Protein–RNA interactions for Protein: Q9D6Z1

Nop56, Nucleolar protein 56, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 580 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nop56Q9D6Z1 Ikzf5-203ENSMUST00000128432 714 ntTSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Nop56Q9D6Z1 Foxi3-202ENSMUST00000163089 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Nop56Q9D6Z1 Stard6-203ENSMUST00000168249 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Nop56Q9D6Z1 Mpig6b-202ENSMUST00000174190 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Nop56Q9D6Z1 Ankrd37-201ENSMUST00000053558 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Nop56Q9D6Z1 Foxi3-201ENSMUST00000069634 1206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Nop56Q9D6Z1 Gm1673-201ENSMUST00000094869 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Nop56Q9D6Z1 4930518J20Rik-201ENSMUST00000195064 1478 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
Nop56Q9D6Z1 Slmap-203ENSMUST00000102956 5476 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Nop56Q9D6Z1 Gm26885-201ENSMUST00000181920 1688 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Nop56Q9D6Z1 Stk32c-202ENSMUST00000165870 1883 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Nop56Q9D6Z1 Gnal-201ENSMUST00000025402 5616 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Nop56Q9D6Z1 Stox2-208ENSMUST00000211737 4573 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Nop56Q9D6Z1 Aim2-204ENSMUST00000166137 2079 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Nop56Q9D6Z1 Ccnd3-215ENSMUST00000183044 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Nop56Q9D6Z1 Fam129c-208ENSMUST00000143662 2267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Nop56Q9D6Z1 Mpst-201ENSMUST00000043865 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Nop56Q9D6Z1 Lrp8-201ENSMUST00000030356 4555 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Nop56Q9D6Z1 Fancg-201ENSMUST00000030165 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Nop56Q9D6Z1 Ankra2-203ENSMUST00000123924 2328 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Nop56Q9D6Z1 4930448E22Rik-202ENSMUST00000215242 2102 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Nop56Q9D6Z1 Nipsnap1-201ENSMUST00000038570 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Nop56Q9D6Z1 Rims3-201ENSMUST00000071093 6505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Nop56Q9D6Z1 Tpra1-223ENSMUST00000204765 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Nop56Q9D6Z1 Mrpl57-201ENSMUST00000022538 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Nop56Q9D6Z1 Snph-203ENSMUST00000109875 4910 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Nop56Q9D6Z1 Clcn2-202ENSMUST00000120099 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Nop56Q9D6Z1 Rab7-202ENSMUST00000113596 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Nop56Q9D6Z1 Dhx32-203ENSMUST00000106139 2233 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Nop56Q9D6Z1 A430078I02Rik-202ENSMUST00000154066 2233 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Nop56Q9D6Z1 Rhof-201ENSMUST00000031401 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Nop56Q9D6Z1 Cfl1-201ENSMUST00000116560 1148 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Nop56Q9D6Z1 Bard1-201ENSMUST00000027393 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Nop56Q9D6Z1 Slc8a3-202ENSMUST00000085238 4927 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Nop56Q9D6Z1 Snx16-201ENSMUST00000029047 2288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Nop56Q9D6Z1 Snrk-201ENSMUST00000118886 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Nop56Q9D6Z1 Ppm1e-201ENSMUST00000055438 6344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Nop56Q9D6Z1 Shc3-201ENSMUST00000021898 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Nop56Q9D6Z1 Gas2-201ENSMUST00000051912 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Nop56Q9D6Z1 Gpr137b-201ENSMUST00000021738 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Nop56Q9D6Z1 Tm2d3-202ENSMUST00000065574 1478 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Nop56Q9D6Z1 Nudt4-201ENSMUST00000020217 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Nop56Q9D6Z1 Sash1-201ENSMUST00000015449 7183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Nop56Q9D6Z1 Aurkaip1-203ENSMUST00000105592 1029 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Nop56Q9D6Z1 Gm29791-202ENSMUST00000207888 369 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
Nop56Q9D6Z1 AC121965.1-201ENSMUST00000221422 861 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Nop56Q9D6Z1 a-201ENSMUST00000029123 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Nop56Q9D6Z1 Dbn1-202ENSMUST00000109921 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Nop56Q9D6Z1 Cdk17-201ENSMUST00000069965 3615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Nop56Q9D6Z1 Sgsm2-201ENSMUST00000057631 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Nop56Q9D6Z1 Eral1-201ENSMUST00000021183 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Nop56Q9D6Z1 Ephb4-203ENSMUST00000111055 4296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Nop56Q9D6Z1 Pon1-201ENSMUST00000002663 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Nop56Q9D6Z1 Igsf8-201ENSMUST00000039506 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Nop56Q9D6Z1 Zmynd19-201ENSMUST00000028350 3903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Nop56Q9D6Z1 Mn1-201ENSMUST00000094463 6860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Nop56Q9D6Z1 Caln1-203ENSMUST00000111288 9327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Nop56Q9D6Z1 Tlk2-204ENSMUST00000106941 3699 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Nop56Q9D6Z1 Naa50-204ENSMUST00000161326 4487 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Nop56Q9D6Z1 Hps5-202ENSMUST00000107653 4702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Nop56Q9D6Z1 Polr2j-202ENSMUST00000111127 900 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Nop56Q9D6Z1 Mpzl1-210ENSMUST00000194437 643 ntTSL 3 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Nop56Q9D6Z1 Gm7514-201ENSMUST00000209475 934 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
Nop56Q9D6Z1 A530016L24Rik-202ENSMUST00000223266 1547 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Nop56Q9D6Z1 Asph-204ENSMUST00000084915 2884 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Nop56Q9D6Z1 Capzb-202ENSMUST00000042675 1604 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
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Nop56Q9D6Z1 Slc16a3-202ENSMUST00000100130 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
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Nop56Q9D6Z1 Efr3a-201ENSMUST00000015146 5215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Nop56Q9D6Z1 Gm26674-201ENSMUST00000180770 1446 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Nop56Q9D6Z1 Slc37a4-203ENSMUST00000213388 2344 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Nop56Q9D6Z1 Fam72a-201ENSMUST00000068613 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Nop56Q9D6Z1 Rnf168-203ENSMUST00000171474 4460 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Nop56Q9D6Z1 Kif21a-204ENSMUST00000109287 6124 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Nop56Q9D6Z1 Kif21a-205ENSMUST00000109288 6142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Nop56Q9D6Z1 Cnot9-201ENSMUST00000087215 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Nop56Q9D6Z1 Ergic3-201ENSMUST00000006035 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Nop56Q9D6Z1 Hif3a-201ENSMUST00000037762 2206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Nop56Q9D6Z1 Agfg1-205ENSMUST00000187899 2078 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Nop56Q9D6Z1 Kcnab3-201ENSMUST00000018614 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Nop56Q9D6Z1 Hivep3-201ENSMUST00000084306 2973 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
Nop56Q9D6Z1 Pld2-201ENSMUST00000018429 3659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Nop56Q9D6Z1 Ssfa2-201ENSMUST00000111784 4999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Nop56Q9D6Z1 Ltbp1-201ENSMUST00000001927 6671 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Nop56Q9D6Z1 Lhx5-201ENSMUST00000031591 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Nop56Q9D6Z1 9930012K11Rik-205ENSMUST00000153871 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Nop56Q9D6Z1 Med30-201ENSMUST00000037115 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Nop56Q9D6Z1 Mboat7-201ENSMUST00000038608 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Nop56Q9D6Z1 Asic2-201ENSMUST00000021045 3436 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Nop56Q9D6Z1 Antxr2-201ENSMUST00000031281 5656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Nop56Q9D6Z1 Plekha8-202ENSMUST00000119706 6739 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Nop56Q9D6Z1 Tor3a-207ENSMUST00000188964 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Nop56Q9D6Z1 Ly6h-204ENSMUST00000127095 1336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Nop56Q9D6Z1 Dgkz-202ENSMUST00000099709 3512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Nop56Q9D6Z1 Zfp281-201ENSMUST00000047734 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Nop56Q9D6Z1 Dgkz-201ENSMUST00000028667 3584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Nop56Q9D6Z1 Ankrd13b-201ENSMUST00000037593 3105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Nop56Q9D6Z1 Plcl2-201ENSMUST00000043938 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Nop56Q9D6Z1 AC125311.2-201ENSMUST00000227477 1940 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
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