Protein–RNA interactions for Protein: Q9D6X5

Slc52a3, Solute carrier family 52, riboflavin transporter, member 3, mousemouse

Predictions only

Length 460 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slc52a3Q9D6X5 Tmtc1-202ENSMUST00000100772 8269 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Slc52a3Q9D6X5 Fam229a-201ENSMUST00000106043 558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Slc52a3Q9D6X5 Ccnd3-ps-201ENSMUST00000117963 881 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Slc52a3Q9D6X5 Rab28-205ENSMUST00000202913 863 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Slc52a3Q9D6X5 Lsm1-203ENSMUST00000211168 343 ntTSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Slc52a3Q9D6X5 0610009B22Rik-201ENSMUST00000007921 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Slc52a3Q9D6X5 Fam131a-202ENSMUST00000118919 2262 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Slc52a3Q9D6X5 Caskin1-201ENSMUST00000024958 6172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Slc52a3Q9D6X5 Inppl1-202ENSMUST00000165052 4730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Slc52a3Q9D6X5 Lrrc14-204ENSMUST00000137649 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Slc52a3Q9D6X5 Trim67-201ENSMUST00000041106 5694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Slc52a3Q9D6X5 Chd5-205ENSMUST00000164662 9375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Slc52a3Q9D6X5 Fuz-201ENSMUST00000071207 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Slc52a3Q9D6X5 Wnt10b-207ENSMUST00000228594 1510 ntAPPRIS P1 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Slc52a3Q9D6X5 Tlk2-201ENSMUST00000015107 3212 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Slc52a3Q9D6X5 4930448E22Rik-201ENSMUST00000181712 1581 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Slc52a3Q9D6X5 Dtnbp1-203ENSMUST00000220555 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Slc52a3Q9D6X5 Ccnd3-202ENSMUST00000171031 2113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Slc52a3Q9D6X5 Trim25-202ENSMUST00000100627 1433 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Slc52a3Q9D6X5 Trap1-201ENSMUST00000006137 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Slc52a3Q9D6X5 Sgta-201ENSMUST00000005067 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Slc52a3Q9D6X5 Purb-201ENSMUST00000179343 8319 ntAPPRIS P1 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Slc52a3Q9D6X5 Dlgap2-203ENSMUST00000133298 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Slc52a3Q9D6X5 4930544I03Rik-201ENSMUST00000181184 1276 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Slc52a3Q9D6X5 Gm17949-201ENSMUST00000210548 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Slc52a3Q9D6X5 Gm26781-201ENSMUST00000181385 1477 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Slc52a3Q9D6X5 C2cd4c-202ENSMUST00000178228 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Slc52a3Q9D6X5 Tnfrsf25-201ENSMUST00000025706 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Slc52a3Q9D6X5 Dscam-201ENSMUST00000056102 7498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Slc52a3Q9D6X5 Clcn2-202ENSMUST00000120099 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Slc52a3Q9D6X5 Ssc4d-204ENSMUST00000111153 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Slc52a3Q9D6X5 Sfrp4-201ENSMUST00000002883 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Slc52a3Q9D6X5 Nsmf-205ENSMUST00000114386 2685 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Slc52a3Q9D6X5 Prmt2-202ENSMUST00000099571 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Slc52a3Q9D6X5 Arhgef25-212ENSMUST00000222006 1896 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Slc52a3Q9D6X5 Vrk2-201ENSMUST00000078362 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Slc52a3Q9D6X5 Gm5414-201ENSMUST00000062879 1659 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Slc52a3Q9D6X5 Gm1673-202ENSMUST00000114382 451 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Slc52a3Q9D6X5 Gm9745-201ENSMUST00000021573 684 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Slc52a3Q9D6X5 Cenps-201ENSMUST00000030813 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Slc52a3Q9D6X5 Eme2-202ENSMUST00000121542 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Slc52a3Q9D6X5 Ern1-204ENSMUST00000106801 1957 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Slc52a3Q9D6X5 Il1rn-201ENSMUST00000114482 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Slc52a3Q9D6X5 Gm16863-201ENSMUST00000181476 2431 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Slc52a3Q9D6X5 Scaf8-201ENSMUST00000076734 4869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Slc52a3Q9D6X5 Asap2-202ENSMUST00000064595 5678 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Slc52a3Q9D6X5 B3gnt9-202ENSMUST00000136822 2516 ntAPPRIS P1 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Slc52a3Q9D6X5 Ffar3-201ENSMUST00000094583 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Slc52a3Q9D6X5 Mtrf1l-201ENSMUST00000019908 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Slc52a3Q9D6X5 Stam2-202ENSMUST00000127316 1928 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Slc52a3Q9D6X5 Htr5b-201ENSMUST00000055884 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Slc52a3Q9D6X5 Ubtf-206ENSMUST00000107123 2759 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Slc52a3Q9D6X5 Gm45606-201ENSMUST00000209836 2795 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Slc52a3Q9D6X5 Mycn-202ENSMUST00000130990 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Slc52a3Q9D6X5 Prickle4-201ENSMUST00000113299 990 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Slc52a3Q9D6X5 Prickle4-202ENSMUST00000113300 1110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Slc52a3Q9D6X5 Gm7977-201ENSMUST00000193787 748 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Slc52a3Q9D6X5 Ankrd39-202ENSMUST00000194894 664 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Slc52a3Q9D6X5 Arpc4-204ENSMUST00000204802 794 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Slc52a3Q9D6X5 Gm18032-201ENSMUST00000222541 538 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Slc52a3Q9D6X5 Banf1-201ENSMUST00000025762 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Slc52a3Q9D6X5 Olfr279-201ENSMUST00000050451 933 ntAPPRIS P1 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Slc52a3Q9D6X5 Spsb2-203ENSMUST00000112473 1322 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Slc52a3Q9D6X5 Derl3-201ENSMUST00000009236 1321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Slc52a3Q9D6X5 Dnaaf5-203ENSMUST00000196441 2426 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Slc52a3Q9D6X5 Ache-201ENSMUST00000024099 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Slc52a3Q9D6X5 Senp2-201ENSMUST00000023561 4499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Slc52a3Q9D6X5 Atp6v0a2-201ENSMUST00000037865 5345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Slc52a3Q9D6X5 F12-201ENSMUST00000021948 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Slc52a3Q9D6X5 Dbn1-202ENSMUST00000109921 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Slc52a3Q9D6X5 Slc30a5-205ENSMUST00000225922 2722 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Slc52a3Q9D6X5 Sars2-201ENSMUST00000094632 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Slc52a3Q9D6X5 Atp6v1b1-206ENSMUST00000206911 1591 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Slc52a3Q9D6X5 Vps53-203ENSMUST00000108419 2209 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Slc52a3Q9D6X5 Tm4sf19-201ENSMUST00000115149 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Slc52a3Q9D6X5 Hmga1-206ENSMUST00000119486 1003 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Slc52a3Q9D6X5 Gm13474-201ENSMUST00000122466 815 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Slc52a3Q9D6X5 Pabpc1l2b-ps-201ENSMUST00000124538 690 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Slc52a3Q9D6X5 Bola2-203ENSMUST00000130498 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Slc52a3Q9D6X5 Serf1-205ENSMUST00000152286 465 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Slc52a3Q9D6X5 Thegl-202ENSMUST00000117880 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Slc52a3Q9D6X5 Apbb1-209ENSMUST00000188368 1970 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Slc52a3Q9D6X5 Mmp28-201ENSMUST00000021020 2311 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Slc52a3Q9D6X5 D1Ertd622e-204ENSMUST00000153115 3495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Slc52a3Q9D6X5 Il17re-208ENSMUST00000204774 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Slc52a3Q9D6X5 Man1c1-201ENSMUST00000038628 4285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Slc52a3Q9D6X5 S1pr5-201ENSMUST00000122088 2500 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Slc52a3Q9D6X5 Kcnab3-201ENSMUST00000018614 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Slc52a3Q9D6X5 Exoc3l2-202ENSMUST00000137613 4016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Slc52a3Q9D6X5 Prdm6-201ENSMUST00000091900 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Slc52a3Q9D6X5 Arfip2-202ENSMUST00000084782 2254 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Slc52a3Q9D6X5 Arhgef19-201ENSMUST00000006618 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Slc52a3Q9D6X5 Eif4enif1-203ENSMUST00000110049 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Slc52a3Q9D6X5 Stambpl1-201ENSMUST00000054956 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Slc52a3Q9D6X5 Psmd13-209ENSMUST00000164681 726 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Slc52a3Q9D6X5 Ntrk1-201ENSMUST00000029712 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Slc52a3Q9D6X5 Mtss1l-201ENSMUST00000052457 4717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Slc52a3Q9D6X5 Fiz1-203ENSMUST00000167804 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Slc52a3Q9D6X5 Hmgxb3-201ENSMUST00000091884 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Slc52a3Q9D6X5 Nr4a1-201ENSMUST00000023779 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.4 ms