7 Samd8-201ENSMUST00000022292 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Cldn23Q9D7D7 Zxdc-203ENSMUST00000113539 4864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Cldn23Q9D7D7 Grina-201ENSMUST00000023225 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Cldn23Q9D7D7 Mon2-202ENSMUST00000073792 9301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Cldn23Q9D7D7 Nsg1-201ENSMUST00000031009 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Cldn23Q9D7D7 Ecel1-201ENSMUST00000027463 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Cldn23Q9D7D7 Xpr1-202ENSMUST00000111774 2753 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Cldn23Q9D7D7 Arhgef7-205ENSMUST00000110909 4926 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Cldn23Q9D7D7 Gclm-201ENSMUST00000029769 5589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Cldn23Q9D7D7 Dhx36-201ENSMUST00000029336 5620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Cldn23Q9D7D7 Ppm1a-201ENSMUST00000021514 7668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Cldn23Q9D7D7 Phf20l1-201ENSMUST00000048188 6670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Cldn23Q9D7D7 Yars2-204ENSMUST00000159962 2805 ntTSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Cldn23Q9D7D7 Cep57-208ENSMUST00000147115 2262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Cldn23Q9D7D7 Man2a2-201ENSMUST00000098346 6554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Cldn23Q9D7D7 Slc7a10-201ENSMUST00000001854 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Cldn23Q9D7D7 Slain2-201ENSMUST00000143829 4828 ntTSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.4 ms