Protein–RNA interactions for Protein: Q9D6N1

Ca13, Carbonic anhydrase 13, mousemouse

Predictions only

Length 262 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ca13Q9D6N1 Nrros-203ENSMUST00000115165 2389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ca13Q9D6N1 Timm17b-201ENSMUST00000033498 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ca13Q9D6N1 Col9a3-203ENSMUST00000132527 3046 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ca13Q9D6N1 Etnk1-204ENSMUST00000205256 2647 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ca13Q9D6N1 Slc9a5-201ENSMUST00000073149 3499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ca13Q9D6N1 Nptn-212ENSMUST00000177292 1390 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ca13Q9D6N1 Gm9774-202ENSMUST00000192538 1392 ntAPPRIS P1 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ca13Q9D6N1 Mtrf1l-201ENSMUST00000019908 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ca13Q9D6N1 March8-202ENSMUST00000101032 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ca13Q9D6N1 Pea15a-202ENSMUST00000111247 2435 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ca13Q9D6N1 Pdcd5-202ENSMUST00000120714 767 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ca13Q9D6N1 Gm7638-201ENSMUST00000121348 967 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Ca13Q9D6N1 Gm12781-201ENSMUST00000146269 395 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ca13Q9D6N1 Snx15-207ENSMUST00000154601 767 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ca13Q9D6N1 Gm27741-201ENSMUST00000185060 237 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Ca13Q9D6N1 Pldi-201ENSMUST00000036304 853 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ca13Q9D6N1 Clasp2-204ENSMUST00000213663 2727 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ca13Q9D6N1 Mfsd13a-201ENSMUST00000086969 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ca13Q9D6N1 Dscc1-201ENSMUST00000023059 1324 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ca13Q9D6N1 Usp13-202ENSMUST00000108228 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ca13Q9D6N1 Gpn3-201ENSMUST00000031420 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ca13Q9D6N1 Farsa-201ENSMUST00000003906 1826 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ca13Q9D6N1 Zbtb8a-201ENSMUST00000030610 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ca13Q9D6N1 Trim68-201ENSMUST00000082175 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ca13Q9D6N1 Agfg1-206ENSMUST00000189220 8044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ca13Q9D6N1 Fuz-201ENSMUST00000071207 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ca13Q9D6N1 Gtf3a-201ENSMUST00000132102 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ca13Q9D6N1 Atp8b2-201ENSMUST00000069805 5559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ca13Q9D6N1 Fkbp5-201ENSMUST00000079413 3542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ca13Q9D6N1 Best2-203ENSMUST00000209421 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ca13Q9D6N1 1600012H06Rik-201ENSMUST00000052691 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ca13Q9D6N1 Zfpm1-201ENSMUST00000054052 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ca13Q9D6N1 Gm15545-202ENSMUST00000141011 899 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ca13Q9D6N1 Gm24841-201ENSMUST00000158676 357 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Ca13Q9D6N1 Gm7791-201ENSMUST00000219066 539 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Ca13Q9D6N1 Mgst3-201ENSMUST00000028005 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ca13Q9D6N1 Gclm-201ENSMUST00000029769 5589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ca13Q9D6N1 Hspbp1-201ENSMUST00000079970 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ca13Q9D6N1 Fam46c-201ENSMUST00000061455 5640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ca13Q9D6N1 Nit1-202ENSMUST00000111295 1335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ca13Q9D6N1 Nagk-203ENSMUST00000113851 1323 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ca13Q9D6N1 Dock9-202ENSMUST00000100299 6476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ca13Q9D6N1 Nf2-205ENSMUST00000109910 4720 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ca13Q9D6N1 Agap3-205ENSMUST00000199856 2685 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ca13Q9D6N1 A930012L18Rik-201ENSMUST00000181094 2364 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ca13Q9D6N1 Tmem80-201ENSMUST00000026578 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ca13Q9D6N1 Fam149b-216ENSMUST00000225942 2151 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ca13Q9D6N1 Gm43702-201ENSMUST00000198772 2546 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Ca13Q9D6N1 Zdhhc6-201ENSMUST00000076891 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ca13Q9D6N1 Mff-208ENSMUST00000160786 1645 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ca13Q9D6N1 Hsf5-201ENSMUST00000093956 4158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ca13Q9D6N1 Rrbp1-202ENSMUST00000037875 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ca13Q9D6N1 Mdfi-203ENSMUST00000113280 1281 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ca13Q9D6N1 D330023K18Rik-201ENSMUST00000133550 920 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ca13Q9D6N1 Hist1h2br-203ENSMUST00000180288 1256 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ca13Q9D6N1 Coq7-201ENSMUST00000032887 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ca13Q9D6N1 Rplp2-201ENSMUST00000084434 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ca13Q9D6N1 Hist1h2bq-202ENSMUST00000091749 1254 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ca13Q9D6N1 Tmem196-201ENSMUST00000058644 1678 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ca13Q9D6N1 Naif1-201ENSMUST00000048431 4650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ca13Q9D6N1 Map3k1-201ENSMUST00000109267 6978 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ca13Q9D6N1 Mpdu1-201ENSMUST00000018905 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ca13Q9D6N1 Cklf-208ENSMUST00000212433 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ca13Q9D6N1 Gm37820-201ENSMUST00000194021 2147 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Ca13Q9D6N1 Matn4-204ENSMUST00000109359 2179 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ca13Q9D6N1 Diras1-201ENSMUST00000055125 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ca13Q9D6N1 Ino80e-202ENSMUST00000106342 1840 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ca13Q9D6N1 Isyna1-201ENSMUST00000019283 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ca13Q9D6N1 Cntln-201ENSMUST00000047023 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ca13Q9D6N1 Clk4-201ENSMUST00000093132 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ca13Q9D6N1 Fam98a-201ENSMUST00000112507 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ca13Q9D6N1 Pigu-201ENSMUST00000077626 1636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ca13Q9D6N1 Adam15-203ENSMUST00000107446 1686 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ca13Q9D6N1 Kmt5c-201ENSMUST00000098853 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ca13Q9D6N1 Ppp2ca-201ENSMUST00000020608 7102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ca13Q9D6N1 Odf2-211ENSMUST00000113767 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ca13Q9D6N1 Prr3-209ENSMUST00000174849 581 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ca13Q9D6N1 Muc2-203ENSMUST00000179227 399 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ca13Q9D6N1 Cyth2-201ENSMUST00000056820 2527 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ca13Q9D6N1 Pcnx-204ENSMUST00000221721 8318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ca13Q9D6N1 Ptges3l-202ENSMUST00000103102 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ca13Q9D6N1 Ssu72-201ENSMUST00000030905 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ca13Q9D6N1 Nup85-201ENSMUST00000021085 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ca13Q9D6N1 Bcs1l-202ENSMUST00000113732 1679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
Ca13Q9D6N1 Ythdc1-203ENSMUST00000120498 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
Ca13Q9D6N1 Aire-204ENSMUST00000128241 1938 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ca13Q9D6N1 Aire-205ENSMUST00000130972 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ca13Q9D6N1 Aire-212ENSMUST00000145975 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ca13Q9D6N1 Aire-201ENSMUST00000019257 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ca13Q9D6N1 Nfil3-201ENSMUST00000071065 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ca13Q9D6N1 H2-Q6-201ENSMUST00000113879 981 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ca13Q9D6N1 Gm13401-201ENSMUST00000117074 291 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Ca13Q9D6N1 Steap1-201ENSMUST00000015796 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ca13Q9D6N1 Pih1d2-201ENSMUST00000000171 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ca13Q9D6N1 Tppp3-202ENSMUST00000176419 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ca13Q9D6N1 4930505A04Rik-201ENSMUST00000041763 904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ca13Q9D6N1 Gm8994-201ENSMUST00000077886 1236 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ca13Q9D6N1 Gm42900-201ENSMUST00000197184 2167 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Ca13Q9D6N1 Agbl5-215ENSMUST00000202060 3121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ca13Q9D6N1 Exoc3l2-202ENSMUST00000137613 4016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.8 ms